Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,039,146 | G→T | 5.4% | R83R (CGC→CGA) | PP_0897 ← | class 1 fumarate hydratase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,039,146 | 0 | G | T | 5.4% | 238.3 / 3.1 | 74 | R83R (CGC→CGA) | PP_0897 | class 1 fumarate hydratase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/36); new base T (2/2); total (36/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.39e-01 |
ACTGCCGGGGTGTTGTCCTTGGTGTTCTTGCGGGCACCGGCCGGGTCGGCCAGGATCGAAGCGCGCAGGACGTTTTCAGGCAGGTTGTAGGCGCGACGCACACCTTCGTTGATCATGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGAGTTGATCAGGATCTGGGCGATGGAATCGCGTGCAGCAGGCGATTCCTCACGCAGATA > NC_002947/1039000‑1039289 | aCTGCCGGGGTGTTGGCCTTGGTGTTCTTGCGGGCACCGGCCGGGTCGGCCAGGATCGAAGCGCGCAGGACGTTTTCAGGCAGGTTGTAGGCGCGACGCACACCTTCGTTGATCATGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCGgcg > 3:49973/1‑149 (MQ=255) cTGCCGGGGTGTTGTCCTTGGTGTTCTTGCGGGCACCGGCCGGGTCGGCCAGGATCGAAGCGCGCAGGACGTTTTCAGGCAGGTTGTAGGCGCGACGCACACCTTCGTTGATCATGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAgcgc > 2:78761/1‑149 (MQ=255) ccGGGGTGTTGTCCTTGGTGTTCTTGCGGGCACCGGCCGGGTCGGCCAGGATCGAAGCGCGCAGGACGTTTTCAGGCAGGTTGTAGGCGCGACGCACACCTTCGTTGATCATGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACg > 8:130813/1‑149 (MQ=255) cTTGGTGTTCTTGCGGGCACCGGCCGGGTCGGCCAGGATCGAAGCGCGCAGGACGTTTTCAGGCAGGTTGTAGGCGCGACGCACACCTTCGTTGATCATGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCAcgc > 2:40138/1‑149 (MQ=255) cTTGGTGTTCTTGCGGGCACCGGCCGGGTCGGCCAGGATCGAAGCGCGCAGGACGTTTTCAGGCAGGTTGTAGGCGCGACGCACACCTTCGTTGATCATGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCAcgc > 4:205484/1‑149 (MQ=255) ggTGTTCTTGCGGGCACCGGCCGGGTCGGCCAGGATCGAAGCGCGCAGGACGTTTTCAGGCAGGTTGTAGGCGCGACGCACACCTTCGTTGATCATGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGa > 7:279313/1‑149 (MQ=255) gtgtTCTTGCGGGCACCGGCCGGGTCGGCCAGGATCGAAGCGCGCAGGACGTTTTCAGGCAGGTTGTAGGCGCGACGCACACCTTCGTTGATCATGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCGGCGCACGTCCATGCCCACGCGGAt < 4:49973/149‑1 (MQ=255) gtgtTCTTGCGGGCACCGGCCGGGTCGGCCAGGATCGAAGCGCGCAGGACGTTTTCAGGCAGGTTGTAGGCGCGACGCACACCTTCGTTGATCATGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGAt < 8:279313/149‑1 (MQ=255) gtgtTCTTGCGGGCACCGGCCGGGTCGGCCAGGATCGAAGCGCGCAGGACGTTTTCAGGCAGGTTGTAGGCGCGACGCACACCTTCGTTGATCATGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGAt < 2:39707/149‑1 (MQ=255) ttGCGGGCACCGGCCGGGTCGGCCAGGATCGAAGCGCGCAGGACGTTTTCACGCAGGTTGTAGGCGCGACGCACACCTTCGTTGATCATGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAacac > 2:202587/1‑149 (MQ=255) gCGGGCACCGGCCGGGTCGGCCAGGATCGAAGCGCGCAGGACGTTTTCAGGCAGGTTGTAGGCGCGACGCACACCTTCGTTGATCATGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAacac < 5:137013/147‑1 (MQ=255) gggCACCGGCCGGGTCGGCCAGGATCGAAGCGCGCAGGACGTTTTCAGGCAGGTTGTAGGCGCGACGCACACCTTCGTTGATCATGTCGTCGACGCTCAAGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTg > 7:348751/1‑149 (MQ=255) ggCACCGGCCGGGTCGGCCAGGATCGAAGCGCGCAGGACGTTTTCAGGCAGGTTGTAGGCGCGACGCACACCTTCGTTGATCATGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGa < 1:78761/149‑1 (MQ=255) ggCACCGGCCGGGTCGGCCAGGATCGAAGCGCGCAGGACGTTTTCAGGCAGGTTGTAGGCGCGACGCACACCTTCGTTGATCATGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGa < 8:337037/149‑1 (MQ=255) cACCGGCCGGGTCGGCCAGGATCGAAGCGCGCAGGACGTTTTCAGGCAGGTTGTAGGCGCGACGCACACCTTCGTTGATCATGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGAc > 6:1218/1‑148 (MQ=255) ggccggGTCGGCCAGGATCGAAGCGCGCAGGACGTTTTCAGGCAGGTTGTAGGCGCGACGCACACCTTCGTTGATCATGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATAc > 4:311473/1‑149 (MQ=255) tCGGCCAGGATCGAAGCGCGCAGGACGTTTTCAGGCAGGTTGTAGGCGCGACGCACACCTTCGTTGATCATGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTc < 5:1218/149‑1 (MQ=255) gCCAGGATCGAAGCGCGCAGGACGTTTTCAGGCAGGTTGTAGGCGCGACGCACACCTTCGTTGATCATGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTg > 7:59667/1‑149 (MQ=255) gCCAGGATCGAAGCGCGCAGGACGTTTTCAGGCAGGTTGTAGGCGCGACGCACACCTTCGTTGATCATGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACCATACCGGTGTCCTg > 3:288407/1‑149 (MQ=255) cAGGATCGAAGCGCGCAGGACGTTTTCAGGCAGGTTGTAGGCGCGACGCACACCTTCGTTGATCATGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGc < 5:63867/149‑1 (MQ=255) aGGATCGAAGCGCGCAGGACGTTTTCAGGCAGGTTGTAGGCGCGACGCACACCTTCGTTGATCATGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCa < 8:212530/149‑1 (MQ=255) aTCGAAGCGCGCAGGACGTTTTCAGGCAGGTTGTAGGCGCGACGCACACCTTCGTTGATCATGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGAt > 3:69924/1‑149 (MQ=255) gAAGCGCGCAGGACGTTTTCAGGCAGGTTGTAGGCGCGACGCACACCTTCGTTGATCATGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTg < 7:130813/148‑1 (MQ=255) aGCGCGCAGGACGTTTTAAGGCAGGTTGTAGGCGCGACGCACACCTTCGTTGATCATGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACAGGTGTCCCGGCAGATTGGAc > 6:25853/1‑149 (MQ=255) cgcgcAGGACGTTTTCAGGCAGGTTGTAGGCGCGACGCACACCTTCGTTGATCATGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGa < 1:202587/149‑1 (MQ=255) gTTTTCAGGCAGGTTGTAGGCGCGACGCACACCTTCGTTGATCATGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTgg < 1:40138/149‑1 (MQ=255) gTTTTCAGGCAGGTTGTAGGCGCGACGCACACCTTCGTTGATCATGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTgg > 3:53854/1‑149 (MQ=255) tttCAGGCAGGTTGTAGGCGCGACGCACACCTTCGTTGATCATGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGgcg > 6:364689/1‑149 (MQ=255) tCAGGCAGGTTGTAGGCGCGTCGCACACCTTCGTTGATCATGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGgcgc < 8:166036/148‑1 (MQ=255) aggcaggTTGTAGGCGCGACGCACACCTTCGTTGATCATGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCCGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGcac < 5:25853/148‑1 (MQ=255) ttGTAGGCGCGACGCACACCTTCGTTGATCATGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGa < 3:54094/149‑1 (MQ=255) ggCGCGACGCACACCTTCGTTGATCATGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGAGt < 5:137956/146‑1 (MQ=255) ggCGCGACGCACACCTTCGTTGATCATGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGAGt > 6:137956/1‑146 (MQ=255) gACGCACACCTTCGTTGATCATGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGAGTTGATCAg > 3:68655/1‑148 (MQ=255) cGCACACCTTCTGTGATCAGGTCGTCGACGCTCAGGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGGCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGAGTTGATCAGGAt < 8:348751/149‑1 (MQ=255) acgttagTTGATCATGTCGTCGACGCTCATGGTCGCGACATCCCAGCTCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGTCGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGAGTTGATCAGGATCTggg < 3:205275/143‑1 (MQ=255) tCGTTGATCATGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGAGTTGATCAGGATCTGGGCGAt > 2:162555/1‑149 (MQ=255) gATCATGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGAGTTGATCAGGATCTGGGCGATGGAAt > 8:327881/1‑149 (MQ=255) tCATGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGAGTTGATCAGGATCTGGGCGATGGAATcg > 4:136909/1‑149 (MQ=255) aTGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGAGTTGATCAGGATCTGGGCGATGGAATcgc < 1:162555/148‑1 (MQ=255) tGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGAGTTGATCAGGATCTGGGCGATGGAATCGCGt < 3:205484/149‑1 (MQ=255) gtcgtcGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGAGTTGATCAGGATCTGGGCGATGGAATCGCGTg > 5:56288/1‑149 (MQ=255) gtcgtcGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGAGTTGATCAGGATCTGGGCGATGGAATCGCGTg > 7:121007/1‑149 (MQ=255) tcgtcgACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTgg > 8:340849/1‑103 (MQ=255) tcgtcgACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTgg < 7:340849/103‑1 (MQ=255) tcgtcgACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGAGTTGATCAGGATCTGGGCGAt < 4:10595/137‑1 (MQ=255) tcgtcgACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGAGTTGATCAGGATCTGGGCGAt > 3:10595/1‑137 (MQ=255) tcgtcgACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGAGTTGATCAGGATCTGGGCGATGGAATCGCGTg < 3:116270/148‑1 (MQ=255) cgtcgACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGAGTTGATCAGGATCTGGGCGATGGAATCGCGTg > 1:52232/1‑147 (MQ=255) gtcgACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGAGTTGATCAGGATCTGGGCGATGGAATCGCGTgca < 3:9519/148‑1 (MQ=255) gtcgACGCTCATGGT‑GCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGAGTTGATCAGGATCTGGGCGATGGAATCGCGGgcagc > 4:224572/1‑149 (MQ=255) aCGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGAGTTGATCAGGATCTGGGCGATGGAATCGCGTGCAGCAgg < 8:59667/149‑1 (MQ=255) gCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGAGTTGATCAGGATCTGGGCGATGGaa > 1:347162/1‑133 (MQ=255) gCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGAGTTGATCAGGATCTGGGCGATGGaa < 2:347162/133‑1 (MQ=255) gCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGAGTTGATCAGGATCTGGGCGATGGAATCGCGTGCAGCAGGc > 1:334774/1‑148 (MQ=255) cTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGAGTTGATCAGGATCTGGGCGATGGAATCGCGTGCAGCAGGCGa < 4:53854/149‑1 (MQ=255) tCATGGTGGCGCCATCCCATCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGc > 1:189580/1‑72 (MQ=255) tCATGGTGGCGCCATCCCATCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGc > 1:195496/1‑72 (MQ=255) tCATGGTGGCGCCATCCCATCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGc < 2:189580/72‑1 (MQ=255) tCATGGTGGCGCCATCCCATCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGc < 2:195496/72‑1 (MQ=255) tCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGAGTTGATCAGGATCTGGGCGATGGAATCGCGTGCAGCAGGCGAt > 7:156466/1‑149 (MQ=255) tggtggCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGAGTTGATCAGGATCTGGGCGATGGAATCGCCTGCTGCACGCGATTcc < 7:327881/149‑1 (MQ=255) ggtggCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGGACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGAGTTGATCAGGATCTGGGCGATGGAATCGCGTGCAGCAGGCGATTCCt > 6:14851/1‑149 (MQ=255) ggtggCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGAGTTGATCAGGATCTGGGCGATGGAATCGCGTGCAGCAGGCGATTCCt > 1:320116/1‑149 (MQ=255) gtggCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGAGTTGATCAGGATCTGGGCGATGGAATCGCGTGCAGCAGGCGATTCCTc < 3:311473/149‑1 (MQ=255) tggCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGAGTTGATCAGGATCTGGGCGATGGAATCGCGTGCAGCAGGCGATTCCTCa < 5:364689/149‑1 (MQ=255) tggCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGAGTTGATCAGGATCTGGGCGATGGAATCGCGTGCAGCAGGCGATTCCTCa > 2:353861/1‑149 (MQ=255) tggCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGAGTTGATCAGGATCTGGGCGATGGAATCGCGTGCAGCAGGCGATTCCTCa < 6:22425/149‑1 (MQ=255) cgcCATCCCAGCGCACGTCCATGCCGATGGGGATGAACTCGGGGTGGTTACGGGTGTGCTGGCAGATGGGACGATTGCAGGTGGCGCAGATGCTCGAGTTGATCTGGATCTGGGCGTTGGATTCGCGTGCAGCAGGCGATTCCTCAGGc < 4:288407/149‑1 (MQ=255) gcCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGgc > 7:54137/1‑84 (MQ=255) gcCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGgc < 8:54137/84‑1 (MQ=255) gcCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGAGTTGATCAGGATCTGGGCGATGGAATCGCGt < 8:123742/127‑1 (MQ=255) gcCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGAGTTGATCAGGATCTGGGCGATGGAATCGCGt > 7:123742/1‑127 (MQ=255) cATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGAGTTGATCAGGATCTGGGCGATGGAATCGCGTGCAGCAGGCGATTCCTCACg > 3:321512/1‑145 (MQ=255) aTCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGAGTTGATCAGGATCTGGGCGATGGAATCGCGTGCAGCAGGCGATTCCTCACGCAGAt < 2:320116/149‑1 (MQ=255) tCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGAGTTGATCAGGATCTGGGCGATGGAATCGCGTGCAGCAGGCGATTCCTCACGCAGATa < 3:136909/149‑1 (MQ=255) | ACTGCCGGGGTGTTGTCCTTGGTGTTCTTGCGGGCACCGGCCGGGTCGGCCAGGATCGAAGCGCGCAGGACGTTTTCAGGCAGGTTGTAGGCGCGACGCACACCTTCGTTGATCATGTCGTCGACGCTCATGGTGGCGCCATCCCAGCGCACGTCCATGCCCACGCGGATGAACACGGTGACGATACCGGTGTCCTGGCAGATTGGACGATGGCCGGTGGCGCACATGCGCGAGTTGATCAGGATCTGGGCGATGGAATCGCGTGCAGCAGGCGATTCCTCACGCAGATA > NC_002947/1039000‑1039289 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |