| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,045,258 | T→C | 7.0% | intergenic (+31/+75) | PP_0905 → / ← PP_0906 | hypothetical protein/RND family multidrug transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,045,258 | 0 | T | C | 7.0% | 204.9 / 2.3 | 71 | intergenic (+31/+75) | PP_0905/PP_0906 | hypothetical protein/RND family multidrug transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (28/37); new base C (2/3); total (31/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AGACCAGTGCGCGTTGCCGCGGGATGCAAAACCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCA‑GGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACGGCAACACAAACAAG > NC_002947/1045110‑1045405 | aGACCAGTGCGCGTTGCCGCGGGATGCAAAACCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCt > 8:68897/1‑149 (MQ=255) ccAGTGCGCGTTGCCGCGGGATGCAAAACCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTcgc < 6:171926/149‑1 (MQ=255) cAGTGCGCGTTGCCGCGGGATGCAAAACCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTcgc > 7:201181/1‑148 (MQ=255) gTTGCCGCGGGATGCAAAACCGCAGCAGCAGTCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAAGCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCggg < 4:261226/149‑1 (MQ=255) gTTGCCGCGGGATGCAAAACCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCggg < 5:44714/149‑1 (MQ=255) cgcgGGATGCAAAACCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCtt < 7:139678/149‑1 (MQ=255) cgcgGGATGCAAAACCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCtt > 2:30477/1‑149 (MQ=255) gcgGGATGCAAAACCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCttt < 7:195030/149‑1 (MQ=255) cgGGATGCAAAACCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTg < 6:226453/149‑1 (MQ=255) gATGCAAAACCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGtt < 7:218198/149‑1 (MQ=255) cAAAACCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAACGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGttttt < 1:60225/149‑1 (MQ=255) cAAAACCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGGCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGtttttt < 1:209770/149‑1 (MQ=255) cAAAACCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGtttttt < 4:118957/149‑1 (MQ=255) cAAAACCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGtttttt < 1:154584/149‑1 (MQ=255) aaaCCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGc > 3:290920/1‑149 (MQ=255) aCCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGt > 2:195257/1‑149 (MQ=255) gcagcagcaGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTg > 3:307186/1‑149 (MQ=255) cagcagcagGCCCGGAGCGAGCCAGACCCGGACCTTATGCTGGTCCTGTTTGGCCTGCGGCAAGGGGTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGc < 4:239198/149‑1 (MQ=255) agcagcagGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGcc < 1:195257/149‑1 (MQ=255) cagGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACACTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCGTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGcc > 6:59454/1‑149 (MQ=255) gCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGc < 4:192639/149‑1 (MQ=255) gcggttcgagcCTGACCTGGTCCTTTTGCTGTTCCTGTTTGTCGTGCGTCAAGGGTTGCGGTGACAGGGTTGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGGCTCGGGATTGGGGGTCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGGGTTGGCGGCct < 4:79980/143‑1 (MQ=255) gagcCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGAGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTcgcg > 2:12742/1‑149 (MQ=255) gcCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCggg > 1:16429/1‑149 (MQ=255) cAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCAATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCa < 2:108608/149‑1 (MQ=255) ccAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCgggtaaacc < 7:68897/149‑7 (MQ=255) ccAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAgccc < 4:307186/149‑1 (MQ=255) ggACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGcc < 4:69945/121‑1 (MQ=255) ggACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGcc > 3:69945/1‑121 (MQ=255) ggACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAgcccgcc > 3:203501/1‑149 (MQ=255) gCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGc > 5:12222/1‑120 (MQ=255) gCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGc < 6:12222/120‑1 (MQ=255) gtaccTCTTTGGCCAGCGTCAAGGGTTGCCGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGACGCCACGCCATAGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTTCCTTGCAGGCCTCTTCCCGGGCAGACCGCCCCAAGGACGGtt > 8:250589/4‑149 (MQ=255) ttCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTc < 3:74833/149‑1 (MQ=255) ttCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTc < 2:196585/149‑1 (MQ=255) cTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAg < 2:49112/149‑1 (MQ=255) cTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGAGGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCTCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAg < 1:111832/149‑1 (MQ=255) gTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGc > 5:338819/1‑148 (MQ=255) gCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAgcccgc > 4:102661/1‑125 (MQ=255) gCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAgcccgc < 3:102661/125‑1 (MQ=255) cTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCA‑g > 6:308530/1‑149 (MQ=255) cTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCA‑g > 4:1310/1‑149 (MQ=255) cTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCA‑g < 1:30477/149‑1 (MQ=255) cTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGAGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGTCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCA‑g < 1:12742/149‑1 (MQ=255) cGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCA‑GGt < 6:5508/148‑1 (MQ=255) gTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCA‑GGTGc > 3:277986/1‑149 (MQ=255) tCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCA‑GGTGc > 2:80972/1‑148 (MQ=255) aaGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAg < 4:248718/133‑1 (MQ=255) aaGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAg > 3:248718/1‑133 (MQ=255) ggTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCA‑GGTGCCTTGgc < 2:16429/149‑1 (MQ=255) gCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTCCA‑GGTGCCTTGCCGCta > 8:322586/1‑148 (MQ=255) cGGTCACACGCATGACCCCGGCGTTTGCTGGAAAA‑CCCAGAGGCCCCGCGATTGCGGGGCCTTGGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCA‑GGTGCCTTGGCGCTCg < 4:277986/149‑1 (MQ=255) gTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCA‑GGTGCCTTGGCGCTCGcc > 7:53575/1‑149 (MQ=255) gTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCA‑GGTGCCTTGGCGCTCGcc > 4:351341/1‑149 (MQ=255) acaGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCA‑GGTGCCTTGGCGCTCGCCTtg > 8:27267/1‑149 (MQ=255) gATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCA‑GGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTgcgc < 5:59454/149‑1 (MQ=255) aTGAACCCTGCGGTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCA‑GGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGcc < 7:250589/149‑1 (MQ=255) gAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCA‑GGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCcag > 6:255761/1‑149 (MQ=255) tGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCA‑GGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGgt > 2:232242/1‑149 (MQ=255) cGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCA‑GGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGgtgt < 1:232242/149‑1 (MQ=255) gTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCA‑GGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTa < 4:290920/149‑1 (MQ=255) gAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCA‑GGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCAc < 1:19604/148‑1 (MQ=255) gAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCA‑GGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACg > 3:332724/1‑149 (MQ=255) aaa‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCA‑GGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACGGc < 3:1310/149‑1 (MQ=255) aaa‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGGCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCATTGTGCCATGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACgg < 1:80972/149‑1 (MQ=255) gCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCA‑GGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACGGCaa > 5:304262/1‑148 (MQ=255) aaagGCCCCGCAATCGCGTGGACTTTGGTTTGTTGTGTGTGCCTTGGCGGCCTCTTCGGGTGAAGCGCGACCCAAGGTCTTTTTAAGAGATTGCT‑GGTTCCTTGGCGGTCGCCTTGTGCGCCAGCAGTGTGTa < 6:359918/131‑1 (MQ=255) aaagGCCCCGCAATCGCGACGCCTTTGGTTTTTTGTGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGAATGCA‑GGTGCCTTGGCGCTCGGCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTa > 5:359918/3‑133 (MQ=255) agGCCCCGCAATCGCGAGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCA‑GGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAgg > 6:251772/1‑126 (MQ=255) agGCCCCGCAATCGCGAGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCA‑GGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAgg < 5:251772/126‑1 (MQ=255) gCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCA‑GGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACGGCAACacaaac > 5:202140/1‑148 (MQ=255) cTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCA‑GGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGCAGATGCACGGCAACACAAACAAg > 5:317691/1‑149 (MQ=255) | AGACCAGTGCGCGTTGCCGCGGGATGCAAAACCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCGGTCACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAA‑GCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCA‑GGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACGGCAACACAAACAAG > NC_002947/1045110‑1045405 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |