| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,120,934 | T→C | 7.2% | V125V (GTT→GTC) ‡ | PP_0982 → | YjgP/YjgQ family permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,120,934 | 0 | T | C | 7.2% | 197.1 / 4.0 | 69 | V125V (GTT→GTC) ‡ | PP_0982 | YjgP/YjgQ family permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (31/33); new base C (2/3); total (33/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CGGGCGCCTGTACCTGGAAAGCGAGATGACCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATACCGAGCAACTGTCGGATGACCGCATCAACCTGGGCGG > NC_002947/1120787‑1121077 | ctggCTCCTGTACCTGGAAAGCGAGATGACCGTGCTGGCGGCCACTGTCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGtt < 6:127452/146‑1 (MQ=255) gggCGCCTGTACCTGGAAAGCGAGATGACCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGc > 2:273113/1‑149 (MQ=255) ccTGTACCTGGAAAGCGCGATGACCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCAACGCCCAgg < 2:295263/149‑1 (MQ=255) ccTGTACCTGGAAAGCGAGATGACCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAgg > 4:45625/1‑149 (MQ=255) cTGTACCTGGAAAGCGAGATGACCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCAACGCCCAggg < 4:279972/149‑2 (MQ=255) tACCTGGAAAGCGAGATGACCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTgc < 5:143188/148‑1 (MQ=255) ccTGGATAGAGAGATGACCGTGCGGTGGGCCACTGGCATGAGCCATCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCGCTGGATGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGGCCAGGTgcag < 6:270382/148‑1 (MQ=255) ccTGGAAAGCGAGATGACCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTgcag > 6:198114/1‑148 (MQ=255) cTGGAAAGCGAGATGACCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTgcag > 3:364988/1‑147 (MQ=255) aaaGCGAGATGACCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGatc < 7:342512/149‑1 (MQ=255) aaaGCGAGATGACCGTGCTGGCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCT‑GCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGatca < 1:315664/149‑1 (MQ=255) aaGCGAGATGACCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGatca > 3:13950/1‑149 (MQ=255) cGTGCTGTCGGCCTCTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCTTGGCGCCGGCTGCCCTGGTCGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCGTGG‑CCCCCCTGGGCAACGCCCAgggg < 5:271860/127‑3 (MQ=255) cGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGACAGCAGCGCCTCCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCGTGCTGGTGGGCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGCGCAACGCCCAgggg > 6:271860/1‑125 (MQ=255) gTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGa > 6:181884/1‑149 (MQ=255) tCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGcc < 4:253807/147‑1 (MQ=255) tCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGGTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGccc < 6:225381/148‑1 (MQ=255) ggCCACTGGCATGAGCCCGCAGCGCCAGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCGGCCCGGGTTTCCCAGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCAGGGGGTTGCCCAGGTGCAGCAGGTAAAAAGCCAGCAGGATTCCCTGa > 8:71187/1‑149 (MQ=255) gCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGcccggcc > 2:346157/1‑145 (MQ=255) gCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGAc < 5:178024/149‑1 (MQ=255) ccACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGAcc < 7:126325/149‑1 (MQ=255) ccACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGAcc < 4:364988/149‑1 (MQ=255) aCTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGAcc > 7:60443/1‑147 (MQ=255) gCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGTCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGt < 3:146209/147‑1 (MQ=255) gCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTc < 5:99882/149‑1 (MQ=255) aTGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCGTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGAGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGACTTCGa > 1:121608/1‑149 (MQ=255) ccAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCt < 3:232607/149‑1 (MQ=255) ccAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCt < 3:68709/149‑1 (MQ=255) ccAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCt > 4:68709/1‑149 (MQ=255) ccAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGCGCGTTGCCCAGGTGCAGCACATCATCAGACAGCAGGATGCCCTGCCCGAGTTCGACACCt > 8:179185/1‑149 (MQ=255) cagcagCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCtt < 5:198114/149‑1 (MQ=255) agcagcGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTg < 8:92482/149‑1 (MQ=255) gcagcGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGGCCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTg < 2:279674/149‑1 (MQ=255) ctgctgGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTc > 6:230772/1‑132 (MQ=255) ctgctgGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTc < 5:230772/132‑1 (MQ=255) ctgctgGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCggg > 3:30703/1‑149 (MQ=255) cATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTc > 3:98979/1‑148 (MQ=255) gACCTTGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCt < 2:151831/128‑1 (MQ=255) gACCTTGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCt > 1:151831/1‑128 (MQ=255) gACCTTGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCt > 1:147400/1‑128 (MQ=255) gACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCTCTTCCAGa > 8:327398/1‑149 (MQ=255) gACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGa > 7:27137/1‑149 (MQ=255) cATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCt > 2:34428/1‑149 (MQ=255) aTGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCtt < 4:98979/149‑1 (MQ=255) cGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGAt < 8:60443/149‑1 (MQ=255) ggCTGCCCTGGGTGCCCTGCGGCGGGCCGGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGATCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATg < 2:121608/149‑1 (MQ=255) tGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCt > 3:286517/1‑149 (MQ=255) cTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTcgcg > 7:156733/1‑149 (MQ=255) tGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCgg > 7:39066/1‑149 (MQ=255) gTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCgg < 4:286517/147‑1 (MQ=255) cccTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAAc < 2:298109/148‑1 (MQ=255) cccTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAAc < 7:71187/148‑1 (MQ=255) cccTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAAc < 1:35211/148‑1 (MQ=255) ctgGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATAc < 1:273113/149‑1 (MQ=255) ggtggCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATAcc > 1:56792/1‑148 (MQ=255) gtggCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATAcc > 8:17594/1‑147 (MQ=255) gtggCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATACCGa < 8:27137/149‑1 (MQ=255) agcctgagcctgG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGCCCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATACCGAGCAACTGTCGGa > 4:176852/1‑149 (MQ=255) agcctgagcctgG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATACCGAGCAACTGTCGGa < 4:108818/149‑1 (MQ=255) agcctgagcctgG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCGTCCCGACCTTGCGGGATGGCTCGCGGGTAACCTATACCGAGCAACTGTCGGa > 4:182658/1‑149 (MQ=255) gcctgagcctgG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATACCGAGCAACTGTCGGAt < 5:181884/149‑1 (MQ=255) ctgagcctgG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATACCGAGCAACTGTCGGATGa > 2:78252/1‑149 (MQ=255) ctgagcctgG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATACCGAGCAACTGTCGGATGa > 2:191891/1‑149 (MQ=255) tgagcctgG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATACCGAGCAACTGTCGGATGAc > 7:281987/1‑149 (MQ=255) agcctgG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCTGGTAACCTATACCGAGCAACTGTCGGATGAc < 3:45625/147‑1 (MQ=255) ccccccTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATACCGAGCAACTGTCGGATGACCGCATCAAc < 8:156733/149‑1 (MQ=255) ccccccTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATACCGAGCAACTGTCGGATGACCGCATCAAc < 4:13950/149‑1 (MQ=255) ccccTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGCCCGAGTTCGACACCGTGGTGCCGGGCCGCGTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATAACGAGCAACTGTCGGATGCCCGCAGCATccg > 6:229721/1‑148 (MQ=255) caccTGGGCAACGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATACCGAGCAACTGTCGGATGACCGCATCAACCt > 8:345331/3‑149 (MQ=255) ggCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATACCGAGCAACTGTCGGATGACCGCATCAACCTGGGCgg < 2:56792/149‑1 (MQ=255) | CGGGCGCCTGTACCTGGAAAGCGAGATGACCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGCCTGAGCCTGG‑CCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATACCGAGCAACTGTCGGATGACCGCATCAACCTGGGCGG > NC_002947/1120787‑1121077 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |