Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,134,089 | A→T | 10.2% | intergenic (+34/+44) | PP_0995 → / ← gltS | membrane protein/glutamate:sodium symporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,134,089 | 0 | A | T | 10.2% | 166.7 / 8.4 | 66 | intergenic (+34/+44) | PP_0995/gltS | membrane protein/glutamate:sodium symporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/28); new base T (2/5); total (33/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.27e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.94e-01 |
CCTGCATTGCCCGGAAATGGGCGTGCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAACGCCCCCACCATCGGCACCACCAGGAAGGCGAG > NC_002947/1133944‑1134237 | cctgcAGTGCCCGGAACTGGGCGGGCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCGCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAacgacg < 8:201351/148‑1 (MQ=255) ctgcATTGCCCGGAAATGGGCGTGCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGtt > 3:82669/1‑149 (MQ=255) gcATTGCCCGGAAATGGGCGTGCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGTCGTTCt < 4:167773/149‑1 (MQ=255) cATTGCCCGGAAATGGGCGTGCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTc < 4:146538/147‑1 (MQ=255) cATTGCCCGGAAATGGGCGTGCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTc < 7:45252/147‑1 (MQ=255) aTTGCCCGGAAATGGGCGTGCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAacgac > 3:218101/1‑142 (MQ=255) aTTGCCCGGAAATGGGCGTGCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAacgac < 4:218101/142‑1 (MQ=255) aTTGCCCGGAAATGGGCGTGCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGa < 3:365806/149‑1 (MQ=255) ttGCCCGGAAATGGGCGTGCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGTCGTTCTGag < 3:97957/149‑2 (MQ=255) cccGGAAATGGGCGTGCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGTCGTTCTGagtt < 1:198379/148‑4 (MQ=255) cGGAAATGGGCGTGCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑ttgctt < 4:263495/149‑1 (MQ=255) gCGTGCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCt > 1:58486/1‑149 (MQ=255) gCGTGCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGGTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTATGA‑TTTCTTGCCATGGCt > 8:248203/1‑149 (MQ=255) cGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGCCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAg > 3:275941/1‑149 (MQ=255) tGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCg > 2:369294/1‑149 (MQ=255) cggctctgtgGTATGTCCTCGGCATGCTCGTCCCGACGGTACTCGGTCCCTGGTCGGGCCCCTGCATCCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGAAACTCAGAACGACGTACTGA‑TTGCTTGCACTCGCATCACACGTTCGt > 4:173714/7‑149 (MQ=255) gtgtgtGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTc < 8:247792/144‑1 (MQ=255) gtgtgtGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTc > 7:247792/1‑144 (MQ=255) gtgtggGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCTGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGAc < 3:173714/149‑1 (MQ=255) tGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAAc > 1:197943/1‑149 (MQ=255) tCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAAccc > 2:325562/1‑149 (MQ=255) cTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTCCTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTCGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGACCGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCg > 5:295627/1‑148 (MQ=255) cGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGca > 3:3393/1‑148 (MQ=255) aTGCTCGGGCCGACGGGACTCGGCGCCTGGGGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCGGGCTTCACAGGGTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACaaa < 6:295627/149‑1 (MQ=255) gCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGcaa > 4:34847/1‑137 (MQ=255) cGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAAt < 3:208221/149‑1 (MQ=255) aCGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTg > 5:55012/1‑115 (MQ=255) aCGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTg < 6:55012/115‑1 (MQ=255) ggTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGc > 1:54377/1‑147 (MQ=255) tACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAgg < 2:58486/149‑1 (MQ=255) tCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAg < 6:329333/135‑1 (MQ=255) tCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAg > 5:329333/1‑135 (MQ=255) ggTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAg > 7:278856/1‑149 (MQ=255) ggTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAg > 4:168288/1‑149 (MQ=255) gTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGc < 8:147510/149‑1 (MQ=255) tggtggGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCt > 7:223980/1‑108 (MQ=255) tggtggGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCt < 8:223980/108‑1 (MQ=255) ggggCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAAt < 2:202464/128‑1 (MQ=255) ggggCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAAt > 1:202464/1‑128 (MQ=255) gggCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGa < 1:325562/149‑1 (MQ=255) gggCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGa > 5:132544/1‑149 (MQ=255) cccGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACa > 5:347744/1‑149 (MQ=255) cGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGcaac < 1:137155/107‑1 (MQ=255) cGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGcaac > 2:137155/1‑107 (MQ=255) gCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATtg < 3:168288/149‑1 (MQ=255) cATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACAATGACATtga < 7:69094/149‑1 (MQ=255) tgctgcGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATtgatg < 2:177644/149‑1 (MQ=255) tgcGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGatgatg > 2:21702/1‑149 (MQ=255) gcGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGt > 3:103127/1‑149 (MQ=255) gcGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGt > 2:233937/1‑149 (MQ=255) ttGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGa < 8:278856/149‑1 (MQ=255) ggTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGAt < 1:369294/148‑1 (MQ=255) agctcTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACTTACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATgaa < 1:100354/145‑1 (MQ=255) tGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGCCCTCGCTTAACCCGCAACAAACCCAGCCAATGCCAGGTACAGCTTCATCACGATGACATTGATGATGTAGATgaa > 2:100354/1‑144 (MQ=255) ccGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAACGcccc < 4:3393/149‑1 (MQ=255) ccGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAACGcccc < 6:347744/149‑1 (MQ=255) cGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTg > 8:324328/1‑110 (MQ=255) cGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTg < 7:324328/110‑1 (MQ=255) ggCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAACGCCCcca > 5:298889/1‑149 (MQ=255) ccccACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAACGCCCCCACCATCg > 4:292512/1‑149 (MQ=255) cACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCGGCACCAACCCAAGGCAATGCCAGGTACCGGTTGATCCCGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAACGCCCCCCCCATCGGcc > 3:104253/1‑148 (MQ=255) cACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAACGCCCCCACCATCGGca > 6:160422/1‑149 (MQ=255) aCGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAACGCCCCCACCATCGGcac < 4:103127/149‑1 (MQ=255) caatCAGAACGTCGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGt > 2:35114/4‑117 (MQ=255) caatCAGAACGTCGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGt < 1:35114/114‑1 (MQ=255) aatCAGAACGTCGTTCTGAGTTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAACGCCCCCACCATCGGcaccac > 6:301278/3‑148 (MQ=255) aGACCGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCTGGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAACGCCCCCACCATCGGCACCACCAGGa < 7:248203/148‑1 (MQ=255) aGAACGTAGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAACGCCCCCACCATCGGCACCACCAGGa < 4:275941/148‑1 (MQ=255) aGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAACGCCCCCACCATCGGCACCACCAGGa < 2:197943/148‑1 (MQ=255) acgTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAACGCCCCCACCATCGGCACCACCAGGAAGGCGAg < 2:54377/149‑1 (MQ=255) | CCTGCATTGCCCGGAAATGGGCGTGCCGTTCTGGGGTGTGTGGTATGTCCTCGGCATGCTCGTGCCGACGGTACTCGGTGCCTGGTGGGGCCCCCGCATGCTGCGTTGGTAGGCTGTACCGGCAGGCCCCACGCAACTCAGAACGACGTTCTGA‑TTGCTTGCCCTGGCTTCACAGGTTCGTGACCTCGCTTAACCCGCAACAAACCAAGGCAATGCCAGGTACAGCTTGATCACGATGACATTGATGATGTCGATGAAGAACGCCCCCACCATCGGCACCACCAGGAAGGCGAG > NC_002947/1133944‑1134237 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |