| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,139,414 | G→A | 5.7% | Y77Y (TAC→TAT) | arcB ← | ornithine carbamoyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,139,414 | 0 | G | A | 5.7% | 215.1 / 2.2 | 70 | Y77Y (TAC→TAT) | arcB | ornithine carbamoyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/32); new base A (2/2); total (36/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CCGGTACGCCGGCGAACTTGGCCAGCTCTTCGACGATTTCCTGCTTGAAGCCACGGTACTCGATGGCGTCATACATGCGCCCGAGCACACGGGCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAGATCAGGGCGATGTTGTTGC‑CCTTCAGGTGCTGCTGCTCGGTGCCCGTGTACTTGGCGCGCTTGAGGTCGCG > NC_002947/1139269‑1139560 | ccGGTACGCCGGCGAACTTGGCCAGCTCTTCGACGATTTCCTGCTTGAAGCCACGGTACTCGATGGCGTCATACATGCGCCCGAGCACACGGGCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAg > 3:252323/1‑149 (MQ=255) cGGCGAACTTGGCCAGCTCTTAGACGATTTCCTGCTTGAAGCCACGGTACTCGATGGCGTCATACATGCGCCCGAGCACACGGGCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTg > 3:53556/1‑149 (MQ=255) ggCGAACTTGGCCAGCTCTTCGACGATTTCCTGCTTGAAGCCACGGTACTCGATGGCGTCATACATGCGCCCGAGCACACGGGCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTgg > 8:109509/1‑149 (MQ=255) gCGAACTTGGCCAGCTCTTCGACGATTTCCTGCTTGAAGCCACGGTACTCGATGGCGTCATACATGCGCCCGAGCACACGGGCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGAc > 6:146830/1‑143 (MQ=255) gCGAACTTGGCCAGCTCTTCGACGATTTCCTGCTTGAAGCCACGGTACTCGATGGCGTCATACATGCGCCCGAGCACACGGGCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGAc < 5:146830/143‑1 (MQ=255) gAACTTGGCCAGCTCTTCGACGATTTCCTGCTTGAAGCCACGGTACTCGATGGCGTCATACATGCGCCCGAGCACACGGGCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGgcgc < 6:331222/149‑1 (MQ=255) aCTTGGCCAGCTCTTCGACGATTTCCTGCTTGAAGCCACGGTACTCGATGGCGTCATACATGCGCCCGAGCACACGGGCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGGCt > 8:346238/1‑149 (MQ=255) gtctTCGACGATTTCCTGCTTTAAGCCACGGTACTCGATGGCGTCATACATGCGCCCGAGCACACGGGCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAgg < 2:173696/148‑1 (MQ=255) ctctTCGACGATTTCCTGCTTGAAGCCACGGTACTCGATGGCGTCATACATGCGCCCGAGCACACGGGCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAgg < 4:252323/149‑1 (MQ=255) atattCGAAGATTTCCTGCTTGAAGCCACTGGACTCGATGTCGTCATACATGCGCCCTAGCACACGGTCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCTATCTGCGAGGAGTTTGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAgg < 4:197174/146‑1 (MQ=255) cgaTTTCCTGCTTGAAGCCACGGTACTCGATGGCGTCATACATGCGCCCGAGCACACGGGCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACt < 3:143782/149‑1 (MQ=255) cTGCTTGAAGCCACGGTACTCGATGGCGTCATACATGCGCCCGAGCACACGGGCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAg < 6:124094/148‑1 (MQ=255) tGCTTGAAGCCACGGTACTCGATGGCGTCATACATGCGCCCGAGCACACGGGCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAgg > 2:32735/1‑148 (MQ=255) ttGAAGCCACGGTACTCGATGGCGTCATACATGCGCCCGAGCACACGGGCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGcac > 7:18681/1‑148 (MQ=255) gAAGCCACGGTACTCGATGGCGTCATACATGCGCCCGAGCACACGGGCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACaa < 7:105701/148‑1 (MQ=255) aaGCCACGGTACTCGATGGCGTCATACATGCGCCCGAGCACACGGGCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAacg > 1:184916/1‑149 (MQ=255) gCCACGGTACTCGATGGCGTCATACATGCGCCCGAGCACACGGGCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAacggg > 1:125800/1‑149 (MQ=255) tACTCGATGGCGTCATACATGCGCCCGAGCACACGGGCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAacgggtacgggt < 2:200037/149‑1 (MQ=255) cGATGGCGTCATACATGCGCCCGAGCACACGGGCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAacgggtacgg > 6:224941/1‑143 (MQ=255) cGATGGCGTCATACATGCGCCCGAGCACACGGGCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAacgggtacgg > 8:135565/1‑143 (MQ=255) cGATGGCGTCATACATGCGCCCGAGCACACGGGCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAacgggtacgg < 7:135565/143‑1 (MQ=255) cGATGGCGTCATACATGCGCCCGAGCACACGGGCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAacgggtacgg < 5:224941/143‑1 (MQ=255) cGATGGCGTCATACATGCGCCCGAGCACACGGGCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAg > 5:141504/1‑149 (MQ=255) gATGGCGTCATACATGCGCCCGAGCACACGGGCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTc < 6:366514/108‑1 (MQ=255) gATGGCGTCATACATGCGCCCGAGCACACGGGCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAgg > 5:282334/1‑149 (MQ=255) aCATGCGCCCGAGCACACGGGCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGTGGGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGaa > 1:81701/1‑149 (MQ=255) gcgcCCGAGCACACGGGCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAGAt > 8:320897/1‑147 (MQ=255) cgcCCGAGCACACGGGCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAGATCAg < 2:125800/149‑1 (MQ=255) gcCCGAGCACACGGGCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAGATCAgg > 4:290155/1‑149 (MQ=255) cccGAGCACACGGGCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAGATCAggg < 3:14385/149‑1 (MQ=255) ccGAGCACACGGGCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGtttt < 7:134371/134‑1 (MQ=255) ccGAGCACACGGGCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGtttt > 8:134371/1‑134 (MQ=255) cacaCGGGCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAGa < 5:356518/137‑1 (MQ=255) cacaCGGGCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACATCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAGa > 6:356518/1‑137 (MQ=255) cacaCGGGCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATATAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAGa > 6:362032/1‑137 (MQ=255) cacaCGGGCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATATAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAGa < 5:362032/137‑1 (MQ=255) acGGGCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAGATCAGGGCGAtgttgt < 7:197092/149‑1 (MQ=255) gggCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGTGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAGATCAGGGCGATGttgttg < 4:53556/149‑1 (MQ=255) tgtCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAGATCAGGGCGATGTTGTTGC‑CCtt > 3:310493/1‑148 (MQ=255) tgtCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTATCGAAGATCAGGGCGATGTTGTTGC‑CCTTc < 1:32735/149‑1 (MQ=255) tCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAGATCAGGGCGATGTTGTTGC‑CCTTCa < 7:109509/148‑1 (MQ=255) tCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAGATCAGGGCGATGTTGTTGC‑CCTTCAg > 4:47777/1‑149 (MQ=255) tCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACATCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAGATCAGGGCGATGTTGTTGC‑CCTTCAg < 6:317794/149‑1 (MQ=255) ttCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAGATCAGGGCGATGTTGTTGC‑CCTTCAGGtg > 2:82725/1‑149 (MQ=255) ttCATGCTTTCCTTGT‑GGACGATCTGCGAGGAGTTGGTGACGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGACATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAGATAAGGGCGATGTTGGTGC‑GCTGCAGGtg > 6:271121/1‑149 (MQ=255) tGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAGATCAGGGCGATGTTGTTGC‑CCTTCAGGtgctgc > 3:331638/1‑149 (MQ=255) cTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAGATCAGGGCGATGTTGTTGC‑CCTTCAGGtgctgct < 5:129632/148‑1 (MQ=255) cTTTCCTTGG‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGTTTTTTTCGAAGATCAGGGCGATGTTGTTGC‑CCTTCAGGtgctgct < 7:346238/148‑1 (MQ=255) tCCTTGT‑GGCCGATATGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAGATCAGGGCGATGTTGTTGC‑CCTTCAGGTGCTGCTGCTc > 2:298690/1‑149 (MQ=255) ttGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACATCGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAGATCAGGGAGATGTTGTTGC‑CCTTCAGGTGCTACTGCTCGGt > 5:85832/1‑149 (MQ=255) gt‑gGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAGATCAGGGCGATGTTGTTGC‑CCTTCAGGTGCTGCTGCTCGGt < 2:184916/147‑1 (MQ=255) gCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAGATCAGGGCGATGTTGTTGC‑CCTTCAGGTGCTGCTGCTCGGTGccc < 2:81701/148‑1 (MQ=255) gCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAGATCAGGGCGATGTTGTTGC‑CCTTCAGGTGCTGCTGCTCGGTGCCCg > 5:157869/1‑149 (MQ=255) gCGAGGAGTTGGGGTCGATATAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAGATCAgg < 8:331248/101‑1 (MQ=255) gCGAGGAGTTGGGGTCGATATAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAGATCAgg > 7:331248/1‑101 (MQ=255) gaggagTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAGATCAGGGCGATGTTGTTGC‑CCTTCAGGTGCTGCTGCTCGGTGCCCGTGTACTTGgc < 4:310493/149‑1 (MQ=255) gTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAGATCAGGGCGATGTTGTTGC‑CCTTCAGGTGCTGCTGCTCGGTGCCCGTGTACTTGGCGCGCt > 6:257813/1‑149 (MQ=255) tGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACAGGAGGAGGTTTTTTCGAAGATCAGGGCGATGTTGTTGC‑CCTTAAGGTGCTGCTCCTCGGTGCCCGTCTACTTGGCGCCCtt > 4:334798/1‑148 (MQ=255) gggTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAGATCAGGGCGATGTTGTTGC‑CCTTCAGGTGCTGCTGCTCGGTGCCCGTGTACTTGGCGCGCTTGAg < 6:141504/149‑1 (MQ=255) gggTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAGATCAGGGCGATGTTGTTGC‑CCTTCAGGTGCTGCTGCTCGGTGCCCGTGTACTTGGCGCGCTTGAg > 8:240430/1‑149 (MQ=255) gggTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAGATCAGGGCGATGTTGTTGC‑CCTTCAGGTGCTACTGCTCGGTGCCCGTGTACTTGGCGCGCTTGAg > 2:187004/1‑149 (MQ=255) ggTCGATGTATGGGACGGTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAGATCAGGGCGATGTTGTTGCTCCTTCAGGTGCTGCTGCTCGGTGCCCGTGTACTTGGCGCGCTTGAg < 1:82725/149‑1 (MQ=255) gTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAg < 6:265448/82‑1 (MQ=255) gTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAg > 5:265448/1‑82 (MQ=255) gTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAGATCAGGGCGATGTTGTTGC‑CCTTCAGGTGCTGCTGCTCGGTGCCCGTGTACTTGGCGCGCTTGAGGt > 8:26902/1‑149 (MQ=255) gATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAGATCAGGGCGATGTTGTTGC‑CCTTCAGGTGCTGCTGCTCGGTGCCCgt > 3:302855/1‑126 (MQ=255) gATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAGATCAGGGCGATGTTGTTGC‑CCTTCAGGTGCTGCTGCTCGGTGCCCgt < 4:302855/126‑1 (MQ=255) gATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACCGGTGGAGGTTTTTTCGAAGATCAGGGCGATGTAGTTGC‑CCTTCAGGTGCTGCTGCTCGGTGCCCGTGTACTAGCCGCGCTTGAGGTcgc > 6:226157/1‑149 (MQ=255) aTGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAGATCAGGGCGATGTTGTTGC‑CCTTCAGGTGCTGCTGCTCGGTGCCCGTGTACTTGGCGCGCTTGAGGTcgcg < 6:282334/149‑1 (MQ=255) aTGTAGGTGACGTTGGAGGCTTTGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACATCGGGTACGGTTGGAGGTTTTTTGGAAGATCATGGCGATGTTGTTGC‑CCTTCAGGTGCTGCTGCTCGGTGCCCGTGTACTTGGCGCGCTTGAGGTcgc < 7:141450/148‑1 (MQ=255) | CCGGTACGCCGGCGAACTTGGCCAGCTCTTCGACGATTTCCTGCTTGAAGCCACGGTACTCGATGGCGTCATACATGCGCCCGAGCACACGGGCGGTGTCCTTCATGCTTTCCTTGT‑GGCCGATCTGCGAGGAGTTGGGGTCGATGTAGGTGACGTTGGCGCCTTGGTCATAGGCTGCGACTTCGAAGGCACAACGGGTACGGGTGGAGGTTTTTTCGAAGATCAGGGCGATGTTGTTGC‑CCTTCAGGTGCTGCTGCTCGGTGCCCGTGTACTTGGCGCGCTTGAGGTCGCG > NC_002947/1139269‑1139560 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |