| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,169,738 | G→A | 5.3% | Y224Y (TAC→TAT) | leuA ← | 2‑isopropylmalate synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,169,738 | 0 | G | A | 5.3% | 228.3 / 2.5 | 75 | Y224Y (TAC→TAT) | leuA | 2‑isopropylmalate synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (37/34); new base A (2/2); total (39/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.08e-01 | |||||||||||
AGGCAGCCTTCGGCACGGTCGGCGCCGGCCATGAGGCCCAGTTCGGTGGCAGCGATGCCGGTGCCGCGGTCGTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTCCACACCTCGATGACCGCGTCGCAGACCTCCTTGGCGAACTCCATTTCAGTGGCGCTGAAGGTTTCTGGCGA > NC_002947/1169592‑1169881 | aGGCAGCCTTCGGCACGGTCGGCGCCGGCCATGAGGCCCAGTTCGGTGGCAGCGATGCCGGTGCCGCGGTCGTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCg > 1:163534/1‑147 (MQ=255) gaaGCCTTCGGCACGGTCGGCGCCGGCCATGAGGCCCAGTTCGGTGGCAGCGATGCCGGTGCCGCGGTCGTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCg > 4:144489/3‑145 (MQ=255) gCAGCCTTCGGCACGGTCGGCGCCGGCCATGAGGCCCAGTTCGGTGGCAGCGATGCCGGTGCCGCGGTCGTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCg > 8:169515/1‑145 (MQ=255) ccTTCGGCACGGTCGGCGCCGGCCATGAGGCCCAGTTCGGTGGCAGCGATGCCGGTGCCGCGGTCGTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGAGGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCATAGATAtt > 4:117759/1‑149 (MQ=255) ccTTCGGCACGGTCGGCGCCGGCCATGAGGCCCAGTTCGGTGGCAGCGATGCCGGTGCCGCGGTCGTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATAtt > 3:239616/1‑149 (MQ=255) aCGGTCGGCGCCGGCCATGAGGCCCAGTTCGGTGGCAGCGATGCCGGTGCCGCGGTCGTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTgg > 3:98688/1‑149 (MQ=255) ggTCGGCGCCGGCCATGAGGCCCAGTTCGGTGGCAGCGATGCCGGTGCCGCGGTCGTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGa > 6:77050/1‑148 (MQ=255) cgcCGGCCATGAGGCCCAGTTCGGTGGCAGCGATGCCGGTGCCGCGGTCGTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTcc < 2:368594/149‑1 (MQ=255) gCCATGAGGCCCAGTTCGGTGGCAGCGATGCCGGTGCCGCGGTCGTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGt > 1:287968/1‑149 (MQ=255) ccATGAGGCCCAGTTCGGTGGCAGCGATGCCGGTGCCGCGGTCGTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTc < 7:25514/142‑1 (MQ=255) ccATGAGGCCCAGTTCGGTGGCAGCGATGCCGGTGCCGCGGTCGTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTc < 7:68235/142‑1 (MQ=255) ccATGAGGCCCAGTTCGGTGGCAGCGATGCCGGTGCCGCGGTCGTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTc > 8:25514/1‑142 (MQ=255) ccATGAGGCCCAGTTCGGTGGCAGCGATGCCGGTGCCGCGGTCGTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTc > 8:68235/1‑142 (MQ=255) cccAGTTCGGTGGCAGCGATGCCGGTGCCGCGGTCGTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGCGAGGTAGCTCACGTTGCGCTGCACACCCACTCGATCTGGTCGCCGTAGATATTTGGCGTGTACACTAACACTGTGGCCg > 1:299384/1‑149 (MQ=255) cccAGTTCGGTGGCAGCGATGCCGGTGCCGCGGTCGTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCgg > 3:4765/1‑146 (MQ=255) cccAGTTCGGTGGCAGCGATGCCGGTGCCGCGGTCGTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCgg < 4:4765/146‑1 (MQ=255) cccAGTTCGGTGGCAGCGATGCCGGTGCCGCGGTCGTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCgg < 8:63934/146‑1 (MQ=255) cccAGTTCGGTGGCAGCGATGCCGGTGCCGCGGTCGTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCgg > 7:63934/1‑146 (MQ=255) ccAGTTCGGTGGCAGCGATGCCGGTGCCGCGGTCGTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAgg > 7:27069/1‑149 (MQ=255) gTTCGGTTGCATCGTTGGCGGTGCCGCGGTCGTTTTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGG‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACAGTTCCACGGTGGc < 8:77374/139‑1 (MQ=255) gTTCGGTGGCAGCGATGCCGGTGCCGCGGTCGTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGc > 7:77374/1‑139 (MQ=255) ttCGGTGGCAGCGATGCCGGTGCCGCGGTCGTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGa < 3:144489/149‑1 (MQ=255) cGGTGGCAGCGATGCCGGTGCCGCGGTCGTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGGCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAgg < 2:119706/149‑1 (MQ=255) ggTGGCAGCGATGCCGGTGCCGCGGTCGTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGga > 5:249017/1‑149 (MQ=255) aGCGATGCCGGTGCCGCGGTCGTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCt > 7:208196/1‑149 (MQ=255) gCGATGCCGGTGCCGCGGTCGTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGATGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCATAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCtt < 3:117759/149‑1 (MQ=255) gCGATGCCGGTGCCGCGGTCGTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCtt < 8:27069/149‑1 (MQ=255) cGATGCCGGTGCCGCGGTCGTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTtg > 6:319970/1‑149 (MQ=255) gATGCCGGTGCCGCGGTCGTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTtgt < 2:163534/149‑1 (MQ=255) gATGCCGGTGCCGCGGTCGTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTtgt < 6:249017/149‑1 (MQ=255) ccGGTGCCGCGGTCGTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGtt < 6:269415/148‑1 (MQ=255) cGGTGCCGCGGTCGTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCa < 6:332813/149‑1 (MQ=255) ggTGCCGCGGTCGTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAg < 2:236926/149‑1 (MQ=255) ccGCGGTCGTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGt < 2:287968/149‑1 (MQ=255) cgcgGTCGTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAgggg > 6:348627/1‑147 (MQ=255) cgcgGTCGTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAgggg > 4:256271/1‑147 (MQ=255) gTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTcc < 5:319970/149‑1 (MQ=255) gTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTc > 7:123143/1‑148 (MQ=255) gCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTCCACACCt > 8:242575/1‑149 (MQ=255) gCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTCCACACCt < 7:169515/149‑1 (MQ=255) gTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGTCACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTCCACACCTCGa > 7:234916/1‑149 (MQ=255) tGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTCCACACCTCGAt < 5:348627/149‑1 (MQ=255) ggCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTCCACACCTCGATGAcc < 3:366609/149‑1 (MQ=255) ggCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGACCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTCCacac < 3:52309/139‑1 (MQ=255) ggCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGACCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTCCacac > 4:52309/1‑139 (MQ=255) cTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTCCACACCTCGATGCCcgc > 4:314971/1‑149 (MQ=255) cTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCAATCGATCTGGTCGGCGTATATATTTGGCGTGGAAACTTCCACGTTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTCCACACCTCGATGCCcgc > 4:93367/1‑149 (MQ=255) tgatgaTCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTCCACACCTCGATGACcgcg > 5:179497/1‑149 (MQ=255) atgatCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTCCACACCTCGATGACCGCGt < 7:242575/148‑1 (MQ=255) atCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTCCACACCTCGATGACCGCGTCg > 2:74076/1‑147 (MQ=255) tCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTCCACACCTCGATGACCGCGTCg > 2:281509/1‑146 (MQ=255) aCGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTGAGGGGTAGGGTTCCACACCTCGATGACCGCGTCGCAGAc > 2:63901/1‑149 (MQ=255) cgc‑‑gGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTCCACACCTCGATGACCGCGTCGCAGACCTCCTTg < 4:239616/149‑1 (MQ=255) c‑‑ggcggcggACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTCCACACCTCGATGACCGCGTCGCAGACCTCCTTGGc < 8:208196/149‑1 (MQ=255) tGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTCCACACCTCGATGACCGCGTCGCAg < 6:176373/131‑1 (MQ=255) tGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTCCACACCTCGATGACCGCGTCGCAGACCTCCTTGGCGAACTc > 5:143212/1‑148 (MQ=255) tGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTCCACACCTCGATGACAGCGTCGCAg > 5:176373/1‑131 (MQ=255) gTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTCCACACCTCGATGACCGCGTCGCAGACCTCCTTGGCGAACTCCAttt < 3:314971/149‑1 (MQ=255) ttGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTCCACACCTCGATGACCGCGTCGCAGACCTCCTTGGCGAACTCCATTTc < 2:299384/149‑1 (MQ=255) cG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTAAGGGGTAGGGTTCCACACCTCGATGACCGCGTCGCAGACCTCCTTGGCGAACTCCATTTCAGt > 4:203544/1‑149 (MQ=255) g‑‑gCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTCCACACCTCGATGACCGCGTCGCAGACCTCCTTGGCGAACTCCATTTCAGTg < 4:98688/149‑1 (MQ=255) g‑‑gCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCATAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTCCACACCTCGATGACCGCGTCGCAGACCTCCTTGGCGAACTCCAttt > 4:224246/1‑144 (MQ=255) g‑‑gCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCATAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTCCACACCTCGATGACCGCGTCGCAGACCTCCTTGGCGAACTCCAttt < 3:224246/144‑1 (MQ=255) cAGAACCACTCGTTCTGGGCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGGAGGGTTCCACACCTCGATGACCGCGTCGCAGACCTCCTTGGCGAACTCCATTTCAGTGgc < 5:279548/149‑1 (MQ=255) aGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTAAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTCCACACCTCGATGACCGCGTCGCAGACCTCCTTGGCGAACTCCATTTCAGTGgcg > 5:81436/1‑149 (MQ=255) gAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGTTTCCACACCTCGATGACCGCGTCGCAGACCTCCTTGGCGAACTCCATTTCAGTGgcgc < 6:143212/149‑1 (MQ=255) gAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTCCACACCTCGATGACCGCCTCGCAGACCTCCTTGGCGAACTCCATTTCAGTGgctc > 7:140495/1‑147 (MQ=255) ccACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTCCACACCTCGATGACCGCGTCGCAGACCTCCTTGGCGAACTCCATTTCAGTGGCGCTg > 5:274114/1‑148 (MQ=255) tCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTCCACACCTCGATGACCGCGTCGCAGACCTCCTTGGCGAACTCCATTTCAGTGGCGCTGAAGGt > 7:14101/1‑149 (MQ=255) gATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTCCACACCTCGATGACCGCGTCGCAGACCTCCTTGGCGAACTCCATTTCAGTGGCGCTGAAGGttt > 6:132576/1‑149 (MQ=255) tCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTCCACACCTCGATGACCGCGTCGCAGACCTCCTTGGCGAACTCCATTTCAGTGGCGCTGAAGGTTTCt > 8:272095/1‑149 (MQ=255) ggTCGACGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTCCACACCTCGATGACCGCGTCGCAGACCTCCTTGGCGAACTCCATTTCAGTGGCGCTGAAGGTTTCTGGc > 1:138869/1‑149 (MQ=255) gTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTCCACACCTCGATGACCGCGTCGCAGACCTCCTTGGCGAACTCCATTTCAGTGGCGCTGAAGGTTTc < 8:123143/144‑1 (MQ=255) gTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTCCACACCTCGATGACCGCGTCGCAGACCTCCTTGGCGAACTCCATTTCAGTGGCGCTGAAGGTTTc < 1:135189/144‑1 (MQ=255) gTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTCCACACCTCGATGACCGCGTCGCAGACCTCCTTGGCGAACTCCATTTCAGTGGCGCTGAAGGTTTCTGGc > 8:180947/1‑148 (MQ=255) gTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTAAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTCCACACCTCGATGACCGCGTCGCAGACCTCCTTGGCGAACTCCATTTCAGTGGCGCTGAAGGTTTCTgg < 6:81436/147‑1 (MQ=255) tCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTCCACACCTCGATGACCGCGTCGCAGACCTCCTTGGCGAACTCCATTTCAGTGGCGCTGAAGGTTTCTGGCGa < 7:272095/149‑1 (MQ=255) tCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTCCACACCTCGATGACCGCGTCGCAGACCTCCTTGGCGAACTCCATTTCAGTGGCGCTGAAGGTTTCTGGCGa < 5:77050/149‑1 (MQ=255) | AGGCAGCCTTCGGCACGGTCGGCGCCGGCCATGAGGCCCAGTTCGGTGGCAGCGATGCCGGTGCCGCGGTCGTTGTGGCAGTGCAGGCTGATGATCACGCTGTCGC‑‑GGCGGCTGACGTTGCG‑‑GCAGAACCACTCGATCTGGTCGGCGTAGATATTTGGCGTGGACACTTCCACGGTGGCCGGCAGGTTGAGGATGATCTTGTGTTCAGGGGTAGGGTTCCACACCTCGATGACCGCGTCGCAGACCTCCTTGGCGAACTCCATTTCAGTGGCGCTGAAGGTTTCTGGCGA > NC_002947/1169592‑1169881 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |