| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,183,364 | T→G | 6.0% | M341L (ATG→CTG) | mltF ← | membrane‑bound lytic murein transglycosylase F |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,183,364 | 0 | T | G | 6.0% | 244.2 / 4.5 | 78 | M341L (ATG→CTG) | mltF | membrane‑bound lytic murein transglycosylase F |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (39/34); new base G (2/3); total (41/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.64e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CCGCCACCGACATTGTAGGCGGCAAGGGCGAACCAGGTGCGGTCCGGCTCCTTGATGCTGTCGTCAAGCTCTTCCTTGATCTTCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGC > NC_002947/1183219‑1183512 | ccgccACCGACATTGTAGGCGGCAAGGGCGAACCAGGTGCGGTCCGGCTCCTTGATGCTGTCGTCAAGCTCTTCCTTGATCTTCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGc < 6:295315/149‑1 (MQ=255) cgccACCGACATTGTAGGCGGCAAGGGCGAACCAGGTGCGGTCCGGCTCCTTGATGCTGTCGTCAAGCTCTTCCTTGATCTTCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGcc > 8:263685/1‑149 (MQ=255) ccACCGACATTGTAGGCGGCAAGGGCGAACCAGTTGCGGTCCGGCTCCTTGATGCTGTCGTCAAGATCTTCCTTGATCTTCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTg < 8:127624/149‑1 (MQ=255) cGACATTGTAGGCGGCAAGGGCGAACCAGGTGCGGTCCGGCTCCTTGATGCTGTCGTCAAGCTCTTCCTTGATCTTCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCg > 3:221595/1‑149 (MQ=255) aCATTGTAGGCGGCAAGGGCGAACCAGGTGCGGTCCGGCTCCTTGATGCTGTCGTCAAGCTCTTCCTTGATCTTCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGt > 7:134268/1‑149 (MQ=255) cATTGTAGGCGGCAAGGGCGAACCAGGTGCGGTCCGGCTCCTTGATGCTGTCGTCAAGCTCTTCCTTGATCTTCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTg > 1:188415/1‑149 (MQ=255) cATTGTAGGCGGCAAGGGCGAACCAGGTGCGGTCCGGCTCCTTGATGCTGTCGTCAAGCTCTTCCTTGATCTTCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCAGGCCATGGGCgtgt < 4:289291/149‑4 (MQ=255) ggcggcAAGGGCGAACCAGGTGCGGTCCGGCTCCTTGATGCTGTCGTCAAGCTCTTCCTTGATCTTCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTgg < 3:131336/148‑1 (MQ=255) ggcggcAAGGGCGAACCAGGTGCGGTCCGGCTCCTTGATGCTGTCGTCAAGCTCTTCCTTGATCTTCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTgg < 3:126051/148‑1 (MQ=255) gcggcAAGGGCGAACCAGGTGCGGTCCGGCTCCTTGATGCTGTCGTCAAGCTCTTCCTTGATCTTCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGt > 4:288797/1‑149 (MQ=255) gcggcAAGGGCGAACCAGGTGCGGTCCGGCTCCTTGATGCTGTCGTCAAGCAATTGCTTGATCTTCATGAAGTACTTGGCCCCGCCCAGGAATCACTGCCTCGGGTCCAGTACGTTCGACACCCCCATTCCCTGGGCGGTGCGCGGGGt > 8:120681/1‑149 (MQ=255) ggcAAGGGCGAACCAGGTGCGGTCCGGCTCCTTGATGCTGTCGTCAAGCTCTTCCTTGATCTTCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCa < 1:172764/149‑1 (MQ=255) cAAGGGCGAACCAGGTGCGGTCCGGCTCCTTGATGCTGTCGTCAAGCTCTTCCTTGATCTTCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGc < 7:263685/149‑1 (MQ=255) cAAGGGCGAACCAGGTGCGGTCCGGCTCCTTGATGCTGTCGTCAAGCTCTTCCTTGATCTTCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCAGGCCATGGGc < 1:333049/133‑1 (MQ=255) cAAGGGCGAACCAGGTGCGGTCCGGCTCCTTGATGCTGTCGTCAAGCTCTTCCTTGATCTTCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCAGGCCATGGGc > 2:333049/1‑133 (MQ=255) ggCGAACCAGGTGCGGTCCGGCTCCTTGATGCTGTCGTCAAGCTCTTCCTTGATCTTCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCa > 1:126622/1‑143 (MQ=255) ggCGAACCAGGTGCGGTCCGGCTCCTTGATGCTGTCGTCAAGCTCTTCCTTGATCTTCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCa < 2:126622/143‑1 (MQ=255) gAACCAGGTGCGGTCCGGCTCCTTGATGCTGTCGTCAAGCTCTTCCTTGATCTTCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCAtcatca < 7:270066/149‑1 (MQ=255) aGGTGCGGTCCGGCTCCTTGATGCTGTCGTCAAGCGCTTCCTTGTTCTTCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCTTGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCcg < 7:120681/149‑1 (MQ=255) gTGCGGTCCGGCTCCTTGATGCTGTCGTCAAGCTCTTCCTTGATCTTCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCcgcg > 4:323837/1‑149 (MQ=255) ggTCCGGCTCCTTGATGCTGTCGTCAAGCTCTTCCTTGATCTTCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACg < 4:221595/149‑1 (MQ=255) gTCCGGCTCCTTGATGCTGTCGTCAAGCTCTTCCTTGATCTTCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGc > 8:11753/1‑149 (MQ=255) gTCCGGCTCCTTGATGCTGTCGTCAAGCTCTTCCTTGATCTTCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGc > 6:38714/1‑149 (MQ=255) gTCCGGCTCCTTGATGCTGTCGTCAAGCTCTTCCTTGATCTTCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGc < 3:323837/149‑1 (MQ=255) cGGCTCCTTGATGCTGTCGTCAAGCTCTTCCTTGATCTTCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCgg > 7:147269/1‑149 (MQ=255) cGGCTCCTTGATGCTGTCGTCAAGCTCTTCCTTGATCTTCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCgg > 2:328750/1‑149 (MQ=255) tCCTTGATGCTGTCGTCAAGCTCTTCCTTGATCTTCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCtt > 5:6480/1‑149 (MQ=255) cTTGATGCTGTCGTCAAGCTCTTCCTTGATCTTCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTgg > 6:342557/1‑149 (MQ=255) cTTGATGCTGTCGTCAAGCTCTTCCTTGATCTTCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTg > 1:213286/1‑148 (MQ=255) ttGATGCTGTCGTCAAGCTCTTCCTTGATCTTCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCAATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTg > 3:94499/1‑147 (MQ=255) gATGCTGTCGTCAAGCTCTTCCTTGATCTTCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAg < 3:140496/148‑1 (MQ=255) aTGCTGTCGTCAAGCTCTTCCTTGATCTTCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGt < 2:356104/149‑1 (MQ=255) gtcAAGCTCTTCCTTGATCTTCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTcc < 7:111941/148‑1 (MQ=255) aGCTCTTCCTTGATCTTCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTg < 4:95174/149‑1 (MQ=255) ttCCTTGATCTTCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCcaca > 2:126038/1‑149 (MQ=255) ttGATCTTCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGa > 1:162091/1‑149 (MQ=255) aTCTTCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGAtt < 5:38714/148‑1 (MQ=255) ttCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTg > 2:6060/1‑149 (MQ=255) tCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCCgg > 8:27830/1‑149 (MQ=255) cATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTg < 1:126038/147‑1 (MQ=255) cATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGt > 8:16578/1‑149 (MQ=255) aTGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTa < 7:16578/149‑1 (MQ=255) tGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAg > 7:77906/1‑149 (MQ=255) gAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTg < 7:287942/112‑1 (MQ=255) gAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTg > 8:287942/1‑112 (MQ=255) gTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCaa < 3:288797/149‑1 (MQ=255) cTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATgg < 7:11753/149‑1 (MQ=255) cTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATg < 6:328925/148‑1 (MQ=255) ttGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGc > 8:35029/1‑149 (MQ=255) gcgcCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGCAGCCATTGGCtac < 2:213286/149‑3 (MQ=255) cgccgcCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGcc > 6:309503/1‑149 (MQ=255) cgccgcCCTGCATGCGCTGCCTCGGGTCCAGGCGCTTCGACACGCCCAGGGCCGGGGCGGGGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACCTCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGc < 8:134268/148‑1 (MQ=255) gcggccCTGGATGCTCTGCCTCGGGTACAGTGGGTTCGACACGCGCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGCAGCCATTGGCTACca < 4:94499/146‑1 (MQ=255) cccTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCcagcag < 6:6480/149‑1 (MQ=255) ccTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAgg > 7:136509/1‑149 (MQ=255) ccTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAgg < 3:178328/149‑1 (MQ=255) tGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGcc < 7:56229/141‑1 (MQ=255) tGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGcc > 8:56229/1‑141 (MQ=255) aTGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCa < 2:188415/149‑1 (MQ=255) ctctGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCTATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTc > 6:364843/1‑149 (MQ=255) tctGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCg > 6:26355/1‑149 (MQ=255) ctGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGa < 1:328750/149‑1 (MQ=255) tCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGAGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGc > 5:4292/1‑149 (MQ=255) cAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCt > 4:310565/1‑149 (MQ=255) gTCGGTTCGACACGCCTATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTg < 5:364843/149‑1 (MQ=255) gTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTg < 8:77906/149‑1 (MQ=255) tCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAg < 3:288932/130‑1 (MQ=255) tCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGCTGACTTCCGGCAGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAg > 4:288932/1‑130 (MQ=255) ggTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCg > 8:246430/1‑149 (MQ=255) gTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTgt < 5:257235/100‑2 (MQ=255) gTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTgg > 6:257235/1‑100 (MQ=255) gTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCg > 3:316159/1‑148 (MQ=255) gcgcaccGCCCAGGCCATGGGC‑GTGCGCTGNGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGc > 1:33224/7‑149 (MQ=255) gACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGct > 4:71639/1‑149 (MQ=255) acGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCtt > 3:113810/1‑149 (MQ=255) ccATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAg > 2:96431/1‑149 (MQ=255) cATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTg < 6:6500/133‑1 (MQ=255) cATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTg > 5:6500/1‑133 (MQ=255) tGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGc < 2:162091/149‑1 (MQ=255) | CCGCCACCGACATTGTAGGCGGCAAGGGCGAACCAGGTGCGGTCCGGCTCCTTGATGCTGTCGTCAAGCTCTTCCTTGATCTTCATGAAGTACTTGGCGCCGCCCTGGATGCTCTGCCTCGGGTCCAGTCGGTTCGACACGCCCATGGCCTGGGCGGTGCGCTGGGTCAGCATCATCAGGCCGCGCACGCCGGTCTTGGAGGTGACTTCCGGCTGCCACATCGATTCCTGGTAGCCAATGGCTGCCAGCAGGCGCCAGTCGACCTGCTCGACCTTGGCGTAGCTCTTGAAGTGC > NC_002947/1183219‑1183512 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |