| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,211,094 | T→C | 6.9% | H458R (CAT→CGT) | PP_1060 ← | glutamate synthase large subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,211,094 | 0 | T | C | 6.9% | 205.8 / 2.4 | 71 | H458R (CAT→CGT) | PP_1060 | glutamate synthase large subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (32/34); new base C (2/3); total (34/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTG > NC_002947/1210946‑1211238 | aCCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGAt > 7:38156/1‑149 (MQ=255)aCCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGAt < 8:21580/149‑1 (MQ=255)aCCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGAt > 1:30140/1‑149 (MQ=255) gCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGTCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGaa < 1:15392/148‑1 (MQ=255) gCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGaa < 3:280648/148‑1 (MQ=255) gCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGaa < 7:237704/148‑1 (MQ=255) tCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGtt > 8:42181/1‑148 (MQ=255) tCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGtt > 4:150032/1‑148 (MQ=255) cAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGtt < 8:277665/147‑1 (MQ=255) aaGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCa < 3:96498/148‑1 (MQ=255) aaGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAg > 1:213522/1‑149 (MQ=255) aaGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAg < 3:170508/149‑1 (MQ=255) acacATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCAcc > 2:210002/1‑149 (MQ=255) cacaTGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCAccc > 1:167951/1‑149 (MQ=255) cacaTGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCAccc > 1:162439/1‑149 (MQ=255) gCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCggg > 4:298051/1‑149 (MQ=255) cATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTgg < 4:149855/148‑1 (MQ=255) cGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCt < 7:153658/145‑1 (MQ=255) cGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGt > 8:189416/1‑149 (MQ=255) cGAGAACAGCTTGATTT‑GGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTc < 3:335387/149‑1 (MQ=255) aGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGcac < 1:7744/149‑1 (MQ=255) ttGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGcaccac > 2:88036/1‑149 (MQ=255) cGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTggg > 7:122515/1‑126 (MQ=255) cGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGACGGAAGTTCAGCACCCGCTggg < 8:122515/126‑1 (MQ=255) ccGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCGTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAAGGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTgg < 4:81006/149‑1 (MQ=255) cGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGCACAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTgg > 1:294351/1‑149 (MQ=255) cGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGgc > 4:268525/1‑149 (MQ=255) aaaTGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGgcg > 6:218768/1‑148 (MQ=255) aaTGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTggtggt < 2:167951/149‑5 (MQ=255) aaTGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTggtggt < 2:162439/149‑5 (MQ=255) aaTGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGgcg > 7:167206/1‑147 (MQ=255) cgccgcACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCg < 1:228425/148‑1 (MQ=255) ccgcACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGAt < 2:30140/149‑1 (MQ=255) aCCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTg < 8:38156/149‑1 (MQ=255) cTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGcc < 5:218768/148‑1 (MQ=255) cTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGt < 2:322467/138‑1 (MQ=255) cTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGt > 1:322467/1‑138 (MQ=255) tCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGt > 7:74431/1‑149 (MQ=255) cAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCg > 8:256068/1‑149 (MQ=255) cAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCg < 7:189416/149‑1 (MQ=255) gTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGGGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCggg < 2:213522/149‑1 (MQ=255) tgCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCAt < 1:88036/148‑1 (MQ=255) ccGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCTGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCAttt < 2:73203/148‑1 (MQ=255) ccGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGAACTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCAttt < 1:210002/148‑1 (MQ=255) cTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGgtgt < 7:256068/149‑1 (MQ=255) tCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGtgtg > 7:190198/1‑149 (MQ=255) ccAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTgg > 6:46345/1‑149 (MQ=255) cAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCATGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTgg > 4:297513/1‑148 (MQ=255) cAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTgg < 2:294351/148‑1 (MQ=255) ggCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAg < 3:268525/149‑1 (MQ=255) cTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCtt > 6:57848/1‑149 (MQ=255) ccgccgc‑cAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCttt < 6:329804/147‑1 (MQ=255) ccgccgc‑cAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGc < 3:150032/149‑1 (MQ=255) gccgc‑cAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGa > 7:214688/1‑149 (MQ=255) c‑cAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGc < 6:280794/101‑1 (MQ=255) c‑cAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGc > 5:280794/1‑101 (MQ=255) 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cAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATg < 8:269019/148‑1 (MQ=255) cAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATg > 7:269019/1‑148 (MQ=255) cAAGGCACGCAACGTGTTGTGACGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTg < 2:134851/135‑1 (MQ=255) cAAGGCACGCAACGTGTTGTGACGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTg < 2:140328/135‑1 (MQ=255) cAAGGCACGCAACGTGTTGTGACGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTg > 1:140328/1‑135 (MQ=255) cAAGGCACGCAACGTGTTGTGACGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTg > 1:134851/1‑135 (MQ=255) aCGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACa > 3:2045/1‑149 (MQ=255) gCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATg < 6:28113/149‑1 (MQ=255) gttgtGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCcgc < 8:214688/149‑1 (MQ=255) gtgATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTg > 3:119575/1‑149 (MQ=255) tgATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGc > 8:201013/1‑79 (MQ=255) tgATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGc < 7:201013/79‑1 (MQ=255) gATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGCTCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGa > 4:309007/1‑126 (MQ=255) | ACCTGGCTTCAAGAACACATGCATCTGCGAGAACAGCTTGATTTCGGTGGCCGAAATGCGCCGCACCAGGTGCTTGGCCTCCAGTTGTGCCGGATGCTCCAGGCCTGCCGCCGC‑CAGCATTTCTGCCAAGGCACGCAACGTGTTGTGATGGAAGTTCAGCACCCGCTGGGCTTTGTCGGGCACCACCAGCGCGCGCTGGCGCAGCGGATCTTGCGTGGCCACGCCGGTCGGGCATTTGTTGGTGTGGCAGCTTTGCGACTGGATGCAGCCGATGGCGAACATGAAGCCGCGTG > NC_002947/1210946‑1211238 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |