| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,277,325 | T→G | 5.5% | Q15H (CAA→CAC) | PP_1116 ← | resolvase family site‑specific recombinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,277,325 | 0 | T | G | 5.5% | 231.9 / 3.6 | 73 | Q15H (CAA→CAC) | PP_1116 | resolvase family site‑specific recombinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (31/38); new base G (2/2); total (33/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.25e-01 | |||||||||||
TCAGAGCTTTTGCACCTTCTGGACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAATTGGGCAGACGTTCGTTAGTGCAAATGGAAATTCTAGATTTCCCAAA > NC_002947/1277177‑1277473 | tCAGAGCTTTTGCACCTTCTGGACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCt > 1:32577/1‑149 (MQ=255)tCAGAGCTTTTGCACCTTCTGGACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCt > 7:247046/1‑149 (MQ=255) agagCTTTTGCACCTTCTGGACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCtt > 5:316801/1‑148 (MQ=255) agagCTTTTGCACCTTCTGGACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCtt > 5:205329/1‑148 (MQ=255) agagCTTTTGCACCTTCTGGACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCtt > 3:27477/1‑148 (MQ=255) agagCTTTTGCACCTTCTGGACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCtt > 2:365108/1‑148 (MQ=255) ttttGCACCTTCTGGACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGActct > 5:99630/1‑149 (MQ=255) ttGCACCTTCTGGACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCAAGGTGActctg < 6:212477/148‑2 (MQ=255) tGCACCTTCTGGACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTg < 1:95126/148‑1 (MQ=255) gCACCTTCTGGACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTgg < 7:252252/148‑1 (MQ=255) cACCTTCTTGACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTa < 4:279967/149‑1 (MQ=255) cACCTTCTGGACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGa < 4:367514/140‑1 (MQ=255) cACCTTCTGGACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGa > 3:367514/1‑140 (MQ=255) cACCTTCTGGACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGt < 2:32577/148‑1 (MQ=255) aCCTTCTGGACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTgg > 2:228105/1‑146 (MQ=255) aCCTTCTGGACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTgg > 8:143654/1‑146 (MQ=255) aCCTTCTGGACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTgg > 8:241255/1‑146 (MQ=255) cTTCTGGACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGa > 1:329572/1‑148 (MQ=255) cTGGACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATa < 6:242380/147‑1 (MQ=255) tGGACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTc > 6:163117/1‑149 (MQ=255) ggACGCTCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTc > 7:82979/1‑148 (MQ=255) gACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTc < 1:128713/147‑1 (MQ=255) gACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCAAAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCg > 6:329160/1‑148 (MQ=255) aCGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGaa < 6:153502/149‑1 (MQ=255) aCGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGaa < 4:7086/149‑1 (MQ=255) gATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATg > 6:345416/1‑149 (MQ=255) cAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATg < 7:241255/143‑1 (MQ=255) cAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTaa < 1:228105/146‑1 (MQ=255) gagcgagcTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTaa < 5:230896/143‑1 (MQ=255) gagcgagcTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTaa > 6:230896/1‑143 (MQ=255) gagcgagcTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGcaac > 8:211718/1‑148 (MQ=255) gcgagcTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCaacaac < 5:329160/149‑1 (MQ=255) gcTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGttt < 7:143654/149‑1 (MQ=255) gcTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGttt < 1:365108/149‑1 (MQ=255) ttGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGt > 1:107636/1‑149 (MQ=255) cGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCatga < 6:316801/149‑1 (MQ=255) cGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCatga < 8:247046/149‑1 (MQ=255) ccACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCatgatgat < 6:205329/148‑1 (MQ=255) cacaTAAACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGATTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTCGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATAATCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCatgatgatg > 3:342907/1‑148 (MQ=255) acaTCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGc < 7:63397/125‑1 (MQ=255) acaTCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGc > 8:63397/1‑125 (MQ=255) caTCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGa > 7:314372/1‑109 (MQ=255) caTCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGa < 8:314372/109‑1 (MQ=255) cacaAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGt < 2:329572/148‑1 (MQ=255) tCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTAGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCATGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGGTTGTCAGGATGATGGCTCGTCTGTGAAt > 4:220174/1‑149 (MQ=255) aCCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTTACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGa < 5:300358/149‑1 (MQ=255) aCCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGa < 4:27477/149‑1 (MQ=255) aCCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGa < 6:99630/149‑1 (MQ=255) aaCGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGACTGTGTATGAGGc > 3:136381/1‑149 (MQ=255) gACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCaa > 1:93272/1‑149 (MQ=255) ccAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTAt < 7:211718/148‑1 (MQ=255) gTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGc < 8:82979/149‑1 (MQ=255) gCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCAt > 6:256867/1‑148 (MQ=255) cTTGGGCCTCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGa < 3:332506/149‑1 (MQ=255) cTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCAt > 4:9533/1‑147 (MQ=255) cTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGa < 5:50579/149‑1 (MQ=255) cTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGa < 5:256867/149‑1 (MQ=255) cTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGa < 2:93272/149‑1 (MQ=255) cTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGa < 3:9533/149‑1 (MQ=255) gCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTAtt > 2:98770/1‑149 (MQ=255) cGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTATGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTg > 5:49877/1‑149 (MQ=255) aCGATGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTTTGAGGCCAAATTATCAACTGCCATGAGTATTTGTc > 2:20123/1‑148 (MQ=255) gTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGACTGTGTATGAGGCCAAt < 1:157494/121‑1 (MQ=255) gTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGACTGTGTATGAGGCCAAt > 2:157494/1‑121 (MQ=255) ttGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAAtt > 5:163581/1‑149 (MQ=255) gCTGGGCTTCCAGACCTATGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATTATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATTAGTATTTGTCAATTTGGCAGActttcgt < 4:342907/149‑1 (MQ=255) cTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTATGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAATTGGGCAGAcgttcgtt < 6:49877/149‑1 (MQ=255) gCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAATTGGGCAGACGTTCGTTAGt < 5:163117/148‑1 (MQ=255) ttCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATTAGTATTTGTCAATTGGGCAGACGTTCGTTAGTGc > 7:54177/1‑148 (MQ=255) ttCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAATTGGGCAGACGTTCGTTAGTGc > 7:55923/1‑148 (MQ=255) gttcTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTTTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAATTGGGCAGACGTTCGTTAGTGCAAATgg < 5:91087/146‑1 (MQ=255) ggCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTAAATTGGGCAGAAGTTCGTTAGTGCAAATgg > 6:91087/1‑143 (MQ=255) caagagTCAAGGTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAATTGGGCAGACGTTCGTTAGTGCAAATGGaaa < 8:1262/142‑1 (MQ=255) caagagTCAAGGTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAATTGGGCAGACGTTCGTTAGTGCAAATGGaaa > 7:1262/3‑144 (MQ=255) caagagTCAAGGTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAATTGGGCAGACGTTCGTTAGTGCAAATGGAAATTCTa > 3:55753/3‑149 (MQ=255) cAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAATTGGGCAGACGTTCGTTAGTGCAAATGGAAATTCTAg < 7:35113/149‑1 (MQ=255) agTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAATTGGGCAGACGTTCGTTa > 5:223357/1‑127 (MQ=255) agTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAATTGGGCAGACGTTCGTTa < 6:223357/127‑1 (MQ=255) cTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAATTGGGCAGACATTCGTTAGTGCAAATGGAAATTCTAGATTTCCCa > 3:363402/1‑148 (MQ=255) ttGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAATTGGGCAGACGTTCGTTAGTGCAAATGGAAATTCTAGATTTCCCaaa > 4:176192/1‑149 (MQ=255) ttGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTAGTCAATTGGGCAGACGATCGTTAGTGCATATGGAAATTCTAGATTTGCCaaa > 4:53801/1‑149 (MQ=255) | TCAGAGCTTTTGCACCTTCTGGACGATCTTCAAGAGCGAGCTTGCCCGATACCACATCCACAAATTCACCAACGACATTCCAGTCGTTCGCTTGGGCCGCACGTTGGATGTAATCACGCTGGGCTTCCAGACCTAGGCCAGAGTCACCTTGACTCTTGGTAGATACTCGAATGTAAGCAACAACGTTTGTCATGATGATGGCTCGTCTGTGTATGAGGCCAATTTATCAACTGCCATGAGTATTTGTCAATTGGGCAGACGTTCGTTAGTGCAAATGGAAATTCTAGATTTCCCAAA > NC_002947/1277177‑1277473 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |