| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,312,319 | T→A | 5.8% | N780Y (AAC→TAC) | rapA ← | RNA polymerase‑associated protein RapA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,312,319 | 0 | T | A | 5.8% | 212.0 / 2.2 | 69 | N780Y (AAC→TAC) | rapA | RNA polymerase‑associated protein RapA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (33/32); new base A (2/2); total (35/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.56e-01 | |||||||||||
GTCGAGCAGGCAGCGCAGTGCCGCTGGCGGCAGGTAGCGGCCCAGTTGCAGGCTACGGGGTGCCACCACCTCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCGGGTGCTCCCAGGTGAGGAATTGCATGTCCTCGCGTGACAGCGCCTGGCCACGGTCGTAGGTGATGGTCACGCCTTCATCGTCGCCCAGCGGGAAGCTG > NC_002947/1312173‑1312464 | ttCGAGCAGGCAGCGCAGTGCCGCTGGCGGCAGGTAGCGGCCCAGATTCAGGCTACGCGGTGCCACCACCTCGCTCACGAACAGCAGATCAAGCAGGACAGTGCCTCGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATAAACGCCACTGCGCTGTTGc > 2:341540/2‑149 (MQ=255) gcaggcagCGCAGTGCCGCTGGCGGCAGGTAGCGGCCCAGTTGCAGGCTACGGGGTGCCACCACCTCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATc > 1:364813/1‑149 (MQ=255) aggcagCGCAGTGCCGCTGGCGGCAGGTAGCGGCCCAGTTGCAGGCTACGGGGTGCCACCACCTCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATc > 3:38216/1‑147 (MQ=255) gcagCGCAGTGCCGCTGGCGGCAGGTAGCGGCCCAGTTGCAGGCTACGGGGTGCCACCACCTCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGc < 7:43981/149‑1 (MQ=255) gcagCGCAGTGCCGCTGGCGGCAGGTAGCGGCCCAGTTGCAGGCTACGGGGTGCCACCACCTCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGc > 3:58267/1‑149 (MQ=255) cagCGCAGTGCCGCTGGCGGCAGGTAGCGGCCCAGTTGCAGGCTACGGGGTGCCACCACCTCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGcc < 3:70295/149‑1 (MQ=255) agCGCAGTGCCGCTGGCGGCAGGTAGCGGCCCAGTTGCAGGCTACGGGGTGCCACCACCTCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCt < 4:38216/149‑1 (MQ=255) cgcAGTGCCGCTGGCGGCAGGTAGCGGCCCAGTTGCAGGCTACGGGGTGCCACCACCTCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGa < 8:63797/149‑1 (MQ=255) tacctGCCGCCAGCGGCAGGTAGCGGCCCAGATGCAGGCTACGGGGTGCCCCCACCTCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGCCAGAGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GGTCTTGCTCAACCCCACGGCGGAGTTGCCCATCGAGCGTGa > 8:145025/5‑148 (MQ=255) tacctGCCGCCAGCGGCAGGTAGAGGCCCAGTTGCAGGCTACGGGGTGCCACCACCTAGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGAGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGa > 4:348317/5‑148 (MQ=255) aGTGCCGCTGGCGGCAGGTAGCGGCCCAGTTGCAGGCTACGGGGTGCCACCACCTCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAg > 1:182989/1‑149 (MQ=255) aGTGCCGCTGGCGGCAGGTAGCGGCCCAGTTGCAGGCTACGGGGTGCCACCACCTCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAg < 2:85269/149‑1 (MQ=255) ccgccagcggcAGGTAGCGGCCCAGTTGCAGGCTACGGGGTGCCACCACCTCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTGTAAAGTTCTAGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCAGATCGAGCGTGACAGc > 1:307792/7‑149 (MQ=255) ccGCTGGCGGCAGGTAGCGGCCCAGTTGCAGGCTACGGGGTGCCACCACCTCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCAcc < 1:313121/149‑1 (MQ=255) ccGCTGGCGGCAGGTAGCGGCCCAGTTGCAGGCTACGGGGTGCCACCACCTCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCAcc < 5:2231/149‑1 (MQ=255) gCTGGCGGCAGGTAGCGGCCCAGTTGCAGGCTACGGGGTGCCACCACCTCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCAc > 4:250982/1‑146 (MQ=255) cTGGCGGCAGGTAGCGGCCCAGTTGCAGGCTACGGGGTGCCACAACCTCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCAc > 1:336622/1‑145 (MQ=255) gcggcAGGTAGCGGCCCAGTTGCAGGCTACGGGGTGCCACCACCTCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATc > 5:175301/1‑148 (MQ=255) ggcAGGTAGCGGCCCAGTTGCAGGCTACGGGGTGCCACCACCTCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGAc < 3:10818/135‑1 (MQ=255) ggcAGGTAGCGGCCCAGTTGCAGGCTACGGGGTGCCACCACCTCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGAc > 4:10818/1‑135 (MQ=255) cAGGTAGCGGCCCAGTTGCAGGCTACGGGGTGCCACCACCTCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATgc < 2:182989/149‑1 (MQ=255) tAGCGGCCCAGTTGCAGGCTACGGGGTGCCACCACCTCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATgccg‑cc < 4:58267/149‑1 (MQ=255) ggCCCAGTTGCAGGCTACGGGGTGCCACCACCTCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGt < 2:137357/149‑1 (MQ=255) gCCCAGTTGCAGGCTACGGGGTGCCACCACCTCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTa > 8:26530/1‑149 (MQ=255) gCCCAGTTGCAGGCTACGGGGTGCCACCACCTCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTa > 3:115715/1‑149 (MQ=255) ccAGTTGCAGGCTACGGGGTGCCACCACCTCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTAcc < 3:250982/149‑1 (MQ=255) ccAGTTGCAGGCTACGGGGTGCCACCACCTCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTAc > 2:171968/1‑148 (MQ=255) gCAGGCTACGGGGTGCCACCACCTCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTAGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCggg > 3:337881/1‑149 (MQ=255) gCAGGCTACGGGGTGCCACCACCTCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTAGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCggg > 7:16406/1‑149 (MQ=255) gaGGCTACGGGGTGCCACCACCTCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGTCAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATGAACGCCACGTCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCggg < 7:145025/147‑1 (MQ=255) cAGGCTACGGGGTGCCACCACCTCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCggg < 4:115715/148‑1 (MQ=255) tACGGGGTGCCACCACCTCGCTGACGAACATCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCATA‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCACATAGAGCCTTACAGCACCAGATACATGCCG‑CCCTGTACCATCGGGTGATc > 4:220656/1‑148 (MQ=255) cGGGGTGCCACCACCTCGCTGAAGAACAGCTGTTCAAGCAGGACAGTGCCTTGTTTGTGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATGAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGGTCCATGCCG‑CCGTGTACCATCGGGTGCTCCCa < 1:341540/149‑1 (MQ=255) tGCCACCACCTCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCGGGTGCTCCCAGGTGa < 1:47778/149‑1 (MQ=255) gCCACCACCTCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCGGGTGCTCCCAGGTGAg > 7:196780/1‑149 (MQ=255) caccacCTCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCGGGTGCTCCCAGGTGAgg > 3:268533/1‑148 (MQ=255) accaccTCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCGGGTGCTCCCAGGTGAGGaa > 7:181242/1‑149 (MQ=255) caccTCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCGGGTGCTCCCAGGTGAGGAAtt > 6:176029/1‑149 (MQ=255) caccTCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCGGGTGCTCCCAGGTGAGGAAtt < 6:175301/149‑1 (MQ=255) accTCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCGGGTGCTCCCAGGTGAGGAATTg < 7:26530/149‑1 (MQ=255) ctcccggACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGCGCCTGGTCTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCCTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCGGGTGCTCCCACGTGAGGAATTGCa < 6:189553/143‑1 (MQ=255) tCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCGGGTGCTCCCAGGTGAGGAATTGCAt > 4:54063/1‑149 (MQ=255) gCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCGGGTGCTCCCAGGTGAGGAATTGCAt < 3:167647/147‑1 (MQ=255) cGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCGGGTGCTCCCAGGTGAGGAATTGCATGTCCTc < 4:304157/148‑1 (MQ=255) gAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GATCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCGGGTGCTCCCAGGTGAGGAATTGCATGTCCTcgc < 2:307792/149‑1 (MQ=255) agcagTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCgg < 6:276024/113‑1 (MQ=255) agcagTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCgg > 5:276024/1‑113 (MQ=255) agcagTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCGGGTGCTCCCAGGTGAGGACATGCAATTCCTcacctgg < 1:171968/149‑7 (MQ=255) agcagTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCGGGTGCTCCCAGGTGAGGAATTGCATGTCCTCGCGTGa > 8:330818/1‑149 (MQ=255) gTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCGGGTGCTCCCAGGTGAGGAATTGCATGTCCTCGCGTGACAgc > 3:43697/1‑149 (MQ=255) aaGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCGGGTGCTCCCAGGTGAGGAATTGCATGTCCTCGCGTGACAGCGCCt < 3:54063/149‑1 (MQ=255) gCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTAGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCGGGTGCTCCCAGTTGAGGAATTGCATGTCCTCGCGTGACAGCGCCTgg < 4:337881/149‑1 (MQ=255) gCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTAGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCGGGTGCTCCCAGGTGAGGAATTGCATGTCCTCGCGTGACAGCGCCTgg < 8:16406/149‑1 (MQ=255) ggACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCGGGTGCTCCCAGGTGAGGAATTGCATGTCCTCGCGTGACAGCGCCTGGCCa > 5:77211/1‑149 (MQ=255) gACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCGGGTGCTCCCAGGTGAGGAATTGCATGTCCTCGCGTGACAGCGCCTGGCCAc > 5:226413/1‑149 (MQ=255) gTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCGGGTGCTCCCAGGTGAGGAATTGCATGTCCTCGCGTGACAGCGCCTGGCCACGGTc < 8:196780/149‑1 (MQ=255) cTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACGAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCGGGTGCTCCCAGGTGAGGAATTGCATGTCCTCGCGTGACAGCGCCTGGCCACGGTCGTAg < 5:311843/149‑1 (MQ=255) tGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCGGGTGCTCCCAGGTGAGGAATTGc > 4:295198/1‑112 (MQ=255) tGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCGGGTGCTCCCAGGTGAGGAATTGc < 3:295198/112‑1 (MQ=255) gTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCGGGTGCTCCCAGGTGAGGAATTGCATGTCCTCGCGTGACAGCGCCTGGCCACGGTCGTAGGt > 4:105733/1‑148 (MQ=255) gcgcTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCGGGTGCTCCCAGGTGAGGAATTGCATGTCCTCGCGTGACAGCGCCTGGCCACGGTCGTAGGTGATGGTc < 6:226413/149‑1 (MQ=255) gATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCGCCCCTGAACCATCGGGTGCTCCCAGGAGAGCAATTGCATGTCCACGCGTGACAGCGCCTCCCCACGGTCGTAGGTGATGTTCAGGCATTAAtc > 1:280969/1‑148 (MQ=255) gATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCGGGTGCTCCCAGGTGAGGAATTGCATGTCCTCGCGTGACAGCGCCTGGCCACGGTCGTAGGTGATGGTCACGCCTTCAtcg > 6:165936/1‑148 (MQ=255) aTCAACGCCACGACGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCGGGTGCTCCCAGGTGAGGAATTGCATGTCCTCGCGTGACAGCGCCTGGCCACGGTCGTAGGTGATGGTCACGCCTTCAtcgtc > 5:120226/1‑149 (MQ=255) tCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCGGGTGCTCCCAGGTGAGGAATTGCATGTCCTCGCGTGACAGCGCCTGGCCACGGTCGTAGGTGATGGTCACGCCTTCAtcgtcg < 8:181242/149‑1 (MQ=255) cAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCGGGTGCTCCCAGGTGAGGAATTGCATGTCCTCGCGTGACAGCGCCTGGCCACGGTCGTAGGTGATGGTCACGCCTTCATCGTCGc > 3:164243/1‑149 (MQ=255) gCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCTG‑CCCTGTACCATCGGGTGCTCCCAGGTGAGGAATTGCATGTCCTCGCGTGACAGCGCCTGGCCACGGTCGTAGGTGATGGTCACGCCTTCATCGTCGCCCAg > 3:74592/1‑149 (MQ=255) cggcggTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCGGGTGCTCCCAGGTGAGGAATTGCATGTCCTCGCGTGACAGCGCCTGGCCACGGTCGTAGGTGATGGTCACGCCTTCATCGTCGCCCAGCggg < 5:136488/149‑1 (MQ=255) tgtTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCGGGTGCTCCCAGGTGAGGAATTGCATGTCCTCGCGTGACAGCGCCTGGCCACGGTCGTAGGTGATGGTCACGCCTTCATCGTCGCCCAGCGGGAAGCTg < 3:105733/149‑1 (MQ=255) | GTCGAGCAGGCAGCGCAGTGCCGCTGGCGGCAGGTAGCGGCCCAGTTGCAGGCTACGGGGTGCCACCACCTCGCTGACGAACAGCAGTTCAAGCAGGACAGTGCCTGGTTTGAGCGCTTT‑‑‑GTTCTTGATCAACGCCACGGCGGTGTTGCCCATCGAGCCTGACAGCACCAGATCCATGCCG‑CCCTGTACCATCGGGTGCTCCCAGGTGAGGAATTGCATGTCCTCGCGTGACAGCGCCTGGCCACGGTCGTAGGTGATGGTCACGCCTTCATCGTCGCCCAGCGGGAAGCTG > NC_002947/1312173‑1312464 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |