| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,327,121 | C→T | 48.5% | intergenic (+97/‑196) | PP_16SE → / → PP_23SE | 16S ribosomal RNA/23S ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,327,121 | 0 | C | T | 48.5% | 47.1 / 133.7 | 99 | intergenic (+97/‑196) | PP_16SE/PP_23SE | 16S ribosomal RNA/23S ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (28/23); new base T (27/21); total (55/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.56e-01 | |||||||||||
AGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTAATCGACGACATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GCATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGACTGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGT > NC_002947/1326975‑1327227 | aGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTAATCGACGACATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GCAt < 7:267652/149‑1 (MQ=32) gTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTAATCGACGACATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GTATc > 3:153585/1‑149 (MQ=17) tCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTAATCGACGACATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GCATc > 4:336492/1‑148 (MQ=32) gTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTAATCGACGACATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GCATCGAATGTTGAtt > 6:372784/1‑149 (MQ=32) tAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTAATCGACGACATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GTATCGAATGTTGAttt > 8:215520/1‑149 (MQ=17) gCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTAATCGACGACATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GTATCGAATGTTGATTTCt < 7:215520/149‑1 (MQ=17) ccGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTAATCGACGACATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GTATCGAATGTTGATTTCTg < 7:34550/149‑1 (MQ=17) cGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTAATCGACGACATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GCATCGAATGTTGATTTCTgg > 7:299259/1‑149 (MQ=32) gTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTAATCGACGACATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GTATCGAATGTTGATTTCTGGc > 6:272289/1‑149 (MQ=17) gTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTAATCGACGACATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GTATCGAATGTTGATTTCTGGc > 4:303510/1‑149 (MQ=17) gTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTAATCGACGACATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GCATCGAATGTTGATTTCTGGc > 4:340290/1‑149 (MQ=32) ggggAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTAATCGACGACATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GCATCGAATGTTGATTTCTGGCttt > 7:8248/1‑149 (MQ=17) gggAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTAATCGACGACATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GTATCGAATGTTGATTTCTGGCtttt < 5:124162/149‑1 (MQ=17) gAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTAATCGACGACATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GCATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTg > 3:97598/1‑148 (MQ=32) gAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTAATCGACGACATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GCATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGt < 6:186942/149‑1 (MQ=32) aaCCTGCGGCTGGATCACCTCCTTAATCGACGACATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GTATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGt > 4:53498/1‑148 (MQ=17) aaCCTGCGGCTGGATCACCTCCTTAATCGACGACATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GCATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTc < 3:175784/149‑1 (MQ=32) cccTACGGCTGGATCACCTCCTTAATCGACGACATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GCATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTc < 8:99865/147‑1 (MQ=17) aCCTGCGGCTGGATCACCTCCTTAATCGACGACATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GCATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCa < 3:340290/149‑1 (MQ=32) ggCTGGATCACCTCCTTAATCGACGACATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GCATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGt > 8:81622/1‑149 (MQ=32) tGGATCACCTCCTTAATCGACGACATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GCATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCt < 3:336492/149‑1 (MQ=32) tCACCTCCTTAATCGACGACATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GTATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTaa < 5:272289/149‑1 (MQ=17) tCACCTCCTTAATCGACGACATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GTATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTaa < 3:53498/149‑1 (MQ=17) ctcctTAATCGACGACATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GCATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAAt > 5:252078/1‑149 (MQ=32) ctcctTAATCGACGACATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GCATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAAt > 2:165770/1‑149 (MQ=32) ctcctTAATCGACGACATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GCATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAAt > 2:160250/1‑149 (MQ=32) ctTAATCGACGACATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GCATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTc < 5:372784/148‑1 (MQ=32) ttAATCGACGACATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GTATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCg > 5:5605/1‑148 (MQ=17) ttAATCGACGACATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GTATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCg > 3:170960/1‑148 (MQ=17) tAATCGACGACATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GTATCGAATGTTGATTTCTg > 7:302688/1‑117 (MQ=17) tAATCGACGACATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GTATCGAATGTTGATTTCTg < 8:302688/117‑1 (MQ=17) aaTCGACGACATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GTATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCgg < 1:212515/147‑1 (MQ=17) aaTCGACGACATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GTATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGa < 6:1038/148‑1 (MQ=17) tCGACGACATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GCATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGatat > 5:137896/1‑149 (MQ=32) gacgacATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GTATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATAtgt > 5:346928/1‑149 (MQ=17) gacgacATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GTATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATAtgt < 8:169668/149‑1 (MQ=17) gacgacATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GTATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATAtgt < 3:302115/149‑1 (MQ=17) gacgacATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GTATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATAtg < 6:5605/148‑1 (MQ=17) gacgacATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GCATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATAtgt > 4:109674/1‑149 (MQ=32) acgacATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GCATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATAtgtg < 3:170771/149‑1 (MQ=32) gctcATCAGCAGGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GCATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTga > 6:10323/4‑149 (MQ=12) cgacATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GTATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTga < 5:369637/149‑1 (MQ=17) gacATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GTATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCTGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTga > 7:77316/1‑148 (MQ=17) aTCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GCATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTga > 6:241062/1‑145 (MQ=32) aTCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GCATCAAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTga > 5:16619/1‑145 (MQ=17) gCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GCATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGAtata < 4:97598/149‑1 (MQ=32) ccTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GTATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTgatagata > 4:12848/1‑146 (MQ=17) tgctgATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GTATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGAc > 7:100475/1‑149 (MQ=17) gctgATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GCATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTc < 7:159320/127‑1 (MQ=32) gctgATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GCATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTc > 8:159320/1‑127 (MQ=32) tgatgaGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GCATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTga > 6:376030/1‑135 (MQ=32) 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aTTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GCATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGACTGAACACCAGTTTCa > 8:237363/1‑143 (MQ=32) aTTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GCATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGACTGAACACCAGTTTCActgctg > 1:259919/1‑149 (MQ=32) aTTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GCATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGACTGAACACCAGTTTCActgctg < 6:252078/149‑1 (MQ=32) aTTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GCATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGACTGAACACCAGTTTCActgctg < 8:8248/149‑1 (MQ=32) ttGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GTATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGACTGAACACAAGTTTCACTGCtgg > 8:212769/1‑149 (MQ=17) ttGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GCATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGACTGAACACCAGTTTCACTGCtgg < 8:73740/149‑1 (MQ=32) gCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GTATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGACTGAACACCAGTTTCACTGCtggtg > 6:18113/1‑149 (MQ=17) ttGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTCGGCATCGAATGTTGATTTCTGGATTTTGTCAGATCGTTATTTAAAAATTCGGATTTGTGATAGATATAGACTGAACACCAGTTTCAATGCtgttg > 1:97087/1‑148 (MQ=11) ttGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GTATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGACTGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGa > 3:329900/1‑149 (MQ=17) ttGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GTATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGACTGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGa > 1:60326/1‑149 (MQ=17) gATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GTATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGACTGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGAt < 8:25200/148‑1 (MQ=17) cATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GTATCGAATGTTGATTTCTGGCTGTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTAGGATATGTGATAGATATAGACTGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGAGCATGc > 8:76038/1‑149 (MQ=11) cATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GCATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGACTGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAgg < 5:10323/148‑1 (MQ=32) aTTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GTATCGAATGTTGATTTATGGCATTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGACTGAACACAAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGc > 2:329647/1‑148 (MQ=255) ttGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GCATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGACTGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCt > 7:253820/1‑148 (MQ=32) gTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GTATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGACTGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTaa < 3:303510/148‑1 (MQ=17) tCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GTATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGACTGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAgg < 6:346928/149‑1 (MQ=17) tCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GTATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGACTGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAg < 2:60326/148‑1 (MQ=17) tCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GCATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGACTGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAgg < 7:116173/149‑1 (MQ=32) gAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GTATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGACTGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGt > 7:305915/1‑148 (MQ=11) gAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GTATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGACTGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGt > 6:62613/1‑148 (MQ=11) | AGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTAATCGACGACATCAGCCTGCTGATGAGCTCCCACACGAATTGCTTGATTCATTGTCGAAGACGTTTTTCCTGGTCAGAACCTGGAAATGAGCATTC‑GCATCGAATGTTGATTTCTGGCTTTTGTCAGATCGTTCTTTAAAAATTCGGATATGTGATAGATATAGACTGAACACCAGTTTCACTGCTGGTGGATCAGGCTAAGGT > NC_002947/1326975‑1327227 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |