| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,470,045 | C→G | 5.2% | C33S (TGT→TCT) | algK ← | alginate biosynthesis protein AlgK |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,470,045 | 0 | C | G | 5.2% | 248.0 / 3.0 | 76 | C33S (TGT→TCT) | algK | alginate biosynthesis protein AlgK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (36/36); new base G (2/2); total (38/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.64e-01 | |||||||||||
GGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAGGCCACGGGCCACGGCTTTGTCGATCAGCCAGTTCAGCGATGGGCCGCGGTC > NC_002947/1469902‑1470188 | gcgTGGCCACCTTGATGTCCGCAAAGCCGAATTGCGCTTCGCTGTAGCACACGACGCCCAGCGACTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGACGTGTCACCGCGCTTCAGCGCCACGATCGCCACGGGCTAGTAGGGCAGGCCGGCACAGCCg > 2:338110/3‑149 (MQ=255) ccACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAgg < 3:359845/149‑1 (MQ=255) cACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGTGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAggg > 8:311972/1‑149 (MQ=255) cACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCTGTGCCGGcct < 5:371556/146‑2 (MQ=255) cACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCTGTGCCGGcct > 6:371556/1‑145 (MQ=255) cACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAggg < 8:98631/149‑1 (MQ=255) aCCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGt < 6:84818/149‑1 (MQ=255) ccTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGt > 3:355534/1‑148 (MQ=255) cTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGa > 2:158223/1‑149 (MQ=255) cTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGa > 2:124583/1‑149 (MQ=255) aTGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATggc > 7:60109/1‑149 (MQ=255) aTGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGGTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATggc < 4:101818/149‑1 (MQ=255) cGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATggcggcgg > 8:32456/1‑149 (MQ=255) gCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATggcggcggc > 5:153528/1‑149 (MQ=255) cAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATggcggcggc > 2:342249/1‑147 (MQ=255) ggCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGt > 7:259867/1‑149 (MQ=255) ccGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGc < 7:38702/149‑1 (MQ=255) aCTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCTGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGcaca < 1:229724/149‑1 (MQ=255) aCTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGcaca > 7:251885/1‑149 (MQ=255) cgcTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAAc < 3:180487/148‑1 (MQ=255) gcTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAgg > 1:29626/1‑120 (MQ=255) gcTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAgg < 2:29626/120‑1 (MQ=255) cGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCa < 1:298066/147‑1 (MQ=255) gCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAgg < 1:46271/148‑1 (MQ=255) cTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCACTCGACCTATACCGTGTCACCGCGCTTCAGAGCCAAGTTGGCCAGGCGCTGGTAGGGCAGGCCGGCACAGCCGGACAGGGTGAAGGCGCCGGCCAGTGCAAACACCCCCAGGta > 8:233015/1‑148 (MQ=255) gTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCa > 6:249919/1‑149 (MQ=255) gCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCAcgc < 7:32456/149‑1 (MQ=255) cccAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCAcgcg < 1:342249/149‑1 (MQ=255) cAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGa < 1:124583/149‑1 (MQ=255) gCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTg > 8:69174/1‑147 (MQ=255) gCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTa < 8:251885/149‑1 (MQ=255) cgaGCGGCTTGTTGTTGCGGTCGGGCATTGCCGTGTCTCCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTTGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGTTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAg < 7:311972/147‑1 (MQ=255) ccTTGTTGTTGCGCTGGGCCTATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCa < 7:233015/149‑1 (MQ=255) ccTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTAt > 7:345264/1‑147 (MQ=255) cTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTAt > 3:78038/1‑146 (MQ=255) gctcTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCAtt < 8:80220/145‑1 (MQ=255) gcgcTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCAtt < 5:249919/148‑1 (MQ=255) gcgcTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCAtt < 8:60109/148‑1 (MQ=255) gcgcTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTg > 1:241071/1‑149 (MQ=255) cgcTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTgt < 8:345264/149‑1 (MQ=255) gcTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAAcc < 4:249449/108‑1 (MQ=255) gcTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAAcc > 3:249449/1‑108 (MQ=255) gcTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTAGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTgtc > 4:347986/1‑149 (MQ=255) ggCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGa < 2:242648/119‑1 (MQ=255) ggCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGa > 1:242648/1‑119 (MQ=255) ggCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGAcc > 7:189043/1‑121 (MQ=255) ggCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGAcc < 8:189043/121‑1 (MQ=255) ggCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTgtccgtc < 4:78038/149‑1 (MQ=255) gCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCAcgcg < 4:251516/110‑1 (MQ=255) gCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCAcgcg > 3:251516/1‑110 (MQ=255) gCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTca > 3:309413/1‑147 (MQ=255) ccGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTcaca < 7:69174/148‑1 (MQ=255) ccGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAg < 2:241071/149‑1 (MQ=255) ccGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGACCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAg < 4:338159/149‑1 (MQ=255) aCCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAggccacgg > 1:265444/1‑149 (MQ=255) aCCGCGCTTCAGGGCATCGTTGGCCAGGCTCTGTTGGGGCAGGCCTGCACAGCCGGCCAGTGTGATGGCGGCTGCCAGTGCACCCAACCGCAGTTTCACGCGGACATTGTATGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAggcaacgg < 1:338110/149‑1 (MQ=255) ccGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAggccacggg > 2:161402/1‑149 (MQ=255) cTTCAGGGCCTCGTAGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAggccacgggccacg < 3:347986/149‑1 (MQ=255) ttCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAGgccacgggccacgg > 8:169676/1‑149 (MQ=255) cAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACCCACCCCCAGGTGCACGCGGCCGTGGTAGGTAGCAGAGAGCATGTGCCGGCCGGCACAGGCCCCGGGCCCCGGcg > 8:114682/1‑148 (MQ=255) tCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAGGCCACGGGCCACGGCTTTGTCGa > 7:330105/1‑149 (MQ=255) ttGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAGGCCACGGGCCACGGCTTTGTCGATCa < 1:158223/149‑1 (MQ=255) ttGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAGGCCACGGGCCACGGCTTTGTCGATCa < 6:153528/149‑1 (MQ=255) gCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAGGCCCCGGGCCACGGCTGTGGCGAtgcgc > 8:343864/1‑144 (MQ=255) gCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAGGCCACGGGCCACGGCTTTGTCGATCAGc < 2:265444/148‑1 (MQ=255) ccAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAGGCCACGGGCCACGGCTTTGTCGATCAGc > 6:27617/1‑147 (MQ=255) aGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAAcccc > 7:33454/1‑66 (MQ=255) aGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAAcccc < 8:33454/66‑1 (MQ=255) ggCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAGGCCACGGGCCACGGCTTTGTCGATCAGCCAGtt < 1:161402/149‑1 (MQ=255) gcgcTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTGACAGGCCACGGGCCACGGCTTTGTCGATCAGCCAGtt > 7:91640/1‑148 (MQ=255) gCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTcac < 2:37237/102‑1 (MQ=255) gCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTcac > 1:37237/1‑102 (MQ=255) tggCCGGCTGTGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAGGCCACGGGCCACGGCTTTg > 4:4/2‑121 (MQ=255) tggCCGGCTGTGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAGGCCACGGGCCACGGCTTTg < 3:4/120‑1 (MQ=255) gCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAGGCCACGGGCCACGGCTTTGTCGATCAGCCAGTTCAGCGATGGGCCGCgg > 8:269972/1‑149 (MQ=255) cGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAGGCCACGGGCCACGGCTTTGTCGATCAGCCAGTTCAGCGATGGGCCGCGGTc > 2:251522/1‑149 (MQ=255) | GGGTGGCCACCTTGATGTCCGCCAGGCCGACTTGCGCTTCGCTGTAGCCCAGGTCGGCCAGCGCCTTGTAGTTGCGCTCGGCCAATGCCGTGTCACCGCGCTTCAGGGCCTCGTTGGCCAGGCGCTGGTCGGGCAGGCCGGCACAGCCGGCCAGGGTGATGGCGGCGGCCAGTGCACACAACCCCAGGTTCACGCGGACCTTGTAGGTATCAGAGATCATTGTCCGTCCCTCACAGGCCACGGGCCACGGCTTTGTCGATCAGCCAGTTCAGCGATGGGCCGCGGTC > NC_002947/1469902‑1470188 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |