| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,618,414 | C→A | 5.9% | S162I (AGC→ATC) | PP_1418 ← | tricarboxylate transport protein TctC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,618,414 | 0 | C | A | 5.9% | 217.1 / 3.5 | 68 | S162I (AGC→ATC) | PP_1418 | tricarboxylate transport protein TctC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (30/34); new base A (2/2); total (32/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.45e-01 | |||||||||||
GGAAATGTCGGTAGAGCCGACCTGGATGTGGCCGCCCAGCAATGCCGTGGCGATTTCGCCGCCGCCCTCCAGGGCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGACCAGGTCATCAAGGGTCTTGTAGGGCGAGTCGCTCTTCACTGCGATGGCACCGTAGCTGGTGCCGACGGCAGCCAGCCATTTCACCGC > NC_002947/1618269‑1618562 | ggAAATGTCGGTAGAGCCGACCTGGATGTGGCCGCCCAGCAATGCCGTGGCGATTTCGCCGCCGCCCTCCAGGGCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGc > 5:231717/1‑149 (MQ=255)ggAAATGTCGGTAGAGCCGACCTGGATGTGGCCGCCCAGCAATGCCGTGGCGATTTCGCCGCCGCCCTCCAGGGCCAAGTAGCGCAGTTCGCGCGGGATG‑ATGCCAGCGGACTTGGCGATCAACGCAGTCTGCTTCCAGTCATGGCTGc > 8:273325/1‑149 (MQ=255) aaaTGTCGGTAGAGCCGACCTGGATGTGGCCGCCCAGCAATGCCGTGGCGATTTCGCCGCCGCCCTCCAGGGCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGcc > 4:312103/1‑148 (MQ=255) tGTCGGTAGAGCCGACCTGGATGTGGCCGCCCAGCAATGCCGTGGCGATTTCGCCGCCGCCCTCCAGGGCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCAGCCAGGACTGGATGCAGAct < 2:138453/149‑2 (MQ=255) cGGTTGAGCCGACCTGGATGTAGCCGCCCAGCAATGGCGTGGCGATTTCGCCGCCGCCCTCCAGGGCCACGTAGCGCATGTCGCGCGGGTTGCATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACgg < 1:286555/148‑1 (MQ=255) ccGACCTGGATGTGGCCGCCCAGCAATGCCGTGGCGATTTCGCCGCCGCCCTCCAGGGCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGa < 1:208988/149‑1 (MQ=255) cGACCTGGATGTGGCCGCCCAGCAATGCCGTGGCGATTTCGCCGCCGCCCTCCAGGGCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGTCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCgg < 4:10531/147‑1 (MQ=255) aCCTGGATGTGGCCGCCCAGCAATGCCGTGGCGATTTCGCCGCCGCCCTCCAGGGCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAAcc > 1:338282/1‑149 (MQ=255) cTGGATGTGGCCGCCCAGCAATGCCGTGGCGATTTCGCCGCCGCCCTCCAGGGCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCg > 2:170971/1‑148 (MQ=255) gATGTGGCCGCCCAGCAATGCCGTGGCGATTTCGCCGCCGCCCTCCAGGGCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGAt < 1:62348/147‑1 (MQ=255) gATGTGGCCGCCCAGCAATGCCGTGGCGATTTCGCCGCCGCCCTCCAGGGCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATc < 2:303549/148‑1 (MQ=255) gATGTGGCCGCCCAGCAATGCCGTGGCGATTTCGCCGCCGCCCTCCAGGGCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCa > 7:54892/1‑149 (MQ=255) gtgGCCGCCCAGCAATGCCGTGGCGATTTCGCCGCCGCCCTCCAGGGCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGa > 4:363720/1‑149 (MQ=255) ggCCGCCCAGCAATGCCGTGGCGATTTCGCCGCCGCCCTCCAGGGCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGAcc > 2:88950/1‑149 (MQ=255) cgccCAGCAATGCCGTGGCGATTTCGCCGCCGCCCTCCAGGGCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTg < 1:42126/149‑1 (MQ=255) ccAGCAATGCCGTGGCGATTTCGCCGCCGCCCTCCAGGGCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTc < 4:70135/149‑1 (MQ=255) cAGCAATGCCGTGGCGATTTCGCCGCCGCCCTCCAGGGCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGTCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACTGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCg < 7:44467/149‑1 (MQ=255) cAGCAATGCCGTGGCGATTTCGCCGCCGCCCTCCAGGGCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCg > 4:252347/1‑149 (MQ=255) cAGCAATGCCGTGGCGATTTCGCCGCCGCCCTCCAGGGCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCg > 4:20321/1‑149 (MQ=255) aaTGCCGTGGCGATTTCGCCGCCGCCCTCCAGGGCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTAc > 3:55902/1‑118 (MQ=255) aaTGCCGTGGCGATTTCGCCGCCGCCCTCCAGGGCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTAc < 4:55902/118‑1 (MQ=255) gCCGTGGCGATTTCGCCGCCGCCCTCCAGGGCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGtcttt > 4:79142/1‑149 (MQ=255) tGGCGATTTCGCCGCCGCCCTCCAGGGCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTttcttc < 3:312103/149‑1 (MQ=255) tGGCGATTTCGCCGCCGCCCTCCAGGGCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTttcttc < 3:20321/149‑1 (MQ=255) gCGATTTCGCCGCCGCCCTCCAGGGCAACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAg > 1:5688/1‑149 (MQ=255) ttCGCCGCCGCCCTCCAGGGCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTg > 1:364279/1‑149 (MQ=255) ttCGCCGCCGCCCTCCAGGGCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTg > 1:201934/1‑149 (MQ=255) gccgccgccCTCCAGGGCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGa < 5:41971/149‑1 (MQ=255) ccgccgccCTCCAGGGCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGAc > 1:14443/1‑149 (MQ=255) ccgccCTCCAGGGCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGACCAg < 3:363720/149‑1 (MQ=255) cccTCCAGGGCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTGTCTTCAGCGCTGCGACCAGGt > 2:355789/1‑148 (MQ=255) ccTCCAGGGCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGTCCTTGGAGCTAAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCAGACGGTAACGCCGGAACCGATAAAGACCTTGCTACGGTCTTTCTTCAGAGCTGCTACCACGtc > 1:329144/1‑148 (MQ=255) cTCCAGGGCCACGTAGGGAAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGGCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGACCAGGtcat < 7:273325/149‑1 (MQ=255) cTCCAGGGCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGACCAGGtcat < 2:201934/149‑1 (MQ=255) tCCAGGGCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGACCAg > 5:68161/1‑143 (MQ=255) tCCAGGGCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGACCAg < 6:68161/143‑1 (MQ=255) cAGGGCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGACCAGGtcatc < 3:252347/147‑1 (MQ=255) cAGGGCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGACCAGGTCATCaa < 1:170971/149‑1 (MQ=255) gggCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGACCAGGTCATCAAgg < 3:79142/149‑1 (MQ=255) gggCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGACCAGGTCATCAAgg < 1:88950/149‑1 (MQ=255) gggCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGACCAGGTCATCAAgg < 8:36037/149‑1 (MQ=255) tAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGACCAGGTCATCAAGGGTCTTGTa < 1:355789/149‑1 (MQ=255) gcgcAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGACCAGGTCATCAAGGGTCTTGt > 3:100567/1‑146 (MQ=255) gcgcAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGACCAGGTCATCAAGGGTCTTGt < 4:100567/146‑1 (MQ=255) cgcAGGTCGCGGGGGTTG‑ATGCCTGCGGCCTTGGGGATCAAGGATTTGTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGTACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGACCAGGTCATCATGGGTCTTGTAggg < 8:119400/149‑1 (MQ=255) cgcAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGACCAGGTCATCAAGGGTCTTGTAggg < 2:14443/149‑1 (MQ=255) tttaTGCCAGCGGCCTTGGCTATAAACGCAGTCTTAATCCAGTCCTGGCTGCTGACGTTACCGCTGGAACCGATCATGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTTCGACCAGGTCATCAATGGTCTTGTAGGGCGAGTCGCTCTTCAc < 2:329144/146‑1 (MQ=255) g‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGACCAGGTCATCAAGGGTCTTGTAGGGCGAGTCGCTCTTCACt < 8:54892/148‑1 (MQ=255) cAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGACCAGGTCATCAAGGGTCTTGTAGGGCGAGTCGCTCTTCACTGCGATg > 3:96805/1‑149 (MQ=255) ggCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGACCAGGTCATCAAGGGTCTTGTAGGGCGAGTCGCTCTTCACTGCGATGGCAc < 6:334908/149‑1 (MQ=255) gATCAACTCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGACCAGGTCATCAAGGGTCTTGTAGGGCGAGTCGCTCTTCACTGCGATGGCACCGTAGCTgg > 1:104089/1‑149 (MQ=255) gATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGACCAGGTCATCAAGGGTCTTGTAGGGCGAGTCGCTCTTCACTGCGATGGCACCGTAGCTgg > 1:142935/1‑149 (MQ=255) aCGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGACCAGGTCATCAAGGGTCTTGTAGGGCGAGTCGCTCTTCACTGCGATGGCa < 5:321681/134‑1 (MQ=255) aCGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGACCAGGTCATCAAGGGTCTTGTAGGGCGAGTCGCTCTTCACTGCGATGGCa > 6:321681/1‑134 (MQ=255) cGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGACGGAACCGATCACGACCTTGCTAGGGTCTTTCTTCAGCGCTGAGACCAGGTCATCAAGGGTCTTGTAGGGCGAGTCGCTCTTCACTGCGATGGCACAGTAGCTGGTGCCGa > 1:243793/1‑149 (MQ=255) gCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGACCAGGTCATCAAGGGTCTTGTAGGGCGAGTCGCTCTTCACTGCGATGGCAcc > 2:52649/1‑134 (MQ=255) gCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGACCAGGTCATCAAGGGTCTTGTAGGGCGAGTCGCTCTTCACTGCGATGGCAcc < 1:52649/134‑1 (MQ=255) aGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGACCAGGTCATCAAGGGTCTTGTAGGGCGAGTCGCTCTTCACTGCGATGGCACCGTAGCTGGTGCCGACgg < 2:104089/149‑1 (MQ=255) gTCGGCAGCCAGGACTGGATGCAGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGACCAGGTCATCAAGGGTCTTGTAGGGCGAGTCGCTCTTCACTGCGATGGCACCGTAGCTGGTGCCGACgg > 1:63187/1‑148 (MQ=255) tcggCAGCCAGGACTGGATGCAGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGACCAGGTCATCAAgg > 7:32136/4‑92 (MQ=38) tcggCAGCCAGGACTGGATGCAGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGACCAGGTCATCAAgg < 8:32136/89‑1 (MQ=38) tCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGACCAGGTCATCAAGGGTCTTGTAGGGCGAGTCGCTCTTCACTGCGATGGCACCGTAGCTGGTGCCGACGGca < 2:364279/149‑1 (MQ=255) tCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGAGCCCGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGACCAGGTCATCAAGGGTCGTGTAGGGCGAGTCGCTCTTCACTGCGATGGCACCGTAGCTGGTGCCGACGGca < 6:231717/149‑1 (MQ=255) tGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGACCAGGTCATCAAGGGTCTTGTAGGGCGAGTCGCTCTTCACTGCGATGGAACCGTAGCTGGTGCCGACGGcagc > 1:109130/1‑149 (MQ=255) tCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGACCAGGTCATCAAGGGTCTTGTAGGGCGAGTCGCTCTTCACTGCGATGGCACCGTAGCTGGTGCCGACGGcagccagc > 7:93815/1‑149 (MQ=255) aGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGACCAGGTCATCAAGGGTCTTGTAGGGCGAGTCGCTCTTCACTGCGATGGCACCGTAGCTGGTGCCGACGGCAGCCAGCCAt < 2:5688/149‑1 (MQ=255) tCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGACCAGGTCATCAAGGGTCTTGTAGGGCGAGTCGCTCTTCACTGCGATGGCACCGTAGCTGGTGCCGACGGCAGCCAGCCAtt > 8:322580/1‑148 (MQ=255) cTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGACCAGGTCATCAAGGGTCTTGTAGGGCGAGTCGCTCTTCACTGCGATGGCACCGTAGCTGGTGCCGACGGCAGCCAGCCATTTCa > 2:50960/1‑149 (MQ=255) cTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGACCAGGTCATCAAGGGTCTTGTAGGGCGAGTCGCTCTTCACTGCGATGGCACCGTAGCTGGTGCCGACGGCAGCCAGCCATTTCACcgc < 1:50960/149‑1 (MQ=255) | GGAAATGTCGGTAGAGCCGACCTGGATGTGGCCGCCCAGCAATGCCGTGGCGATTTCGCCGCCGCCCTCCAGGGCCACGTAGCGCAGGTCGCGCGGGTTG‑ATGCCAGCGGCCTTGGCGATCAACGCAGTCTGCATCCAGTCCTGGCTGCCGACGGTACCGCCGGAACCGATCACGACCTTGCTCGGGTCTTTCTTCAGCGCTGCGACCAGGTCATCAAGGGTCTTGTAGGGCGAGTCGCTCTTCACTGCGATGGCACCGTAGCTGGTGCCGACGGCAGCCAGCCATTTCACCGC > NC_002947/1618269‑1618562 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |