| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,744,887 | T→C | 9.1% | intergenic (‑13/+328) | PP_1542 ← / ← PP_1543 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,744,887 | 0 | T | C | 9.1% | 211.9 / 9.4 | 78 | intergenic (‑13/+328) | PP_1542/PP_1543 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (26/44); new base C (2/5); total (28/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.71e-01 | |||||||||||
TTGTTGGCGTCGTCATAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCAGCTCTCGGCATTGATGAGGATCAGGT > NC_002947/1744741‑1745031 | ttgttgGCGTCGTCATAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCtt < 2:323733/148‑1 (MQ=255)ttgttgGCGTCGTCATAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAACGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTg < 8:148582/149‑1 (MQ=255) gttgGCGTCGTCATAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGc > 3:71315/1‑149 (MQ=255) gttgGCGTCGTCATAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAACACCGGCTTgg < 3:24488/148‑1 (MQ=255) ttgGCGTCGTCATAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGcc < 4:366469/149‑1 (MQ=255) ggCGTCGTCATAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCg < 4:16003/148‑1 (MQ=255) gCGTCGTCATAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGgt < 5:194736/149‑1 (MQ=255) gtcgtcATAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGgtgt > 8:15998/1‑149 (MQ=255) gtcgtcATAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGgtgt > 3:305069/1‑149 (MQ=255) tcgtcATCGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTCCGGCATCCCGGGTTCATGCCCAACGTGTGGCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGTCGTCGAGCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGATTGGCCGGtgtt < 8:274416/149‑1 (MQ=255) gtcATAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCCAAGCCGgtgctt < 7:75307/148‑4 (MQ=255) cATAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTtgtg > 5:304669/1‑148 (MQ=255) aTAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGcc < 1:331191/149‑1 (MQ=255) aTAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCCAAGCCGgtgcttgcat < 5:106811/149‑8 (MQ=255) aTAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCCAAGCCGgtgcttgca < 7:102056/148‑7 (MQ=255) aTAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCCAAGCCGgtgcttgca < 3:116487/148‑7 (MQ=255) tAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCt > 5:19728/1‑149 (MQ=255) tAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCAATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCt > 6:260090/1‑149 (MQ=255) gCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGa > 7:138982/1‑149 (MQ=255) gCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGGGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGa < 2:79514/149‑1 (MQ=255) ccTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGAt < 1:184450/149‑1 (MQ=255) ggCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGt < 4:221087/148‑1 (MQ=255) ggCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGt < 4:4038/148‑1 (MQ=255) ggCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTg < 5:192329/149‑1 (MQ=255) cTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGc < 4:305069/149‑1 (MQ=255) tGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTACCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCACAACGTGTGCCACAGCAAGTCGAGCTGCTTCACGGTGGCTTCGATAATGGCTTTATCCATGCAAGCACAGGCTTGCCCGCTGTTGAGGCTGATAGTggg > 4:279847/1‑147 (MQ=255) gTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAAt < 8:138982/149‑1 (MQ=255) gTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAAt < 6:19728/149‑1 (MQ=255) ggAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTaa < 2:250547/149‑1 (MQ=255) gAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAAt > 8:345647/1‑149 (MQ=255) gAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAAt < 1:46269/149‑1 (MQ=255) aaaTGGTTTCTGTTGCCGGTACTGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAAt < 5:60739/148‑1 (MQ=255) aaaTGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATg < 1:162208/149‑1 (MQ=255) aTGGTTTCTGTTGCCGGTACGTCATCGCGGGTTCATTCCCAAGGTGTGCCAGATCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGTTCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTTGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATgg < 3:279847/148‑1 (MQ=255) aTGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTaa > 6:94319/1‑145 (MQ=255) aTGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTaa < 5:94319/145‑1 (MQ=255) tttCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGGGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTGTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCAttt > 7:134266/1‑149 (MQ=255) tCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTg < 6:269369/148‑1 (MQ=255) ttGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTggg < 2:307901/146‑1 (MQ=255) ccGGTACTGCATCCCGGGTGCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCTAGCTGCTTCTCGGTGGCGTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTatt < 1:322675/148‑1 (MQ=255) ccGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTatt < 1:317311/148‑1 (MQ=255) cGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTattga < 4:71315/149‑1 (MQ=255) gTACGACATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTattgatt > 5:255240/1‑149 (MQ=255) cGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGt < 5:260090/148‑1 (MQ=255) gCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAAt < 7:345647/149‑1 (MQ=255) cATCCCGGGTTCAGTCCCAAGTTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCGTTCTCCTTGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATa < 8:130475/149‑1 (MQ=255) cATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCTTGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATa < 8:125333/149‑1 (MQ=255) aTCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATAc < 6:304669/149‑1 (MQ=255) tCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTTGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTaa < 4:6787/145‑1 (MQ=255) tCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTTGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTaa > 3:6787/1‑145 (MQ=255) ccGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCa < 7:15998/148‑1 (MQ=255) ccGGGTGCCGGCCCAAGGTGGGCCCGAGCCAGTCGCGCTGCGTCGCGGTGGCGTCGCTCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCGTGGCCGGTGTGGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCa < 8:134266/148‑1 (MQ=255) gTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGtgttgt < 7:248905/95‑1 (MQ=255) gTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGtgttgt > 8:248905/1‑95 (MQ=255) ttCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAAc < 4:231055/149‑1 (MQ=255) aGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACga < 5:322126/148‑1 (MQ=255) tCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCTGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGAt < 5:260319/149‑1 (MQ=255) ccAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCCAAGCCGgtgc < 1:172618/74‑2 (MQ=255) ccAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCCAAGCCGgtgc > 2:172618/1‑73 (MQ=255) gTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTaa > 8:289409/1‑112 (MQ=255) gTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTaa < 7:289409/112‑1 (MQ=255) ctTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATg < 4:234503/131‑1 (MQ=255) ctTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATg > 3:234503/1‑131 (MQ=255) ctcGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTTCCTGATAGTTGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCa < 8:202826/148‑1 (MQ=255) tCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGa < 3:130324/104‑1 (MQ=255) tCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGa > 4:130324/1‑104 (MQ=255) aTGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGTTTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCa < 2:228297/132‑1 (MQ=255) aTGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCa > 1:228297/1‑132 (MQ=255) ggCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTAAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGACAACCAACCAGGAAATCGCAGCAGCtctc > 8:108999/1‑149 (MQ=255) cTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTAGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAAGGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCACCTCTCg > 7:307443/1‑148 (MQ=255) tcCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCAGCTCTCGGCAtt > 8:102171/1‑148 (MQ=255) tcCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCAGCTCTCGGCAtt > 6:310206/1‑148 (MQ=255) cATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCAGCTCTCGGCATtgat > 3:87975/1‑149 (MQ=255) aacACCGGCCAAGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCAGCTCTCGGCATTGATGAGGAt > 6:282737/3‑149 (MQ=255) gCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGGAATCGCAGCAGCTCTCGGCATTGATGAGGAt > 2:175713/1‑148 (MQ=255) ccGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCAGCTCTCGGCATTGATGAGGATCAgg > 6:141885/1‑149 (MQ=255) cGGCTTGGCCGGTGTTGTGTCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCTAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCAACTCTCGGCATtgatg > 1:135389/1‑139 (MQ=255) cGGCTTGGCCGGTGTTGTGGCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCAACTCTCGGCATtgatg < 2:135389/139‑1 (MQ=255) cGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCAGCTCTCGGCATTGATGAGGATCAGGt < 5:310206/149‑1 (MQ=255) | TTGTTGGCGTCGTCATAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCAGCTCTCGGCATTGATGAGGATCAGGT > NC_002947/1744741‑1745031 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |