Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,053,630 | A→T | 7.7% | intergenic (‑30/+36) | PP_1828 ← / ← PP_1829 | hypothetical protein/alpha/beta family hydrolase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,053,630 | 0 | A | T | 7.7% | 190.5 / 5.5 | 65 | intergenic (‑30/+36) | PP_1828/PP_1829 | hypothetical protein/alpha/beta family hydrolase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (32/28); new base T (3/2); total (35/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.12e-01 |
GGCAGTGCTGCCAGGCGTAGCAGCTGGAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTGG > NC_002947/2053485‑2053775 | ggCAGTGCTGCCAGGCGTAGCAGCTGGAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCg > 8:351193/1‑149 (MQ=255) cAGTGCTGCCAGGCGTAGCAGCTGGAGATGTTCGGCGGTCAGCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCgg > 7:213137/1‑148 (MQ=255) gctgcCAGGCGTAGCAGCTGGAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCggcagg > 7:62623/1‑148 (MQ=255) gctgcCAGGCGTAGCAGCTGGAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCggcagg > 3:241133/1‑148 (MQ=255) gcCAGGCGTCGCAGCTGGAGATGTGCGGCGGTCCGCGCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGCCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATg < 8:213137/149‑1 (MQ=255) ccAGGCGTAGCAGCTGGAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATgg > 7:272800/1‑149 (MQ=255) ctggCGTCGCAGCGGGAAAGGTGCGCCGGCCCCCGCGCCCCAGGGCCGGGGGGGGGTTTCCGGGGGGTCGGCGGCCGGCGCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGc < 3:350957/147‑1 (MQ=255) aGGCGTAGCAGCTGGAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCt > 5:375916/1‑149 (MQ=255) gCGTAGCTGCTGGAAATGTGCGGCGGTCAGCTCGGCCCAGGGCTGGGCGGGGGTTTCCTGGGGGTCTTCGGCCGGCGCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTga < 2:140905/149‑1 (MQ=255) gCGTAGCAGCTGGAAATGTGCGGCGGTCAGCGCGGCCCCGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCCGATACAGCAGGCATAGCTga < 3:111285/149‑1 (MQ=255) aggtGGAAATGTTGGGGGTGCAGCTGGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGCCGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGa < 6:299966/146‑1 (MQ=255) gcTGGAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAg > 1:19669/1‑149 (MQ=255) aaggtccgggggTCTCCTCGGCCCTGGGACGGGCGGGGGTTGGCGGGGGTTCTGCGGCCGGCTGGCCGGGGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGt < 8:220065/142‑1 (MQ=255) ttCGGCGGTCAGCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGa < 4:241133/148‑1 (MQ=255) ttCGGCGGTCAGCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGa < 7:351193/148‑1 (MQ=255) ggcggGCAGCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTa > 7:331980/1‑149 (MQ=255) tctaGCGCGGCCCCGGGCCGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACg < 4:10187/144‑1 (MQ=255) gCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACg > 3:10187/1‑143 (MQ=255) gCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAg < 8:331980/149‑1 (MQ=255) cccAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAAt > 4:141702/1‑149 (MQ=255) agggcagggcGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCt > 8:320053/1‑149 (MQ=255) ggcagggcGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTg > 2:161850/1‑148 (MQ=255) agggcGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGAt > 3:320875/1‑148 (MQ=255) gcGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAAc > 8:286443/1‑149 (MQ=255) gcGGGGGTTTCCTGGGGTGCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGTCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAAc < 3:44423/149‑1 (MQ=255) gggTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCggc < 6:43978/87‑1 (MQ=255) gggTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCggc > 5:43978/1‑87 (MQ=255) ctgTTTCCTTGGGTTCTTCGGCCGGCTCTACGGCGGTTGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACGTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTc < 4:120453/146‑1 (MQ=255) ggTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTcac < 8:272800/149‑1 (MQ=255) gTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTcac > 4:320071/1‑148 (MQ=255) tttCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTc > 3:120453/1‑145 (MQ=255) ggTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGGGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATtcgctcg < 6:375916/149‑1 (MQ=255) cttcGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCa > 2:283426/1‑149 (MQ=255) cggccggcTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAAt < 5:332265/135‑1 (MQ=255) cggccggcTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAAt > 6:332265/1‑135 (MQ=255) gccggcTCGACGGAGGTGGGGGAGGTCGTCAACAGGCAATCTACTCACCTATGCCTGCTGTATCGGCACGCATGGCTGAGAACTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGCATGAACCTCACAATACGCTCGCCCAGCtaa > 7:14748/1‑147 (MQ=255) ccggcTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCAc < 2:19669/149‑1 (MQ=255) ccggcTCGACGGCGGGGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTTAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCAc < 8:62623/149‑1 (MQ=255) cTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACgcgc < 3:141702/149‑1 (MQ=255) gggggAGGTGGTCATCAGGGCCTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTc > 8:42282/1‑149 (MQ=255) ggAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCt > 5:361079/1‑145 (MQ=255) ggAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCt < 6:361079/145‑1 (MQ=255) ggAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCggg < 1:52902/149‑1 (MQ=255) ggtggtCATCAGGGCGTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGtt < 8:312438/149‑1 (MQ=255) gtggtCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAg > 7:296261/1‑139 (MQ=255) gtggtCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAg < 8:296261/139‑1 (MQ=255) tggtCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGa < 7:320053/149‑1 (MQ=255) gtCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAgg > 5:248253/1‑149 (MQ=255) tcatcaGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAgg > 1:52685/1‑148 (MQ=255) ggCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTc < 3:320071/149‑1 (MQ=255) tCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCgctg > 4:244646/1‑149 (MQ=255) tcTCAGCCATGCCTGCCGATACAGCAGGCATAGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGCGTTGAGGTAGCTGTCGCgctgc > 4:40849/2‑149 (MQ=38) cTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCgctgct > 8:46762/1‑149 (MQ=255) tCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCGTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCgctgct > 1:76238/1‑149 (MQ=255) tCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGctgctg > 5:191903/1‑149 (MQ=255) tCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGctgctg > 2:355189/1‑149 (MQ=255) tCAGCCATGCCTGCCGATACAGCAGGCATAGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTcgc < 4:91988/142‑1 (MQ=38) tCAGCCATGCCTGCCGATACAGCAGGCATAGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTcgc > 3:91988/1‑142 (MQ=38) aGCCATGCCTGCCGATACAGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGc > 7:34000/1‑149 (MQ=255) cTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTc < 7:286443/149‑1 (MQ=255) tgctgTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAgg > 8:94063/1‑121 (MQ=255) tgctgTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAgg < 7:94063/121‑1 (MQ=255) tgctgTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCt > 4:358220/1‑149 (MQ=255) ctgTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCtt < 7:46762/148‑1 (MQ=255) tATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTgg < 1:283426/147‑1 (MQ=255) | GGCAGTGCTGCCAGGCGTAGCAGCTGGAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTGG > NC_002947/2053485‑2053775 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |