| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,053,631 | T→A | 7.7% | intergenic (‑31/+35) | PP_1828 ← / ← PP_1829 | hypothetical protein/alpha/beta family hydrolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,053,631 | 0 | T | A | 7.7% | 190.9 / 5.7 | 65 | intergenic (‑31/+35) | PP_1828/PP_1829 | hypothetical protein/alpha/beta family hydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (32/28); new base A (3/2); total (35/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.38e-01 | |||||||||||
GGCAGTGCTGCCAGGCGTAGCAGCTGGAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTGGGGC > NC_002947/2053485‑2053778 | ggCAGTGCTGCCAGGCGTAGCAGCTGGAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCg > 8:351193/1‑149 (MQ=255) cAGTGCTGCCAGGCGTAGCAGCTGGAGATGTTCGGCGGTCAGCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCgg > 7:213137/1‑148 (MQ=255) gctgcCAGGCGTAGCAGCTGGAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCggcagg > 3:241133/1‑148 (MQ=255) gctgcCAGGCGTAGCAGCTGGAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCggcagg > 7:62623/1‑148 (MQ=255) gcCAGGCGTCGCAGCTGGAGATGTGCGGCGGTCCGCGCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGCCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATg < 8:213137/149‑1 (MQ=255) ccAGGCGTAGCAGCTGGAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATgg > 7:272800/1‑149 (MQ=255) ctggCGTCGCAGCGGGAAAGGTGCGCCGGCCCCCGCGCCCCAGGGCCGGGGGGGGGTTTCCGGGGGGTCGGCGGCCGGCGCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGc < 3:350957/147‑1 (MQ=255) aGGCGTAGCAGCTGGAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCt > 5:375916/1‑149 (MQ=255) gCGTAGCTGCTGGAAATGTGCGGCGGTCAGCTCGGCCCAGGGCTGGGCGGGGGTTTCCTGGGGGTCTTCGGCCGGCGCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTga < 2:140905/149‑1 (MQ=255) gCGTAGCAGCTGGAAATGTGCGGCGGTCAGCGCGGCCCCGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCCGATACAGCAGGCATAGCTga < 3:111285/149‑1 (MQ=255) aggtGGAAATGTTGGGGGTGCAGCTGGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGCCGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGa < 6:299966/146‑1 (MQ=255) gcTGGAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAg > 1:19669/1‑149 (MQ=255) aaggtccgggggTCTCCTCGGCCCTGGGACGGGCGGGGGTTGGCGGGGGTTCTGCGGCCGGCTGGCCGGGGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑t < 8:220065/142‑1 (MQ=255) ttCGGCGGTCAGCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGa < 4:241133/148‑1 (MQ=255) ttCGGCGGTCAGCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGa < 7:351193/148‑1 (MQ=255) ggcggGCAGCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTa > 7:331980/1‑149 (MQ=255) tctaGCGCGGCCCCGGGCCGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACg < 4:10187/144‑1 (MQ=255) gCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACg > 3:10187/1‑143 (MQ=255) gCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAg < 8:331980/149‑1 (MQ=255) cccAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAAt > 4:141702/1‑149 (MQ=255) agggcagggcGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCt > 8:320053/1‑149 (MQ=255) ggcagggcGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTg > 2:161850/1‑148 (MQ=255) agggcGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGAt > 3:320875/1‑148 (MQ=255) gcGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAAc > 8:286443/1‑149 (MQ=255) gcGGGGGTTTCCTGGGGTGCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGTCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAAc < 3:44423/149‑1 (MQ=255) gggTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCggc < 6:43978/87‑1 (MQ=255) gggTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCggc > 5:43978/1‑87 (MQ=255) ctgTTTCCTTGGGTTCTTCGGCCGGCTCTACGGCGGTTGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACGTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTc < 4:120453/146‑1 (MQ=255) ggTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTcac < 8:272800/149‑1 (MQ=255) gTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTcac > 4:320071/1‑148 (MQ=255) tttCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTc > 3:120453/1‑145 (MQ=255) ggTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGGGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATtcgctcg < 6:375916/149‑1 (MQ=255) cttcGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCa > 2:283426/1‑149 (MQ=255) cggccggcTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAAt > 6:332265/1‑135 (MQ=255) cggccggcTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAAt < 5:332265/135‑1 (MQ=255) gccggcTCGACGGAGGTGGGGGAGGTCGTCAACAGGCAATCTACTCACCTATGCCTGCTGTATCGGCACGCATGGCTGAGAACTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGCATGAACCTCACAATACGCTCGCCCAGCtaa > 7:14748/1‑147 (MQ=255) ccggcTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCAc < 2:19669/149‑1 (MQ=255) ccggcTCGACGGCGGGGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTTAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCAc < 8:62623/149‑1 (MQ=255) cTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACgcgc < 3:141702/149‑1 (MQ=255) gggggAGGTGGTCATCAGGGCCTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTc > 8:42282/1‑149 (MQ=255) ggAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCt < 6:361079/145‑1 (MQ=255) ggAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCt > 5:361079/1‑145 (MQ=255) ggAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCggg < 1:52902/149‑1 (MQ=255) ggtggtCATCAGGGCGTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGtt < 8:312438/149‑1 (MQ=255) gtggtCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAg < 8:296261/139‑1 (MQ=255) gtggtCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAg > 7:296261/1‑139 (MQ=255) tggtCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGa < 7:320053/149‑1 (MQ=255) gtCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAgg > 5:248253/1‑149 (MQ=255) tcatcaGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAgg > 1:52685/1‑148 (MQ=255) ggCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTc < 3:320071/149‑1 (MQ=255) tCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCgctg > 4:244646/1‑149 (MQ=255) tcTCAGCCATGCCTGCCGATACAGCAGGCATAGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGCGTTGAGGTAGCTGTCGCgctgc > 4:40849/2‑149 (MQ=38) cTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCgctgct > 8:46762/1‑149 (MQ=255) tCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCGTG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCgctgct > 1:76238/1‑149 (MQ=255) tCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGctgctg > 2:355189/1‑149 (MQ=255) tCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGctgctg > 5:191903/1‑149 (MQ=255) tCAGCCATGCCTGCCGATACAGCAGGCATAGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTcgc > 3:91988/1‑142 (MQ=38) tCAGCCATGCCTGCCGATACAGCAGGCATAGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTcgc < 4:91988/142‑1 (MQ=38) aGCCATGCCTGCCGATACAGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGc > 7:34000/1‑149 (MQ=255) cTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTc < 7:286443/149‑1 (MQ=255) tgctgTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAgg < 7:94063/121‑1 (MQ=255) tgctgTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAgg > 8:94063/1‑121 (MQ=255) tgctgTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCt > 4:358220/1‑149 (MQ=255) ctgTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCtt < 7:46762/148‑1 (MQ=255) tATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTgg < 1:283426/147‑1 (MQ=255) tCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TGATTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTGGGGc > 1:27164/1‑149 (MQ=255) tCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTGGGGc < 1:161850/148‑1 (MQ=255) | GGCAGTGCTGCCAGGCGTAGCAGCTGGAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCC‑TG‑TTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTGGGGC > NC_002947/2053485‑2053778 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |