| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,451,808 | T→C | 5.2% | K1104R (AAG→AGG) ‡ | mfd ← | transcription‑repair coupling factor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,451,808 | 0 | T | C | 5.2% | 227.4 / 2.1 | 76 | K1104R (AAG→AGG) ‡ | mfd | transcription‑repair coupling factor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/38); new base C (2/2); total (36/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.38e-01 | |||||||||||
TTCCTTAGGCAGGCTGTGGGGTCAGGCGCTCGAACAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAGTGACGTCAGGCGCATCAGGTTCTTGGTCGGCTCTGGC > NC_002947/2451665‑2451954 | ttCCTTAGGCAGGCTGTGGGGTCAGGCGCTCGAACAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAt > 8:6851/1‑148 (MQ=255) ccTTAGGCAGGCTGTGGGGTCAGGCGCTCGAACAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑c < 3:234114/147‑1 (MQ=255) ccTTAGGCAGGCTGTGGGGTCAGGCGCTCGAACAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑Ca < 6:281828/148‑1 (MQ=255) ccTTACGCATGCTGTGGGGTCAGGCGCTCGAACAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGTTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAt < 6:257836/146‑1 (MQ=255) cTTAGGCAGGCTGTGGGGTCAGGCGCTCGAACAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAgc > 7:327399/1‑148 (MQ=255) caggcCGGGGGGTCAGGCGCTCGAACAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGATCTGGGGGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCT‑GATCAAGCTGATCCAGGGTCAgc < 5:222877/149‑2 (MQ=255) gcTGTGGGGTCAGGCGCTCGAACAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTggg < 2:19276/149‑1 (MQ=255) tCAGGCGCTCGAACAGCGACTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGTGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGTAGTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAAGGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGGCGACCGgt < 4:342020/149‑1 (MQ=255) aGGCGCTCGAACAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAgg > 4:320335/1‑129 (MQ=255) aGGCGCTCGAACAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAgg < 3:320335/129‑1 (MQ=255) gcgcTCGAACAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑Gttt > 5:271785/1‑149 (MQ=255) cgcTCGAACAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTc < 2:305079/149‑1 (MQ=255) gcTCGAACAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCg < 6:80205/149‑1 (MQ=255) tCGAACAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGt > 4:135016/1‑129 (MQ=255) tCGAACAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGt < 3:135016/129‑1 (MQ=255) cGAACAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑GAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCt > 2:136003/1‑149 (MQ=255) aaCAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTc > 1:87895/1‑149 (MQ=255) aaCAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTc < 5:31175/149‑1 (MQ=255) aaCAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTc < 3:165124/149‑1 (MQ=255) aaCAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTc < 7:295966/149‑1 (MQ=255) cTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTc > 5:25190/1‑147 (MQ=255) cTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGa < 7:6851/149‑1 (MQ=255) cTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGa < 4:337150/149‑1 (MQ=255) tCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCT‑GATCAAGCTGATCCAGGGTCAgc > 1:92450/1‑116 (MQ=38) tCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCT‑GATCAAGCTGATCCAGGGTCAgc < 2:92450/117‑2 (MQ=38) aGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCtt < 2:87895/149‑1 (MQ=255) ggTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCACTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGAACATGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGAACGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGc > 7:158393/1‑149 (MQ=255) gTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGc > 4:361383/1‑148 (MQ=255) gTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGc > 1:88660/1‑148 (MQ=255) gAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGt > 6:12159/1‑149 (MQ=255) aaccGTCCGGCGGGGCGTTCCCTCGGACCCCGCACGCGCAACGGGGTGCCCCCTTCCAACTTCTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGGGGGGCCCCCGGG‑GTTGCGCCTTCCAACTCGACCTTGCCACCGtt < 2:88660/146‑1 (MQ=255) aaaCGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGtt > 3:173244/1‑149 (MQ=255) aCGTTCGTCTGGGCGCGCCATCGGTACCAGCAAGCGGAACTGGGTGGCCTCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTgg < 8:327399/149‑1 (MQ=255) aCGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTgg < 4:173244/149‑1 (MQ=255) cGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTggg < 2:44415/149‑1 (MQ=255) cgtcgGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCAAGCTTGCCACCGTTGGGcccc > 6:349729/1‑149 (MQ=255) tcgGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAgg < 1:212611/90‑1 (MQ=255) tcgGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAgg > 2:212611/1‑90 (MQ=255) gggCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATc > 8:28127/1‑149 (MQ=255) gCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGa > 3:349283/1‑149 (MQ=255) ccATCTGAACCAGTAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGTACTAGTAACGTTTGCGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTc < 8:158393/149‑1 (MQ=255) ggTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGa < 6:271785/148‑1 (MQ=255) cAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGcc > 8:288925/1‑147 (MQ=255) cAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGcc > 2:216450/1‑147 (MQ=255) ggAAGCTGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGc < 5:12159/149‑1 (MQ=255) ggAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGtt > 1:169877/1‑118 (MQ=255) ggAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGtt < 2:169877/118‑1 (MQ=255) ggAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTcc > 8:121517/1‑149 (MQ=255) cTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGt < 7:28127/149‑1 (MQ=255) ggTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCAAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGc < 5:349729/148‑1 (MQ=255) gCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCtt > 2:299160/1‑149 (MQ=255) cccTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCtt > 3:237996/1‑147 (MQ=255) cccTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCtt > 4:302371/1‑147 (MQ=255) cTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAGt < 4:237996/149‑1 (MQ=255) gAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAGTGAc < 7:288925/148‑1 (MQ=255) aaCTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAGTGACGt > 3:171857/1‑149 (MQ=255) aCTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAGTGACGt > 3:71334/1‑148 (MQ=255) ttGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTc < 6:103838/108‑1 (MQ=255) ttGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAg > 3:29728/1‑140 (MQ=255) ttGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAg < 4:29728/140‑1 (MQ=255) ttGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAGTGACGTCAg > 8:104668/1‑149 (MQ=255) tAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAGTGACGTCAGgc < 4:171857/148‑1 (MQ=255) aaCGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAGTGACGTCAGgcg > 7:25906/1‑148 (MQ=255) gTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTggg < 3:39425/85‑1 (MQ=255) gTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTggg > 4:39425/1‑85 (MQ=255) gCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAGTGACGTCAGGCGCATCAGGTTc > 5:193626/1‑149 (MQ=255) gCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAGTGACGTCAGGCGCATCAGGTTc > 3:234047/1‑149 (MQ=255) acTGACCCT‑GATCAAGCTGATCCAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAGTGACGTCAGGCGCATCAGGTTc > 6:54664/2‑149 (MQ=255) cTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAGTGACGTCAGGCGCATCAGGTTCt < 7:121517/149‑1 (MQ=255) cTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAGTGACGTCAGGCGCATCAGGTTCt < 1:136003/149‑1 (MQ=255) aCCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAGTGACGTCAGGCGCATCAGGTTCtt < 8:25906/147‑1 (MQ=255) tGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGTAGTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAGTGACGTCAGGCGCATCAGGTTCTTGGTCg > 1:61019/1‑149 (MQ=255) aTCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAGTGACGTCAGGCGCATCAGGTTCTTg < 3:338448/141‑1 (MQ=255) aTCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAGTGACGTCAGGCGCATCAGGTTCTTg > 4:338448/1‑141 (MQ=255) aGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAGTGACGTCAGGCGCATCAGGTTCTTGGTCGGCTCTgg < 6:25190/149‑1 (MQ=255) gCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAGTGACGTCAGGCGCATCAGGTTCTTGGTCGGCTCTGGc < 1:216450/149‑1 (MQ=255) | TTCCTTAGGCAGGCTGTGGGGTCAGGCGCTCGAACAGCGCCTCCAGGGTATTGAAACGTTCGTCGGGGCGTTCCATCGGTACCAGGAAGCGGAACTGGGTGGCCCCTTCGAACTTGTAACGTTTGGGCTGACCCTGGATCAGCTTGAT‑CAGGGTCAGTGGGTCGACCGGT‑GTTTCGGCTTCGAACTCGAGCTTGCCACCGTTGGGCCCCGCATCGACTTTCTTGATGCCGAGCTTTTCCGCGTGCAGCTTGAGTGACGTCAGGCGCATCAGGTTCTTGGTCGGCTCTGGC > NC_002947/2451665‑2451954 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |