| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,711,550 | G→A | 5.8% | A1185V (GCG→GTG) | metH ← | cobalamin‑dependent methionine synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,711,550 | 0 | G | A | 5.8% | 211.4 / 2.5 | 69 | A1185V (GCG→GTG) | metH | cobalamin‑dependent methionine synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (32/33); new base A (2/2); total (34/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.37e-01 | |||||||||||
GTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGC > NC_002947/2711402‑2711697 | gTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGAccg > 6:373709/1‑149 (MQ=255) cccAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGAccgccgccgc > 5:147287/1‑149 (MQ=255) cccAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATATGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGAccgccgccgc > 7:72442/1‑149 (MQ=255) ccAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGAccgccgccgcc < 5:162551/149‑1 (MQ=255) ggTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGAGCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCggg < 7:2008/149‑1 (MQ=255) gcgcCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATc > 6:71326/1‑149 (MQ=255) gcgcCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATc < 6:173571/149‑1 (MQ=255) gccagccaGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCAGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATcgc > 5:160678/1‑149 (MQ=255) ccagcGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAATATCGCGAAGt > 1:355871/1‑149 (MQ=255) cagcGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAATATCGCGAAGTg < 2:355871/149‑1 (MQ=255) gcgcTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCGTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCt < 8:294298/149‑1 (MQ=255) tcgctcACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGt > 6:107246/1‑149 (MQ=255) gctcACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGt > 4:177807/1‑147 (MQ=255) aCGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGt < 5:38478/148‑1 (MQ=255) aCGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTa < 6:135140/149‑1 (MQ=255) gCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTaca > 2:207910/1‑149 (MQ=255) gATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑ccc > 7:317443/1‑149 (MQ=255) tCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGATCGAACTGGTCCTTGTCGACATTCCCTACGGCAAAATACATCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACAAGCCGCTTACCGCCGCCGCAGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCt > 6:147221/1‑149 (MQ=255) tGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCgg > 3:38661/1‑149 (MQ=255) gCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGcc > 8:305390/1‑149 (MQ=255) cTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACATTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGAGGGTGGGCGAAGTTCCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGTGAACATCGCGAAGTGATCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCCGCCCg > 8:63606/1‑149 (MQ=255) tgcgtgcgCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGt < 3:290403/148‑1 (MQ=255) tgcgtgcgCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCACCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGtt > 2:301012/1‑149 (MQ=255) tGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGTGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATg > 7:199742/1‑149 (MQ=255) gTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATgg > 4:339086/1‑149 (MQ=255) tAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATgg < 3:339086/148‑1 (MQ=255) gCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCTAAATACTTCGCCTGCTGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCTGGAACATcgc < 7:196681/97‑1 (MQ=255) tCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGc > 3:305904/1‑148 (MQ=255) aggTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGa < 6:160678/147‑1 (MQ=255) gTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCAt < 1:207910/143‑1 (MQ=255) gTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAg > 3:146327/1‑147 (MQ=255) gTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGc < 5:373709/148‑1 (MQ=255) gTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCa < 8:317443/149‑1 (MQ=255) gTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCACCGCCATCggt < 3:7833/147‑3 (MQ=255) ccTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAgg > 3:101682/1‑149 (MQ=255) ccTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCACCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAgg > 6:116758/1‑149 (MQ=255) ccTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCAGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAgc > 7:21371/1‑148 (MQ=255) cTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAgg < 4:146327/148‑1 (MQ=255) cTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCACCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGc < 1:301012/149‑1 (MQ=255) ttGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCg > 4:327772/1‑149 (MQ=255) gTCGACCTTGCGTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACAGCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCgg < 5:288375/148‑1 (MQ=255) gTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCg < 4:305904/147‑1 (MQ=255) tCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGAAGGCGGTCCCATCGAGCAGGCGGaa > 8:24952/1‑149 (MQ=255) gACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGGGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGc < 1:2766/127‑1 (MQ=255) gACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGc > 2:2766/1‑126 (MQ=255) aCCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGt > 5:267921/1‑89 (MQ=255) aCCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGt < 6:267921/89‑1 (MQ=255) ttGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGt > 4:297404/1‑149 (MQ=255) cTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACa < 5:182370/141‑1 (MQ=255) cTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACa > 6:182370/1‑141 (MQ=255) cTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTc < 8:199742/148‑1 (MQ=255) tACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCt > 6:246469/1‑149 (MQ=255) ctgCAAAATACTTCGCCTGCGGGGGGGCGAAGTACCCGCCGCTGCCCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCtt < 8:72442/146‑1 (MQ=255) ggCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCtttt < 5:246469/149‑1 (MQ=255) ggCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCtttt > 4:275708/1‑149 (MQ=255) ggCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCtttt > 2:36075/1‑149 (MQ=255) aaaTACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCtttt > 5:109652/1‑145 (MQ=255) aaaTACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCtttt < 6:109652/145‑1 (MQ=255) aaaTACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAgt < 2:251010/149‑1 (MQ=255) aaTACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAgtg > 8:87928/1‑149 (MQ=255) aTACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAgtgt < 1:245961/149‑1 (MQ=255) cTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTgg < 4:101682/148‑1 (MQ=255) cGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAg > 7:333483/1‑140 (MQ=255) cGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAg < 8:333483/140‑1 (MQ=255) ccTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCgggg < 3:327772/149‑1 (MQ=255) cTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGc < 7:305390/149‑1 (MQ=255) gggTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCtttt > 4:65670/1‑130 (MQ=255) gggTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCtttt < 3:65670/130‑1 (MQ=255) gTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCg > 6:333347/1‑149 (MQ=255) gAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAAc < 3:275708/149‑1 (MQ=255) gTACCAGCCGCTGACCACCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCg < 5:116758/149‑1 (MQ=255) gCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCa < 6:73456/92‑1 (MQ=255) gCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCa > 5:73456/1‑92 (MQ=255) cgccgccgccgGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGc > 5:142850/1‑149 (MQ=255) cgccgccgccgGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGc > 1:351385/1‑149 (MQ=255) | GTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACA‑CCCCGCTCGGCCCGGTTTCACCGATGGCGGTGCCATCGAGCAGGCGGAACAGAGTTTCCTTTTCAGTGTGGTCGGGGCAGGCCGGATAACCCGGCGCAGGGCGGATGC > NC_002947/2711402‑2711697 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |