| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,024,308 | T→A | 5.1% | intergenic (+123/+31) | dapA‑II → / ← PP_2640 | 4‑hydroxy‑tetrahydrodipicolinate synthase/GNAT family acetyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,024,308 | 0 | T | A | 5.1% | 235.1 / 2.3 | 78 | intergenic (+123/+31) | dapA‑II/PP_2640 | 4‑hydroxy‑tetrahydrodipicolinate synthase/GNAT family acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (37/37); new base A (2/2); total (39/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.50e-01 | |||||||||||
GTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCC‑TTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAGCCCGGCAAACTCACCCACGTCGCCTGCCAGGGTGAAGCCGTAGCGTTGGTAGGCGGGTACAGAA > NC_002947/3024167‑3024450 | gtgtTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCC‑TTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCgg > 7:108526/1‑148 (MQ=255)gtgtTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCC‑TTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCgg < 8:108526/148‑1 (MQ=255)gtgtTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCC‑TTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGc > 8:281123/1‑149 (MQ=255) ttCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCC‑TTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCt > 2:65024/1‑149 (MQ=255) ttCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCC‑TTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCt > 2:35501/1‑149 (MQ=255) cACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCC‑TTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCAAAGCGGCCCTg < 5:5344/148‑1 (MQ=255) aCTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCC‑TTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTc < 5:148435/149‑1 (MQ=255) aCTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCC‑TTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTc > 5:179879/1‑149 (MQ=255) ggCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCC‑TTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTcgc < 8:120423/147‑1 (MQ=255) ggCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCC‑TTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGa > 2:255026/1‑149 (MQ=255) gcCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCC‑TTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCgg < 2:336929/135‑1 (MQ=255) gcCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCC‑TTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCgg > 1:336929/1‑135 (MQ=255) gcCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCC‑TTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCAAAGCGGCCCTg > 1:360347/1‑140 (MQ=255) gcCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCC‑TTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCAAAGCGGCCCTg < 2:360347/140‑1 (MQ=255) cTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCGTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGAccc > 1:76672/1‑148 (MQ=255) aaGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCC‑TTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTcgc > 5:44309/1‑139 (MQ=255) aaGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCC‑TTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTcgc < 6:44309/139‑1 (MQ=255) aaGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCC‑TTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGAAGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAgg < 6:320309/148‑1 (MQ=255) aGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCC‑TTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGtt > 6:232324/1‑149 (MQ=255) gCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCC‑TTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTc < 8:217530/149‑1 (MQ=255) ggTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCC‑TTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACg > 8:297994/1‑149 (MQ=255) ggTTGACAAGCCGCCACACCC‑TTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTc < 3:110810/149‑1 (MQ=255) ggTTGACAAGCCGCCACACCC‑TTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTc < 5:358986/149‑1 (MQ=255) aaGCCGCCACACCC‑TTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGgc > 1:362227/1‑149 (MQ=255) ccACACCC‑TTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCtttt < 7:281123/149‑1 (MQ=255) cacaCCC‑TTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGCATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCA‑‑GGCTCGCTCGGCACgcgcatatc > 7:333697/1‑144 (MQ=255) cacCC‑TTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTct > 8:74417/1‑147 (MQ=255) acCC‑TTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTcc > 7:218958/1‑147 (MQ=255) acCC‑TTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTcc < 8:218958/147‑1 (MQ=255) cc‑TTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCa > 3:42651/1‑106 (MQ=255) cc‑TTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTcc > 5:9530/1‑145 (MQ=255) cc‑TTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTcc < 6:9530/145‑1 (MQ=255) cc‑TTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCg < 2:76672/149‑1 (MQ=255) cc‑TTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCg > 2:184000/1‑149 (MQ=255) cc‑TTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCg > 8:59108/1‑149 (MQ=255) cc‑TTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTAATGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGCTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCg > 3:30494/1‑149 (MQ=255) cc‑TTGGTTGGTTCGGGGGCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCg < 4:197391/149‑1 (MQ=255) ttggttggTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGc > 7:110809/1‑149 (MQ=255) ggttggttCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGAGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGc < 5:3026/147‑1 (MQ=255) gttCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGCCAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATaca > 4:329494/1‑149 (MQ=255) ttCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATacac < 5:232324/149‑1 (MQ=255) ggggTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCa < 1:35501/148‑1 (MQ=255) ggggTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAg > 6:49959/1‑149 (MQ=255) tCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAGCCCg < 1:255026/149‑1 (MQ=255) cTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGAt < 6:70021/127‑1 (MQ=255) cTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGAt > 5:70021/1‑127 (MQ=255) cTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAGCCCGGCAAACTCAcc > 2:300404/1‑149 (MQ=255) cTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAGCCCGGCAAACTCAcc > 5:150649/1‑149 (MQ=255) gcgAGTGGATTTCTGCCAGCAACGCTCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCGTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTAAGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCAATCGGCTGATACACCATCCCGGCAAACTCAccc < 4:302233/147‑1 (MQ=255) cgAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAGCCCGGCAAACTCACCCACg < 1:184000/149‑1 (MQ=255) gCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAGCCCGGCAAACTCACCCACGTCg > 6:359473/1‑149 (MQ=255) gCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGATGCTCCTACCCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAGCCCGGCAAACTCACCCACGTCg > 4:145987/1‑149 (MQ=255) gATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAGCCCGGCAAACTCACCCACGTCGCCt < 6:179879/149‑1 (MQ=255) aTTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAGCCCGGCAAACTCACCCACGTCGCCTg > 7:211498/1‑149 (MQ=255) ttgtgacAGCATCGCGCTGAGACAGTGTATTTCCAGGGCCGCTTTGGGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAGCCCGGCAAACTCACCCACGTCGCCTGc < 2:362227/142‑1 (MQ=255) ttCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGt > 6:339646/1‑68 (MQ=255) ttCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGt < 5:339646/68‑1 (MQ=255) ttCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAGCCCGGCaaa > 6:147757/1‑130 (MQ=255) ttCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAGCCCGGCaaa < 5:147757/130‑1 (MQ=255) tCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAGCCCGGCAAACTCACCCACGTCGCCTGcc < 1:300404/148‑1 (MQ=255) ccAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAGCCCGGCAAACTCACCCACGTCGCCTGCCAGGGt < 5:49959/149‑1 (MQ=255) ccAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAGCCCGGCAAACTCACCCACGTCGCCTGCCAGGGt > 3:203297/1‑149 (MQ=255) aGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAGCCCGGCAAACTCACCCACGTCGCCTg > 3:291885/1‑140 (MQ=255) aGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAGCCCGGCAAACTCACCCACGTCGCCTg < 4:291885/140‑1 (MQ=255) aGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAGCCCGGCAAACTCACCCACGTCGCCTGCCAGGGTGa < 8:211498/149‑1 (MQ=255) gCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAGCCCGGCAAACTCACCCACGTCGCCTGCCAGGGTGaa < 6:150649/149‑1 (MQ=255) agaCAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAGCCCGGCAAACTCACCCACGTCGCCTGCCAGGGTGAAGCCGTAGCGtt < 5:359473/149‑1 (MQ=255) agaCAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAGCCCGGCAAACTCACCCACGTCGCCTGCCAGGGTGAAGCCGTAGCGtt < 7:59108/149‑1 (MQ=255) gaCAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAGCGCGGCAAACTCACCCACGTCGCCTGCCAGGGTGAAGCCGTAGCGTTg < 3:145987/149‑1 (MQ=255) cAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCTGAGGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAGCCCGGCAAACTCACCCACGTCGCCTGCCAGGGTGAAGCCGTAGCGTTg > 1:106516/1‑149 (MQ=255) agTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAGCCCGGCAAACTCACCCACGTCGCCTGCCAGGGTGAAGCCGTAGCGTTGGTAgg > 5:158199/1‑149 (MQ=255) gTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAGCCCGGCAAACTCACCCCCGTCGCCTGCCAGGGTGAAGCCGTAGCGTTGGTAGGc < 1:65024/149‑1 (MQ=255) gcgacAGGGCCGCAAAGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAGCCCGGCAAACTCACCCACGTCGCCTGCCAGGGTGAAGCCGTAGCGTTGGTAGGCggg > 3:209600/5‑149 (MQ=255) aGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAGCCCGGCAAACTCACCCACGTCGCCTg > 1:6077/1‑113 (MQ=255) aGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAGCCCGGCAAACTCACCCACGTCGCCTg < 2:6077/113‑1 (MQ=255) gggCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAGCCCGGCAAACTCACCCACGTCGCCTGCCAGGGTGAAGCCGTAGCGTTGGTAGGCGGGTACag > 4:303553/1‑148 (MQ=255) ggCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAGCCCGGCAAACTCACCCACGTCGCCTGCCAGGGTGAAGCCGTAGCGTTGGTAGGCGGGTACagaa < 7:297994/149‑1 (MQ=255) ggCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAGCCCGGCAAACTCACCCACGTCGCCTGCCAGGGTGAAGCCGTAGCGTTGGTAGGCGGGTACagaa < 3:329494/149‑1 (MQ=255) | GTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCC‑TTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCT‑‑GGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAGCCCGGCAAACTCACCCACGTCGCCTGCCAGGGTGAAGCCGTAGCGTTGGTAGGCGGGTACAGAA > NC_002947/3024167‑3024450 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |