| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 239,466 | C→T | 10.5% | L183F (CTC→TTC) | hemD → | uroporphyrinogen‑III synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 239,466 | 0 | C | T | 10.5% | 205.8 / 11.5 | 76 | L183F (CTC→TTC) | hemD | uroporphyrinogen‑III synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/34); new base T (3/5); total (37/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.12e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.75e-01 | |||||||||||
GATCGTTCGCGGCGTCGGAGGTCGCGAACTGCTGGCAGAGCGTCTTGCAGAGCAAGGTGCTAGTGTCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGTGCCGATTGGCTGCGGTTGGCCCAGTTGCCGCTGTTCGTGCCCAGCCCGCGGGTCGCCGAGCAGGCCAAGGCCGCCGGGGCCCAACAGGT > NC_002947/239321‑239614 | gATCGTTTGCGGCGTCGGAGGTCGCGAACTGCTGGCAGAGCGTCTTGCAGAGCAAGGTGCTAGTGTCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑AGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTc > 2:246248/1‑148 (MQ=255) gTTCGCGGCGTCGGAGGTCGCGAACTGCTGGCAGAGCGTCTTGCAGAGCAAGGTGCTAGTGTCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAGGCGTTCCGCTTCAATgc < 3:38354/149‑2 (MQ=255) ttCGCGGCGTCGGAGGTCGCGAACTGCTGGCAGAGCGTCTTGCAGAGCAAGGTGCTAGTGTCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAGGCGTTCCGCTTCAATgcg < 1:167882/149‑3 (MQ=255) gcggcgTCGGAGGTCGCGAACTGCTGGCAGAGCGTCTTGCAGAGCAAGGTGCTAGTGTCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAGGCGTTCCGCTTCAATgcggc < 3:50371/148‑5 (MQ=255) gcggcgTCGGAGGTCGCGAACTGCTGGCAGAGCGTCTTGCAGAGCAAGGTGCTAGTGTCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCt < 6:63695/148‑1 (MQ=255) cggcgTCGGAGGTCGCGAACTGCTGGCAGAGCGTCTTGCAGAGCAAGGTGCTAGTGTCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCtgg < 4:23795/149‑1 (MQ=255) gTCGGAGGTCGCGAACTGCTGGCAGAGCGTCTTGCAGAGCAAGGTGCTAGTGTCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTggtggt < 8:80647/149‑1 (MQ=255) tCGGAGGTCGCGAACTGCTGGCAGAGCGTCTTGCAGAGCAAGGTGCTAGTGTCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTc < 5:54333/149‑1 (MQ=255) ggAGGTCGCGAACTGCTGGCAGAGCGTCTTGCAGAGCAAGGTGCTAGTGTCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTcag < 5:231538/149‑1 (MQ=255) gTCGCGAACTGCTTGCAGATCGTTTTGCAGATCAATGTGCTTGTGTCGTATATCTTGAACTGTATTGTCGCTTCCCTCAGCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTcag < 1:299893/148‑1 (MQ=255) gTCGCGAACTGCTGGCAGAGCGTCTTGCAGAGCAAGGTGCTAGTGTCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGt > 7:283128/1‑149 (MQ=255) aCTGCTGGCAGAGCGTCTTGCAGAGCAAGGTGCTAGTGTCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAgg < 2:252102/149‑1 (MQ=255) aCTGCTGGCAGAGCGTCTTGCAGAGCAAGGTGCTAGTGTCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAgg < 5:43021/149‑1 (MQ=255) ctgGCAGAGCGTCTTGCAGAGCAAGGTGCTAGTGTCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCaa > 7:113121/1‑119 (MQ=255) ctgGCAGAGCGTCTTGCAGAGCAAGGTGCTAGTGTCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCaa < 8:113121/119‑1 (MQ=255) tgGCAGAGCGTCTTGCAGAGCAAGGTGCTAGTGTCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGtttt > 7:183088/1‑149 (MQ=255) tgGCAGAGCGTCTTGCAGAGCAAGGTGCTAGTGTCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGtttt > 7:241701/1‑149 (MQ=255) ggCAGAGCGTCTTGCAGAGCAAGGTGCTAGTGTCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAGGCGTTCCGCTTCAATg > 7:329065/1‑119 (MQ=255) ggCAGAGCGTCTTGCAGAGCAAGGTGCTAGTGTCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAGGCGTTCCGCTTCAATg < 8:329065/119‑1 (MQ=255) gCAGAGCGTCTTGCAGAGCAAGGTGCTAGTGTCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTg > 3:21854/1‑148 (MQ=255) gagCGTCTTGCAGAGCAAGGTGCTAGTGTCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACa > 7:206917/1‑149 (MQ=255) tCTTGCAGAGCAAGGTGCTAGTGTCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTgc < 8:183088/149‑1 (MQ=255) tCTTGCAGAGCAAGGTGCTAGTGTCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑GGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTgc < 1:246248/149‑1 (MQ=255) ttGCAGAGCAAGGTGCTAGTGTCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTgcag > 4:152089/1‑149 (MQ=255) gCAGAGCAAGGTGCTAGTGTCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGGTTTAGGCACACATGCGCCGCATTCAAGCGGAACGCCACAATGCCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGTTTTTGAACAtttc > 1:114948/1‑147 (MQ=255) gCAGAGCAAGGTGCTAGTGTCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAGGCGTTCCGCTTCAATg < 2:164758/106‑1 (MQ=255) gCAGAGCAAGGTGCTAGTGTCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAGGCGTTCCGCTTCAATg > 1:164758/1‑106 (MQ=255) gCAGAGCAAGGTGCTAGTGTCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTgcag > 6:254881/1‑147 (MQ=255) gCAGAGCAAGGTGCTAGTGTCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTgcag > 1:28525/1‑147 (MQ=255) gCAGAGCAAGGTGCTAGTGTCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTgcag < 8:51450/147‑1 (MQ=255) agagCAAGGTGCTAGTGTCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCAGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTCGGAAGGGTTTTGAACATTTGaagcag > 8:263266/1‑148 (MQ=255) agCAAGGTGCTAGTGTCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTg < 7:216602/140‑1 (MQ=255) agCAAGGTGCTAGTGTCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTg > 8:216602/1‑140 (MQ=255) aGTGTCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGaa > 2:217332/1‑123 (MQ=255) aGTGTCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGaa < 1:217332/123‑1 (MQ=255) gtgtCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGTGCCGAt < 7:123475/149‑1 (MQ=255) tgtCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGTGCCGAtt < 1:125304/149‑1 (MQ=255) tgtCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGTGCCGAt < 5:254881/148‑1 (MQ=255) gtCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCTCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCGGCAGATGGCCGGTGCCGAtt < 4:205313/148‑1 (MQ=255) gtCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCGGCAGATGGCCGGTGCCGAtt > 3:205313/1‑148 (MQ=255) tCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGTGCCGATTgg < 5:40007/149‑1 (MQ=255) tCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGTGCCGATTgg > 5:43084/1‑149 (MQ=255) aaTATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGTGCCGATTGGCTg > 6:156047/1‑149 (MQ=255) atatCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGTGCCGATTGGCTGc > 3:31050/1‑149 (MQ=255) cTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGTGCCGATTGGCTGCGGtt > 1:134818/1‑149 (MQ=255) ggAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGt > 4:14236/1‑130 (MQ=255) ggAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGt < 3:14236/130‑1 (MQ=255) gAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGTGCCGATTGGCTGCGGTTg < 5:156047/147‑1 (MQ=255) tGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGTGCCGATTGGCTGCGGTTGGCCCAg > 8:75571/1‑149 (MQ=255) tGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGTGCCGATTGGCTGCGGTTGGCCCAg > 3:249863/1‑149 (MQ=255) tATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGTGCCGATTGGCTGCGGTTGGCCCAg < 3:152089/147‑1 (MQ=255) tATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGTGCCGATTGGCTGCGGTTGGCCCAGtt > 3:258086/1‑149 (MQ=255) tATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGTGCCGATTGGCTGCGGTTGGCCCAGtt < 2:134818/149‑1 (MQ=255) cgC‑TGCCT‑‑CCCGGCCTACCCGGGGGG‑‑TA‑‑CGCTGTTCCGCCGCATTGCAGGGGATCGCCTGAATGGCCTGGAGTTCTGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCTGGAGATGTCCGGTGCCGATTGGCTTCGGTTGGCCCAGTTGCCGCt < 4:288598/149‑1 (MQ=255) gC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGTGCCGATTGGCTGCGGTTGGCCCAGTTGCCGCTg < 6:43084/149‑1 (MQ=255) gC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGTGCCGATTGGCTGCGGTTGGCCCAGTTGCCGCTg < 8:241701/149‑1 (MQ=255) cct‑‑gccGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGTGCCGATTGGCTGCGGTTGGCCCAGTTGCCGCTGTTc < 4:31050/148‑1 (MQ=255) t‑‑gccGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGCACATTTGCAGCAGATGGCCGGTGCCGATTGGCTGCGGTTGGCCCAGTTGCCGCTGTTCGTg > 1:61050/1‑149 (MQ=255) t‑‑gccGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTgc > 2:153008/1‑96 (MQ=255) t‑‑gccGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTgc < 1:153008/96‑1 (MQ=255) t‑‑gccGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGTGCCGATTGGCTGCGGTTGGCCCAGTTGCCGCTGTTCGTg > 4:198724/1‑149 (MQ=255) cccGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGGGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGTGCCGATTGGCTGCGGTTGGCCCAGTTGCCGCTGTTCGTGCCCAGCCcgc < 2:114948/149‑1 (MQ=255) ccGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGTGCCGATTGGCTGCGGTTGGCCCAGTTGCCGCTGTTCGTGCCCAGCCcgcg > 8:111724/1‑149 (MQ=255) cggcggG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGTCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGGAGATGGCCGGTGCCGATTGGCTGCGGTTGGCCCAGTTGCCGCTGTTCGTGCCCAGCCCGCgg < 7:263266/149‑1 (MQ=255) cggcggG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGt > 6:379900/1‑62 (MQ=255) cggcggG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGt < 5:379900/62‑1 (MQ=255) cGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGTGCCGATTGGCTGCGGTTGGCCCAGTTGCCGCTGTTCGTGCCCAGCCCGCGGGTCGCCGa < 2:28525/148‑1 (MQ=255) gcgcCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGTGCCGATTGGCTGCGGTTGGCCCAGTTGCCGCTGTTCGTGCCCAGCCCGCGGGTCGCCGAGCAGGcc > 1:231569/1‑148 (MQ=255) gccgcATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGTGCCGATTGGCTGCGGTTGGCCCAGTTGCCGCTGTTCGTGCCCAGCCCGCGGGTCGCCGAGCAGGCCAAg > 6:246650/1‑149 (MQ=255) cATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGTGCCGATTGGCTGCGGTTGGCCCAGTTGCCGCTGTTCGTGCCCAGCCCGCGGGTCGCCGAGCAGGCCAAGgccg > 2:11096/1‑149 (MQ=255) aTTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGTGCCGATTGGCTGCGGTTGGCCCAGTTGCCGCTGTTCGTGCCCAGCCCGCGGGTCGCCGAGCAGGCCAAGgccgc > 2:252254/1‑149 (MQ=255) gAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGTGCCGATTGGCTGCGGTTGGCCCAGTTGCCGCTGTTCGTg < 2:205179/111‑1 (MQ=255) gAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGTGCCGATTGGCTGCGGTTGGCCCAGTTGCCGCTGTTCGTg > 1:205179/1‑111 (MQ=255) aaGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGTGCCGATTGGCTGCGGTTGGCCCAGTTGCCGCTGTTCGTGCCCAGCCCGCGGGTCGCCGAGCAGGCCAAGGCCGCCggg > 6:132360/1‑149 (MQ=255) aaGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGTGCCGATTGGCTGCGGTTGGCCCAGTTGCCGCTGTTCGTGCCCAGCCCGCGGGTCGCCGAGCAGGCCAAGGCCGCCggg < 1:61537/149‑1 (MQ=255) gcgttccGCTTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGTGCCGATTGGCTGCGGTTGGCCCAGTTGCCGCTGTTCGTGCCCAGCCCGCGGGTCGCCGAGCAGGCCAAGGCCGCCGGGGc > 5:348034/7‑149 (MQ=255) ccTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGTGCCGATTGGCTGCGGTTGGCCCAGTTGCCGCTGTTCGTGCCCAGCCCGCGGGTCGCCGAGCAGGCCAAGGCCGCCGGGGCCCAACAgg > 4:343711/1‑149 (MQ=255) cTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGTGCCGATTGGCTGCGGTTGGCCCAGTTGCCGCTGTTCGTGCCCa < 5:34407/103‑1 (MQ=255) cTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGTGCCGATTGGCTGCGGTTGGCCCAGTTGCCGCTGTTCGTGCCCa > 6:34407/1‑103 (MQ=255) cTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGTGCCGATTGGCTGCGGTTGGCCCAGTTGCCGCTGTTCGTGCCCAGCCCGCGGGTCGCCGAGCAGGCCAAGGCCGCCGGGGCCCAACAGGt > 5:350745/1‑149 (MQ=255) cTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGTGCCGATTGGCTGCGGTTGGCCCAGTTGCCGCTGTTCGTGCCCAGCCCGCGGGTCGCCGAGCAGGCCAAGGCCGCCGGGGCCCAACAGGt > 5:55969/1‑149 (MQ=255) | GATCGTTCGCGGCGTCGGAGGTCGCGAACTGCTGGCAGAGCGTCTTGCAGAGCAAGGTGCTAGTGTCGAATATCTGGAACTGTATCGTCGC‑TGCCT‑‑GCCGGCCTACCCGGCGGG‑‑TA‑‑CGCTGATGCGCCGCATTGAAGCGGAACGCCTCAATGGCCTGGTGGTCAGCAGTGGGCAGGGTTTTGAACATTTGCAGCAGATGGCCGGTGCCGATTGGCTGCGGTTGGCCCAGTTGCCGCTGTTCGTGCCCAGCCCGCGGGTCGCCGAGCAGGCCAAGGCCGCCGGGGCCCAACAGGT > NC_002947/239321‑239614 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |