| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,183,328 | G→T | 7.7% | E330* (GAG→TAG) ‡ | PP_2793 → | acyl‑CoA dehydrogenase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,183,328 | 0 | G | T | 7.7% | 200.9 / 4.1 | 63 | E330* (GAG→TAG) ‡ | PP_2793 | acyl‑CoA dehydrogenase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/25); new base T (3/2); total (36/27) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GGCGAGCACCAGGGCGTGGGTTTCATGCTGGCCGACAACATGATGGACCTG‑CACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTCCGCATCTATGACGGCCCGAGCGAAGTGCACCGCATGAGCCTGGC > NC_002947/3183181‑3183476 | ggCGAGCACCAGGGCGTGGGTTTCATGCTGGCCGACAACATGATGGACCTG‑CACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGa < 4:111949/149‑1 (MQ=255) gCACCAGGGCGTGGGTTTCATGCTGGCCGACAACATGATGGACCTG‑CACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCTCGgcgc > 8:138105/1‑149 (MQ=255) cAGGGCGTGGGTTTCATGCTGGCCGACAACATGATGGACCTG‑CACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCTCGGCGCtgat < 8:283820/149‑3 (MQ=255) aGGGCGTGGGTTTCATGCTGGCCGACAACATGATGGACCTG‑CACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCTCGGCGCtgatc < 7:138105/149‑4 (MQ=255) gggCGTGGGTTTCATGCTGGCCGACAACATGATGGACCTG‑CACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGc < 1:367655/149‑1 (MQ=255) gCGTGGGTTTCATGCTGGCCGACACCATGATGGACCTG‑CACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCgg < 8:159837/149‑1 (MQ=255) tGGGTTTCATGCTGGCCGACAACATGATGGACCTG‑CACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGggtg < 1:310830/149‑1 (MQ=255) gTTTCATGCTGGCCGACAACATGATGGACCTG‑CACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTc < 6:176258/149‑1 (MQ=255) tttCATGCTGGCCGACAACATGGTGGACCTG‑CACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTc > 7:231571/1‑148 (MQ=255) tttCATGCTGGCCGACAACATGATGGACCTGACACGTGGTGCGTCTGGCGGTATGGCACTGCGCCTGGTTGCTC‑GACAAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGCCGCTGTGGCGGGTGGTc > 1:225906/1‑149 (MQ=255) tttCATGCTGGCCGACAACATGATGGACCTG‑CACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCtgt < 8:334322/137‑1 (MQ=255) tttCATGCTGGCCGACAACATGATGGACCTG‑CACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCtgt > 7:334322/1‑137 (MQ=255) tttCATGCTGGCCGACAACATGATGGACCTG‑CACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCg < 8:231571/149‑1 (MQ=255) tCATGCTGGCCGACAACATGATGGACCTG‑CACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGa < 1:173793/148‑1 (MQ=255) cTGGCCGACAACATGATGGACCTG‑CACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGtt < 5:22528/148‑1 (MQ=255) gCCGACAACATGATGGACCTG‑CACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGt < 2:225906/149‑1 (MQ=255) caTGATGGACCTG‑CACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTAt > 3:218968/1‑149 (MQ=255) aCCTG‑CACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTgg < 8:165493/144‑1 (MQ=255) aCCTG‑CACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTgg > 7:165493/1‑144 (MQ=255) ccTG‑CACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTCAGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGa > 1:82143/1‑149 (MQ=255) cACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCgg > 5:89859/1‑111 (MQ=255) cACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCgg < 6:89859/111‑1 (MQ=255) cACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCgg < 2:82143/149‑1 (MQ=255) gtggtgCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGt > 6:189428/1‑149 (MQ=255) gtggtgCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAAAGTCGATTAGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGAGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTGGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGt > 8:232163/1‑149 (MQ=255) tggtgCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGc > 4:205212/1‑122 (MQ=255) tggtgCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGc < 3:205212/122‑1 (MQ=255) gTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCggg > 1:222888/1‑149 (MQ=255) gTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCggg < 5:189428/149‑1 (MQ=255) gTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCggg > 7:78954/1‑132 (MQ=255) gTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCggg < 8:78954/132‑1 (MQ=255) gTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGAGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCgt > 6:84728/1‑149 (MQ=255) tGGCACTGCGCCTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCgtggt > 1:187522/1‑149 (MQ=255) aCTGCGCCTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAg > 6:328353/1‑149 (MQ=255) cTGCGCCTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGc < 6:298861/149‑1 (MQ=255) cgcCTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGa < 5:328353/149‑1 (MQ=255) gcCTGGGTGCTC‑GACCTGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCATGGT‑GATCAGCGCCGTGGCGCTGTGGCTGGTGGTCTATCGTTGCGTCCTTGTATTGTGTGGACGCGGGTTGACCTGGGACACCGTGGTGGAGCGGAt < 7:232163/149‑1 (MQ=255) ccTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCggg < 6:58073/128‑1 (MQ=255) ccTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCggg > 5:58073/1‑128 (MQ=255) ccTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATc > 3:132240/1‑149 (MQ=255) gTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCcg < 4:132240/149‑1 (MQ=255) tC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGAt > 1:266288/1‑140 (MQ=255) tC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGGCGATCGTTGCGGCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGAt < 2:266288/139‑1 (MQ=255) c‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGTCCGGGGACACCgtggt < 7:250814/129‑1 (MQ=255) c‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCgtggt > 8:250814/1‑129 (MQ=255) aCCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACAtt > 7:164585/1‑149 (MQ=255) aCCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACAtt > 6:18848/1‑149 (MQ=255) cAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCg > 5:5446/1‑149 (MQ=255) ggCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTc < 5:18848/149‑1 (MQ=255) aTGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTCCGCATCTAt > 3:43049/1‑149 (MQ=255) tCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTCCGCATCTATGAc > 8:256368/1‑149 (MQ=255) ttCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTCCGCATCTATGACGGcc > 2:5837/1‑149 (MQ=255) ccAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTTGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTCCGCATCTATGACGGCCCGAGCGAAGTg > 6:233897/1‑149 (MQ=255) cAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTCCGCATCTATGACGGCCCGAGCGAAGTg > 7:253472/1‑148 (MQ=255) aaGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTCCGCATCTATGACGGCCCGAGCGAAGTGCa > 1:103785/1‑149 (MQ=255) aaGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACAGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTCCGCATCTATGACGGCCCGAGCGAAGTGCa > 8:254938/1‑149 (MQ=255) gT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTCCGCATCTATGACGGCCCGAGCGAAGTGCACCg > 7:290064/1‑149 (MQ=255) gccacAGCGCCTCGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTCCGCATCTATGACGGCCCGAGCGAAGTGCACCg > 1:192498/5‑148 (MQ=255) gccacAGCGCCTCGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTCCGCATCTATGACGGCCCGAGCGAAGTGCACCg > 5:18146/5‑148 (MQ=255) aTCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTCCGCATCTATGACGGCCCGAGCGAAGTGCACCGCa < 8:253472/148‑1 (MQ=255) cAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTCCGCATCTATGACGGCCCGAGCGAAGTGCACCGCAt > 4:46639/1‑147 (MQ=255) gcgcCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTCCGCATCTATGACGGCCCGAGCGAAGTGCACCGCATGAGc > 8:219174/1‑149 (MQ=255) gcCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTCCGCATCTATGACGGCCCGAGCGAAGTGCACCGCATGAGCCt > 7:222684/1‑149 (MQ=255) gAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTCCGCATCTATGACGGCCCGAGCGAAGTGCACCGCATGAGCCTGGc > 2:57092/1‑149 (MQ=255) | GGCGAGCACCAGGGCGTGGGTTTCATGCTGGCCGACAACATGATGGACCTG‑CACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTC‑GACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGT‑GATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTCCGCATCTATGACGGCCCGAGCGAAGTGCACCGCATGAGCCTGGC > NC_002947/3183181‑3183476 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |