Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,476,725 | G→A | 5.5% | intergenic (‑13/+155) | PP_3087 ← / ← PP_3088 | excinuclease ABC subunit A/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,476,725 | 0 | G | A | 5.5% | 225.6 / 2.5 | 74 | intergenic (‑13/+155) | PP_3087/PP_3088 | excinuclease ABC subunit A/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/36); new base A (2/2); total (35/39) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.75e-01 |
TTGCCCGAGCCGGACACGCCGGTGAACACCACCAAGGCGTCGCGGGGGATATCGACATCGATGTTCTTCAGGTTGTGCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAATCTACCCGATAGAGCCGGTGGGGTGGCAGGGCGCCGGCTGTCTTCGCCTTACCTGACGTTCGTCTCAAGGCTTTTA > NC_002947/3476579‑3476870 | ttGCCCGAGCCGGACACGCCGGTGAACACCACCAAGGCGTCGCGGGGGATATCGACATCGATGTTCTTCAGGTTGTGCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTc > 7:197974/1‑149 (MQ=255) ggACACGCCGGTGAACACCACCAAGGCGTCGCGGGGGATATCGACATCGATGTTCTTCAGGTTGTGCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAg > 4:323709/1‑148 (MQ=255) gACACGCCGGTGAACACCACCAAGGCGTCGCGGGGGATATCGACATCGATGTTCTTCAGGTTGTGCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAg > 5:70920/1‑147 (MQ=255) gACACGCCGGTGAACACCACCAAGGCGTCGCGGGGGATATCGACATCGATGTTCTTCAGGTTGTGCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCa < 3:28906/149‑1 (MQ=255) acGCCGGTGAACACCACCAAGGCGTCGCGGGGGATATCGACATCGATGTTCTTCAGGTTGTGCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTATCTGAAGCTGAGCAGTg > 5:30295/1‑149 (MQ=255) acGCCGGTGAACACCACCAAGGCGTCGCGGGGGATATCGACATCGATGTTCTTCAGGTTGTGCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTATCTGAAGCTGAGCAGTg > 5:24955/1‑149 (MQ=255) gCCGGTGAACACCACCAAGGCGTCGCGGGGGATATCGACATCGATGTTCTTCAGGTTGTGCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTgcg > 3:150592/1‑149 (MQ=255) ggTGAACACCACCAAGGCGTCGCGGGGGATATCGACATCGATGTTCTTCAGGTTGTGCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTc < 8:231914/149‑1 (MQ=255) gTGAACACCACCAAGGCGTCGCGGGGGATATCGACATCGATGTTCTTCAGGTTGTGCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCa < 8:290275/149‑1 (MQ=255) tGAACACCACCAAGGCGTCGCGGGGGATATCGACATCGATGTTCTTCAGGTTGTGCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCaa < 1:269618/149‑1 (MQ=255) tGAACACCACCAAGGCGTCGCGGGGGATATCGACATCGATGTTCTTCAGGTTGTGCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCaa < 5:65470/149‑1 (MQ=255) tgcaccacCAAGGCGGCGCGGGGGATCTCGACATCGATGTTCTTCAGGTTGTGCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGAATCCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGt < 4:267657/147‑1 (MQ=255) acacCACCAATGCTGCGCGGGTGATATCGACATCGATGTTCTTCAGGTTGTGCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGtt < 6:256744/149‑1 (MQ=255) caccacCAAGGCGTCGCGGGGGATATCGACATCGATGTTCTTCAGGTTGTGCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTc < 5:263141/123‑1 (MQ=255) caccacCAAGGCGTCGCGGGGGATATCGACATCGATGTTCTTCAGGTTGTGCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTc > 6:263141/1‑123 (MQ=255) accaccAAGGCGTCGCGGGGGATATCGACATCGATGTTCTTCAGGTTGTGCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTaa < 5:240026/149‑1 (MQ=255) caccaAGGCGTCGCGGGGGATATCGACATCGATGTTCTTCAGGTTGTGCTCGCGGGTGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTaa > 5:111455/1‑147 (MQ=255) caccaAGGCGTCGCGGGGGATATCGACATCGATGTTCTTCAGGTTGTGCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACa < 2:235193/149‑1 (MQ=255) ggCGTCGCGGGGGATATCGACATCGATGTTCTTCAGGTTGTGCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAAtt > 6:73168/1‑149 (MQ=255) gCGTCGCGGGGGATATCGACATCGATGTTCTTCAGGTTGTGCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTg < 1:95157/149‑1 (MQ=255) gTCGCGGGGGATATCGACATCGATGTTCTTCAGGTTGTGCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTg > 6:60437/1‑147 (MQ=255) gTCGCGGGGGATATCGACATCGATGTTCTTCAGGTTGTGCTCGCGCGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCa > 7:272282/1‑149 (MQ=255) gggATATCGACATCGATGTTCTTCAGGTTGTGCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCt > 3:167567/1‑149 (MQ=255) ggATATCGACATCGATGTTCTTCAGGTTGTGCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCtt < 5:105479/149‑1 (MQ=255) aCATCGATGTTCTTCAGGTTGTGCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAAt < 8:239402/129‑1 (MQ=255) aCATCGATGTTCTTCAGGTTGTGCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAAt > 7:239402/1‑129 (MQ=255) cATCGATGTTCTTCAGGTTGTGCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGgca < 2:94686/149‑1 (MQ=255) cATCGATGTTCTTCAGGTTGTGCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGgca < 4:167567/149‑1 (MQ=255) ttcttcAGGTTGTGCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCaa < 3:323709/149‑1 (MQ=255) cttcAGGTTGTGCTCGCGTGCGCCAAGGACGTGGATGAATCGGCTTGGGGTGGTCGGGCTTTGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAg < 8:272282/148‑1 (MQ=255) cttcAGGTTGTGCTCGCGGGTGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAg < 6:111455/148‑1 (MQ=255) cttcAGGTTGTGCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAg < 6:70920/148‑1 (MQ=255) tcAGGTTGTGCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGaa > 3:169027/1‑149 (MQ=255) cAGGTTGTGCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAAt > 4:357970/1‑149 (MQ=255) aGGTTGTGCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAATc > 8:15021/1‑149 (MQ=255) aGGTTGTGCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAATc > 2:280343/1‑149 (MQ=255) gTTGTGCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGATACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCat < 7:239857/111‑2 (MQ=255) gTTGTGCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCaa > 8:239857/1‑111 (MQ=255) gTTGTGCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAATCTa > 3:302042/1‑149 (MQ=255) ttGTGCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAATCTAc < 5:60437/149‑1 (MQ=255) gtgCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAATCTAcc < 5:73168/148‑1 (MQ=255) cgtgggCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAATCTACCCGa > 7:127104/4‑146 (MQ=255) cgGGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAATCTACCCGATagag > 7:154655/1‑149 (MQ=255) gcCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAATCTACCCGATAGAGCCggt < 4:169027/149‑1 (MQ=255) ccACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGATGCATGAATCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAATCTACCCGATAGAGCCggtg < 6:219873/149‑1 (MQ=255) ccACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAATCTACCCGATAGAGCCggtg < 7:15021/149‑1 (MQ=255) cACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAATCTACCCGATAGAGCCggtgg > 6:304951/1‑149 (MQ=255) cGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAATCTACCCGATAGAGCCggtgggg < 1:280343/149‑1 (MQ=255) cGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAATCTACCCGATAGAGCCggtgggg < 4:150592/149‑1 (MQ=255) cgcgGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAATCTACCCGATAGAGCCggtggggtgg > 6:54612/1‑148 (MQ=255) aaaCCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAATCTACCCGATAGAGCCGGTGGGGTGGCAGGGCGcc > 2:152886/1‑149 (MQ=255) aCCGCTTGGGGTGGTCTGTCGTGGAGGCATGAAGCATGCCTTTTCTGAATCTGAGCAGTGCTCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAATCTACCCGATAGAGCCGGTGGGGTGGCAGCGCGCCgg < 8:154655/149‑1 (MQ=255) ggggTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAATCTACCCGATAGAGCCGGTGGGGTGGCAGGGCGCCGGCTGTc < 5:54612/147‑1 (MQ=255) ggggTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAAATGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAATCTACCCGATAGAGCCGGTGGGGTGGCAGGGCGCCGGCTGTCtt > 2:357678/1‑149 (MQ=255) ggtggtCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAATCTACCCGATAGAGCCGGTGGGGTGGCAGGGCGCCGGCTGTCTTCg > 4:36787/1‑149 (MQ=255) gtggtCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAATCTACCCGATAGAGCCGGTGGGGTGGCAGGGCGCCGGCTGTCTTCGc < 1:152886/149‑1 (MQ=255) gtggtCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAATCTACCCGATAGAGCCGGTGGGGTGGCAGGGCGCCGGCTGTCTTCGc < 8:127104/149‑1 (MQ=255) gggCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTaa > 4:311638/1‑56 (MQ=255) gggCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTaa < 3:311638/56‑1 (MQ=255) gggCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAATCTACCCGATAGAGCCGGTGGGGTGGCAGGGCGCCGGCTGTCTTCGCCTTAc < 3:36787/148‑1 (MQ=255) ggCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAATCTACCCGATAGAGCCGGTGGGGTGGCAGGGCGCCGGCTGTCTTCGCCTTACCt < 4:302042/149‑1 (MQ=255) gAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAATCTACCCGATAGAGCCGGTGGGGTGGCAGGGCGCCGGCTGTCTTCGCCTTACCt > 7:126305/1‑143 (MQ=255) gAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAATCTACCCGATAGAGCCGGTGGGGTGGCAGGGCGCCGGCTGTCTTCGCCTTACCt < 8:126305/143‑1 (MQ=255) aGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAATCTACCCGATAGAGCCGGTGGGGTGGCAGGGCGCCGGCTGTCTTCGc < 8:47210/135‑1 (MQ=255) aGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAATCTACCCGATAGAGCCGGTGGGGTGGCAGGGCGCCGGCTGTCTTCGc > 7:47210/1‑135 (MQ=255) aGGCATGAAGCAGTCCTTATCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAATCTACCCGATAGAGCCGGTGGGGTGGCAGGGCGCCGGCTGTCTTCGCCTTACCTGACGTTc < 6:30295/149‑1 (MQ=255) aGGCATGAAGCAGTCCTTATCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAATCTACCCGATAGAGCCGGTGGGGTGGCAGGGCGCCGGCTGTCTTCGCCTTACCTGACGTTc < 6:24955/149‑1 (MQ=255) aTGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAATCTACCCGATAGAGCCGGTGGGGTGGCAGGGCGCCGGCTGTCTTCGCCTTACCTGACGTTCGtct > 4:5407/1‑149 (MQ=255) gAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAATCTACCCGATAGAGCCGGTGGGGTGGCAGGGCGCCGGCTGTCTTCGCCTTACCTGACGTTCGtctc > 4:27286/1‑148 (MQ=255) gCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAATCTACCCGATAGAGCCGGTGGGGTGGCAGGGCGCCGGCTGTCTTCGCCTTACCTGACGTTCGTCTCAAgg > 2:194416/1‑149 (MQ=255) aGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCACCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAATCAACCCGATAGAGCCGGTGGGGTGGCAGGGCGCCGGCTGTCTTCGCCTTACCTGACGATCCTCTCAAGGCt > 3:58193/1‑149 (MQ=255) cTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAATCTACCCGATAGAGCCGGTGGGGTGGCAGGGCGCCGGCTGTCTTCGCCTTACCTGACGTTCGTCTCAAGGCTTTTa > 2:331804/1‑149 (MQ=255) ttGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAATCTACCCGATAGAGCCGGTGGGGTGGCAGGGCGCCGGCTGTCTTCGCCTTACCTGACGTTCGTCTCAAGGCtttt > 4:227394/1‑147 (MQ=255) ttGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAATCTACCCGATAGAGCCGGTGGGGTGGCAGGGCGCCGGCTGTCTTCGCCTTACCTGACGTTCGTCTCAAGGCtttt < 3:227394/147‑1 (MQ=255) | TTGCCCGAGCCGGACACGCCGGTGAACACCACCAAGGCGTCGCGGGGGATATCGACATCGATGTTCTTCAGGTTGTGCTCGCGGGCGCCACGGACGCGGATGAAACCGCTTGGGGTGGTCGGGCTTGGAGGCATGAAGCAGTCCTTGTCTGAAGCTGAGCAGTGCGCTCAAGTTAACAGCAATTGCAGCGCCCTTGCGTGGGCAGCAGTCAAGGAATCTACCCGATAGAGCCGGTGGGGTGGCAGGGCGCCGGCTGTCTTCGCCTTACCTGACGTTCGTCTCAAGGCTTTTA > NC_002947/3476579‑3476870 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |