Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,591,021 | G→A | 6.4% | A73T (GCC→ACC) | PP_3169 → | membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,591,021 | 0 | G | A | 6.4% | 184.8 / 2.1 | 62 | A73T (GCC→ACC) | PP_3169 | membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (29/29); new base A (2/2); total (31/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.67e-01 |
ACGCTCGCTGCTGTATGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGGGTATACCTTGCCCAG‑GCTTTTTTTGGCGTTCTGGCTGGTATTGGTAACCCATCCGGTGCTCGACGCCTTCACGGTTTACGGCACGCAGTTGTTCTGGCCTTTGCACACCACCCC > NC_002947/3590876‑3591169 | aCGCTCGCTGCTGTATGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCct < 2:80693/149‑1 (MQ=255) gctcgctGCTGTATGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCctgg < 5:147713/149‑1 (MQ=255) gctgctGTATGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCctggctgg < 8:234066/149‑1 (MQ=255) ctgctgTATGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGt < 7:346000/149‑1 (MQ=255) ctgTATGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCaa > 6:271394/1‑149 (MQ=255) gTATGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACa > 2:363374/1‑149 (MQ=255) tATGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAg < 7:26268/149‑1 (MQ=255) aTGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGAccagccag < 4:177026/140‑7 (MQ=255) aTGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGAccagccag > 3:177026/1‑134 (MQ=255) tGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGgc < 6:359119/149‑1 (MQ=255) tGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCt > 4:290281/1‑149 (MQ=255) tGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCt > 2:48720/1‑149 (MQ=255) cagcaCTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTgg > 3:99777/1‑149 (MQ=255) ggCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCctgg < 3:124630/123‑1 (MQ=255) ggCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGAGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCctgg > 4:124630/1‑123 (MQ=255) gCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAg < 5:84977/149‑1 (MQ=255) cACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAgg < 5:266745/149‑1 (MQ=255) aCGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAggg < 5:191373/149‑1 (MQ=255) aCGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAggg < 8:273959/149‑1 (MQ=255) aCGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAggg < 5:26708/149‑1 (MQ=255) aCGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAggg < 4:99777/149‑1 (MQ=255) gCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGGGt < 1:48720/149‑1 (MQ=255) gCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGGGt < 3:290281/149‑1 (MQ=255) ccTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCACCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGTATACCCCTTGc < 7:54167/149‑1 (MQ=255) cTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGGTATTCTCCCACTCGTTGTACGTGCTAACCGGCCTCGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCACGGCAAGGGGTATACCTTGc > 1:285911/1‑149 (MQ=255) cTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGACCAGCCAGGCCAACAg < 3:108538/119‑1 (MQ=255) cTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGACCAGCCAGGCCAACAg > 4:108538/1‑119 (MQ=255) tGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGTCCCGGCAAGGGGTATACCTTGcc > 7:117865/1‑148 (MQ=255) gATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGGGTATACCTTGCCCAg > 6:183375/1‑149 (MQ=255) aTGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGGGTATACCTTGCCCAg‑g < 5:271394/149‑1 (MQ=255) tgATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGccc < 2:15550/122‑1 (MQ=255) tgATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGccc > 1:15550/1‑122 (MQ=255) aTCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGGGTATACCTTGCCCAG‑GCtttt > 3:12627/1‑149 (MQ=255) aTTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGGGTATACCTTGCCCAG‑GCtttttt < 5:129175/148‑1 (MQ=255) gCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGGGTATACCTTGCCCAG‑GCTTTTTTTGGCg > 5:300036/1‑149 (MQ=255) tATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGGGTATACCTTGCCCAG‑GCTTTTTTTGGCGt > 5:340250/1‑148 (MQ=255) tGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGGGTATACCTTGCCCAG‑GCTTTTTTTGGCGTTc < 4:12627/148‑1 (MQ=255) gCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGGGTATACCTTGCCCAG‑GCTTTTTTTGGCGTTct > 4:229733/1‑148 (MQ=255) gCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGGGTATACCTTGCCCAG‑GCTTTTTTTGGCGTTct < 3:229733/148‑1 (MQ=255) cGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATGGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGGGTATACCTTGCCCAG‑GCTTTTTTTg > 1:207315/1‑139 (MQ=255) cGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGGGTATACCTTGCCCAG‑GCTTTTTTTg < 2:207315/139‑1 (MQ=255) ccGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGGGTATACCTTGCCCAG‑GCTTTTTTTGGCGTTctggctgg > 2:80208/1‑148 (MQ=255) cGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGGGTATACCTTGCCCAG‑GCTTTTTTTGGCGTTCTTGCTGGTa > 6:328094/1‑149 (MQ=255) tCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGc < 4:243403/99‑1 (MQ=255) tCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGc > 3:243403/1‑99 (MQ=255) gACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCCGCAAGGGGTATACCTTGCCCAG‑GCTTTTTTTGGCGTGCTGGCTGGTATTGGTAACCAATc > 6:208501/1‑149 (MQ=255) cTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGGGTATACCTTGCCCAG‑GCTTTTTTTGGCGTTCTGGCTGGTATTGGTAACCCATCCg < 5:183375/149‑1 (MQ=255) ttATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGGGTATACCTTGCCCAG‑GCTTTTTTTGGCGTTctggct > 7:189308/1‑129 (MQ=255) ttATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGGGTATACCTTGCCCAG‑GCTTTTTTTGGCGTTctggct < 8:189308/129‑1 (MQ=255) tcatcGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGGGTATACCTTGCCCAG‑GCTTTTTTTGGCGTTCTGGCTGGTATTGGTAACCCATCCGGTGc > 5:349783/1‑149 (MQ=255) tcGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGGGTATACCTTGCCCAG‑GCTTTTTTTGGCGTTCTGGCTGGTATTGGTAACCCATCCGGTGCTCg < 1:363374/149‑1 (MQ=255) tcCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGGGTATACCTTGCCCAG‑GCTTTTTTTGGCGTTCTGGCTGGTATTGGTAACCCATCCGGTGCTCGACGCCTTCAc > 2:309459/1‑149 (MQ=255) ccACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGGGTATACCTTGCCCAG‑GCTTTTTTTGGCGTTCTGGCTGGTATTGGTAACCCATCCGGTGCTCGACGCCTTCACgg > 1:180548/1‑149 (MQ=255) ccACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGGGTATACCTTGCCCAG‑GCTTTTTTTGGCGTTCTGGCTGGTATTGGTAACCCATCCGGTGCTCGACGCCTTCACgg > 1:174823/1‑149 (MQ=255) aCTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGGGTATACCTTGCCCAG‑GCTTTTTTTGGCGTTCTGGCTGGTATTGGTAACCCATCCGGTGCTCGAc > 7:295104/1‑137 (MQ=255) aCTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGGGTATACCTTGCCCAG‑GCTTTTTTTGGCGTTCTGGCTGGTATTGGTAACCCATCCGGTGCTCGAc < 8:295104/137‑1 (MQ=255) tCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGGGTATACCTTGCCCAG‑GCTTTTTTTGGCGTTCTGGCTGGTATTGGTAACCCATCCGGTGCTCGACGCCTTCACGGTTTACGGCACGCAgttg > 4:307758/1‑149 (MQ=255) aCCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGGGTATACCTTGCCCAG‑GCTTTTTTTGGCGTTCTGGCTGGTATTGGTAACCCATCCGGTGCTCGACGCCTTCACGGTTTACGGCACGCAgttgtt > 6:204639/1‑149 (MQ=255) gcctggcctTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGGGTATACCTTGCCCAG‑GCTTTTTTTGGCGTTCTGGCTGGTATTGGTAACCCATCCGGTGCTCGACGCCTTCACGGTTTACGGCACGCAGTTGTTCTgg < 6:349783/149‑1 (MQ=255) ttGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGGGTATACCTTGCCCAGAGCTTTTTTTGGCGTTCTGGCTGGTATTGGTAACCCATCCGGTGCTCGACGCCTTCACGGTTTACGGCACGCAGTTGTTCTGGCCTTTGCAcacca > 1:96084/1‑149 (MQ=255) ttGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGGGTATACCTTGCCCAG‑GCTTTTTTTGGCGTTCTGGCTGGTATTGGTAACCCATCCGGTGCTCGACGCCTTCACGGTTTACGGCACGCAGTTGTTc < 4:24962/132‑1 (MQ=255) ttGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGGGTATACCTTGCCCAG‑GCTTTTTTTGGCGTTCTGGCTGGTATTGGTAACCCATCCGGTGCTCGACGCCTTCACGGTTTACGGCACGCAGTTGTTc > 3:24962/1‑132 (MQ=255) gCCTGGCTGGTCAACAGTCGCTGGCCCGGCAAGTGGTATACCTTGCCCAG‑GCt < 3:94908/53‑1 (MQ=255) gCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGGGTATACCTTGCCCAG‑GCTTTTTTTGGCGTTCTGACTGGTATTGGTAACCCATCCGGTGCTCGACGCCTTCACGGTTTACGGCACGCAGTTGTTCTGGCCTTTGCACACCAcccc > 2:128471/1‑149 (MQ=255) gCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTCGCCCGGCAAGGGGTATACCTTGCCCAG‑GCt > 4:94908/1‑53 (MQ=255) | ACGCTCGCTGCTGTATGGTGCAGCACTGGGCACGCTGCCGGACCTGGATGTGATCATTCGCTATGCCGACCCGGTGTCGCAGATGACTTATCATCGCGG‑CTTCTCCCACTCGTTGTTCGTGCTCACCGGCCTGGCCTTGCTGTTGGCCTGGCTGGTCAACAGGCGCTGGCCCGGCAAGGGGTATACCTTGCCCAG‑GCTTTTTTTGGCGTTCTGGCTGGTATTGGTAACCCATCCGGTGCTCGACGCCTTCACGGTTTACGGCACGCAGTTGTTCTGGCCTTTGCACACCACCCC > NC_002947/3590876‑3591169 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |