Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,965,661 | C→G | 7.8% | intergenic (+67/‑147) | PP_3496 → / → ydcP | endoribonuclease L‑PSP/peptidase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,965,661 | 0 | C | G | 7.8% | 193.5 / 4.2 | 63 | intergenic (+67/‑147) | PP_3496/ydcP | endoribonuclease L‑PSP/peptidase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (26/31); new base G (3/2); total (29/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.58e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.28e-01 |
GGTGCGTGCGGCGGTGGGTGTGGCTTCACTGGCCTTTGAAGGCATGCGTGTGGAAGTGACGGCGATGGCTGCCAAGCGCTGAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTACCCGCAGCCAATCCCGCACCTCTCGGCACCCCAATGATGCCGCCAGCCCGTTTCACCGCTACAATGCCCGCCTAAACCGTGACAGCCCGAAAATATAACGAC > NC_002947/3965513‑3965807 | ggTGCGTGCGGCGGTGGGTGTGGCTTCACTGGGCATTGAAGGCATGCGTGTGGAAGTGACGGCGATGGCTGCCAAGCGCTGAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGctc > 1:240301/1‑149 (MQ=255) gtgcgGCGGTGGGTGTGGCTTCACTGGCCTTTGAAGGCATGCGTGTGGAAGTGACGGCGATGGCTGCCAAGCGCTGAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCgg > 6:374342/1‑149 (MQ=255) cggcggTGGGTGTGGCTTCACTGGCCTTTGAAGGCATGCGTGTGGAAGTGACGGCGATGGCTGCCAAGCGCTGAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGccc < 4:135985/149‑1 (MQ=255) gtgggtgTGGCTTCACTGGCCTTTGAAGGCATGCGTGTGGAAGTGACGGCGATGGCTGCCAAGCGCTGAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTcg < 1:7466/149‑1 (MQ=255) gCTTCACTGGCCTTTGAAGGCATGCGTGTGGAAGTGACGGCGATGGCTGCCAAGCGCTGAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGa > 4:74463/1‑143 (MQ=255) gCTTCACTGGCCTTTGAAGGCATGCGTGTGGAAGTGACGGCGATGGCTGCCAAGCGCTGAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGa < 3:74463/143‑1 (MQ=255) gCTTCACTGGCCTTTGAAGGCATGCGTGTGGAAGTGACGGCGATGGCTGCCAAGCGCTGAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAg > 5:186300/1‑149 (MQ=255) gCTTCACTGGCCTTTGAAGGCATGCGTGTGGAAGTGACGGCGATGGCTGCCAAGCGCTGAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAg < 3:285686/149‑1 (MQ=255) ttCACTGGCCTTTGAAGGCATGCGTGTGGAAGTGACGGCGATGGCTGCCAAGCGCTGAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGc > 3:71747/1‑149 (MQ=255) tGGCCTTTGAAGGCATGCGTGTGGAAGTGACGGCGATGGCTGCCAAGCGCTGAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTc > 7:119605/1‑149 (MQ=255) gCCTATGAAGGGATCCTTGTGGATGGGACGGCTTTGGCTGCCTTGCGCTTAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCTACATGGGTGTTTGGTGGGAAAATCGACGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTTGGCCGCTc < 4:9714/147‑1 (MQ=255) cTTTGAAGGCATGCGTGTGGAAGTGACGGCGATGGCTGCCAAGCGCTGAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCca > 8:50690/1‑148 (MQ=255) cTTTGAAGGCATGCGTGTGGAAGTGACGGCGATGGCTGCCAAGCGCTGAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCAGAGCGGccccg > 2:245331/1‑124 (MQ=255) cTTTGAAGGCATGCGTGTGGAAGTGACGGCGATGGCTGCCAAGCGCTGAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCAGAGCGGccccg < 1:245331/126‑3 (MQ=255) tttGAAGGCATGCGTGTGGAAGTGACGGCGATGGCTGCCAAGCGCTGAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCAGAGCGGccccgg < 2:111378/126‑4 (MQ=255) tttGAAGGCATGCGTGTGGAAGTGACGGCGATGGCTGCCAAGCGCTGAGCTGCGCTTGTGGGGATGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCAGAGCGGccccgg > 1:111378/1‑123 (MQ=255) tGAAGGCATGCGTGTGGAAGTGACGGCGATGGCTGCCAAGCGCTGAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCcaca < 3:344374/147‑1 (MQ=255) aGGCATGGGTGTGGAAGTGACGTGGATGGCTTCCAAGCGCTTAGCTTCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACTTCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTg < 4:71747/148‑1 (MQ=38) gCATGCGTGTGGAAGTGACGGCGATGGCTGCCAAGCGCTGAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTgcgc < 7:50690/149‑1 (MQ=255) gCATGCGTGTGGAAGTGACGGCGATGGCTGCCAAGCGCTGAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTgcgc < 7:496/149‑1 (MQ=255) gCATGCGTGTGGAAGTGACGGCGATGGCTGCCAAGCGCTGAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTgcgc < 5:374342/149‑1 (MQ=255) gCGTGTGGAAGTGACGGCGATGGCTGCCAAGCGCTGAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTAc > 4:309600/1‑149 (MQ=255) tgtgGAAGTGACGGCGATGGCTGCCAAGCGCTGAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTACCCg > 2:72773/1‑149 (MQ=255) tgGAAGTGCCGGCTTTGGCTGCCAAGCGCTGAGCGGCGCTTGTGGGGGTGCTCAGGGCCCCGACATCTCTTATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTACCCGCa < 8:119605/149‑1 (MQ=38) ggAAGTGACGGCGATGGCTGCCAAGCGCTGAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTACCCGCAg < 2:240301/149‑1 (MQ=255) gAAGTGACGGCGATGGCTGCCAAGCGCTGAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTACCCGCAg < 8:350692/148‑1 (MQ=255) cGGCGATGGCTGCCAAGCGCTGAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTACCCGCAGCCAATccc > 3:237579/1‑149 (MQ=255) ggCGAGGTCTGCCAAGCGCGGAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGAGTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTATGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACATTTGCGCGTACCCGCAGCCAATCCCg < 8:4660/149‑1 (MQ=255) gATGGCTGCCAAGCGCTGAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTACCCGCAGCCAATCCCGCAc > 1:274094/1‑149 (MQ=255) cTGCCAAGCGCTGAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTACCCGCAGCCAATCCCGCACCtctc > 6:325043/1‑149 (MQ=255) cTGCCAAGCGCTGAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTACCCGCAGCCAATCCCGCACCtctc < 6:186300/149‑1 (MQ=255) tGCCAAGCGCTGAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGtt > 4:116007/1‑117 (MQ=255) tGCCAAGCGCTGAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGtt < 3:116007/117‑1 (MQ=255) ccAAGCGCTGAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTAccc < 6:260825/125‑1 (MQ=255) ccAAGCGCTGAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTAccc > 5:260825/1‑125 (MQ=255) ccAAGCGCTGAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTACCCGCAGCCAATCCCGCACCTCTCgg < 2:17997/148‑1 (MQ=255) ccAAGCGCTGAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTACCCGCAGCCAATCCCGCACCTCTCg < 2:274094/147‑1 (MQ=255) aaGCGCTGAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTACCCGCAGCCAATCCCGCACCTCTCGGCAc > 6:89198/1‑149 (MQ=255) gcTGAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTACCCGCAGCCAATCCCGCAc > 4:90065/1‑135 (MQ=255) gcTGAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTACCCGCAGCCAATCCCGCAc < 3:90065/135‑1 (MQ=255) cTGAGCGGCGCTGGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTACCCGCAGCCAATCCCGCACCTCTCGGCACCCCaa < 6:280613/149‑1 (MQ=255) aGCTGCGCTTGTGGGGTTGCTCAGCGCCGCGAGATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGAAGCAAGGCCGCTCGCTCATTTTCGCGTACCCTCAGCCAATCCCGGACGTCTCGGGAGCCCTat < 2:106853/147‑1 (MQ=25) ttGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTACCCGCAGCCAATCCCGCACCTCTCGGCACCCCAATGATGCCGCCa > 3:106259/1‑149 (MQ=255) gTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTACCCGCAGCCAATCCCGCACCTCTCg > 7:228608/1‑121 (MQ=255) gTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTACCCGCAGCCAATCCCGCACCTCTCg < 8:228608/121‑1 (MQ=255) cGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTACCCGCAGCCAATCCCGCACCTCTCGGCACCCCAATGATGCCGCCAGCCCGTTTCACCGCTACAATg > 4:28986/1‑149 (MQ=255) gACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTACCCGCAGCCAATCCCGCACCTCTCGGCACCCCAATGATGCCGCCAGCCCGTTTCACCGCTACAATGc > 5:350344/1‑149 (MQ=255) aCATCGGTGTTTGGTCGGAAATTCGCCGGGTCGGCTCTGCGGCACTTTCGCGACGCTATGCCGCTCCCACATTTGCGCGTACCCGCAGCCAATCCCGCACCTCTCGGCACCCCAATGATGCCGCCAGGCCGTTTCACCGCTACAATGcc < 1:45627/149‑1 (MQ=255) cATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTACCCGCAGCCAATCCCGCACCTCTCGGCACCCCAATGATGCCGCCAGCCCGTTTCACCGCTACAATGccc < 4:106259/149‑1 (MQ=255) tCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTACCCGCAGCCAATCCCGCACCTCTCGGCACCCCAATGATGCCGCCAGCCCGTTTCACCGCTACAATGCCCGc < 3:333288/149‑1 (MQ=255) cGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTACCCGCAGCCAATCCCGCACCTCTCGGCAcccc < 6:343837/109‑1 (MQ=255) cGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTACCCGCAGCCAATCCCGCACCTCTCGGCAcccc > 5:343837/1‑109 (MQ=255) tGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTACCCGCAGCCAATCCCGCACCTCTCGGCACCCCAATGATGCCGCCAGCCCGTTTCACCGCTACAATGCCCGCCTa > 2:119166/1‑148 (MQ=255) gTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTACCCGCAGCCAATCCCGCACCTCTCGGCACCCCAATGATGCCGCCAGCCCGTTTCACCGCTACAATGCCCGCCTAAACCGt > 3:242058/1‑148 (MQ=255) gCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTACCCGCAGCCAATCCCGCACCTCTCGGCACCCCAATGATGCCGCCAGCCCGTTTCACCGCTACAATGCCCGCCTAAACCGTGAc < 3:309600/148‑1 (MQ=255) gCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTACCCGCAGCCAATCCCGCACCTCTCGGCACCCCAATGATGCCGCCAGCCCGTTTCACCGCTACAATGCCCGCCTAAACCGTGACa > 8:171558/1‑149 (MQ=255) aaTCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTACCCGCAGCCAATCCCGCACCTCTCGGCACCCCAACGATGCCGCCAGCCCGTTTCACCGCTACAATGCCCGCCTAAACCGTGACAGccc < 4:237579/149‑1 (MQ=255) gaaagggCCGCAGAGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTACCCGCAGCCAATCCCGCACCTCTCGGCACCCCAATGATGCCGCCAGCCCGTTTCACCGCTACAATGCCCGCCTAAACCGTGACAGCCCGaa > 3:31280/5‑148 (MQ=255) gggCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTACCCGCAGCCAATCCCGCACCTCTCGGCACCCCAATGATGCCGCCAGCCCGGTTCACCGCTACAATGCCCGCCTAAACCGTGACAGCCCGAAAata > 5:203218/1‑148 (MQ=255) ggCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTACCCGCAGCCAATCCCGCACCTCTCGGCACCCCAATGATGCCGCCAGCCCGTTTCACCGCTACAATGCCCGCCTAAACCGTGACAGCCCGaaa < 2:343674/144‑1 (MQ=255) ggCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTACCCGCAGCCAATCCCGCACCTCTCGGCACCCCAATGATGCCGCCAGCCCGTTTCACCGCTACAATGCCCGCCTAAACCGTGACAGCCCGaaa > 1:343674/1‑144 (MQ=255) ccGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTACCCGCAGCCAATCCCGCACCTCTCGGCACCCCAATGATGCCGCCAGCCCGTTTCACCGCTACAATGCCCGCCTAAACCGTGACAGCCCGAAAATATaa < 7:171558/148‑1 (MQ=255) ccGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTACCCGCAGCCAATCCCGCACCTCTCGGCACCCCAATGATGCCGCCAGCCCGTTTCACCGCTACAATGCCCGCCTAAACCGTGACAGCCCGAAAATATAAc < 5:325043/149‑1 (MQ=255) cGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTACCCGCAGCCAATCCCGCACCTCTCGCCCCCCCAATGATGCCGCCAGCCCGTTTCACAGCTACAATGCCCGCCTAAAACGTGACAGCCCGAAAATATAACg > 8:279078/1‑149 (MQ=255) ctctGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTACCCGCAGCCAATCCCGCACCTCTCGGCACCCCAATGATGCCGCCAGCCCGTTTCACCGCTACAATGCCCGCCTAAACCGTGACAGCCCGAAAATATAACGAc < 5:89198/149‑1 (MQ=255) | GGTGCGTGCGGCGGTGGGTGTGGCTTCACTGGCCTTTGAAGGCATGCGTGTGGAAGTGACGGCGATGGCTGCCAAGCGCTGAGCTGCGCTTGTGGGGGTGCGCAGCGCCCCGACATCGCTGATTGGTCGCAAAATCGCCGGGGCCGCTCTGCGGCCCTTTCGCGACGCTAGGCCGCTCCCACAGTTGCGCGTACCCGCAGCCAATCCCGCACCTCTCGGCACCCCAATGATGCCGCCAGCCCGTTTCACCGCTACAATGCCCGCCTAAACCGTGACAGCCCGAAAATATAACGAC > NC_002947/3965513‑3965807 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |