| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,244,986 | C→A | 6.6% | G12V (GGC→GTC) | aruH ← | arginine‑‑pyruvate transaminase AruH |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,244,986 | 0 | C | A | 6.6% | 230.6 / 2.0 | 72 | G12V (GGC→GTC) | aruH | arginine‑‑pyruvate transaminase AruH |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/32); new base A (3/2); total (38/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATACGGTGTACAAATCGGCGAGCAACGCGCCGTTGATTTCTTCCATCTCGGCCT > NC_002947/4244839‑4245133 | ccAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGcc > 8:226855/1‑149 (MQ=255)ccAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTATCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGcc > 1:270595/1‑149 (MQ=255) cgcAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGAt < 7:131976/149‑1 (MQ=255) gcAGGCTGTCGTTGGCCGCCTCGACGTTAGGCGCGGGAGTGTCGAAGGCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCCCAGCCTTCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCATCGCCGGCGACGGCGCTg < 7:54108/149‑1 (MQ=255) gCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGtt > 2:58604/1‑149 (MQ=255) gCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGGCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGtt < 8:261072/149‑1 (MQ=255) gccTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGc < 2:270595/149‑1 (MQ=255) cTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCg > 7:102267/1‑148 (MQ=255) tCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCg > 1:62961/1‑147 (MQ=255) acgaTAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAgcg < 5:203198/149‑1 (MQ=255) acgaTAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAgcg > 3:54469/1‑149 (MQ=255) gcgcGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGt > 3:63194/1‑127 (MQ=255) gcgcGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGt < 4:63194/127‑1 (MQ=255) gggAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAAtct > 2:143847/1‑149 (MQ=255) aGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCt < 1:143847/149‑1 (MQ=255) aGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCt < 6:161598/149‑1 (MQ=255) gtgtCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCtt > 8:339740/1‑149 (MQ=255) tgtCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCtt < 7:226855/148‑1 (MQ=255) gAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAAt < 8:102267/149‑1 (MQ=255) tCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGc > 4:257822/1‑148 (MQ=255) ggTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGc < 1:327658/115‑1 (MQ=255) ggTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGc > 2:327658/1‑115 (MQ=255) gTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAAttt > 6:116562/1‑148 (MQ=255) tCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCa < 4:54469/149‑1 (MQ=255) cccccaccGACACCAGCAGGATGTCCTTGTCCCCAGCCTGCATCGCCACGGCGCGGTATTGGATGTCCCACGCCGCATCGCCGTCGCCGGCGAAGCGTTGGGGGATCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAg < 2:62961/147‑1 (MQ=255) accGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTcgac > 7:90595/1‑149 (MQ=255) cGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTcgacga < 5:158234/149‑1 (MQ=255) cagcagGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCt > 4:116980/1‑149 (MQ=255) cagcagGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCt > 2:10498/1‑149 (MQ=255) agcagGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCtt > 4:146917/1‑149 (MQ=255) gcagGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTc < 1:58604/149‑1 (MQ=255) agGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCgg < 2:108616/149‑1 (MQ=255) gATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGt > 4:63392/1‑149 (MQ=255) gtccttgtcctCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGt > 2:201288/1‑136 (MQ=255) gtccttgtcctCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGt < 1:201288/136‑1 (MQ=255) ccttgtcctCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGaa > 7:211476/1‑149 (MQ=255) cttgtcctCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGCTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAAt > 1:1393/1‑149 (MQ=255) ttgtcctCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGaa < 6:15568/147‑1 (MQ=255) ttgtcctCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGaa > 5:15568/1‑147 (MQ=255) ttgtcctCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAAtt > 4:300427/1‑149 (MQ=255) ttgtcctCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAAtt > 2:362801/1‑149 (MQ=255) gtcctCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGc > 1:154799/1‑149 (MQ=255) tCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGAGGTAGTGGATGTACCAGGCCGAAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGAGAGCTT‑GGCGTAGCGCATCTCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTagaa > 4:144035/1‑121 (MQ=255) aGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATa < 3:63392/149‑1 (MQ=255) ccTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATACg > 7:296717/1‑149 (MQ=255) cTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTc > 7:218299/1‑127 (MQ=255) cTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTc < 8:218299/127‑1 (MQ=255) cAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATACGgtgt < 7:339740/149‑1 (MQ=255) cgcCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATACGGTGTAc > 5:37532/1‑148 (MQ=255) ccAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTAGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATACGGTGTACaaa > 1:340872/1‑149 (MQ=255) gcgcGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATACGGTGTACAAATCGGc < 8:296717/149‑1 (MQ=255) gcgcGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATACGGTGTACAAATCGGc < 3:257822/149‑1 (MQ=255) gcgGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATACGGTGTACAAATCGGCGa < 1:10498/149‑1 (MQ=255) gATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGt > 2:312239/1‑89 (MQ=255) gATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGt < 1:312239/89‑1 (MQ=255) gATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATACGGTGTACAAATCGGCGAGCAACgcgc > 4:161576/1‑149 (MQ=255) ccAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGTGGTTAGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCaa < 1:55575/77‑1 (MQ=255) ccAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCaa > 2:55575/1‑76 (MQ=255) ccAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTc > 2:212516/1‑97 (MQ=255) ccAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTc < 1:212516/97‑1 (MQ=255) ccAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGGATTGCCCCTTACGTGGTACAAATCGGCGAGAACGGCGCCGTTGa > 3:38984/1‑149 (MQ=255) ccAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCAGGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATACGGTGTACAAATCGGCGAGCAACGCGCCGTTg < 4:328456/148‑1 (MQ=255) ccaacGCATCGCCGGCGACGGCGCTGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATACGGTGTACAAATCGGCGAGCAACGCGCCGTTGAtt > 6:204041/5‑149 (MQ=255) aGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATACGGTGTACAAATCGGCGAGCAACGCGCCGTTGAtt > 7:75922/1‑149 (MQ=255) aacGCATCGCCGGCGACGGCGCTGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATACGGTGTACAAATCGGCGAGCAAc < 3:38355/133‑1 (MQ=255) aacGCATCGCCGGCGACGGCGCTGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTAGGGTTGGAATTGCCCCATACGGTGTACAAATCGGCGAGCAAc > 4:38355/3‑135 (MQ=255) ccGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATACGGTGTACAAATCGGCGAGCAACGCGCCGTTGATttct < 8:75922/149‑1 (MQ=255) ccGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATACGGTGTACAAATCGGCGAGCAACGCGCCGTTGATttct < 2:154799/149‑1 (MQ=255) cGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATACGGTGTACAAATCGGCGAGCAACGCGCCGTTGATttctt < 5:116562/149‑1 (MQ=255) gCAGAGCGGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGAAGTGTATCTTCGGGTTGGTATTGCCCCATACGGTGTAGAAATCGGCGAGCAACGCGCCGTTGATttcttc < 2:340872/149‑1 (MQ=255) tcgcCGGCGACGGCGCTGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATACGGTGTACAAATCGGCGAGCAACGCGCCGTTGATTTCTTCCa > 5:243001/2‑148 (MQ=255) cgcCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATACGGTGTACAAATCGGCGAGCAACGCGCCGTTGATTTCTTCCAtc < 3:300427/149‑1 (MQ=255) cGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATACGGTGTACAAATCGGCGAGCAACGCGCCGTTGATTTCTTCCATCTCg > 1:146434/1‑149 (MQ=255) gCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCACCATACGGTGTACAAATCGGCGAGCAACGCGCCGTTGATTTCTTCCATCTCGGCCt > 5:65612/1‑149 (MQ=255) | CCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTT‑GGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATACGGTGTACAAATCGGCGAGCAACGCGCCGTTGATTTCTTCCATCTCGGCCT > NC_002947/4244839‑4245133 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |