Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,321,067 | A→G | 7.9% | intergenic (‑303/‑115) | PP_3791 ← / → PP_5629 | site‑specific recombinase/protease/amidase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,321,067 | 0 | A | G | 7.9% | 176.9 / 5.0 | 63 | intergenic (‑303/‑115) | PP_3791/PP_5629 | site‑specific recombinase/protease/amidase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (28/30); new base G (2/3); total (30/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.61e-01 |
CTGGAGTCAATTGCGTGTTATCTAAGATGCGTCAGCTTCGCTTTCGCCCTCATAATCGTAGTCAATCAAGCTTGCCGACACTTGACAAATTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGCT‑AGCTGA‑‑ACCTTGATGTCTGTTTGAAGCCGCCGTACGCTATCGGCATTCATGGAGGAATCTGGCTGATGGCACGCGTGGGTTTGATACTGACACCG > NC_002947/4320920‑4321211 | cTGGAGTCAATTGCGTGTTATCTAAGATGCGTCAGCTTCGCTTTCGCCCTCATAATCGTAGTCAATCAAGCTTGCCGACACTTGACAAATTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGaa > 8:319788/1‑149 (MQ=255) cTGGAGTCAATTGCGTGTTATCTAAGATGCGTCAGCTTCGCTTTCGCCCTCATAATCGTAGTCAATCAAGCTTGCCGACACTTGACAAATTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGaa > 4:133808/1‑149 (MQ=255) gAGTCAATTGCGTGTTATCTAAGATGCGTCAGCTTCGCTTTCGCCCTCATAATCGTAGTCAATCAAGCTTGCCGACACTTGACAAATTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAAt < 8:327939/147‑1 (MQ=255) gAGTCAATTGAGTGTTATATAAGATGCGTCAGCTTCTCTTTCGCCCTCATAATCGTAGTCAATCAAGCTTGCCTACACTTGACAAATTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATc < 3:249038/148‑1 (MQ=255) aGTCAATTGCGTGTTATCTAAGATGCGTCAGCTTCGCTTTCGCCCTCATAATTGTAGTCAATCAAGCTTGCCGACACTTGACAAATTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGTAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATcc > 4:59664/1‑148 (MQ=255) gTCAATTGCGTGTTATCTAAGATGCGTCAGCTTCGCTTTCGCCCTCATAATCGTAGTCAATCAAGCTTGCCGACACTTGACAAATTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCaa > 6:372707/1‑149 (MQ=255) tCAATTGCGTGTTATCTAAGATGCGTCAGCTTCGCTTTCGCCCTCCTAATCGTAGTCAATCAAGCTTGCCGACACTTGACAAATTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCaa > 2:131489/1‑148 (MQ=255) aTTGCGTGTTATCTAAGATGCGTCAGCTTCGCTTTCGCCCTCATAATCGTAGTCAATCAAGCTTGCCGACACTTGACAAATTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATc > 1:345640/1‑149 (MQ=255) cGTGTTATCTAAGATGCGTCAGCTTCGCTTTCGCCCTCATAATCGTAGTCAATCAAGCTTGCCGACACTTGACAAATTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGGATTCAATATcgaaa < 8:75897/149‑4 (MQ=255) cGTGTTATCTAAGATGCGTCAGCTTCGCTTTCGCCCTCATAATCGTAGTCAATCAAGCTTGCCGACACTTGACAAATTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGa > 4:318016/1‑149 (MQ=255) gtTATCTAAGATGCGTCAGCTTCGCTTTCGCCCTCATAATCGTAGTCAATCAAGCTTGCCGACACTTGACAAATTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCg > 2:313258/1‑149 (MQ=255) aTCTAAGATGCGTCAGCTTCGCTTTCGCCCTCATAATCGTAGTCAATCAAGCTTGCCGACACTTGACAAATTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGGATTCAATATcgaaatt < 5:367676/145‑6 (MQ=255) aTCTAAGATGCGTCAGCTTCGCTTTCGCCCTCATAATCGTAGTCAATCAAGCTTGCCGACACTTGACAAATTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGGATTCAATATcgaaatt > 6:367676/1‑140 (MQ=255) aTCTAAGATGCGTCAGCTTCGCTTTCGCCCTCATAATCGTAGTCAATCAAGCTTGCCGACACTTGACAAATTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCggg < 1:313258/148‑1 (MQ=255) cTAAGATGCGTCAGCTTCGCTTTCGCCCTCATAATCGTAGTCAATCAAGCTTGCCGACACTTGACAAATTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGaa > 4:169743/1‑148 (MQ=255) tAAGATGCGTCAGCTTCGCTTTCGCCCTCATAATCGTAGTCAATCAAGCTTGCCGACACTTGACAAATTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGa > 4:228571/1‑146 (MQ=255) tAAGATGCGTCAGCTTCGCTTTCGCCCTCATAATCGTAGTCAATCAAGCTTGCCGACACTTGACAAATTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGa < 3:228571/146‑1 (MQ=255) tAAGATGCGTCAGCTTCGCTTTCGCCATCATAATCGTAGTCAATCAAGCTTGCCCACACTTCACAAATTTCAAAATACCCTAACGCCCTGGTTCCAGCACCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAAca > 2:106352/1‑149 (MQ=255) aGATGCGTCAGCTTCGCTTTCGCCCTCATAATCGTAGTCAATCAAGCTTGCCGACACTTGACAAATTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAAc < 7:319788/146‑1 (MQ=255) gATGCGTCAGCTTCGCTTTCGCCCTCATAATCGTAGTCAATCAAGCTTGCCGACACTTGACAAATTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAAcatca < 3:318016/149‑1 (MQ=255) tGCGTCAGCTTCGCTTTCGCCCTCATAATCGTAGTCAATCAAGCTTGCCGACACTTGACAAATTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACatcatc < 3:133808/149‑1 (MQ=255) tCGCTTTCGCCCTCCTAATCGTAGTCAATCAAGCTTGCCGACACTTGACAAATTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTa < 1:131489/149‑1 (MQ=255) gCCCTCATAATCGTAGTCAATCAAGCTTGCCGACACTTGACAAATTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑GCGATATTGGATTCAATATcgaaa < 8:283059/117‑4 (MQ=255) gCCCTCATAATCGTAGTCAATCAAGCTTGCCGACACTTGACAAATTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑GCGATATTGGATTCAATATcgaaa > 7:283059/1‑114 (MQ=255) ccTCATAATCGTAGTCAATCAAGCTTGCCGACACTTGACAAATTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGc > 5:93008/1‑149 (MQ=255) ccTCATAATCGTAGTCAATCAAGCTTGCCGACACTTGACAAATTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGc < 5:372707/149‑1 (MQ=255) aTAATCGTAGTCAATCAAGCTTGCCGACACTTGACAAATTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGCT‑a < 4:206764/147‑1 (MQ=255) tAATCGTAGTCAATCAAGCTTGCCGACACTTGACAAATTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGCT‑AGCt < 1:342107/149‑1 (MQ=255) gTAGTCAATCAAGCTTGCCGACACTTGACAAATTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGCT‑AGCTGA‑‑Ac < 3:266311/148‑1 (MQ=255) gTCAATCAAGCTTGCCGACACTTGACAAATTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGCT‑AGCTGA‑‑ACCtt > 6:173587/1‑148 (MQ=255) aatcaaGCTTGCCGACACTTGACAAATTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGCT‑AGCTGA‑‑ACCTTGAt < 6:54580/148‑1 (MQ=255) aatcaaGCTTGCCGACACTTGACAAATTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGCT‑AGCTGA‑‑ACCTTGATg > 3:78066/1‑149 (MQ=255) atcaaGCTTGCCGACACTTGACAAATTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGCT‑AGCTGA‑‑ACCTTGATGt > 2:354138/1‑149 (MQ=255) caaGCTTGCCGACACTTGACAAATTTC‑AATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAAcatca < 6:158160/107‑1 (MQ=255) caaGCTTGCCGACACTTGACAAATTTC‑AATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAAcatca > 5:158160/1‑107 (MQ=255) gCTTGCCGACACTTGACAAATTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGCT‑AGCTGA‑‑ACCTTGATGTCTGtt < 2:345640/149‑1 (MQ=255) cacTTGACAAATTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGTAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGCT‑AGCTGA‑‑ACCTTGATGTCTGTTTGAAgccgc < 3:59664/149‑1 (MQ=255) ttGACAAATTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGCT‑AGCTGA‑‑ACCTTGATGTCTGTTTGAAGccgccg > 1:147828/1‑148 (MQ=255) ttGACAAATTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGCT‑AGCTGA‑‑ACCTTGATGTCTGTTTGAAGccgccg > 3:17290/1‑148 (MQ=255) aaaTTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGCT‑AGCTGA‑‑ACCTTGATGTCTGTTTGAAGCCGCCGTActc > 4:363822/1‑146 (MQ=255) aaTTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGCT‑AGCTGA‑‑ACCTTGATGTCTGTTTGAAGCCGCCGTACGCTa > 8:238012/1‑149 (MQ=255) tttCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGCT‑AGCTGA‑‑ACCTTGATGTCTGTTTGAAGCCGCCGTACGCTATc > 1:82592/1‑149 (MQ=255) ttACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATTGTCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGCT‑AGCTGA‑‑ACCTTGATGTCTGTTTGAAGCCGCCGTACGCTATCGGCAtt > 1:256587/1‑149 (MQ=255) aCCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGCT‑AGCTGA‑‑ACCTTGATGTCTGTTTGAAGCCGCCGTACGCTATCGGCATTCa < 3:169743/148‑1 (MQ=255) cccTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGCT‑AGCTGA‑‑ACCTTGATGTCTGTTTGAAGCCGCCGTACGCTATCGGCATTCATg < 6:135518/149‑1 (MQ=255) cTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGCT‑AGCTGA‑‑ACCTTGATGTCTGTTTGAAGCCGCCGTACGCTATCGGCATTCATgga < 4:17290/149‑1 (MQ=255) tAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGCT‑AGCTGA‑‑ACCTTGATGTCTGTTTGAAGCCGCCGTACGCTATCGGCATTCATgg > 8:289117/1‑147 (MQ=255) tAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGCT‑AGCTGA‑‑ACCTTGATGTCTGTTTGAAGCCGCCGTACGCTATCGGCATTCATgg < 7:289117/147‑1 (MQ=255) gCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGCT‑AGCTGA‑‑ACCTTGATGTCTGTTTGAAGCCGCCGTACGCTATCGGCATTCATGGAGGAAt < 5:173587/149‑1 (MQ=255) ccTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGCT‑AGCTGA‑‑ACCTTGATGTCTGTTTGAAGCCGCCGTACGCTATCGGCATTCATgg < 3:62136/141‑1 (MQ=255) ccTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGCT‑AGCTGA‑‑ACCTTGATGTCTGTTTGAAGCCGCCGTACGCTATCGGCATTCATgg > 4:62136/1‑141 (MQ=255) cTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGCT‑AGCTGA‑‑ACCTTGATGTCTGTTTGAAGCCGCCGTACGCTATCGGCATTCATGGAGGAATCTg < 4:78066/149‑1 (MQ=255) ccAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGCT‑AGCTGA‑‑ACCTTGATGTCTGTTTGAAGCCGCCGTACGCTATCGGCATTCATGGAGGAATCTGGCTGAt < 2:82592/149‑1 (MQ=255) agcatcACATTTTTATTAATT‑TCGATATTGAATACAATATAGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATTAGCACCGCT‑AGCTTATCTCCTTGATGTCTGTTTGAAGCCGCCGTACGCTATCGGCATTCATGGAGGAATCTGGCTGAt < 1:106352/149‑1 (MQ=255) agcagcACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGCT‑AGCTGA‑‑ACCTTGATGTCTGTTTGAAGCCGCCGTACGCTATCGGCATTCATGGAGGAATCTGGCTGATgg > 7:172294/1‑149 (MQ=255) gcaCAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGCT‑AGCTGA‑‑ACCTTGATGTCTGTTTGAAGCCGCCGTACGCTATCGGCATTCATGGAGGAATCTGGCTGATGGCAcg > 7:162960/1‑149 (MQ=255) ttCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGCT‑AGCTGA‑‑ACCTTGATGTCTGTTTGAAGCCGCCGTACGCTATCGGCATTCATGGAGGAATCTGGCTGATGGCAc < 7:302045/140‑1 (MQ=255) ttCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGCT‑AGCTGA‑‑ACCTTGATGTCTGTTTGAAGCCGCCGTACGCTATCGGCATTCATGGAGGAATCTGGCTGATGGCAc > 8:302045/1‑140 (MQ=255) ttCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGCT‑AGCTGA‑‑ACCTTGATGTCTGTTTGAAGCCGCCGTACGCTATCGGCATTCATGGAGGAATCTGGCTGATGGCACGCGTGGGtt < 6:93008/149‑1 (MQ=255) ttAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGCT‑AGCTGA‑‑ACCTTGATGTCTGTTTGAAGCCGCCGTACGCTATCGGCATTCATGGAGGAATCTGGc > 7:319886/1‑128 (MQ=255) ttAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGCT‑AGCTGA‑‑ACCTTGATGTCTGTTTGAAGCCGCCGTACGCTATCGGCATTCATGGAGGAATCTGGc < 8:319886/128‑1 (MQ=255) aaTT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGCT‑AGCTGA‑‑ACCTTGATGTCTGTTTGAAGCCGCCGTACGCTATCGGCATTCATGGAGGAATCTGGCTGATGGCACGCGTGGGTTTg < 7:238012/146‑1 (MQ=255) tt‑tCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGCT‑AGCTGA‑‑ACCTTGATGTCTGTTTGAAGCCGCCGTACGCTATCGGCATTCATGGAGGAATCTGGCTGATGGCACGCGTGGGTTTGATACt > 7:94913/1‑149 (MQ=255) tt‑tCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGCT‑AGCTGA‑‑ACCTTGATGTCTGTTTGAAGCCGCCGTACGCTATCGGCATTCATGGAGGAATCTGGCTGATGGCACGCGTGGGTTTGATACt < 1:354138/149‑1 (MQ=255) ttGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGCTAAGCTGA‑‑ACCTTGATGTCTGTTTGAAGCCGCCGTACGCTATCGGCATTCATGGAGGAATCTGGCTGATGGCACGCGTGGGTTTGATACTGACACCg > 1:280943/1‑149 (MQ=255) | CTGGAGTCAATTGCGTGTTATCTAAGATGCGTCAGCTTCGCTTTCGCCCTCATAATCGTAGTCAATCAAGCTTGCCGACACTTGACAAATTTCAAATTACCCTAAGGCCCTGGTGCCAGCAGCACAGTATTCTTAATT‑TCGATATTGAATCCAATATCGCGACCGGGAACATCATCCTCCCTTCTATGAGCACCGCT‑AGCTGA‑‑ACCTTGATGTCTGTTTGAAGCCGCCGTACGCTATCGGCATTCATGGAGGAATCTGGCTGATGGCACGCGTGGGTTTGATACTGACACCG > NC_002947/4320920‑4321211 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |