| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,341,849 | T→A | 7.2% | I161N (ATC→AAC) ‡ | PP_3815 → | polyamine ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,341,849 | 0 | T | A | 7.2% | 204.9 / 5.2 | 70 | I161N (ATC→AAC) ‡ | PP_3815 | polyamine ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (23/41); new base A (2/3); total (26/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.95e-01 | |||||||||||
CCTGGTGCCCAAGGGCTGGGGCCGTTGGCTGCTGAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCGACCATGCACGCCATCGACCCGATGGTGCTGCAGGCAGGTTCGATCTGT > NC_002947/4341703‑4341991 | ccTGGTGCCCAAGGGCTGGGGCCGTTGGCTGCTGAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCatcatc > 6:348305/1‑148 (MQ=255) cccAAGGGCTGGGGCCGTTGGCTGCTGAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGAGCACCTACTCGTTGCTGGTTATGCTGCATAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTAATGGCCATGGGCCTCAGCGATGcccc > 6:92948/1‑149 (MQ=255) ccAAGGGCTGGGGCCGTTGGCTGCTGAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCGATGATGccca < 5:366148/148‑2 (MQ=255) ccAAGGGCTGGGGCCGTTGGCTGCTGAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCGATGATGccca > 6:366148/1‑147 (MQ=255) aaGGGCTGGGGCCGTTGGCTGCTGAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCGATGATGcccatgg < 2:86307/149‑5 (MQ=255) aaGGGCTGGGGCCGTTGGCTGCTGAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCt > 5:28967/1‑149 (MQ=255) aGGGCTGGGGCCGTTGGCTGCTGAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTg < 3:164492/149‑1 (MQ=255) gggCCGTTTGCTGCTGAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCTGCCTGCTGGCGCGCACCTAGTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGTTCAACAAGGCGTTGATGTCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATg < 5:158115/148‑1 (MQ=255) ggacGTTGGCTGCTGAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTTGCGCGCACCTACTCGTTGCTTGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCAATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGt < 5:92948/146‑1 (MQ=255) ggCCGTTGGCTGCTGAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGt < 5:69033/149‑1 (MQ=255) ggCTGCTGAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCTGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACaa < 2:11271/148‑1 (MQ=255) ggCTGCTGAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACaa < 5:304972/148‑1 (MQ=255) gctgctGAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAAc < 6:28967/148‑1 (MQ=255) ctgctgAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAAc < 3:119092/147‑1 (MQ=255) ctgctgAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAAc > 4:119092/1‑147 (MQ=255) ctgctgAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCt < 6:295244/149‑1 (MQ=255) aTCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACGTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGGAGAGCTCGGGCGTGATGAACAAGGGGTTGATGGCCCTGGGCAGCATCGATGCCGCGCGGGAAATGGTGCACCACCGCGCCGGCGt > 4:200417/1‑149 (MQ=255) aTCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGt < 4:244799/149‑1 (MQ=255) tCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTg < 3:153756/149‑1 (MQ=255) gTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTgg < 8:104955/148‑1 (MQ=255) gTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTgg < 5:125769/148‑1 (MQ=255) ctgTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCg < 7:208958/148‑1 (MQ=255) tgTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGt < 1:144051/139‑1 (MQ=255) tgTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGt > 2:144051/1‑139 (MQ=255) gTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCa > 3:155373/1‑149 (MQ=255) gTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCa > 7:155343/1‑149 (MQ=255) gATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCGATGATGcccatg > 6:310888/1‑104 (MQ=255) gATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCGATGATGcccatg < 5:310888/107‑4 (MQ=255) gATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGa < 3:233267/149‑1 (MQ=255) tgtgGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGc < 8:290911/149‑1 (MQ=255) tgtgGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCAGCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGc < 5:370216/149‑1 (MQ=255) tgGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTa < 5:98616/149‑1 (MQ=255) ggACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGTCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTAc < 8:174614/149‑1 (MQ=255) gCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATg > 5:4691/1‑149 (MQ=255) ctgGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATccc < 1:245407/149‑1 (MQ=255) ctgGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATccc < 4:155373/149‑1 (MQ=255) tgGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATg > 5:125641/1‑98 (MQ=255) tgGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATg < 6:125641/98‑1 (MQ=255) gcgcACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCa > 8:280670/1‑149 (MQ=255) gcgcACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCa < 7:333627/149‑1 (MQ=255) gcgcACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCa < 3:166033/149‑1 (MQ=255) gcACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATc < 6:4691/149‑1 (MQ=255) aCCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGt > 5:35298/1‑149 (MQ=255) gTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCa > 6:270773/1‑113 (MQ=255) gTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCa < 5:270773/113‑1 (MQ=255) gCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTg > 7:311255/1‑148 (MQ=255) gTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAg < 8:155343/147‑1 (MQ=255) gctgctgcAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAg < 8:229239/145‑1 (MQ=255) gctgctgcAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAg > 7:229239/1‑145 (MQ=255) tgctgcAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCGAc > 3:246911/1‑148 (MQ=255) tgcAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCGACCATg > 8:217811/1‑149 (MQ=255) agagCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCGACCATGCAc > 5:185000/1‑149 (MQ=255) agagCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCGACCATGCAc < 7:217811/149‑1 (MQ=255) gCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAgg > 4:293511/1‑129 (MQ=255) gCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAgg < 3:293511/129‑1 (MQ=255) gCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCGACCATGCACGCCATCGAc < 3:200417/149‑1 (MQ=255) gCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCGACCATGCACGCCATCGAc < 6:185000/149‑1 (MQ=255) tCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCGACCATGCACGCCATCGACCCGATg > 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gTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGtgctg < 2:79151/103‑1 (MQ=255) gTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGtgctg > 1:79151/1‑103 (MQ=255) ttGATGGCCATGGGCATCATGGATGCCCGGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTTCATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCGACCATGCACGCCATCGACCCGATGGTGCTgcaggc < 6:4224/149‑1 (MQ=255) ccATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCGACCATGCACGCCATCGACCCGATGGTGCTGCAGGCAGGtt < 6:359015/147‑1 (MQ=255) ccATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCGACCATGCACGCCATCGACCCGATGGTGCTGCAGGCAGGtt > 5:359015/1‑147 (MQ=255) ccATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCGACCATGCACGCCATCGACCCGATGGTGCTGCAGGCAGGTTCg > 8:92760/1‑149 (MQ=255) aTGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCGACCATGCACGCCATCGACCCGATGGTGCTGCAGGCAGGTTCGAt < 7:92760/149‑1 (MQ=255) gCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCGACCATGCACGCCATCGACCCGATGGTGCTGCAGGCAGGTTCGATCtgt < 2:29782/149‑1 (MQ=255) atcGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCGACCATGCACGCCATc > 2:142119/1‑111 (MQ=255) atcGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCGACCATGCACGCCATc < 1:142119/111‑1 (MQ=255) | CCTGGTGCCCAAGGGCTGGGGCCGTTGGCTGCTGAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCGACCATGCACGCCATCGACCCGATGGTGCTGCAGGCAGGTTCGATCTGT > NC_002947/4341703‑4341991 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |