Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 6,013,885 | T→C | intergenic (+90/+20) | xpt → / ← PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 6,013,885 | 0 | T | C | 100.0% | 69.4 / NA | 21 | intergenic (+90/+20) | xpt/PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (7/14); total (7/14) |
CTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCTGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCA > NC_002947/6013745‑6014025 | cTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGTCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGTAGCGGGCGTGCCCGCGAATg < 8:110651/148‑1 (MQ=255) ggcgcgGGACGGTGGTGGGGTCAGCTTCATCGAATACACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGAGCAGCACAGGGCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCtttt < 8:58520/146‑1 (MQ=37) acggtggtGGGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGTAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGtt < 4:107537/146‑1 (MQ=255) gtggtCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACCCCCCCGCCCACAGGTGCCGCACAGGTCTCGAACGCGGTGGCGTGACGGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGCATTGCCGCCACCCATTTATAATGTTggcgcccg > 4:57251/1‑146 (MQ=255) cAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCg < 3:157261/148‑1 (MQ=255) cTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCCCCCCCCCACCCACACGTGCAGCCCACGGGTGGCACGCGGTGGCGGGCCGGTGGGGGCGGGCGGGCCCCCGCAAGGGCCCCACCCGTTTTTATGGTTTGCGCccccccccccc > 4:39036/1‑147 (MQ=255) tCGAATAACCGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCcaacaac < 3:57251/148‑1 (MQ=255) aaccgcgACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACCGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGGGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAgcgc < 5:156651/145‑1 (MQ=255) cTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGACCGCTGTGCCGTACCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGttc < 1:108499/148‑1 (MQ=255) ttCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGttctt < 4:24101/146‑1 (MQ=255) tCCCACAGGTGCCGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCCACACCCAGCGCTGGTACAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTg > 7:111920/1‑148 (MQ=39) tCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCGTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTg > 4:154978/1‑148 (MQ=255) caccGGGGCAGCCCAGGTCGCGAACGCTGTGCCGAACCTGTGGGCGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGc < 7:169/146‑1 (MQ=255) acaGGGCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCTCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCg < 6:182214/148‑1 (MQ=255) gTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGcc > 5:41891/1‑146 (MQ=255) gCCGTACCTGTGGGCGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACCAGCGCTGGGAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCa < 3:47050/146‑1 (MQ=255) cGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATAcc < 3:39036/148‑1 (MQ=255) cGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATAc < 5:92793/147‑1 (MQ=255) cTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGTCAGCAACACTTTTATATGGTTGCCGCCAGCCCCTCCAACAACAAGAGCTTGTAAAGTTCTTCTTTAATCCCCTGAGGCTGCCACAACTGCATCAGCACAAGGTGGCTTTCATACCCATcc > 8:140463/1‑148 (MQ=255) aGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCg < 4:138645/148‑1 (MQ=255) gCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATCCCCCTCCGGCCCCGGTGCa > 1:181450/1‑148 (MQ=255) | CTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCTGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCA > NC_002947/6013745‑6014025 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |