| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,186,057 | Δ1 bp | 5.2% | coding (403/1716 nt) | aceK ← | isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,186,057 | 0 | G | . | 5.2% | 246.1 / 6.5 | 77 | coding (403/1716 nt) | aceK | isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (32/41); new base . (2/2); total (34/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.93e-01 | |||||||||||
GCGCAGTTGTTCTTCCAGCCGCGCCAGGTCGCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGCCAACTCGTCGTCCAGGCGGGGGTCGATCAGGTGGATATAGGC > NC_002947/5185914‑5186201 | gcgcAGTTGTTCTTCCAGCCGCGCCAGGTCGCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCTCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCcgc < 8:287903/149‑1 (MQ=255)gcgcAGTTGTTCTTCCAGCCGCGCCAGGGCGCCATCCAGGTCTCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCcgc < 8:282754/149‑1 (MQ=255) cAGTTGTTCTTCCAGCCGCGCCAGGTCGCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCa < 6:191669/149‑1 (MQ=255) aGTTGTTCTTCCAGCCGCGCCAGGTCGCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCAt > 8:298830/1‑149 (MQ=255) gttCTTCCAGCCGCGCCAGGTCGCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCgcgc > 5:162982/1‑143 (MQ=255) gttCTTCCAGCCGCGCCAGGTCGCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCgcgc < 6:162982/143‑1 (MQ=255) ttcttcCAGCCGCGCCAGGTCGCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGaa < 5:313440/148‑1 (MQ=255) ttcCAGCCGCGCCAGGTCGCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGcc > 2:161214/1‑149 (MQ=255) ttcCAGCCGCGCCAGGTCGCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGcc > 4:110112/1‑149 (MQ=255) ccAGCCGCGCCAGGTCGCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCg < 1:161214/148‑1 (MQ=255) cAGCCGCGCCAGGTCGCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCggg > 6:386021/1‑149 (MQ=255) cAGCCGCGCCAGGTCGCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCgg < 5:19081/148‑1 (MQ=255) gCCGCGCCAGGTCGCCTTCCCGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCgcgc < 1:23783/134‑1 (MQ=255) gCCGCGCCAGGTCGCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCgcgc > 2:23783/1‑134 (MQ=255) gCCGCGCCAGGTCGCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTa < 3:110112/149‑1 (MQ=255) ccGCGCCAGGTCGCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAg < 5:84576/149‑1 (MQ=255) cAGGTCGCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGa < 2:282819/149‑1 (MQ=255) ctgcagCCCTCCCGCTCGCCCTAGCGCATGTCCAACGGGGACTCGGCGCACCCCGCGCGCAGCACGTTCCTGCCACCGCCGTCCAGCCGATCGGTCCGGGTGTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAACGCCGGGTAGTGCGGAt < 8:348848/144‑1 (MQ=255) atgTCGCCGTCCTGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCTGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGAt < 4:55078/147‑1 (MQ=255) gTCGCCTTCCAGGTAGCCATAGGGCATGTCGTACGGGTAATCGGCGAACAGCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCTAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGGGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGGATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGa < 4:145931/149‑1 (MQ=255) tCGCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAgg > 5:231420/1‑131 (MQ=255) tCGCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAgg < 6:231420/131‑1 (MQ=255) tCGCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTATTGTGGAt > 7:348848/1‑146 (MQ=255) gCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCgg > 4:372437/1‑133 (MQ=255) gCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCgg < 3:372437/133‑1 (MQ=255) gCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAAc < 3:145566/148‑1 (MQ=255) aGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑C‑CGCGAGCGCGCCGCGCaaaccc > 7:186985/1‑115 (MQ=38) aGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑C‑CGCGAGCGCGCCGCGCaaaccc < 8:186985/120‑6 (MQ=38) cATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAgg > 7:190729/1‑148 (MQ=255) aagTCGAACGTGTAATCGTCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCTTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGt < 8:141611/146‑1 (MQ=255) gAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATgg < 7:298830/148‑1 (MQ=255) gAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGc > 7:347792/1‑149 (MQ=255) aCGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTg < 8:190729/149‑1 (MQ=255) aaTCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCACATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATc < 7:281352/131‑1 (MQ=255) aaTCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCACATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATc > 8:281352/1‑131 (MQ=255) tCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTa > 4:31133/1‑99 (MQ=255) tCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCt > 4:95285/1‑149 (MQ=255) cGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAgg < 4:83963/91‑1 (MQ=255) cGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAgg > 3:83963/1‑91 (MQ=255) gCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGc > 1:8328/1‑148 (MQ=255) gCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCAGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCTTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGc > 8:173549/1‑148 (MQ=255) gAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCaaa < 5:386021/149‑1 (MQ=255) aaCACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCaaaa > 1:15265/1‑149 (MQ=255) acacCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCaaaa > 7:108891/1‑148 (MQ=255) cacCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACAGCCGTCAAGCCGATAGCTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGAG‑GCCGCGCATCCAAGGCCCGGTAGAGTGGAAGAACAAGCAGCCGTCGCTGAACAGGTCAAGGCTGAAGACGCTGCAAAACa > 6:69482/1‑149 (MQ=255) acCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATgg < 6:258069/129‑1 (MQ=255) acCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAg > 4:211704/1‑149 (MQ=255) cgcgcgCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGAAAAACAGc > 3:91391/1‑148 (MQ=255) caAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTAcc < 6:388913/149‑1 (MQ=255) caAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTAc > 2:56595/1‑148 (MQ=255) caAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTAc > 4:31716/1‑148 (MQ=255) aaGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTTCGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCa < 5:69482/149‑1 (MQ=255) aaGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCa < 2:129919/149‑1 (MQ=255) aGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAg < 5:127973/149‑1 (MQ=255) ttCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGt > 3:22105/1‑139 (MQ=255) ttCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGt < 4:22105/139‑1 (MQ=255) tGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTctct > 1:249755/1‑149 (MQ=255) cgaCTGCCGTCATGGCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GGCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGc < 4:56008/148‑1 (MQ=255) agaCTTCCGTCAAGCCTAGAGTTACGTGTTTGCGCGG‑CGAGCTCGCG‑TCCGCTCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGTATTAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGTCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCTAGTTGTACCAGGTctct < 4:91391/147‑1 (MQ=255) agaCTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTctct < 3:95285/147‑1 (MQ=255) gaCTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGcc < 3:211704/149‑1 (MQ=255) aCTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGcc > 5:257426/1‑148 (MQ=255) ccGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGCCAACtc < 8:347792/149‑1 (MQ=255) ccGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGCCAACtc < 2:8328/149‑1 (MQ=255) cGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGCCAACtcg < 2:15265/149‑1 (MQ=255) ccGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGCCAACTCGTCGTCCa < 2:249755/149‑1 (MQ=255) gATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAGACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGCCAACTCGTCGTCCAgg > 5:342879/1‑149 (MQ=255) aCGCGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGACGGGTAGTGTGGAAGAACATGCAGCCGTCGCTGATCATGTCATGGATGAAGAGGCTACAAAACAGCGAATTGTACGAGGTATCTGACAACTCGACGTCCAGGCGGGGGt > 2:268989/1‑149 (MQ=255) cGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGCCAACTCGTCGTCCAGGCGGGGGt < 3:31716/148‑1 (MQ=255) tttGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAATACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGCCAACTCGTCGTCCAGGCGGGGGTCGATc < 6:342879/149‑1 (MQ=255) atGCGCGGCCGCGAGCGC‑‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGtt < 2:135566/104‑1 (MQ=255) atGCGCGGCCGCGAGCGC‑‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGtt > 1:135566/2‑105 (MQ=255) tGCGCGGCCGCGAGCGC‑‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGCCAACTCGTCGTCCAGGCgggg > 4:193199/1‑140 (MQ=255) tGCGCGGCCGCGAGCGC‑‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGCCAACTCGTCGTCCAGGCgggg < 3:193199/140‑1 (MQ=255) gcgg‑cgcgCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGCCAACTCGTCGTCCAGGCGGGGGTCGATCAGGTg < 6:257426/149‑1 (MQ=255) tCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGCCAACTCGTCGTCCAGGCGGGGGTCGATCAGGTGGATATAg > 2:254876/1‑147 (MQ=255) tCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCGGAAGAGGCTGCAAACCCGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGCCAACTCGTCGTCCAGGCGGGGGTCGAGCAGGTGGATATAGGc > 2:373473/1‑149 (MQ=255) | GCGCAGTTGTTCTTCCAGCCGCGCCAGGTCGCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGCCAACTCGTCGTCCAGGCGGGGGTCGATCAGGTGGATATAGGC > NC_002947/5185914‑5186201 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |