Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 185,364 | Δ1 bp | 6.2% | coding (249/957 nt) | PP_0161 ← | putative transmembrane sensor |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 185,364 | 0 | T | . | 6.2% | 207.8 / 6.7 | 65 | coding (249/957 nt) | PP_0161 | putative transmembrane sensor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (31/30); new base . (2/2); total (33/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CGAGCCATCGGGCAGGGTGAAGACGCGTCGCTCGCCCGTGCCGGTGGCA‑TAGTCTGACGTCCAGGCACTCACAGTATCGAGGTCTTTGGCCAGCCAGCTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGTCAAGGTCCTTATGAAGGTGAACCATACGCTGCCAGGCCTGTTCGTTTTCGTGGTGGCTGCTGCGCCATTGCGCGC > NC_002947/185220‑185512 | cGAGCCATCGGGCAGGGTGAAGACGCGTCGCTCGCCCGTGCCGGTGGCA‑TAGTCTGACGTCCAGGCACTCACAGTATCGAGGTCTTTGGCCAGCCAGCTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGAc > 4:35096/1‑149 (MQ=255) gCAGGGTGAAGACGCGTCGCTCGCCCGTGCCGGTGGCA‑TAGTCTGACGTCCAGGCACTCACAGTATCGAGGTCTTTGGCCAGCCAGCTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGgcgc < 8:98782/149‑1 (MQ=255) ggTGAAGACGCGTCGCTCGCCCGTGCCGGTGGCATTAGTCTGACGTCCAGGCACTCACAGTATCGAGGTCTTTGGCCAGCCAGCTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGCCGGCG‑CAGGCgctgc > 1:242684/1‑149 (MQ=255) ggTGAAGACGCGTCGCTCGCCCGTGCCGGTGGCA‑TAGTCTGACGTCCAGGCACTCACAGTATCGAGGTCTTTGGCCAGCCAGCTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTG‑CGCCGTCGACAGGCgctgaa < 7:188325/149‑3 (MQ=255) tGAAGACGCGTCGCTCGCCCGTGCCGGTGGCA‑TAGTCTGACGTCCAGGCACTCACAGTATCGAGGTCTTTGGCCAGCCAGCTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTgctgg > 5:83075/1‑149 (MQ=255) aGACGCGTCGCTCGCCCGTGCCGGTGGCA‑TAGTCTGACGTCCAGGCACTCACAGTATCGAGGTCTTTGGCCAGCCAGCTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTgctggctg < 4:359357/149‑1 (MQ=255) aGACGCGTCGCTCGCCCGTGCCGGTGGCA‑TAGGCTGACGTCCAGGCACTCACAGTATCGAGGTCTTTGGCCAGCCAGCTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTgctggctg < 3:23197/149‑1 (MQ=255) gACGCGTCGCTCGCCCGTGCCGGTGGCA‑TAGTCTGACGTCCAGGCACTCACAGTATCGAGGTCTTTGGCCAGCCAGCTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGctggctgg > 3:353395/1‑149 (MQ=255) tcgctcgcCCGTGCCGGTGGCA‑TAGTCTGACGTCCAGGCACTCACAGTATCGAGGTCTTTGGCCAGCCAGCTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCa < 4:353395/149‑1 (MQ=255) tcgctcgcCCGTGCCGGTGGCA‑TAGTCTGACGTCCAGGCACTCACAGTATCGAGGTCTTTGGCCAGCCAGCTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCa < 5:82750/149‑1 (MQ=255) tcgctcacCCGTGCCGGTGGCA‑TAGTCTGACGTCCAGGCACTCACAGTATCGAGGTCTTTGGCCAGCCAGCTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCa < 3:294058/149‑1 (MQ=255) cgctcgcCCGTGCCGGTTTCA‑TAGTCTGACGTCCAGGCAGTCACAGTATCGAGGTCTTTGGCCAGCCAGCTCGCCTTCCCTTCCATGACAACGCCACCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAg < 3:268315/149‑1 (MQ=255) gctcgcCCGTGCCGGTGGCA‑TAGTCTGACGTCCAGGCACTCACAGTATCGAGGTCTTTGGCCAGCCAGCTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAg < 2:242684/148‑1 (MQ=255) ccGTGCCGGTGGCA‑TAGTCTGACGTCCAGGCACTCACAGTATCGAGGTCTTTGGCCAGCCAGCTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTg > 3:332972/1‑148 (MQ=255) ccGGTGGCA‑TAGTCTGACGTCCAGGCACTCACAGTATCGAGGTCTTTGGCCAGCCAGCTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGc < 4:109466/149‑1 (MQ=255) ggTGGCA‑TAGTCTGACGTCCAGGCACTCACAGTATCGAGGTCTTTGGCCAGCCAGCTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCa < 6:41130/149‑1 (MQ=255) gTGGCA‑TAGTCTGACGTCCAGGCACTCAGAGTATCGAGGTCTTTGGCCAGCCAGCTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGc > 1:214040/1‑146 (MQ=255) gTGGCA‑TAGTCTGACGTCCAGGCACTCACAGTATCGAGGTCTTTGGCCAGCCAGCTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGc < 2:214040/146‑1 (MQ=255) tGACGTCCAGGCACTCACAGTATCGAGGTCTTTGGCCAGCCAGCTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCgctgc > 2:114519/1‑109 (MQ=255) cGTCCAGGCACTCACAGTATCGAGGTCTTTGGCCAGCCAGCTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGa < 7:249832/149‑1 (MQ=255) aCTCACAGTATCGAGGTCTTTGGCCAGCCAGCTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCa < 3:35096/149‑1 (MQ=255) aCTCACAGTATCGAGGTCTTTGGCCAGCCAGCTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCa < 4:332972/149‑1 (MQ=255) aCTCACAGTATCGAGGTCTTTGGCCAGCCAGCTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCa < 4:98155/149‑1 (MQ=255) tCACAGTATCGAGGTCTTTGGCCAGCCAGCTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAgg > 7:170046/1‑149 (MQ=255) cacaGTATCGAGGTCTTTGGCCCGCCAGCTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGt > 2:242602/1‑149 (MQ=255) gAGGTCTTTGGCCAGCCAGCTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGTCAAGGTCCt > 6:187072/1‑149 (MQ=255) ggTCTTTGGCCAGCCAGCTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCa > 2:204413/1‑135 (MQ=255) ggTCTTTGGCCAGCCAGCTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCa < 1:204413/135‑1 (MQ=255) gTCTTTGGCCAGCCAGCTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGTCAAGGTCCTTAt > 6:159986/1‑149 (MQ=255) tttGGCCAGCCAGCTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGTCAAGGTCCTTATg > 4:70637/1‑147 (MQ=255) tttGGCCAGCCAGCTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCA‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGTCAAGGTCCTTATg > 8:234093/1‑147 (MQ=255) gccagccaGCTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGTCAAGGTCCTTATGAAGGt > 1:187352/1‑148 (MQ=255) gccagccaGCTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGTCAAGGTCCTTATGAAGGt < 4:129927/148‑1 (MQ=255) cagccagcTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGTCAAGGTCCTTATGAAGGTGaa > 7:203646/1‑149 (MQ=255) cagccagcTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGGGAAGGTCCTTATGAAGGTgca > 8:311370/1‑147 (MQ=255) cagcTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATa > 4:242901/1‑114 (MQ=255) cagcTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATa < 3:242901/114‑1 (MQ=255) cagcTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGTCAAGGTCCTTATGaa > 1:161683/1‑139 (MQ=255) cagcTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGTCAAGGTCCTTATGaa < 2:161683/139‑1 (MQ=255) gcTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGTCAAGGTCCTTATGAAGGTGAAc < 4:252347/144‑1 (MQ=255) gcTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGTCAAGGTCCTTATGAAGGTGAAc > 3:252347/1‑144 (MQ=255) tCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGTCAAGGTCCTTa < 1:80938/131‑1 (MQ=255) tCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGTCAAGGTCCTTa > 2:80938/1‑131 (MQ=255) tCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGTCAAGGTCCTTATGAAGGTGAACCATACGc > 3:360304/1‑149 (MQ=255) gACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGTCAAGGTCCTTATGAAGGt < 6:272066/133‑1 (MQ=255) gACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGTCAAGGTCCTTATGAAGGt > 5:272066/1‑133 (MQ=255) ccTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGTCAAGGTCCTTATGAAgg > 2:35394/1‑129 (MQ=255) ccTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGTCAAGGTCCTTATGAAGGTGAACCATACGCTGCCAGGc < 2:369691/149‑1 (MQ=255) ccTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGCATAGCGCGCAGGTCAAGGTCCTTATGAAgg < 1:35394/129‑1 (MQ=255) cTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGTCAAGGTCCTTATGAAGGTGCACCATACGCTGCCAGGcc > 4:41694/1‑149 (MQ=255) aaCGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGTCAAGGTCCTTATGAAGGTGAACCATACGCTGcc > 6:212179/1‑134 (MQ=255) aaCGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGTCAAGGTCCTTATGAAGGTGAACCATACGCTGcc < 5:212179/134‑1 (MQ=255) aaCGCCGCCAAGCAGCTTAAGCGCCTTTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTTGCTCGTATCAAGTGACTGCAATGCCAGCCCCGCACCCGGGATAGCGCGAAGGTGAAGGTCCTTATGAATGTGAACCATACGCTGCCAGGCCTGTTCGttt > 5:259313/1‑148 (MQ=255) aCGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGTCAAGGTCCTTATGAAGGTGAACCATACGCTGCCAGGCCTGTTCGTTTTc < 3:70637/149‑1 (MQ=255) gccgccAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGTCAAGGTCCTTATGAAGGTGAACCATACGCTGCCAGGCCTGTTCGTTTTCgt < 6:83075/149‑1 (MQ=255) gccAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCA‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGTCAAGGTCCTTATGAAGGTGAACCATACGCTGCCAGGCCTGTTCGTTTTCgtggt < 7:234093/149‑1 (MQ=255) ccAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGTCAAGGTCCTTATGAAGGTGAACCATACGCTGCCAGGCCTGTTCGTTTTCgtggtg > 7:279912/1‑149 (MQ=255) cAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGTCAAGGTCCTTATGAAGGTGAACCATACGCTGCCAg < 4:173378/128‑1 (MQ=255) ccagcAGCGCCTG‑CGCCGTCGACAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGTCAAGGTCCTTATGAAGGTGAACCATACGCTGCCAGGCCTGTTCGTTTTCGTGGTGGctgctg > 6:20027/5‑149 (MQ=255) cTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGTCAAGGTCCTTATGAAGGTGAACCATACGCTGCCAGGCCTGTTCGTTTTCGTGGTGGCtgctgc > 1:365367/1‑149 (MQ=255) agcAGCGCCTG‑CGCCGTCGACAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGTCAAGGTCCTTATGAAGGTGAACCATACGCTGCCAGGCCTGTTCGTTTTCgt < 1:241788/134‑1 (MQ=255) agcAGCGCCTG‑CGCCGTCGACAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGTCAAGCTCCTTATGAAGGTGAACCATACGCTGCCAGGCCTGTTCGTTTTCgt > 2:241788/3‑136 (MQ=255) tCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGTCAAGGTCCTTATGAAGGTGAACCATACGCTGCCAGGCCTGTTCGTTTTCGTGGTGGCTGCTgcgc > 3:163349/1‑149 (MQ=255) cgcCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGTCAAGGTCCTTATGAAGGTGAACCATACGCTGCCTGGCCTGTTCGTTTTCGTGGTGGCTGCTGCGCCAtt < 4:163349/149‑1 (MQ=255) gcCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGTCAAGGTCCTTATGAAGGTGAACCATACGCTGCCAGGCCTGTTCGTTTTCGTGGTGGCTGCTGCGCCATTg > 6:129098/1‑149 (MQ=255) tCGACGTCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGTCAAGGTCCTTATGAAGGTGAACCATACGCTGCCAGGCCTGTTCGTTTTCGTGGTGGCTGCTGCGCCATTgcgcgc < 8:170046/149‑1 (MQ=255) tCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGTCAAGGTCCTTATGAAGGTGAACCATACGCTGCCAGGCCTGTTCGTTTTCGTGGTGGCTGCTGCGCCATTgcgcg > 4:313555/1‑148 (MQ=255) tCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGTCAAGGTCCTTATGAAGGTGAACCATACGCTGCCAGGCCTGTTCGTTTTCGTGGTGGCTGCTGCGCCATTgcgc < 7:311370/147‑1 (MQ=255) | CGAGCCATCGGGCAGGGTGAAGACGCGTCGCTCGCCCGTGCCGGTGGCA‑TAGTCTGACGTCCAGGCACTCACAGTATCGAGGTCTTTGGCCAGCCAGCTCGCCGACCCTGCCATGACAACGCCGCCAAGCAGCTTCAGCGCCTGTCGACGGCG‑CAGGCGCTGCTGGCTGGTTTCCAGTGTCTGCAATGCCAGCCCGGCACCCGGGATAGCGCGCAGGTCAAGGTCCTTATGAAGGTGAACCATACGCTGCCAGGCCTGTTCGTTTTCGTGGTGGCTGCTGCGCCATTGCGCGC > NC_002947/185220‑185512 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |