| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,552,399:1 | +G | 5.1% | coding (56/978 nt) | PP_3137 → | group 2 family glycosyl transferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,552,399 | 1 | . | G | 5.1% | 325.6 / 10.7 | 79 | coding (56/978 nt) | PP_3137 | group 2 family glycosyl transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (35/40); new base G (2/2); total (37/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.67e-01 | |||||||||||
GTAGATGTGCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCACCGCCGCACGCGC > NC_002947/3552252‑3552546 | gTAGATGTGCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑g > 3:115929/1‑149 (MQ=255) gATGTGCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑gct < 5:353783/148‑2 (MQ=255) gATGTGCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑gcg < 7:149439/148‑1 (MQ=255) tgCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCG‑CTCGAGGCGCT‑gg < 5:129280/148‑2 (MQ=255) ggCCTGACAATTCACTGGCTGGGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGGATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGTTATTCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑Gcc < 8:165716/148‑1 (MQ=255) ccTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCtt > 5:303629/1‑149 (MQ=255) cTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTg < 1:271785/149‑1 (MQ=255) aTTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGc < 3:310972/149‑1 (MQ=255) tCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTg > 2:294735/1‑149 (MQ=255) aCTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTgg < 2:116373/148‑1 (MQ=255) aCTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGgc > 2:111992/1‑149 (MQ=255) cTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTCAGGCCTATGGCAACGGCGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGgcg > 3:316723/1‑149 (MQ=255) gCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCACCGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCAc > 5:281218/1‑149 (MQ=255) gCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCAc > 5:207645/1‑149 (MQ=255) ggggTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGcc < 8:43591/149‑1 (MQ=255) gggTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCg < 1:353201/149‑1 (MQ=255) ccGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACaaa < 2:120342/149‑1 (MQ=255) ccGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACa > 4:270752/1‑147 (MQ=255) ggCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGt > 5:143405/1‑149 (MQ=255) ccATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCa > 1:374790/1‑149 (MQ=255) catcatCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCATTGTTTCGCTGGCGCTCGGGGCCGACAAAGTCAt > 6:87901/1‑149 (MQ=255) atcaAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTAc > 4:232002/1‑149 (MQ=255) tcaAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGC‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACg > 3:331448/1‑149 (MQ=255) tcaAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACg > 5:267247/1‑149 (MQ=255) ggCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGa < 6:303629/149‑1 (MQ=255) ccGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCttca > 4:364111/1‑105 (MQ=255) ccGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCttca < 3:364111/107‑3 (MQ=255) ccGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTc > 7:76936/1‑149 (MQ=255) ccGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTc < 4:239841/149‑1 (MQ=255) cGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGGTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGCCTCg > 6:199613/1‑149 (MQ=255) cATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGCGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCgtgt < 4:316723/149‑1 (MQ=255) aTCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGtt < 2:287899/149‑1 (MQ=255) ggCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGTGTTCCAc < 6:207645/149‑1 (MQ=255) ggCCGCCGGGGGATGTGTGGAGTGTGGCCTTTGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCTCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCAc < 8:334455/149‑1 (MQ=255) cttCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACTGTTATGGTGGGGGTGGTAATCGGCATCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGGT‑GCGTTGTTTCTCTGGCTCACGGGGCCGACTAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTctc < 4:331448/147‑3 (MQ=255) aTCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCt < 4:115929/149‑1 (MQ=255) aTCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCt > 7:27167/1‑149 (MQ=255) ggTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCACACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCa < 1:294735/149‑1 (MQ=255) gTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAg < 3:270752/149‑1 (MQ=255) gAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGgccg > 5:1263/1‑149 (MQ=255) aGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCg < 5:245504/135‑1 (MQ=255) aGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCg > 6:245504/1‑135 (MQ=255) gtcTATGGCAACGGTGATCCGGGTGGTGGTAATCGGCGGCAATGAAGGCCAGCCCCTCGA‑GCGCA‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCCAGGGGCCGACAAAGTCATGTCCGTCGACTCGGGTTCCACCGAAGGTTCGGTGCAGTAGgccgcc > 6:110858/3‑148 (MQ=255) cTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCt > 4:56337/1‑133 (MQ=255) cTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCt < 3:56337/133‑1 (MQ=255) tATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAAcc > 4:251943/1‑149 (MQ=255) aaCGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCg > 2:263783/1‑149 (MQ=255) aCGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGt < 3:361845/149‑1 (MQ=255) cGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGgccgcc < 1:164492/137‑1 (MQ=255) cGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGgccgcc > 2:164492/1‑137 (MQ=255) tGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCa < 2:374790/149‑1 (MQ=255) aTCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCtt > 5:183020/1‑138 (MQ=255) aTCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCtt < 6:183020/138‑1 (MQ=255) aTCCGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCATCGCCTCGA‑GCGCA‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGCGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTAGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAg > 2:315921/1‑148 (MQ=255) ggggTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACt < 6:1263/149‑1 (MQ=255) gggTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTg > 7:93070/1‑149 (MQ=255) ggtggtggtAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCCACCTTGGCGTGGCAGTACTgg > 5:263540/1‑149 (MQ=255) tAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGTCCGACAAAGTCAGGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGAc < 3:232002/149‑1 (MQ=255) actCGGCCCCAATGAAGGCCAGCGCCGCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGCCGCCCGGGGCCGACAAAGTCATGTCCGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGGGGCAGTACTGGCGCTGGACa < 6:263540/147‑1 (MQ=255) ttCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACATAGTCATGTACGTCGACTGGGGTTCCACCGTTGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACAt < 5:110858/148‑1 (MQ=255) aTCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACa < 1:263783/148‑1 (MQ=255) aTCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACAt < 8:76936/149‑1 (MQ=255) aTCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACAt < 1:111992/149‑1 (MQ=255) ggCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGa < 3:251943/148‑1 (MQ=255) ggCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGa < 8:27167/148‑1 (MQ=255) ggCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCCCACGGGGCCGACAAACTCATATACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGa < 6:281218/148‑1 (MQ=255) cGCAATGAAGGCCAGCGCGTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCg < 8:122112/121‑1 (MQ=255) cGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCg > 7:122112/1‑121 (MQ=255) cGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACa > 6:120076/1‑142 (MQ=255) cGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACa < 5:120076/142‑1 (MQ=255) gAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGAc > 1:376810/1‑135 (MQ=255) gAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGAc < 2:376810/135‑1 (MQ=255) gAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGtt > 7:281176/1‑149 (MQ=255) ggCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCAc < 6:267247/149‑1 (MQ=255) aggcAGCG‑CTCGAGGCGCTGGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCa > 5:218248/4‑149 (MQ=255) aggcAGCG‑CTCGAGGCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGa < 5:81186/133‑1 (MQ=255) aggcAGCG‑CTCGAGGCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGa > 6:81186/4‑136 (MQ=255) ccAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCAccg > 3:71188/1‑149 (MQ=255) aGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTAGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCAccgcc > 2:245382/1‑149 (MQ=255) cGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGAc > 3:130497/1‑55 (MQ=255) cGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGAc < 4:130497/55‑1 (MQ=255) gA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCACCGCCGCACgcgc < 8:281176/149‑1 (MQ=255) | GTAGATGTGCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAATCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCACCGCCGCACGCGC > NC_002947/3552252‑3552546 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |