New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 151249 = | 45 (0.760) | 4 (0.070) | 4/248 | NT | 8.4% | coding (858/1026 nt) | PP_0143 | membrane protein |
? | NC_002947 | 151284 = | 44 (0.770) | coding (823/1026 nt) | PP_0143 | membrane protein |
ATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTGG‑GCGGGAAGTTCTGCTTGTGGGTC‑CAGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTGGTAGATCCGCTCGTTCAGGCCGCGTGGCGCGTTGATGGCGGTGTAGGCATACAGGCCACTGCTGCGGATGCGGCTGGCGGCAATTTCGTCCAGCGAGTCGCCCGGTT > NC_002947/151102‑151397 | atTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTGG‑GCGGGAAGTTCTGCTTGTGGGTC‑CAGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAggg > 2:310353/1‑149 (MQ=255) atTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTGG‑GCGGGAAGTTCTGCTTGTGGGTC‑CAGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAggg > 2:104845/1‑149 (MQ=255) aggtggcggtgagtaccgaagtaatgaaccgccaaccgggcgactcgctggacgaaattgccgccagccgcatccgcagcagtggcctgtatgcctacaccgccatcaacgcgccacgcggcctgaacgagcggatctaccacgtgtgg > 2:63872‑M1/148‑149 (MQ=255) ccaccTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTGG‑GCGGGAAGTTCTGCTTGTGGGTC‑CAGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATg < 3:334888/149‑1 (MQ=255) caccTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTGG‑GCGGGAAGTTCTGCTTGTGGGTC‑CAGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGc > 5:380941/1‑149 (MQ=255) gAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTGG‑GCGGGAAGTTCTGCTTGTGGGTC‑CAGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTc < 3:198781/147‑1 (MQ=255) cGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTCCCTACCGGGTTGG‑GCGGGAAGTTCTGCTTGTGGGTC‑CAGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACctc < 1:310353/149‑1 (MQ=255) cGCCGATCACTTGCCCCTCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTGG‑GCGGGAAGTTCTGCTTGTGGGTC‑CAGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCg < 4:60378/149‑1 (MQ=255) gCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTGGAGCGGGAAGTTCTGCTTGTGGGTC‑CAGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCg > 1:298178/1‑149 (MQ=255) cGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTGG‑GCGGGAAGTTCTGCTTGTGGGTC‑CAGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTcc < 1:104845/149‑1 (MQ=255) aaccgccaaccgggcgactcgctggacgaaattgccgccagccgcatccgcagcagtggcctgtatgcctacaccgccatcaacgcgccacgcggcctgaacgagcggatctaccacgtgtGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTcc < 6:74719‑M1/28‑1 (MQ=255) ccATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTGG‑GCGGGAAGTTCTGCTTGTGGGTC‑CAGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCacac > 1:133784/1‑149 (MQ=255) cgggcgactcgctggacgaaattgccgccagccgcatccgcagcagtggcctgtatgcctacaccgccatcaacgcgccacgcggcctgaacgagcggatctaccacgtgtGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCcaca > 5:74719‑M1/112‑149 (MQ=255) aTCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTGG‑GCGGGAAGTTCTGCTTGTGGGTC‑CAGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCcacatca > 8:180136/1‑146 (MQ=255) cTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTGG‑GCGGGAAGTTCTGCTTGTGGGTC‑CAGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTgg < 5:176342/148‑1 (MQ=255) tCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTGG‑GCGGGAAGTTCTGCTTGTGGGTC‑CAGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTgg > 1:305427/1‑147 (MQ=255) ggTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTGG‑GCGGGAAGTTCTGCTTGTGGGTC‑CAGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTGGTAg < 5:99246/148‑1 (MQ=255) aGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTGG‑GCGGGAAGTTCTGCTTGTGGGTC‑CAGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTGGTAGATCCg < 3:349302/149‑1 (MQ=255) cACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTGG‑GCGGGAAGTTCTGCTTGTGGGTC‑CAGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTGGTAGATCCGCt < 6:380941/149‑1 (MQ=255) aCCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGGTGG‑GCGGGAAGTTCTGCTTGTGGGTC‑CAGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTGGTAGATCCGCTc < 2:133784/149‑1 (MQ=255) ccTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTGG‑GCGGGAAGTTCTGCTTGTGGGTC‑CAGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGc < 1:361632/127‑1 (MQ=255) ccTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTGG‑GCGGGAAGTTCTGCTTGTGGGTC‑CAGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGc > 2:361632/1‑127 (MQ=255) aCTTGCCTACCGGGTTGG‑GCGGGAAGTTCTGCTTGTGGGTC‑CAGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTGGt > 8:360919/1‑126 (MQ=255) aCTTGCCTACCGGGTTGG‑GCGGGAAGTTCTGCTTGTGGGTC‑CAGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTGGt < 7:360919/126‑1 (MQ=255) tACCGGGTTGG‑GCGGGAAGTTCTGCTTGTGGGTC‑CAGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCtt > 2:364815/1‑95 (MQ=255) tACCGGGTTGG‑GCGGGAAGTTCTGCTTGTGGGTC‑CAGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCtt < 1:364815/95‑1 (MQ=255) gggTTGG‑GCGGGAAGTTCTGCTTGTGGGTC‑CAGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTGGTAGATCCGCTCGTTCAGGCCGCGTGGCGCGTTGAt > 6:67835/1‑149 (MQ=255) ggTTGG‑GCGGGAAGTTCTGCTTGTGGGTC‑CAGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTc < 3:316963/97‑1 (MQ=255) ggTTGG‑GCGGGAAGTTCTGCTTGTGGGTC‑CAGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTc > 4:316963/1‑97 (MQ=255) gTTGG‑GCGGGAAGTTCTGCTTGTGGGTCGCAGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTGGTAGATCCGCTc > 1:23314/1‑124 (MQ=255) gTTGG‑GCGGGAAGTTCTGCTTGTGGGTC‑CAGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTGGTAGATCCGCTc < 2:23314/123‑1 (MQ=255) gg‑gCGGGAAGTTCTGCTTGTGGGTC‑CAGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTGGTAGATCCGCTCGTTCAGGCCGCGTGGCGCGTTGATGGCg < 5:32538/148‑1 (MQ=255) cGGGAAGTTCTGCTTGTGGGTC‑CAGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTGGTAGATCCGCTCGTTCAGGCCTCGTGGCGCGTTGATGGCGgtg > 5:292972/1‑148 (MQ=255) gcctgtatgcctacaccgccatcaacgcgccacgcggcctgaacgagcggatctaccacgtatGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTg < 5:306662‑M1/42‑1 (MQ=255) gcctgtatgcctacaccgccatcaacgcgccacgcggcctgaacgagcggatctaccacgtatGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTg > 6:306662‑M1/64‑105 (MQ=255) ggAAGTTCTGCTTGTGGGTC‑CAGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCGGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCGTGCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTGGTAGATCCGCTCGTTCAGGCCGCGTGGCGCGTTGATGGCGGTGTAg < 1:273927/149‑1 (MQ=255) gAAGTTCTGCTTGTGGGTC‑CAGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTGGTAGATCCGCTCGTTCAGGCCGCGTGGCGCGTTGATGGCGGTGTAgg < 2:298178/149‑1 (MQ=255) gTTCTTCTTGTGGGTC‑CAGGCACGATAGCCTTACTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCTGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTGGTAGATCCGCTCGTTCAGGCCGCGTGGCGCGTTGATGGCGGTGTAGGCAt < 6:385420/149‑1 (MQ=255) cTTGTGGGTC‑CAGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTGGTAGATCCGCTCGTTCAGGCCGCGTGGCGCGTTGATGGCGGTGTAGGCATACAg < 3:280435/147‑1 (MQ=255) gTC‑CAGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTGGTAGATCCGCTCGTTCAGGCCGCGTGGCGCGTTGATGGCg > 1:165745/1‑126 (MQ=255) gTC‑CAGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTGGTAGATCCGCTCGTTCAGGCCGCGTGGCGCGTTGATGGCg < 2:165745/126‑1 (MQ=255) gTC‑CAGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTGGTAGATCCGCTCGTTCAGGCCGCGTGGCGCGTTGATGGCGGTGTAGGCATACAGGCCActgct > 6:371016/1‑149 (MQ=255) aGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTGGTAGATCCGCTCGTTCAGGCCGCGTGGCGCGTTGATGGCGGTGTAGGCATACAGGCCACTGCTGCg > 3:167163/1‑148 (MQ=255) gCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTGGTAGATCCGCTCGTTCAGGCCGCGTGGCGCGTTGATGGCGGTGTAGGCATACAGGCCACTGCTGCGGAt > 5:369182/1‑149 (MQ=255) cGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTGGTAGATCCGCTCGTTCAGGCCGCGTGGCGCGTTGATGGCGGTGTAGGCATACAGGCCACTGCTGCGGATGCg < 5:67835/149‑1 (MQ=255) ttccttGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTGGTAGATCCGCTCGTTCAGGCCGCGTGGCGCGTTGATGGCGGTGTAGGCATACAGGCCACTGCTGCGGATGCGGCTggcgg > 6:130186/1‑149 (MQ=255) gcccgccGTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTGGTAGATCCGATCGTTCAGGCCGCGTGGCGCGTTGATGGCGGTGTAGGCATACAGGCCACTGCTGCGGATGCGGCTGGCGGCAATTTCg > 4:264113/1‑149 (MQ=255) ccgccgTGGATGTCCGGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTGGTAGATCCGCTCGTTCAGGCCGCGTGGCGCGTTGATGGCGGTGTAGGCATACAGGCCACTGCTGCGGATGCGGCTGGCGGCAATTTCGTc > 6:384388/1‑149 (MQ=255) ccgccgTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTGGTAGATCCGCTCGTTCAGGCCGCGTGGCGCGTTGATGGCGGTGTAGGCATACAGGCCACTGCTGCGGATGCGGCTGGCGGCAATTTCGTc > 2:259125/1‑149 (MQ=255) ccgccgTGGATGTCCAGGGCAATGCGGGCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTGGTAGATCCGCTCGTTCAGGCCGCGTGGCGCGTTGATGGCGGTGTAGGCATACAGGCCACTGCTGCGGATGCGGCTGGCGGCAATTTCGTc < 1:259125/149‑1 (MQ=255) cgTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTGGTAGATCCGCTCGTTCAGGCCGCGTGGCGCGTTGATGGCGGTGTAGGCATACAGGCCACTGCTGCGGATGCGGCTGGCGGCAATTTCGTCCAGc < 5:130186/149‑1 (MQ=255) ggATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTGGTAGATCCGCTCGTTCAGGCCGCGTGGCGCGTTGATGGCGGTGTAGGCATACAGGCCACTGCTGCGGATGCGGCTGGCGGCAATTTCGTCCAGCGAg > 8:61376/1‑149 (MQ=255) ccAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTGGTAGATCCGCTCGTTCAGGCCGCGTGGCGCGTTGATGGCGGTGTAGGCATACAGGCCACTGCTGCGGATGCGGCTGGCGGCAATTTCGTCCAGCGAGTCGccc > 3:81521/1‑149 (MQ=255) cAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTGGTAGATCCGCTCGTTCAGGCCGCGTGGCGCGTTGATGGCGGTGTAGGCATACAGGCCACTGCTGCGGATGCGGCTGGCGGCAATTTCGTCCAGCGAGTCGCCCg > 7:129336/1‑149 (MQ=255) cAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTGGTAGATCCGCTCGTTCAGGCCGCGTGGCGCGTTGATGGCGGTGTAGGCATACAGGCCACTGCTGCGGATGCGGCTGGCGGCAATTTCGTCCAGCGAGTCGCCCg > 3:258193/1‑149 (MQ=255) GGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTGGTAGATCCGCTCGTTCAGGCCGCGTGGCGCGTTGATGGCGGTGTAGGCATACAGGCCACTGCTGCGGATGCGGCTGGCGGCAATTTCGTCCAGCGAGTCGCCCGGtt < 7:267085‑M1/149‑1 (MQ=255) GGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTGGTAGATCCGCTCGTTCAGGCCGCGTGGCGCGTTGATGGCGGTGTAGGCATACAGGCCACTGCTGCGGATGCGGCTGGCGGCAATTTCGTCCAGCGAGTCGCCCGGtt < 2:4917‑M1/149‑1 (MQ=255) | ATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTGG‑GCGGGAAGTTCTGCTTGTGGGTC‑CAGGCACGATAGCCTTCCTTGCGCCCGCCGTGGATGTCCAGGGCAATGCGGTCGACCTCTTGGCCGTCCTTCTGCCACACGTGGTAGATCCGCTCGTTCAGGCCGCGTGGCGCGTTGATGGCGGTGTAGGCATACAGGCCACTGCTGCGGATGCGGCTGGCGGCAATTTCGTCCAGCGAGTCGCCCGGTT > NC_002947/151102‑151397 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |