| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 469491 | 91 (1.540) | 7 (0.120) | 4/250 | NT | 7.7% | coding (1466/3744 nt) | PP_0386 | sensory box protein |
| ? | NC_002947 | = 469534 | 78 (1.350) | coding (1423/3744 nt) | PP_0386 | sensory box protein | |||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
TGCCGTCCAGTTCGAAGGTTTCAGCCGAAGTCAGGCCAGTGAACAGTTGGCCGTTGCTGCGGCGGAAGCTCATTTCCAGGTTACGGATACCACCTTGGTGCAACCTTTCAAGCAGGAGCGGGCCACTGCCCTCTACGCCCCACAGGTCAAGGTCGGTGGCAGTGCGGCCAATGACCTGGTCTGGGGGCAGTCCGATCTGCTCTTCGAAAGCCTCGTTCACCTCCAGCAGGCA‑GCCATCGCTGTGGCGAGCGATCAGCAAGATATCGGGGCACTGCTGGAATACCGAGG > NC_002947/469351‑469638 | gCCGTCCAGTTCGAAGGTTTCAGCCGAAGTCAGGCCAGTGAACAGTTGGCCGTTGCTGCGGCGGAAGCTCATTTCCAGGTTACGGATACCACCTTGGTGCAACCTTTCAAGCAGGAGCGGGCCACTGCCCTCTACGCCCCACAGGTc > 2:221855/1‑147 (MQ=255) gTCCAGTTCGAAGGTTTCAGCCGAAGTCAGGCCAGTGAACAGTTGGCCGTTGCTGCGGCGGAAGCTCATTTCCAGGTTACGGATACCACCTTGGTGCAACCTTTCAAGCAGGAGCGGGCCACTGCCCTCTACGCCCCccagaccaggt > 6:383247‑M1/1‑137 (MQ=255) gTCCAGTTCGAAGGTTTCAGCCGAAGTCAGGCCAGTGAACAGTTGGCCGTTGCTGCGGCGGAAGCTCATTTCCAGGTTACGGATACCACCTTGGTGCAACCTTTCAAGCAGGAGCGGGCCACTGCCCTCTACGCCCCACAGGTCAAGGt > 5:29547/1‑149 (MQ=255) ccAGTTCGAAGGTTTCAGCCGAAGTCAGGCCAGTGAACAGTTGGCCGTTGCTGCGGCGGAAGCTCATTTCCAGGTTACGGATACCACCTTGGTGCAACCTTTCAAGCAGGAGCGGGCCACTGCCCTCTACGCCCCACAGGTCAAGGTCg > 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ttCGAAGGTTTCAGCCGAAGTCAGGCCAGTGAACAGTTGGCCGTTGCTGCGGCGGAAGCTCATTTCCAGGTTACGGATACCACCTTGGTGCAACCTTTCAAGCAGGAGCGGGCCACTGCCCTCTACGCCCCACAGGTCAAGGTCGGTgg > 1:156280/1‑149 (MQ=255) tCGAAGGTTTCAGCCGAAGTCAGGCCAGTGAACAGTTGGCCGTTGCTGCGGCGGAAGCTCATTTCCAGGTTACGGATACCACCTTGGTGCAACCTTTCAAGCAGGAGCGGGCCACTGCCCTCTACGCCCCACAGGTCAAGGTCGGTggg > 3:28710/1‑148 (MQ=255) cGAAGGTTTCAGCCGAAGTCAGGCCAGTGAACAGTTGGCCGTTGCTGCGGCGGAAGCTCATTTCCAGGTTACGGATACCACCTTGGTGCAACCTTTCAAGCAGGAGCGGGCCACTGCCCTCTACGCCCCACAGGTCAAGGTCGGTGGc < 1:255693/148‑1 (MQ=255) gAAGGTTTCAGCCGAAGTCAGGCCAGTGAACAGTTGGCCGTTGCTGCGGCGGAAGCTCATTTCCAGGTTACGGATACCACCTTGGTGCAACCTTTCAAGCAGGAGCGGGCCACTGCCCTCTACGCCCCACAGGTCAAg > 2:132680/1‑138 (MQ=255) gAAGGTTTCAGCCGAAGTCAGGCCAGTGAACAGTTGGCCGTTGCTGCGGCGGAAGCTCATTTCCAGGTTACGGATACCACCTTGGTGCAACCTTTCAAGCAGGAGCGGGCCACTGCCCTCTACGCCCCACAGGTCAAg < 1:132680/138‑1 (MQ=255) aaGGTTTCAGCCGAAGTCAGGCCAGTGAACAGTTGGCCGTTGCTGCGGCGGAAGCTCATTTCCAGGTTACGGATACCACCTTGGTGCAACCTTTCAAGCAGGAGCGGGCCACTGCCCTCTACGCCCCACAGGTCAAGGTCGGTGGCAGt > 4:352407/1‑149 (MQ=255) ggTTTCAGCCGAAGTCAGGCCAGTGAACAGTTGGCCGTTGCTGCGGCGGAAGCTCATTTCCAGGTTACGGATACCACCTTGGTGCAACCTTTCAAGCAGGAGCGGGCCACTGCCCTCTACGCCCCACAGGTCAAGGTCGGTGGCAGTGc < 3:154552/149‑1 (MQ=255) gTTTCAGCCGAAGTCAGGCCAGTGAACAGTTGGCCGTTGCTGCGGCGGAAGCTCATTTCCAGGTTACGGATACCACCTTGGTGCAACCTTTCAAGCAGGAGCGGGCCACTGCCCTCTACGCCCCACAGGTCAAGGTCGGTGGCAGTGCg > 5:268439/1‑149 (MQ=255) tCAGCCGAAGTCAGGCCAGTGAACAGTTGGCCGTTGCTGCGGCGGAAGCTCATTTCCAGGTTACGGATACCACCTTGGTGCAACCTTTCAAGCAGGAGCGGGCCACTGCCCTCTACGCCCCACAGGTCAAGGTCGGTGGCAGTGCGGc < 3:154315/148‑1 (MQ=255) tCAGCCGAAGTCAGGCCAGTGAACAGTTGGCCGTTGCTGCGGCGGAAGCTCATTTCCAGGTTACGGATACCACCTTGGTGCAACCTTTCAAGCAGGAGCGGGCCACTGCCCTCTACGCCCCACAGGTCAAGGTCGGTGGCAGTGCGGc > 4:151464/1‑148 (MQ=255) 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gctgcGGCGGAAGCTCATTTCCAGGTTACGGATACCACCTTGGTGCAACCTTTCAAGCAGGAGCGGGCCACTGCCCTCTACG‑CCCccagaccaggtcattggccgcactgccaccgaccttgacctgtggggc < 4:344778‑M1/133‑49 (MQ=255) gctgcGGCGGAAGCTCATTTCCAGGTTACGGATACCACCTTGGTGCAACCTTTCAAGCAGGAGCGGGCCACTGCCCTCTACG‑CCCccagaccaggtcattggccgcactgccaccgaccttgacctgtggggc > 3:344778‑M1/1‑85 (MQ=255) cggAAGCTCATTTCCAGGTTACGGATACCACCTTGGTGCAACCTTTCAAGCAGGAGCGGGCCACTGCCCTCTACGCCGCACAGGTCAAGGTCGGTGGCAGTGCGGCCAATGACCTGGTCTGGGGGCAGTCCGATCTGCTCTTCGAAAGc > 1:119768/1‑149 (MQ=255) aaGCTCATTTCCAGGTTACGGATACCACCTTGGTGCAACCTTTCAAGCAGGAGCGGGCCACTGCCCTCTACGCCCCACAGGTCAAGGTCGGTGGCAGTGCGGCCAATGACCTGGTCTGGGGGCAGTCCGATCTGCTCTTCg < 1:55253/141‑1 (MQ=255) aaGCTCATTTCCAGGTTACGGATACCACCTTGGTGCAACCTTTCAAGCAGGAGCGGGCCACTGCCCTCTACGCCCCACAGGTCAAGGTCGGTGGCAGTGCGGCCAATGACCTGGTCTGGGGGCAGTCCGATCTGCTCTTCg > 2:55253/1‑141 (MQ=255) gCTCATTTCCAGGTTACGGATACCACCTTGGTGCAACCTTTCAAGCAGGAGCGGGCCACTGCCCTCTACGCCCCACAGGTCAAGGTCGGTGGCAGTGCGGCCAATGACCTGGTCTGGGGGCAGTCCGATCTGCTCTTCGAAAGCCTCGt < 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ggCCACTGCCCTCTACGCCCCACAGGTCAAGGTCGGTGGCAGTGCGGCCAATGACCTGGTCTGGGGGCAGTCCGATCTGCTCTTCGAAAGCCTCGTTCACCTCCAGCAGGCA‑GCCATCGCTGTGGCGAGCGATCAGCAAGATATCgggg < 5:213180/149‑1 (MQ=255) gCCACTGCCCTCTACGCCCCACAGGTCAAGGTCGGTGGCAGTGCGGCCAATGACCTGGTCTGGGGGCAGTCCGATCTGCTCTTCGAAAGCCTCGTTCACCTCCAGCAGGCA‑GCCATCGCTGTgg > 4:204540/1‑124 (MQ=255) gCCACTGCCCTCTACGCCCCACAGGTCAAGGTCGGTGGCAGTGCGGCCAATGACCTGGTCTGGGGGCAGTCCGATCTGCTCTTCGAAAGCCTCGTTCACCTCCAGCAGGCA‑GCCATCGCTGTgg < 3:204540/124‑1 (MQ=255) gCCACTGCCCTCTACGCCCCACAGGTAAAGGTCGGTGGCAGTGCGGCCAATGACCTGGTCTGGGGGCAGTCCGATCTGCTCTTCGAAAGCCTCGTTCACCTCCAGCAGGCA‑GCCATCGCTGTGGCGAGCGATCAGCAAGATATCGGGGc < 1:369583/149‑1 (MQ=255) cccTCTACGCCCCACAGGTCAAGGTCGGTGGCAGTGCGGCCAATGACCTGGTCTGGGGGCAGTCCGATCTGCTCTTCGAAAGCCTCGTTCACCTCCAGCAGGCA‑GCCATCGCTGTgg < 8:195898/117‑1 (MQ=255) cccTCTACGCCCCACAGGTCAAGGTCGGTGGCAGTGCGGCCAATGACCTGGTCTGGGGGCAGTCCGATCTGCTCTTCGAAAGCCTCGTTCACCTCCAGCAGGCA‑GCCATCGCTGTgg > 7:195898/1‑117 (MQ=255) cccTCTACGCCCCACAGGTCAAGGTCGGTGGCAGTGCGGCCAATGACCTGGTCTGGGGGCAGTCCGATCTGCTCTTCGAAAGCCTCGTTCACCTCCAGCAGGCA‑GCCATCGCTGTGGCGAGCGATCAGCAAGATATCGGGGCActgctg < 8:230888/149‑1 (MQ=255) ccTCTACGCCCCACAGGTCAAGGTCGGTGGCAGTGCGGCCAATGACCTGGTCTGGGGGCAGTCCGATCTGCTCTTCGAAAGCCTCGTTCACCTCCAGCAGGCACCCCATCGCTGTGGCGAGCGATCAGCAAGATATCGGGGCActgctg < 1:269419/149‑1 (MQ=255) ccTCTACGCCCCACAGGTCAAGGTCGGTGGCAGTGCGGCCAATGACCTGGTCTGGGGGCAGTCCGATCTGCTCTTCGAAAGCCTCGTTCACCTCCAGCAGGCA‑GCCATCGCTGTGGCGAGCGATCAGCAAGATATCGGGGCActgctg > 5:215731/1‑148 (MQ=255) ctctACGCCCCACAGGTCAAGGTCGGTGGCAGTGCGGCCAATGACCTGGTCTGGGGGCAGTCCGATCTGCTCTTCGAACGCCTCGTTCACCTCCAGCAGGCA‑GCCATCGCTGTGGCGAGCGATCAGCAAGATATCGGGGCACTGCTgg > 7:243190/1‑148 (MQ=255) gCCCCACAGGTCAAGGTCGGTGGCAGTGCGGCCAATGACCTGGTCTGGgggcgtagagggcagtggcccgctcctgcttgaaaggttgcaccaaggtggtatccgtaacctggaaatgagcttccgccgcagc > 3:344778‑M2/1‑48 (MQ=255) gCCCCACAGGTCAAGGTCGGTGGCAGTGCGGCCAATGACCTGGTCTGGgggcgtagagggcagtggcccgctcctgcttgaaaggttgcaccaaggtggtatccgtaacctggaaatgagcttccgccgcagc < 4:344778‑M2/133‑86 (MQ=255) ccccACAGGTCAAGGTCGGTGGCAGTGCGGCCAATGACCTGGTCTGGggggcgtagagggcagtggcccgctcctgcttgaaaggttgcaccaaggtggtatccgtaacctggaaatgagcttccgccgcagcaacggccaactgttca < 5:383247‑M2/149‑103 (MQ=255) ccccACAGGTCAAGGTCGGTGGCAGTGCGGCCAATGACCTGGTCTGGGGGCAGTCCGATCTGCTCTTCGAAAGCCTCGTTCACCTCCAGCAGGCA‑GCCATCGCTGTGGCGAGCGATCAGCAAGATATCGGGGCACTGCTGGAATACCGa < 8:243190/149‑1 (MQ=255) cccACAGGTCAAGGTTGGTGGCAGTGCGGCCAATGACCTGGTCTGGgggcgtagagggcagtggcccgctcctgcttgaaaggttgcaccaaggtggtatccgtaacctggaaatgagcttccgccgcagcaacggccaactgttcact < 4:253244‑M2/149‑104 (MQ=255) cccACAGGTCAAGGTCGGTGGCAGTGCGGCCAATGACCTGGTCTGGggggcgtagagggcagtggcccgctcctgcttgaaaggttgcaccaaggtggta < 7:220954‑M2/100‑55 (MQ=255) cccACAGGTCAAGGTCGGTGGCAGTGCGGCCAATGACCTGGTCTGGggggcgtagagggcagtggcccgctcctgcttgaaaggttgcaccaaggtggta > 8:220954‑M2/1‑46 (MQ=255) cccACAGGTCAAGGTCGGTGGCAGTGCGGCCAATGACCTGGTCTGGGGGCAGTCCGATCTGCTCTTCGAAAGCCTCGTTCACCTCCAGCAGGCA‑GCCATCGCTGTGGCGAGCGATCAGCAAGATATCGGGGCACTGCTGGAATACCGAg < 7:130003/149‑1 (MQ=255) ccccagaccaggtcattggccgcactgccaccgaccttgacctgtggggcgtagagggcagtggcccgctcctgcttgaaaggttgcaccaaggtggtatccgtaacctggaaatgagcttccgccgcagcaacggccaactgttcact > 3:352407‑M1/1‑2 (MQ=255) ccccagaccaggtcattggccgcactgccaccgaccttgacctgtggggcgtagagggcagtggcccgctcctgcttgaaaggttgcaacaaggtggtatccgtaacctggaaatgagcttccgcagcagcaacggccaactgttcact > 6:64581‑M1/1‑2 (MQ=255) ccACAGGTCAAGGTCGGTGGCAGTGCGGCCAATGACCTGGTCTGGGGGCAGTCCGATCTGCTCTTCGAAAGCCTCGTTCACCTCCAGCAGGCA‑GCCATCGCTGTGGCGAGCGATCAGCAAGATATCGGGGCACTGCTGGAATACCGAgg < 3:75571/149‑1 (MQ=255) | TGCCGTCCAGTTCGAAGGTTTCAGCCGAAGTCAGGCCAGTGAACAGTTGGCCGTTGCTGCGGCGGAAGCTCATTTCCAGGTTACGGATACCACCTTGGTGCAACCTTTCAAGCAGGAGCGGGCCACTGCCCTCTACGCCCCACAGGTCAAGGTCGGTGGCAGTGCGGCCAATGACCTGGTCTGGGGGCAGTCCGATCTGCTCTTCGAAAGCCTCGTTCACCTCCAGCAGGCA‑GCCATCGCTGTGGCGAGCGATCAGCAAGATATCGGGGCACTGCTGGAATACCGAGG > NC_002947/469351‑469638 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |