New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2794768 = | 44 (0.740) | 3 (0.050) | 3/248 | NT | 5.6% | coding (611/735 nt) | PP_2447 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 2794820 = | 58 (1.010) | coding (663/735 nt) | PP_2447 | hypothetical protein |
GAGCGAGCCGCGCTATGCGGTGTTGATGGGCTATGACCGTTACAAGCAGCGGGTGCTGCTGCGCTCGGGCATGCACCGGCGGCAGGTGATGGCATTCGATGAATTTGCATCGGCATGGGAGAAGCAGGGGAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGATGAATTGGCCAAGGCCGGGCAAGAGATTGCGGCGAAGCAGGCGGTCAATAGCCTGAACGAATAGCGTTGCCTGTGCCGGCTTCTTCG > NC_002947/2794622‑2794915 | ccacacggactgtgcaataagcacaaatcctgtgggcgcgggcttgccggcgaagaagccggcacaggcaacgctattcgttcaggctattgaccgcctgcttcgccgcaatctcttgcccggccttggccaattcatccgcagcaTGc > 1:150826‑M1/147‑149 (MQ=255) cgagcCGCGCTATGCGGTGTTGATGGGCTATGACCGTTACAAGCAGCGGGTGCTGCTGCGCTCGGGCATGCACCGGCGGCAGGTGATGGCATTCGATGAATTTGCATCGGCATGGGAGAAGCAGGGGAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGc > 4:65881/1‑149 (MQ=255) tGACCGTTACAAGCAGCGGGTGCTGCTGCGCTCGGGCATGCACCGGCGGCAGGTGATGGCATTCGATGAATTTGCATCGGCATGGGAGAAGCAGGGGAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATc < 5:150358/149‑1 (MQ=255) gACCGTTACAAGCAGCGGGTGCTGCTGCGCTCGGGCATGCACCGGCGGCAGGTGATGGCATTCGATGAATTTGCATCGGCATGGGAGAAGCAGGGGAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCg > 6:131831/1‑149 (MQ=255) gcttgcaggcgaagaagccggcacaggcaacgctattcgttcaggctattgaccgcctgcttcgccgcaatctcttgcccggccttggccaattcatccgcagcaTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCgg < 5:350026‑M1/44‑1 (MQ=255) aCAAGCAGCGGGTGCTGCTGCGCTCGGGCATGCACCGGCGGCAGGTGATGGCATTCGATGAATTTGCATCGGCATGGGAGAAGCAGGGGAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCgg > 5:309523/1‑149 (MQ=255) aaGCAGCGGGTGCTGCTGCGCTCGGGCATGCACCGGCGGCAGGTGATGGCATTCGATGAATTTGCATCGGCATGGGAGAAGCAGGGGAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGAACACCAGCggtg > 1:319329/1‑149 (MQ=255) cagcGGGTGCTGCTGCGCTCGGGCATGCACCGGCGGCAGGTGATGGCATTCGATGAATTTGCTTCGTCATGGGAGAATCAGGGGAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGtt < 3:1867/149‑1 (MQ=255) agcGGGTGCTGCTGCGCTCGGGCATGCACCGGCGGCAGGTGATGGCATTCGATGAATTTGCATCGGCATGGGAGAAGCAGGGGAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTg > 1:50419/1‑149 (MQ=255) ggcgaagaagccggcacaggcaacgctattcgttcaggctattgaccgcctgcttcgccgcaatctcttgcccggccttggccaattcatccgcagcaTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGc > 2:12959‑M1/99‑149 (MQ=255) gTGCTGCTGCGCTCGGGCATGCACCGGCGGCAGGTGATGGCATTCGATGAATTTGCATCGGCATGGGAGAAGCAGGGGAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCAtgc < 2:50419/149‑1 (MQ=255) gaagccggcacaggcaacgctattcgttcaggctattgaccgcctgcttcgccgcaatctcttgcccggccttggccaattcatccgcagcaTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCAtgctg > 6:350026‑M1/93‑149 (MQ=255) ctgcGCTCGGGCATGCACCGGCGGCAGGTGATGGCATTCGATGAATTTGCATCGGCATGGGAGAAGCAGGGGAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCgg < 5:131831/148‑1 (MQ=255) ctgcGCTCGGGCATGCACCGGCGGCAGGTGATGGCATTCGATGAATTTGCATCGGCATGGGAGAAGCAGGGGAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGa < 2:206715/149‑1 (MQ=255) ctgcGCTCGGGCATGCACCGGCGGCAGGTGATGGCATTCGATGAATTTGCATCGGCATGGGAGAAGCAGGGGAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGa > 6:104758/1‑149 (MQ=255) tgcGCTCGGGCATGCACCGGCGGCAGGTGATGGCATTCGATGAATTTGCATCGGCATGGGAGAAGCAGGGGAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATc < 8:73106/123‑1 (MQ=255) tgcGCTCGGGCATGCACCGGCGGCAGGTGATGGCATTCGATGAATTTGCATCGGCATGGGAGAAGCAGGGGAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATc > 7:73106/1‑123 (MQ=255) aTGCACCGGCGGCAGGTGATGGCATTCGATGAATTTGCATCGGCATGGGAGAAGCAGGGGAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGATGAATTGGcc > 3:374471/1‑147 (MQ=255) cggcAGGTGATGGCATTCGATGAATTTGCATCGGCATGGGAGAAGCAGGGGAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGATGAATTGGCCAAGGCCGGGCa < 4:374471/149‑1 (MQ=255) cAGGTGATGGCATTCGATGAATTTGCATCGGCATGGGAGACGCAGGGGAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGATGAATTGGCCAAGGCCGGGCAaga < 6:309523/149‑1 (MQ=255) aGGTGATGGCATTCGATGAATTTGCATCGGCATGGGAGAAGCAGGGGAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGATGAATTgg < 6:288313/132‑1 (MQ=255) aGGTGATGGCATTCGATGAATTTGCATCGGCATGGGAGAAGCAGGGGAGTTGGGCGGTGCTGGAGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGATGAATTgg > 5:288313/1‑132 (MQ=255) gTGATGGCATTCGATGAATTTGCATCGGCATGGGAGAAGCAGGGGAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGATGAATTGGCCAAGGCCGGGCAAGAGAt > 6:235577/1‑149 (MQ=255) aTGGCATTCGATGAATTTGCATCGGCATGGGAGAAGCAGGGGAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGATGAATTGGCCAAGGCCGGGCAAGAGATTgc > 8:305817/1‑149 (MQ=255) cATTCGATGAATTTGCATCGGCATGGGAGAAGCAGGGGAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGATGAATTGGCCAAGGCCGGGCAAGAGATTgcggc > 3:77348/1‑148 (MQ=255) tCGATGAATTTGCATCGGCATGGGAGAAGCAGGGGAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGATGAATTGGCCAAGGCCGGGCAAGAGATTGCGGCGAAg > 5:363420/1‑149 (MQ=255) aTTTGCATCGGCATGGGAGAAGCAGGGGAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGATGAATTGGCCAAGGCCGGGCAAGAGATTGCGGCGAAGCAGGCgg < 3:65881/149‑1 (MQ=255) tttGCATCGGCATGGGAGAAGCAGGGGAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGATGAATTGGCCAAGGCCGGGCAag < 8:47093/127‑1 (MQ=255) tttGCATCGGCATGGGAGAAGCAGGGGAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGATGAATTGGCCAAGGCCGGGCAag > 7:47093/1‑127 (MQ=255) gCATCGGCATGGGAGAAGCAGGGGAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGATGAATTGGCCAAGGCCGGGCAAGAGATTGCGGCGAAGCAGGCGGTCaa > 3:352107/1‑149 (MQ=255) aTCGGCATGGGAGAAGCAGGGGAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGATGAATTGGCCAAGGCCGGGCAAGAGATTGCGGCGAAGCAGGCGGTCaa > 5:106950/1‑147 (MQ=255) ggAGAAGCAGGGGAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGATGAATTGGCCAAGGCCGGGCAAGAGATTGCGGCGAAGCAGGCGGTCAATAGCCTGAAc < 5:104758/148‑1 (MQ=255) agaAGCAGGGGAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGATGAATTGGCCAAGGCCGGGCAAGAGATTGCGGCGAAGCAGGCGGTCAATAGCCTGAACGaa > 1:17832/1‑149 (MQ=255) agaAGCAGGGGAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGATGAATTGGCCAAGGCCGGGCAAGAGATTGCGGCGAAGCAGGCGGTCAATAGCCTGAACGaa > 4:103206/1‑149 (MQ=255) aaGCAGGGGAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGATGAATTGGCCAAGGCCGGGCAAGAGATTGCGGCGAAGCAGGCGGTCAATAGCCTGAACGaa > 7:128044/1‑147 (MQ=255) aGCAGGGGAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGATGAATTGGCCAAGGCCGGGCAAGAGATTGCGGCGAAGCAGGCGGTCAATAGCCTGAACGAATa < 6:106950/148‑1 (MQ=255) ggggAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGATGAATTGGCCAAGGCCGGGCAAGAGATTGCGGCGAAGCAGGCGGTCAATAGCCTGAACGAATAGCGtt > 2:121109/1‑149 (MQ=255) ggggAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGATGAATTGGCCAAGGCCGGGCAAGAGATTGCGGCGAAGCAGGCGGTCAATAGCCTGAACGAATAGCGtt < 6:363420/149‑1 (MQ=255) gggAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGATGAATTGGCCAAGGCCggg < 2:90437/99‑1 (MQ=255) gggAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGATGAATTGGCCAAGGCCggg > 1:90437/1‑99 (MQ=255) gggAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGATGAATTGGCCAAGGCCGGGCAAGAGATTGCGGCGAAGCAGGCGGTCAATAGCCTGAACGAATAGCGTTg > 8:7919/1‑149 (MQ=255) ggAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGATGAATTGGCCAAGGCCGGGCAAGAGATTGCGGCGAAGCAGGCGGTCAATAGCCTGAACGAATAGCGTTGc < 1:314104/149‑1 (MQ=255) gggCAGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGATGAATTGGCCAAGGCCGGGCAAGAGATTGCGGCGAAGCAGGCGGTCAATAGCCTGAACGAATAGCGTTGCCTGTGc > 8:288541/1‑149 (MQ=255) ggCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGATGAATTGGCCAAGGCCGGGCAAGAGATTGCGGCGAAGCAGGCGGTCAATAGCCTGAACGAATAGCGTTGCCTGTGcc > 5:194950/1‑149 (MQ=255) gCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGATGAATTGGCCAAGGCCGGGCAAGAGATTGCGGCGAAGCAGGCGGTCAATAGCCTGAACGaa < 1:13574/132‑1 (MQ=255) gCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGATGAATTGGCCAAGGCCGGGCAAGAGATTGCGGCGAAGCAGGCGGTCAATAGCCTGAACGaa > 2:13574/1‑132 (MQ=255) ggTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGATGAATTGGCCAAGGCCGGGCAAGAGATTGCGGCGAAGCAGGCGGTCAATAGCCTGCACGAATAGCGTTGCCTGTGCCGGc > 8:8433/1‑149 (MQ=255) tGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGATGAATTGGCCAAGGCCGGGCAAGAGATTGCGGCGAAGCAGGCGGTCAATAGCCTGAACGAATAGCGTTGCCTGTGCCGGctt > 5:68696/1‑149 (MQ=255) tGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGATGAATTGGCCAAGGCCGGGCAAGAGATTGCGGCGAAGCAGGCGGTCAATAGCCTGAACGAATAGCGTTGCCTGTGCCGGcttctt > 6:298192/1‑149 (MQ=255) tGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGATGAATTGGCCAAGGCCGGGCAAGAGATTGCGGCGAAGCAGGCGGTCAATAGCCTGAACGAATAGCGTTGCCTGTGCCGGcttctt > 3:91388/1‑149 (MQ=255) ggTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGATGAATTGGCCAAGGCCGGGCAAGAGATTGCGGCGAAGCAGGCGGTCAATAGCCTGAACGAATAGCGTTGCCTGTGCCGGCttcttc > 6:204546/1‑149 (MQ=255) gTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGATGAATTGGCCAAGGCCGGGCAAGAGATTGCGGCGAAGCAGGCGGTCAATAGCCTGAACGAATAGCGTTGCCTGTGCCGGCTTCTTCg > 2:337714/1‑149 (MQ=255) | GAGCGAGCCGCGCTATGCGGTGTTGATGGGCTATGACCGTTACAAGCAGCGGGTGCTGCTGCGCTCGGGCATGCACCGGCGGCAGGTGATGGCATTCGATGAATTTGCATCGGCATGGGAGAAGCAGGGGAGTTGGGCGGTGCTGGTGCAGCCACCGCGGCAACTGCCGGCCCAGGTTGATCGCCAGCGGTGGTTGCATGCTGCGGATGAATTGGCCAAGGCCGGGCAAGAGATTGCGGCGAAGCAGGCGGTCAATAGCCTGAACGAATAGCGTTGCCTGTGCCGGCTTCTTCG > NC_002947/2794622‑2794915 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |