Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC | NC_002947 | 2,958,780 | Δ61 bp | 8.4% | intergenic (+46/+36) | PP_2589 → / ← PP_2590 | aldehyde dehydrogenase family protein/ferric siderophore receptor |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2958779 | 49 (0.830) | 4 (0.070) | 4/244 | NT | 8.4% | intergenic (+45/+97) | PP_2589/PP_2590 | aldehyde dehydrogenase family protein/ferric siderophore receptor |
? | NC_002947 | 2958841 = | 41 (0.730) | intergenic (+107/+35) | PP_2589/PP_2590 | aldehyde dehydrogenase family protein/ferric siderophore receptor |
CGTTCGGTGGGGGCAAGCAGTCGGGGTTTGGCCGCGATCTGTCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAGGTCCGCGGCGCCCCCAAC > NC_002947/2958631‑2958924 | cGTTCGGTGGGGGCAAGCAGTCGGGGTTTGGCCGCGATCTGTCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGC < 5:146711‑M1/149‑1 (MQ=255) gTGGGGGCAAGCAGTCGGGGTTTGGCCGCGATCTGTCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCATCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCca > 1:156669/1‑148 (MQ=255) gggggCAAGCAGTCGGGGTTTGGCCGCGATCTGTCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAg > 7:175333/1‑149 (MQ=255) gggggCAAGCAGTCGGGGTTTGGCCGCGATCTGTCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAg < 3:163946/149‑1 (MQ=255) gCAAGCAGTCGGGGTTTGGCCGCGATCTGTCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTc < 7:3964/149‑1 (MQ=255) aGCAGTCGGGGTTTGGCCGCGATCTGTCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGc < 3:108935/149‑1 (MQ=255) cAGTCGGGGTTTGGCCGCGATCTGTCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGcac < 3:173782/149‑1 (MQ=255) tCGGGGTTTGGCCGCGATCTATCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCGGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTCCAGCACaac > 1:212276/1‑148 (MQ=39) gTTTGGCCGCGATCTGTCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAg < 4:76065/138‑1 (MQ=255) gTTTGGCCGCGATCTGTCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAg > 3:76065/1‑138 (MQ=255) tGGCCGCGATCTGTCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCATCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAgg < 2:156669/148‑1 (MQ=255) cgcgATCTGTCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTtgt > 1:60958/1‑149 (MQ=255) gcgATCTGTCACTGCATTCGTTAGACAAGTTTTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTTATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTtgtg < 8:314762/149‑1 (MQ=255) tCTGTCACTGCTTTCGTTCTACAAGTATTCGCAACTCAAGACTACCTGGTACCAGTTGCGG‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTg < 4:2881/148‑1 (MQ=255) tCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTCCAGCACAACCCTCAGACTTGTGCTGAAc < 7:348738/147‑1 (MQ=25) tCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAACCCTCAGACTTGTGCTGAAc < 3:250671/147‑1 (MQ=38) tCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCGGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTCCAGCACAACCCTCAGACTTGTGCTGAAcc < 2:212276/148‑1 (MQ=25) aCTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCtgt < 8:175333/149‑1 (MQ=255) aCTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCtgt < 8:204448/149‑1 (MQ=255) tGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGtt > 8:83979/1‑134 (MQ=255) tGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGtt < 7:83979/134‑1 (MQ=255) cATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTgg > 1:284637/1‑148 (MQ=255) cATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTgg > 8:28659/1‑147 (MQ=255) gACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGgcgcg > 4:173505/1‑149 (MQ=255) aaGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGccc > 1:62644/1‑149 (MQ=255) ttCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCcgcg > 2:29209/1‑147 (MQ=255) ttCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCcgcg > 5:289800/1‑147 (MQ=255) gCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAagag > 3:342543/1‑149 (MQ=255) gCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAagag > 4:37134/1‑149 (MQ=255) aaCTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAgg > 7:277720/1‑148 (MQ=255) aaCTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAgg < 8:277720/148‑1 (MQ=255) cTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCCAGCACAACCCTCAGACTTGTGCTga < 5:272988/115‑2 (MQ=21) tCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCgaagaggccgtatctggcgccgcggcgggacccggt > 5:195337‑M1/1‑77 (MQ=255) tCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCgaagaggccgtatctggcgccgcggcgggacccggt < 6:195337‑M1/113‑37 (MQ=255) tCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCg > 6:369207/1‑148 (MQ=255) aaGACCACCTGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACCGGTTCCGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGt < 7:109391/147‑1 (MQ=255) aGACCACCTGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTAta > 3:1053/1‑148 (MQ=255) caccTGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACaa < 2:232883/89‑1 (MQ=255) caccTGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACaa > 1:232883/1‑89 (MQ=255) ccAGTTGCGC‑GGCTGATGTTTTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACCGGTTCAGCACACGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCgcggcg < 2:284637/149‑1 (MQ=255) cTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTa < 7:268384/148‑1 (MQ=255) cTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAg < 5:369207/149‑1 (MQ=255) tGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCgaagaggccgtatctggcgccgcggcgggacccggttagaagtccacgctagccgaaagctgataggt < 6:53787‑M1/116‑69 (MQ=255) tGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCgaagaggccgtatctggcgccgcggcgggacccggttagaagtccacgctagccgaaagctgataggt > 5:53787‑M1/1‑48 (MQ=255) tGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCGGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTa > 8:268384/1‑147 (MQ=255) aTTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCa > 1:343039/1‑149 (MQ=255) ttGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCAc > 7:213480/1‑149 (MQ=255) ttGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCAc > 4:338192/1‑149 (MQ=255) aTTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTACACGCTAg < 7:28659/148‑1 (MQ=255) tcTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGCCCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAg > 7:123247/1‑149 (MQ=255) tcTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAg < 2:62644/149‑1 (MQ=255) tcTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCACCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAATTCCACCCTAGCCCAAATCAGATAg > 8:75867/1‑149 (MQ=38) tGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAGGt < 3:307173/149‑1 (MQ=255) gcgGGCAGGCCCGCTCCCACCGGTTCAGCACAAGTCTGCGGGTGGGGCGGGACCTGGGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAGGTCCgcgg < 3:37134/149‑1 (MQ=38) tGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAGGTCCGCGGCGccccc < 2:60958/149‑1 (MQ=255) ccGCgaagaggccgtatctggcgccgcggcgggacccggttagaagtccac > 1:245857‑M1/1‑4 (MQ=255) ccGCgaagaggccgtatctggcgccgcggcgggacccggttagaagtccac < 2:245857‑M1/51‑48 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGTCCCGGTTAGAAGTCCCCGCTAGCCGAAAGCTGATAGGTCCGCGGCGCCCCCAAc > 7:250696/1‑149 (MQ=255) | CGTTCGGTGGGGGCAAGCAGTCGGGGTTTGGCCGCGATCTGTCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGC‑GGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAGGTCCGCGGCGCCCCCAAC > NC_002947/2958631‑2958924 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |