New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3891041 = | 58 (0.980) | 3 (0.050) | 3/242 | NT | 5.0% | coding (25/1587 nt) | PP_3435 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 3891104 = | 58 (1.040) | coding (88/1587 nt) | PP_3435 | hypothetical protein |
CTTATTGTTGTATTCGTAAATCGATTCTACATTGCGTAAAATGGTTTGTCGCGTTTTAGTTGCTCGTACGCGGCGACAAACGGCTATCCTC‑TCGTTTTTACTCCATGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTGGCCGTGATGAACTGGCAGGTCGAACGTGAAATGCAGGCCAGCAGCCACGCCACCACCCGCCAGGCGTTGGAGCACGTCGAA > NC_002947/3890896‑3891187 | cTTATTGTTGTATTCGTAAATCGATTCTACATTGCGTAAAATGGTTTGTCGCGTTTTAGTTGCTCGTACGCGGCGACAAACGGCTATCCTC‑TCGTTTTTACTCCATGATAGTCAGATCAGAATGCCCCTTACCGTCAAAcgccgcgccg > 2:264616/1‑149 (MQ=255) atgggctgtcagtcagtggaagtagcgaattggcggcacgggacaggttgtcgagtatgtgttcgacgtgctccaacgcctggcgggtggtggcgtggctgctggcctgcatttcacgttcgacctgccagttcatcacggccagg > 6:18510‑M1/146‑146 (MQ=255) atgggctgtcagtcagtggaagtagcgaattggcggcacgggacaggttgtcgaggatgtgttcgacgtgctccaacgcctggcgggtggtggcgtggctgctggcctgcatttcacgttcgacctgccagttcatcacggccagGCCg < 4:325204‑M1/4‑1 (MQ=255) aTTGTTGTATTCGTAAATCGATTCTACATTGCGTAAAATGGTTTGTCGCGTTTTAGTTGCTCGTACGCGGCGACAAACGGCTATCCTC‑TCGTTTTTACTCCATGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAAcgccgcg < 6:312691/143‑1 (MQ=255) aTTGTTGTATTCGTAAATCGATTCTACATTGCGTAAAATGGTTTGTCGCGTTTTAGTTGCTCGTACGCGGCGACAAACGGCTATCCTC‑TCGTTTTTACTCCATGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAAcgccgcg > 5:312691/1‑143 (MQ=255) ggctgtcagtcagtggaagtagcgaattggcggcacgggacaggttgtcgaggatgtgttcgacgtgctccaacgcctggcgggtggtggcgtggctgctggcctgcatttcacgttcgacctgccagttcatcacggccagGCCGCa > 3:325204‑M1/143‑148 (MQ=255) tgtcagtcagtggaagtagcgaattggcggcacgggacaggttgtcgaggatgtgttcgacgtgctccaacgcctggcgggtggtggcgtggctgctggcctgcatttcacgttcgacctgccagttcatcacggccagg < 7:344332‑M1/1‑1 (MQ=255) tgtcagtcagtggaagtagcgaattggcggcacgggacaggttgtcgaggatgtgttcgacgtgctccaacgcctggcgggtggtggcgtggctgctggcctgcatttcacgttcgacctgccagttcatcacggccagg > 8:344332‑M1/140‑140 (MQ=255) tCGTAAATCGATTCTACATTGCGTAAAATGGTTTGTCGCGTTTTAGTTGCTCGTACGCGGCGACAAACGGCTATCCTC‑TCGTTTTTACTCCATGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGgc < 8:136302/148‑1 (MQ=255) gTAAATCGATTCTACATTGCGTAAAATGGTTTGTCGCGTTTTAGTTGCTCGTACGCGGCGACAAACGGCTATCCTC‑TCGTTTTTACTCCATGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCa > 1:105519/1‑149 (MQ=255) aaTCGATTCTACATTGCGTAAAATGGTTTGTCGCGTTTTAGTTGCTCGTACGCGGCGACAAACGGCTATCCTC‑TCGTTTTTACTCCATGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGc > 8:225334/1‑149 (MQ=255) tCGATTCTACATTGCGTAAAATGGTTTGTCGCGTTTTAGTTGCTCGTACGCGGCGACAAACGGCTATCCTC‑TCGTTTTTACTCCATGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGctc > 3:80663/1‑149 (MQ=255) aTTCTACATTGCGTAAAATGGTTTGTCGCGTTTTAGTTGCTCGTACGCGGCGACAAACGGCTATCCTCGTGGTTTTTACTCCATGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCtt > 1:118117/1‑149 (MQ=255) aCATTGCGTAAAATGGTTTGTCGCGTTTTAGTTGCTCGTACGCGGCGACAAACGGCTATCCTC‑TCGTTTTTACTCCATGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTg > 6:7749/1‑149 (MQ=255) cATTGCGTAAAATGGTTTGTCGCGTTTTAGTTGCTCGTACGCGGCGACAAACGGCTATCCTC‑TCGTTTTTACTCCATGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTgg < 1:369249/149‑1 (MQ=255) cATTGCGTAAAATGGTTTGTCGCGTTTTAGTTGCTCGTACGCGGCGACAAACGGCTATCCTC‑TCGTTTTTACTCCATGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTgg < 2:301094/149‑1 (MQ=255) ttGCGTAAAATGGTTTGTCGCGTTTTAGTTGCTCGTACGCGGCGACAAACGGCTATCCTC‑TCGTTTTTACTCCATGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCa < 6:327687/133‑1 (MQ=255) gcggcacgggacaggttgtcgaggatgtgttcgacgtgctccaacgcctggcgggtggtggcgtggctgctggcctgcatttcacgttcgacctgccagttcatcacggccagGc < 8:125307‑M1/2‑1 (MQ=255) gcggcacgggacaggttgtcgaggatgtgttcgacgtgctccaacgcctggcgggtggtggcgtggctgctggcctgcatttcacgttcgacctgccagttcatcacggccagGc > 7:125307‑M1/114‑115 (MQ=255) tAAAATGGTTTGTCGCGGTTTAGTTGCTCGTACGCGGCGACAAACGGCTATCCTC‑TCGTTTTTACTCCATGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGtcgtcg < 4:173579/149‑1 (MQ=255) aaTGGTTTGTCGCGTTTTAGTTGCTCGTACGCGGCGACAAACGGCTATCCTC‑TCGTTTTTACTCCATGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCg < 5:272157/149‑1 (MQ=255) aggttgtcgaggatgtgttcgacgtgctccaacgcctggcgggtggtggcgtggctgctggcctgcatttcacgttcgacctgccagttcatcacggccagGCCg > 2:123074‑M1/102‑105 (MQ=255) aggttgtcgaggatgtgttcgacgtgctccaacgcctggcgggtggtggcgtggctgctggcctgcatttcacgttcgacctgccagttcatcacggccagGCCg < 1:123074‑M1/4‑1 (MQ=255) tGTCGCGTTTTAGTTGCTCGTACGCGGCGACAAACGGCTATCCTC‑TCGTTTTTACTCCATGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGtgctgc < 2:118117/148‑1 (MQ=255) tCGCGTTTTAGTTGCTCGTACGCGGCGACAAACGGCTATCCTC‑TCGTTTTTACTCCATGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCgg > 7:69601/1‑149 (MQ=255) gcgTTTTAGTTGCTCGTACGCGGCGACAAACGGCTATCCTC‑TCGTTTTTACTCCATGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGt < 2:105519/148‑1 (MQ=255) gTTTTAGTTGCTCGTACGCGGCGACAAACGGCTATCCTC‑TCGTTTTTACTCCATGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCAt > 5:347494/1‑149 (MQ=255) tGCTCGTACGCGGCGACAAACGGCTATCCTC‑TCGTTTTTACTCCATGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGc < 1:167981/148‑1 (MQ=255) cgacgtgctccaacgcctggcgggtggtggcgtggctgctggcctgcatttcacgttcgacctgccagttcatcacggccagGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTg > 7:251853‑M1/83‑148 (MQ=255) gacgtgctccaacgcctggcgggtggtggcgtggctgctggcctgcatttcacgttcgacctgccagttcatcacggccagGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGc > 6:19602‑M1/82‑144 (MQ=255) gacgtgctccaacgcctggcgggtggtggcgtggctgctggcctgcatttcacgttcgacctgccagttcatcacggccagGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGc < 5:19602‑M1/63‑1 (MQ=255) cgcgGCGACAAACGGCTATCCTC‑TCGTTTTTACTCCATGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTGGCCGt < 4:80663/148‑1 (MQ=255) cgcgGCGACAAACGGCTATCCTC‑TCGTTTTTACTCCATGATAGTCAGATCAGAATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTGCCCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTGGCCGt < 1:264616/149‑1 (MQ=255) gcggcgACAAACGGCTATCCTC‑TCGTTTTTACTCCATGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCAt < 7:288376/132‑1 (MQ=255) gcggcgACAAACGGCTATCCTC‑TCGTTTTTACTCCATGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCAt > 8:288376/1‑132 (MQ=255) gcggcgACAAACGGCTATCCTC‑TCGTTTTTACTCCATGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTGGCCGtga > 6:242865/1‑149 (MQ=255) cgACAAACGGCTATCCTC‑TCGTTTTTACTCCATGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTc > 5:64640/1‑126 (MQ=255) cgACAAACGGCTATCCTC‑TCGTTTTTACTCCATGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTc < 6:64640/126‑1 (MQ=255) aaCGGCTATCCTC‑TCGTTTTTACTCCATGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTGGCCGTGATGAACTGGc < 2:279830/149‑1 (MQ=255) aCGGCTATCCTC‑TCGTTTTTACTCCATGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTGGCCGTGATGAACTGGCa < 7:225334/149‑1 (MQ=255) ggCTATCCTC‑TCGTTTTTACTCCATGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTGGCCGTGATGAACTGGCAgg < 2:181106/149‑1 (MQ=255) ctc‑tCGTTTTTACTCCATGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTGGCCGTGATGAACTGGCAGGTCGAACg > 7:182823/1‑149 (MQ=255) tc‑tcGTTTTTACTCCATGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTgg < 1:72345/123‑1 (MQ=255) tc‑tcGTTTTTACTCCATGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTgg > 2:72345/1‑123 (MQ=255) tc‑tcGTTTTTACTCCATGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTGGCCGTGATGAACTGGCAGGTCGAACGt > 8:52015/1‑149 (MQ=255) tc‑tcGTTTTTACTCCATGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTGGCCGTGATGAACTGGCAGGTCGAACGt > 5:177082/1‑149 (MQ=255) c‑tcGTTTTTACTCCATGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTGGCCGTGATGAACTGGCAGGTCGAACGt > 5:328372/1‑148 (MQ=255) gTTTTTACTCCATGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTGGCCGTGATGAACTGGCAGGTCGAACGTGaa < 6:347494/148‑1 (MQ=255) cTCCATGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTGGCCGTGATGAACTGGCAGGTCGAACGTGAAATGCAGGc < 8:69601/149‑1 (MQ=255) cATGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTGGCCGTGATGAACTGGCAGGTCGAACGTGAAATGCAGGCca < 5:242865/148‑1 (MQ=255) aTGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCTGACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTGGCCGTGATGAACTGGCAGGTCGAACGTGAAATGCAGGc > 1:269737/1‑145 (MQ=255) aTGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTGGCCGTGATGAACTGGCAGGTCGAACGTGAAATGCAGGc < 2:269737/145‑1 (MQ=255) aGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTGGCCGTGATGAACTGGCAGGTCGAACGTGAAATGCAGGCCAGCAgcca > 4:92856/1‑149 (MQ=255) tCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTGGCCGTGATGAACTGGCAGGTCGAACGTGAAATGCAGGCCAGCAgccac > 4:349847/1‑148 (MQ=255) tCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTGGCCGTGATGAACTGGCAGGTCGAACGTGAAATGCAGGCCAGCAgccac < 3:349847/148‑1 (MQ=255) aGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTGGCCGTGATGAACTGGCAGGTCGAACGTGAAATGCAGGCCAGCAgccacgc > 2:221816/1‑148 (MQ=255) aGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATCTGCGGCCTGGCCGTGATGAACTGGCAGGTCGAACGTGAAATGCAGGCCAGCAgccacgcc > 5:124700/1‑149 (MQ=255) gATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTGGCCGTGATGAACTGGCAGGTCGAACGTGAAATGCAGGCCAGCAgccacgcca < 6:177082/149‑1 (MQ=255) aTCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTGGCCGTGATGAACTGGCAGGTCGAACGTGAAATGCAGGCCAGCAgccacgccac < 1:82036/149‑1 (MQ=255) aTCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTGGCCGTGATGAACTGGCAGGTCGAACGTGAAATGCAGGCCAGCAgccacgccac > 8:206035/1‑149 (MQ=255) ccccTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTGGCCGTGATGAACTGGCAGGTCGAACGTGAAATGCAGGCCAGCAgcgacgccac < 6:58649/140‑1 (MQ=255) ccccTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTGGCCGTGATGAACTGGCAGGTCGAACGTGAAATGCAGGCCAGCAgcgacgccac > 5:58649/1‑140 (MQ=255) ccTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTGGCCGTGATGAACTGGCAGGTCGAACGTGAAATGCAGGCCAGCAGCCACGCCACCACCCGCCAgg > 7:156177/1‑149 (MQ=255) aCCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTGGCCGTGATGAACTGGCAGGTCGAACGTGAAATGCAGGCCAGCAGCCACGCCACCACCCGCCAGGCGt < 3:92856/148‑1 (MQ=255) ccGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTGGCCGTGATGAACTGGCAGGTCGAACGTGAAATGCAGGCCAGCAGCCACGCCACCACCCGCCAGGCGTTg < 6:124700/149‑1 (MQ=255) cGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGcc < 7:282275/77‑1 (MQ=255) cGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGcc > 8:282275/1‑77 (MQ=255) gTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTGGCCGTGATGAACTGGCAGGTCGAACGTGAAATGCAGGCCAGCAGCCACGCCACCACCCACCAGGCGTTg > 4:87167/1‑147 (MQ=255) tCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTGGCCGTGATGAACTGGCAGGTCGAACGTGAAATGCAGGCCAGCAGCCACGCCACCACCCGCCAGGCGTTGGAg < 8:156177/149‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGCCGCAATCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCAGGTCATGTGCGGCCTGGCCGTGATGAACTATCAGGTCGAACGTGAAATGCAGGCCAGAAGCCACGCCACAACCCGCAAGGCGTTGGAGCAc > 8:203657/1‑149 (MQ=255) aaCGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTGGCCGTGATGAACTGGCAGGTCGAACGTGAAATGCAGGCCAGCAGCCACGCCACCACCCGCCAGGCGTTGGAGCAc > 4:92871/1‑149 (MQ=255) aCGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTGGCCGTGATGAACTGGCAGGTCGAACGTGAAATGCAGGCCAGCAGCCACGCCACCACCCGCCAGGCGTTGGAGCACg < 7:52015/149‑1 (MQ=255) aCGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTGGCCGTGATGAACTGGCAGGTCGAACGTGAAATGCAGGCCAGCAGCCACGCCACCACCCGCCAGGCGTTGGAGCACg < 5:7749/149‑1 (MQ=255) gcgccgcACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTGGCCGTGATGAACTGGCAGGTCGAACGTGAAATGCAGGCCAGCAGCCACGCCACCACCCGCCAGGCGTTGGa > 3:230908/1‑139 (MQ=255) gcgccgcACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTGGCCGTGATGAACTGGCAGGTCGAACGTGAAATGCAGGCCAGCAGCCACGCCACCACCCGCCAGGCGTTGGa < 4:230908/139‑1 (MQ=255) gcgccgcACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTGGCCGTGATGAACTGGCAGGTCGAACGTGAAATGCAGGCCAGCAGCCACGCCACCACCCGCCAGGCGTTGGAGCACGTCGaa < 7:206035/149‑1 (MQ=255) | CTTATTGTTGTATTCGTAAATCGATTCTACATTGCGTAAAATGGTTTGTCGCGTTTTAGTTGCTCGTACGCGGCGACAAACGGCTATCCTC‑TCGTTTTTACTCCATGATAGTCAGATCAGCATGCCCCTTACCGTCAAACGCCGCGCCGCACTCAGCTGGCGCACGCTCTTG‑CCCTGGGTCGTCGGCGTGCTGCCGGTCATGTGCGGCCTGGCCGTGATGAACTGGCAGGTCGAACGTGAAATGCAGGCCAGCAGCCACGCCACCACCCGCCAGGCGTTGGAGCACGTCGAA > NC_002947/3890896‑3891187 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |