New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5594092 = | 46 (0.780) | 11 (0.240) | 7/200 | NT | 24.2% | intergenic (‑39/+106) | PP_4921/thiC | NCS1 family transporter/phosphomethylpyrimidine synthase |
? | NC_002947 | 5594185 = | 33 (0.710) | intergenic (‑132/+13) | PP_4921/thiC | NCS1 family transporter/phosphomethylpyrimidine synthase |
ATCAGGCCGATGCCGAGGGAAAACCACAGTGAAAACAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCG > NC_002947/5593944‑5594239 | tcgatgaagatcacccaggaagtgcgtgagtacgctgccaagatcgaggccgtggatgtgacggtcgagcaaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcacctta < 4:126067‑M1/1‑1 (MQ=255) tCAGGCCGATGCCGAGGGAAAACCACAGTGAAAACAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGTTTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATAcaccac > 4:96204/1‑149 (MQ=255) gatgaagatcacccaggaagtgcgtgagtacgctgccaagatcgaggccgtggatgtgacggtcgagcaaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttAcc < 3:136696‑M1/3‑1 (MQ=255) gCCGATGCCGAGGGAAAACCACAGTGAAAACAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGAGGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCtg > 6:73020/1‑149 (MQ=255) gATGCCGAGGGAAAACCACAGTGAAAACAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTgg < 7:276560/149‑1 (MQ=255) tcacccaggaagtgcgtgagtacgctgccaagatcgaggccgtggatgtgacggtcgagcaaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTgg < 3:258868‑M1/9‑1 (MQ=255) tcacccaggaagtgcgtgagtacgctgccaagatcgaggccgtggatgtgacggtcgagcaaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTgg < 1:335991‑M1/9‑1 (MQ=255) cacccaggaagtgcgtgagtacgctgccaagatcgaggccgtggatgtgacggtcgagcaaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAg < 5:4107‑M1/12‑1 (MQ=255) cGAGGGAAAACCACAGTGAAAACAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCg > 5:332898/1‑149 (MQ=255) aggaagtgcgtgagtacgctgccaagatcgaggccgtggatgtgacggtcgagcaaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCGGGc < 5:64975‑M1/17‑1 (MQ=255) aggaagtgcgtgagtacgctgccaagatcgaggccgtggatgtgacggtcgagcaaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCGGGc < 4:252689‑M1/17‑1 (MQ=255) aagtgcgtgagtacgctgccaagatcgaggccgtggatgtgacggtcgagcaaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttCCCCTGTGGGAGCGGGCTTg < 4:119069‑M1/20‑1 (MQ=255) aagtgcgtgagtacgctgccaagatcgaggccgtggatgtgacggtcgagcaaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCGGGCTTg > 5:366793‑M1/130‑149 (MQ=255) gtgcgtgagtacgctgccaagatcgaggccgtggatgtgacggtcgagcaaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCGGGCTTGcc < 5:350028‑M1/22‑1 (MQ=255) aaCCACAGTGAAAACAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGcc < 7:126090/149‑1 (MQ=255) tgcgtgagtacgctgccaagatcgaggccgtggatgtgacggtcgagcaaggcatgcgttagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCGGGCTTGcc‑c > 3:192483‑M1/127‑149 (MQ=255) cgtgagtacgctgccaagatcgaggccgtggatgtgacggtcgagcaaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑cgc > 5:266548‑M1/125‑149 (MQ=255) cgtgagtacgctgccaagatcgaggccgtggatgtgacggtcgagcaaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑cgc > 3:252689‑M1/125‑149 (MQ=255) cacaGTGAAAACAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑cgc > 5:81377/1‑149 (MQ=255) tgagtacgctgccaagatcgaggccgtggatgtgacggtcgagcaaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGa > 3:317967‑M1/123‑149 (MQ=255) caGTGAAAACAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑cgcg > 3:220909/1‑148 (MQ=255) aaaaCAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAacac < 3:96204/148‑1 (MQ=255) aaaCAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCg < 5:73020/149‑1 (MQ=255) aaCAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCgg < 4:105467/149‑1 (MQ=255) aaCAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCgg > 2:372414/1‑149 (MQ=255) ggTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCGGCa > 1:313083/1‑147 (MQ=255) gAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑cgc > 3:230335/1‑130 (MQ=255) gAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑cgc < 4:230335/130‑1 (MQ=255) gCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCGTTCC‑CGCCAACACCCGCAAAGCCGGttc > 1:352525/1‑147 (MQ=255) cACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGCTTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGcc < 6:204346/149‑1 (MQ=255) gccgtggatgtgacggtcgagcaaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCAt < 4:3408‑M1/49‑1 (MQ=255) cgcTGCTGGATGGGGAATGGATTGTCTTGAGAGAACTGTCTGGGTTATGTCATGGTCATGTCCGCAGTAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCa < 6:184857/148‑1 (MQ=37) gctgctTGTTGGGGATTGGATGCTCGGGAGAGAACTGGCTGTGTGATGTCAGGTTAATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGt < 2:277579/149‑1 (MQ=37) gctgctGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCATGGCACCggctt < 2:220008/149‑5 (MQ=255) ctgGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGtgctt < 6:81377/149‑1 (MQ=255) ggATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCTCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATg < 1:216219/135‑1 (MQ=255) ggATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATg > 2:216219/1‑134 (MQ=255) gATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGtgcttg < 3:111428/147‑1 (MQ=255) gcaaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTcg < 4:250898‑M1/69‑1 (MQ=255) gcaaggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctctaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTcg < 4:255865‑M1/69‑1 (MQ=255) ggATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTcgcg > 5:71731/1‑149 (MQ=255) gATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCgg < 1:372414/149‑1 (MQ=255) gATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCgg < 4:220909/149‑1 (MQ=255) aggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGtgcttg < 5:334505‑M1/64‑1 (MQ=255) aggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGtgcttg > 6:334505‑M1/78‑141 (MQ=255) aggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCgg > 3:255865‑M1/78‑149 (MQ=255) aggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCgg > 3:119069‑M1/78‑149 (MQ=255) aggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCgg > 3:3408‑M1/78‑149 (MQ=255) aggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCgg > 3:250898‑M1/78‑149 (MQ=255) gATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAg > 6:92224/1‑149 (MQ=255) gATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCGGCAAAGCCCGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAg > 5:291945/1‑149 (MQ=255) aTGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTTAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGc < 5:83659/149‑1 (MQ=255) tCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCg > 4:136696/1‑148 (MQ=255) tCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGc < 6:332898/149‑1 (MQ=255) gggAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGGTTGGC‑CGCGCACACCGGCAAAGCCCGTGCCATTCACCGGAGTGCTTGCGTCGCGGGCAAGCCCGCTc > 2:335991/1‑149 (MQ=255) agagaACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCAAGCACTGCGGtgcatggc > 6:92291/1‑126 (MQ=37) gaACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAg > 8:267050/1‑149 (MQ=255) ctggGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGCACCGCCGCCAAGCCGGTGCCCTGCACCCCAGTGCTTGCTTAGCCGGCAAGCCCGCGCCCCCACGGGAAgg > 6:4107/1‑149 (MQ=37) tggGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAgg < 7:75637/142‑1 (MQ=255) tggGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAgg > 8:75637/1‑142 (MQ=255) gggTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGtg > 2:288854/1‑149 (MQ=255) gccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCggg > 8:4280‑M1/49‑121 (MQ=255) gccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCggg < 7:4280‑M1/73‑1 (MQ=255) tcatggtcatgTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGCACACCGGCAAAGCCCGTGCCATGCACCCCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGtt > 3:94010/1‑149 (MQ=255) tcatggtcatgTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCCCAGGGGAAGGTGCTGCGGtt > 3:289353/1‑149 (MQ=255) atggtcatgTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCC‑CCCGAACACCCGCCAACCCCGTGCCCAGCACCGCAGTGCTTGCTTAGCGGGCAAGCCCCCGCCCACACGGGAAGGTGcggcgggt > 1:194049/1‑145 (MQ=25) atgTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTTGC‑CGCGAACACCGGCAAAACCCGTGCCATGCAACGCAGTGCTTTGTTCGCGGGCCAGCCCGCTCCCACACGCTAAGGTTCTGCGGTTTATACttt > 8:173505/1‑149 (MQ=255) tgTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTTCC‑CCCCAACACCGGCAAAGCCGGTGCCAAGCAACCCACTGCTTTCTTAGCGGCGAAGCCCGCACCCACAAGGTAACGGGCTGCGGGTTAGACTTtg > 6:204806/1‑149 (MQ=25) tCCGCAGGAGTTATTTTAAGTGGCATACACCCCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGGTAACACCGGCAACGCGGGTGCCATGCACCGCAGTGGTTGCTTGGGGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTtgtg < 4:94010/149‑1 (MQ=37) gCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTa < 5:92224/149‑1 (MQ=255) 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ATCAGGCCGATGCCGAGGGAAAACCACAGTGAAAACAGGTCGCGAGCACCGAAAATGCGCTGCTGGATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCC‑CGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCG > NC_002947/5593944‑5594239 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |