New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5652405 = | 76 (1.290) | 4 (0.070) | 4/246 | NT | 5.3% | coding (65/1065 nt) | fba | fructose‑bisphosphate aldolase |
? | NC_002947 | 5652444 = | 70 (1.230) | coding (26/1065 nt) | fba | fructose‑bisphosphate aldolase |
TTCGATGGCAGCCAGGATCAGGTGGCGCAGGAATGGCGCACCCGCGTATTTGCGGGCACCGGCCGAAGCCTGAACGATCACCGGGGAGTCGGTCTTGTCGGCCGCTTCCATGATGGCGCGCATCTGCTCGAGGTTGTTGACGTTGAAAGCTGGTACGCCGTAGCCGAACTCGGCGGCGTGGT‑CCAGCATCTGGCGCATGCTAATGAGTGCCATTGTGTATCTCTCTCCCGACAAGCGTCGTTTGTTTCGTGCAAGCCTGCCGCAGGGGCGGTTGCTGTTCAAGTAGTGTGGG > NC_002947/5652257‑5652548 | ttCGATGGCAGCCAGGATCAGGTGGCGCAGGAATGGCGCACCCGCGTATTTGCGGGCACCGGCCGAAGCCTGAACGATCACCGGGGAGTCGGTCTTGTCGGCCGCTTCCATGATGGCGCGCATCTGCTCGAGGTTGTTGACGTTGAAAg > 5:14241/1‑149 (MQ=255) cGATTGCAGCCAGGATCAGGTGGCGCAGGAATGGCGCACCCGCGTATTTGCGGGCACCGGCCGAAGCCTGAACGATCACCGGGGAGTCGGTCTTGTCGGCCGCTTCCATGATGGCGCGCATCTGCTCGAGGTTGTTGACGTTGAAAGc < 6:366944/148‑1 (MQ=255) gggctgcaaggcaccgtgactggccgggccgcgagggtggcccacactacttgaacagcaaccgcccctgcggcaggcttgcacgaaacaaacgacgcttgtcgggagagagatacacaatggcactcattagcatgcgccagatGCTg < 7:251857‑M1/4‑1 (MQ=255) ggctgcaaggcaccgtgactggccgggccgcgagggtggcccacactacttgaacagcaaccgcccctgcggcaggcttgcacgaaacaaacgacgcttgtcgggagagagatacacaatggcactcattagcatgcgccagatGCTgg > 6:66633‑M1/145‑149 (MQ=255) aGCCAGGATCAGGTGGCGCAGGAATGGCGCACCCGCGTATTTGCGGGCACCGGCCGAAGCCTGAACGATCACCGGGGAGTCGGTCTTGTCGGCCGCTTCCATGATGGCGCGCATCTGCTCGAGGTTGTTGACGTTGAAAGCTGGTACGc > 6:156069/1‑149 (MQ=255) ccAGGATCAGGTGGCGCAGGAATGGCGCACCCGCGTATTTGCGGGCACCGGCCGAAGCCTGAACGATCACCGGGGAGTCGGTCTTGTCGGCCGCTTCCATGATGGCGCGCATCTGCTCGAGGTTGTTGACGTTGAAAGCTGGTACGCCg > 1:200523/1‑149 (MQ=255) cAGGATCAGGTGGCGCAGGAATGGCGCACCCGCGTATTTGCGGGCACCGGCCGAAGCCTGAACGATCACCGGGGAGTCGGTCTTGTCGGCCGCTTCCATGATGGCGCGCATCTGCTCGAGGTTGTTGACGTTGAAAGCTGGTACGCCGt < 2:256667/149‑1 (MQ=255) ggATCAGGTGGCGCAGGAATGGCGCACCCGCGTATTTGCGGGCACCGGCCGAAGCCTGAACGATCACCGGGGAGTCGGTCTTGTCGGCCGCTTCCATGATGGCGCGCATCTGCTCGAGGTTGTTGACGTTGAAAGCTGGTACGCCGTAg < 3:158173/149‑1 (MQ=255) gATCAGGTGGCGCAGCAATGCCGCAAACGCGTATTTGCGGGCACCGGCCGAAGCCTGAACGATCACCGGGGAGTCGGTCTTGTCGGCCGCTTACATGATGGCGAGCATCTGCTCGAGGTTGTTGACGTTCAAAGCTGGTACGCCCTAGc > 6:183209/1‑149 (MQ=255) ggTGGCGCAGGAATGGCGCACCCGCGTATTTGCGGGCACCGACCGAAGCCTGAACGATCACCGGGGAGTCGGTCTTGTCGGCCGCTTCCATGATGGCGCGCATCTGCTCGAGGTTGTTGACGTTGAAAGCTGGTACGACGTAGCCGaa > 8:122685/1‑148 (MQ=255) gcAGGAATGGCGCACCCGCGTATTTGCGGGCACCGGCCGAAGCCTGAACGATCACCGGGGAGTCGGTCTTGTCGGCCGCTTCCATGATGGCGCGCATCTGCTCGAGGTTGTTGACGTTGAAAGCTGGTACGCCGTAGCCGAACTcggcg < 8:231423/149‑1 (MQ=255) gcAGGAATGGCGCACCCGCGTATTTGCGGGCACCGGCCGAAGCCTGAACGATCACCGGGGAGTCGGTCTTGTCGGCCGCTTCCATGATGGCGCGCATCTGCTCGAGGTTGTTGACGTTGAAAGCTGGTACGCCGTAGCCGAACTcggcg < 1:129647/149‑1 (MQ=255) gAATGGCGCACCCGCGTATTTGCGGGCACCGGCCGAAGCCTGAACGATCACCGGGGAGTCGGTCTTGTCGGCCGCTTCCATGATGGCGCGCATCTGCTCGAGGTTGTTGACGTTGAAAGCTGGTACGCCGTAGCCGAACTCGGCGGCGt > 6:132323/1‑149 (MQ=255) tGGCGCACCCGCGTATTTGCGGGCACCGGCCGAAGCCTGAACGATCACCGGGGAGTCGGTCTTGTCGGCCGCTTCCATGATGGCGCGCATCTGCTCGAGGTTGTTGACGTTGAAAGCTGGTACGCCGTAGCCGAACTCGGCGGCGTGGt > 2:244973/1‑149 (MQ=255) 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aaGCCTGAACGATCACCGGGGAGTCGGTCTTGTCGGCCGCTTCCATGATGGCGCGCATCTGCTCGAGGTTGTTGACGTTGAAAGCTGGTACGCCGTAGCCGAACTCGGCGGCGTGGT‑CCAGCATCTGGCGCATGCTAATGAGTGCCAtt < 5:35311/149‑1 (MQ=255) tGAACGATCACCGGGGAGTCGGTCTTGTCGGCCGCTTCCATGATGGCGCGCATCTGCTCGAGGTTGTTGACGTTGAAAGCTGGTACGCCGTAGCCGAACTCGGCGGCGTGGT‑CCAGCATCTGGCGCATGCTAATGAGTGCCATTGTGTa > 3:348973/1‑149 (MQ=255) gAACGATCACCGGGGAGTCGGTCTTGTCGGCCGCTTCCATGATGGCGCGCATCTGCTCGAGGTTGTTGAAGTTGAAAGCTGGTACGCCGTAGCCGAACTCGGCGGCGTGGT‑CCAGCATCTGGCGCATGCTAATGAGTGCCATTGTGTa > 1:28951/1‑148 (MQ=255) aCGATCACCGGGGAGTCGGTCTTGTCGGCCGCTTCCATGATGGCGCGCATCTGCTCGAGGTTGTTGACGTTGAAAGCTGGTACGCCGTAGCCGAACTCGGCGGCGTGGT‑CCAGCATCTGGCGCATGCTAATGAGTGCCATTGTGTAtct < 8:29713/149‑1 (MQ=255) gATCACCGGGGAGTCGGTCTTGTCGGCCGCTTCCATGATGGCGCGCATCTGCTCGAGGTTGTTGACGTTGAAAGCTGGTACGCCGTAGCCGAACTCGGCGGCGTGGT‑CCAGCATCTGGCGCATGCTAATGAGt < 4:50653/133‑1 (MQ=255) gATCACCGGGGAGTCGGTCTTGTCGGCCGCTTCCATGATGGCGCGCATCTGCTCGAGGTTGTTGACGTTGAAAGCTGGTACGCCGTAGCCGAACTCGGCGGCGTGGT‑CCAGCATCTGGCGCATGCTAATGAGt > 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ggTTGTTGACGTTGAAAGCTGGTACGCCGTAGCCGAACTCGGCGGCGTGGT‑CCAGCATCTGGCGCATGCTAATGAGTGCCATTGTGTATCTCTCTCCCGACAAGCGTCGTTTGTTTCGTGCAAGCCTGCCGCAGGGGCGGTTGCTGTTc < 4:223670/149‑1 (MQ=255) gttgttGACGTTGAAAGCTGGTACGCCGTAGCCGAACTCGGCGGCGTGGT‑CCAGCATCTGGCGCATGCTAATGAGTGCCATTGTGTATCTCTCTCCCGACAAGCGTCGTTTGTTTCGTGCAAGCCTGCCGCAGGGGCGGTTGCTGTTc < 5:365801/148‑1 (MQ=255) ttgttgACGTTGAAAGCTGGTACGCCGTAGCCGAACTCGGCGGCGTGGT‑CCAGCATCTGGCGCATGCTAATGAGTGCCATTGTGTATCTCTCTCCCGACAAGCGTCGTTTGTTTCGTGCAAGCCTGCCGCAGGGGCGGTTGCTGTTCaa < 6:298215/149‑1 (MQ=255) gttgACGTTGAAAGCTGGTACGCCGTAGCCGAACTCGGCGGCGTGGT‑CCAGCATCTGGCGCATGCTAATGAGTGCCATTGTGTATCTCTCTCCCGACAAGCGTCGTTTGTTTCGTGCAAGCCTGCCGCAGGGGCGGTTGCTGTTCAag > 5:6029/1‑148 (MQ=255) ttgACGTTGAAAGCTGGTACGCCGTAGCCGAACTCGGCGGCGTGGT‑CCAGCATCTGGCGCATGCTAATGAGTGCCATTGTGTATCTCTCTCCCGACAAGCGTCGTTTGTTTCGTGCAAGCCTGCCGCAGGGGCGGTTGCTGTTc < 6:341009/144‑1 (MQ=255) ttgACGTTGAAAGCTGGTACGCCGTAGCCGAACTCGGCGGCGTGGT‑CCAGCATCTGGCGCATGCTAATGAGTGCCATTGTGTATCTCTCTCCCGACAAGCGTCGTTTGTTTCGTGCAAGCCTGCCGCAGGGGCGGTTGCTGTTc > 5:341009/1‑144 (MQ=255) tgACGTTGAAAGCTGGTACGCCGTAGCCGAACTCGGCGGCGTGGT‑CCAGCATCTGGCGCATGCTAATGAGTGCCATTGTGTATCTCTCTCCCGACAAGCGTCGTTTGTTTCGTGCAAGCCTGCCGCAGGGGCGGTTGCTGTTCAagtag > 2:2959/1‑149 (MQ=255) aCGTTGAAAGCTGGTACGCCGTAGCCGAACTCGGCGGCGTGGT‑CCAGCATCTGGCGCATGCTAATGAGTGCCATTGTGTATCTCTCTCCCGACAAGCGTCGTTTGTTTCGt > 4:35572/1‑111 (MQ=255) aCGTTGAAAGCTGGTACGCCGTAGCCGAACTCGGCGGCGTGGT‑CCAGCATCTGGCGCATGCTAATGAGTGCCATTGTGTATCTCTCTCCCGACAAGCGTCGTTTGTTTCGt < 3:35572/111‑1 (MQ=255) gTTGAAAGCTGGTACGCCGTAGCCGAACTCGGCGGCGTGGT‑CCAGCATCTGGCGCATGCTAATGAGTGCCATTGTGTATCTCTCTCCCGACAAGCGTCGTTTGTTTCGTGCAAGCCTGCCGCAGGGGCGGTTGCTGTTCAAGTAGtgtg < 7:21719/149‑1 (MQ=255) gTTGAAAGCTGGTACGCCGTAGCCGAACTCGGCGGCGTGGT‑CCAGCATATGGCGCATGCTAATGAGTGCCATTGTGTATCTCTCTACCGACAATCGTCGTTTGTTTCTTGCAAGCCTGCCGCAGGGGCGGTTGCTGTTAAAGTAGtgtg > 3:111836/1‑149 (MQ=255) ttGAAAGCTGGTACGCCGTAGCCGAACTCGGCGGCGTGGT‑CCAGCATCTGGCGCATGCTAATGAGTGCCATTGTGTATCTCTCTCCCGACAAGCGTCGTTTGTTTCGTGCAAGCCTGCCGCAGGGGCGGTTGCTGTTCAAGTAGTGTgg > 4:238890/1‑149 (MQ=255) gAAAGCTGGTACGCCGTAGCCGAACTCGGCGGCGTGGT‑CCAGCATCTGGCGCATGCTAATGAGTGCCATTGTGTATCTCTCTCCCGACAAGCGTCGTTTGTTTCGTGCAAGCCTGCCGCAGGGGCGGTTGCTGTTCAAGTAGTGTggg < 3:238890/148‑1 (MQ=255) GCTGGTACGCCGTAGCCGAACTCGGCGGCGTGGT‑CCAGCATCTGGCGCATGCTAATGAGTGCCATTGTGTATCTCTCTCCCGACAAGCGTCGTTTGTTTCGt > 5:11872‑M1/1‑102 (MQ=255) GCTGGTACGCCGTAGCCGAACTCGGCGGCGTGGT‑CCAGCATCTGGCGCATGCTAATGAGTGCCATTGTGTATCTATCTCCCGACAAGCGTCGTTTGTTTCGt < 6:11872‑M1/102‑1 (MQ=255) | TTCGATGGCAGCCAGGATCAGGTGGCGCAGGAATGGCGCACCCGCGTATTTGCGGGCACCGGCCGAAGCCTGAACGATCACCGGGGAGTCGGTCTTGTCGGCCGCTTCCATGATGGCGCGCATCTGCTCGAGGTTGTTGACGTTGAAAGCTGGTACGCCGTAGCCGAACTCGGCGGCGTGGT‑CCAGCATCTGGCGCATGCTAATGAGTGCCATTGTGTATCTCTCTCCCGACAAGCGTCGTTTGTTTCGTGCAAGCCTGCCGCAGGGGCGGTTGCTGTTCAAGTAGTGTGGG > NC_002947/5652257‑5652548 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |