| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 594771 = | 40 (0.680) | 6 (0.110) | 4/234 | NT | 11.2% | intergenic (‑10/+117) | PP_0505/PP_0506 | hypothetical protein/ABC transporter permease |
| ? | NC_002947 | 594856 = | 59 (1.090) | intergenic (‑95/+32) | PP_0505/PP_0506 | hypothetical protein/ABC transporter permease | |||||
CCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGCCAGCAAGGTCCATTCATGGG > NC_002947/594714‑595003 | ccATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCgg > 8:173965/1‑149 (MQ=255) ggCATCGCTACCAGCAACAGCATGGCCAGCAGCAGGTGAATTGCGGGCCTGTTCGCGGGCATGCCCGGTCCCACCGGTACTGCTCTAGTTCCAAAGGCTGCGGGGGTCCCTGTGGGAGGGGGGGGGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGgt < 8:280615/148‑1 (MQ=255) aTCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGttt > 5:215766/1‑149 (MQ=255) tCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGttt > 7:198309/1‑148 (MQ=255) cTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGAt > 7:106552/1‑148 (MQ=255) agcaacagcaaGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTAc < 5:160351/149‑1 (MQ=255) caacagcaaGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTAcgc > 2:108134/1‑149 (MQ=255) cagcaaGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCgg > 3:244626/1‑125 (MQ=255) caaGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGt > 7:224512/1‑123 (MQ=255) caaGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATGATTACGCGCACt > 5:260891/1‑148 (MQ=255) gcagcaTGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGgtg > 8:31532/1‑148 (MQ=255) ccgcaTGGCCATGGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCCCCCACCGTAACTCCACACGCACCAAAGCCTGGGGGGCTCCCTGTGGGAGGGGGGGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTa < 2:314267/147‑1 (MQ=255) ccGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTca < 7:31532/149‑1 (MQ=255) ggCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTAc > 5:155233/1‑116 (MQ=255) ggCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTcagc > 7:330798/1‑149 (MQ=255) ggCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTcagc > 7:325639/1‑149 (MQ=255) ctctTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTcagccag > 6:184238/1‑149 (MQ=255) TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGa < 6:194143‑M1/149‑1 (MQ=255) gaGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGAt < 1:267553‑M1/147‑1 (MQ=255) CGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGAt > 7:173965‑M1/1‑148 (MQ=255) GCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTg < 3:301517‑M1/149‑1 (MQ=255) GGCATGCCCGCTCCCACCGGTACTCCACAAGCTCCAATCCCGGCGGGGCTCCCTGGGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCg > 2:267553‑M1/1‑149 (MQ=255) gCATGCCCGGTCCCCCCTGTACTGCCAAACGCCCAAACGCGGGGGGGCGACCTGGGGGTCGGGGGGTGCCCGGGTATGCTGGGGGTTAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCg < 1:108134/149‑1 (MQ=255) cccGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAg < 5:2087/148‑1 (MQ=255) cccGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGc < 2:295020/149‑1 (MQ=255) ccgctcccacagggagccccgcaggctttggggcttgtgcagtacctgtgggagcgggcatgcccgcgaag‑AGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGccc > 8:351992‑M2/72‑149 (MQ=255) cgctcccacagggagccccgcaggctttggagcttgtgcagtacctgtgggagcgggcatgcccgcgaagCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGccc > 8:30113‑M2/71‑149 (MQ=255) ctcccacagggagccccgcaggctttggagcttgtgcagtacctgtgggagcgggcatgcccgcgaagCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGcc < 7:19865‑M2/53‑1 (MQ=255) ctcccacagggagccccgcaggctttggagcttgtgcagtacctgtgggagcgggcatgcccgcgaagCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGcc < 7:14353‑M2/53‑1 (MQ=255) ctcccacagggagccccgcaggctttggagcttgtgcagtacctgtgggagcgggcatgcccgcgaagCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGcc > 8:14353‑M2/69‑121 (MQ=255) ctcccacagggagccccgcaggctttggagcttgtgcagtacctgtgggagcgggcatgcccgcgaagCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGcc > 8:19865‑M2/69‑121 (MQ=255) ccACGGGTCCTGCACAAGCCCCAACGCCGGGGGGGCGCCCTGGGGGCGGGGGGGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGcc < 8:330798/147‑1 (MQ=255) ccACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGgt > 4:363017/1‑78 (MQ=255) ccACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGgt < 3:363017/78‑1 (MQ=255) acaGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAg < 7:205510/139‑1 (MQ=255) acaGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAg > 8:205510/1‑139 (MQ=255) acaGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGc > 3:186633/1‑149 (MQ=255) acaGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACACAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGc > 1:309109/1‑149 (MQ=255) gTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGc > 6:273536/1‑145 (MQ=255) gTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGc < 5:273536/145‑1 (MQ=255) acaAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGc > 3:8011/1‑149 (MQ=255) caAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGCGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCgg < 4:214386/123‑1 (MQ=255) caAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGCGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCgg > 3:214386/1‑123 (MQ=255) caAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGcc > 5:183842/1‑149 (MQ=255) tCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCAt > 8:206067/1‑147 (MQ=255) cAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCa < 5:184238/147‑1 (MQ=255) cAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAg > 8:234242/1‑148 (MQ=255) cAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAg > 2:63990/1‑148 (MQ=255) cAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAg > 6:220167/1‑148 (MQ=255) cAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAg > 6:235357/1‑148 (MQ=255) aaaGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGc > 1:17022/1‑148 (MQ=255) aGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAAc < 5:194143/149‑1 (MQ=255) cTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAAcgcg < 8:198309/149‑1 (MQ=255) cTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAAcgcg < 3:293702/149‑1 (MQ=255) tGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCgg > 1:323578/1‑149 (MQ=255) tGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCgg > 4:224528/1‑149 (MQ=255) cGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCgg < 4:301517/147‑1 (MQ=255) gCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGc > 3:91095/1‑128 (MQ=255) gCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGc < 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7:234242/147‑1 (MQ=255) ggAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGTCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGTACAGGCCGTCATACAGCGATTGCCGGTAACACCGCCACGCCGTCACGCTGCCCAGCAGCAACGCGGCCACCAGgatgaaacc > 4:212901/1‑145 (MQ=255) aGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCag < 4:77208/55‑1 (MQ=255) aGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCag > 3:77208/1‑55 (MQ=255) aGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCa < 5:96571/122‑1 (MQ=255) aGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCa > 6:96571/1‑122 (MQ=255) gCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGCCAGCAAg > 1:237742/1‑149 (MQ=255) tgcccgcgaagCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGCCAGCAAGGTc < 3:212901‑M2/138‑1 (MQ=255) tgcccgcgaagCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGCCAGCAAGGTc < 1:63990‑M2/138‑1 (MQ=255) gcccgcgaagCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGCCAGCAAGGTc > 4:154730‑M2/11‑148 (MQ=255) ccgcgaagCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGc > 7:343990‑M2/9‑136 (MQ=255) ccgcgaagCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGc < 8:343990‑M2/128‑1 (MQ=255) ccgcgaagCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGCCAGCAAGGTCCAt < 2:323578‑M2/141‑1 (MQ=255) gaagCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGCCAGCAAGGTCCATTCAt < 5:220167‑M2/145‑1 (MQ=255) agCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGCCAGCAAGGTCCATTCATgg < 5:235357‑M2/147‑1 (MQ=255) gCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGCCAGCAAGGTCCATTCATggg < 3:154730‑M2/148‑1 (MQ=255) cAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGCCAGCAAGGTCCATTCATggg > 3:114179/1‑148 (MQ=255) | CCATAGAGGCATCGCTACCAGCAACAGCAAGGCCAGCAGCATGTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACAAGCTCCAAAGCCTGCGGGGCTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCG‑AAGCAGGCGGTGAGGTGTTTGATCATTACGCGCACTCAGAGGTGTATGGACAGGCCGTCAGCCAGCGATTGCCGGTAAGCCCGCCACGCCGGCACGCTGCCCATCAGCAACGCGGCCCCCAGGATGATAGCCAGCAAGGTCCATTCATGGG > NC_002947/594714‑595003 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |