New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2092024 | 53 (0.900) | 3 (0.050) | 3/246 | NT | 6.1% | coding (1350/1680 nt) | deaD | ATP‑dependent DEAD‑box RNA helicase DeaD |
? | NC_002947 | = 2092057 | 42 (0.740) | coding (1383/1680 nt) | deaD | ATP‑dependent DEAD‑box RNA helicase DeaD |
GGGTTGCAGCGCGCGTGCCCTGGCTTCGGCCCTGCTGCGCAAGGCCACCAATGGCCAGGCGCTGGACCTGGCGGCGGTAGAGCGTGAGCAGCCGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGATCGTGGTGACCGTGAGCGCCGTGCACCGTTGCCGTTGGCCGAAGGCCGCGTGCGTTGCCGTACCGCCTTGGGTGCCCGTGATGGCATCGCTGCCAAGAATCTGCTGGGGGCGATCCTCAACGAAGGTGG > NC_002947/2091913‑2092200 | gggTTGCAGCGCGCGTGCCCTGGCTTCGGCCCTGCTGCGCAAGGCCACCAATGGCCAGGCGCTGGACCTGGCGGCGGTAGAGCGTGAGCAGCCGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTggc < 6:46464‑M2/148‑4 (MQ=255) ggTTGCAGCGCGCGTGCCCTGGCTTCGGCCCTGCTGCGCAAGGCCACCAATGGCCAGGCGCTGGACCTGGCGGCGGTAGAGCGTGAGCAGCCGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTggc < 6:368874‑M2/147‑4 (MQ=255) gTTGCAGCGCGCGTGCCCTGGCTTCGGCCCTGCTGCGCAAGGCCACCAATGGCCAGGCGCTGGACCTGGCGGCGGTAGAGCGTGAGCAGCCGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAg > 3:286225/1‑149 (MQ=255) cAGCGCGCGTGCCCTGGCTTCGGCCCTGCTGCGCAAGGCCACCAATGGCCAGGCGCTGGACCTGGCGGCGGTAGAGCGTGAGCAGCCGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTc < 4:286225/149‑1 (MQ=255) aGCGCGCGTGCCCTGGCTTCGGCCCTGCTGCGCAAGGCCACCAATGGCCAGGCGCTGGACCTGGCGGCGGTAGAGCGTGAGCAGCCGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTcc > 4:319791/1‑149 (MQ=255) aGCGCGCGTGCCCTGGCTTCGGCCCTGCTGCGCAAGGCCACCAATGGCCAGGCGCTGGACCTGGCGGCGGTAGAGCGTGAGCAGCCGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTcc < 4:123840/149‑1 (MQ=255) gcgcgcGTGCCCTGGCTTCGGCCCTGCTGCGCAAGGCCACCAATGGCCAGGCGCTGGACCTGGCGGCGGTAGAGCGTGAGCAGCCGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCt < 7:121693/149‑1 (MQ=255) gcgcgcGTGCCCTGGCTTCGGCCCTGCTGCGCAAGGCCACCAATGGCCAGGCGCTGGACCTGGCGGCGGTAGAGCGTGAGCAGCCGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCt < 5:295105/149‑1 (MQ=255) cccTGGCTTCGGCCCTGCTGCGCAAGGCCACCAATGGCCAGGCGCTGGACCTGGCGGCGGTAGAGCGTGAGCAGCCGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGATCgtgg < 5:89786/148‑1 (MQ=255) cTTCGGCCCTGCTGCGCAAGGCCACCAATGGCCAGGCGCTGGACCTGGCGGCGGTAGAGCGTGAGCAGCCGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGATCGTGGTGACCGt < 1:157977/149‑1 (MQ=255) gcgcAAGGCCACCAATGGCCAGGCGCTGGACCTGGCGGCGGTAGAGCGTGAGCAGCCGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGATCGTGGTGACCGTGAGCGCCGTGCAc > 8:143735/1‑149 (MQ=255) gcAAGGCCACCAATGGCCAGGCGCTGGACCTGGCGGCGGTAGAGCGTGAGCAGCCGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGATCGTGGTGACCGTGAGCGCCGTGCAccg > 6:112887/1‑149 (MQ=255) aaGGCCACCAATGGCCAGGCGCTGGACCTGGCGGCGGTAGAGCGTGAGCAGCCGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGATCGTGGTGACCGTGAGCGCCGTGCAccgtt > 6:324782/1‑149 (MQ=255) aaGGCCACCAATGGCCAGGCGCTGGACCTGGCGGCGGTAGAGCGTGAGCAGCCGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGATCGTGGTGACCGTGAGCGCCGTGCAccgtt < 5:372843/149‑1 (MQ=255) gCCACCAATGGCCAGGCGCTGGACCTGGCGGCGGTAGAGCGTGAGCAGCCGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGATCGTGGTGACCGTGAGCGCCGTGCAccgttgcc > 2:41206/1‑149 (MQ=255) ccaccaATGGCCAGGCGCTGGACCTGGCGGCGGTAGAGCGTGAGCAGCCGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGa < 1:188931/115‑1 (MQ=255) ccaccaATGGCCAGGCGCTGGACCTGGCGGCGGTAGAGCGTGAGCAGCCGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGa > 2:188931/1‑115 (MQ=255) caATGGCCAGGCGCTGGACCTGGCGGCGGTAGAGCGTGAGCAGCCGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGATCGTGGTGACCGTGAGCGCCGTGCACCGTTGCCGTTgg > 5:231089/1‑149 (MQ=255) gCCAGGCGCTGGACCTGGCGGCGGTAGAGCGTGAGCAGCCGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGATCGTGGTGACCGTGAGCGCCGTGCACCGTTGCCGTTGGCCg > 2:119630/1‑147 (MQ=255) ggCGCTGGACCTGGCGGCGGTAGAGCGTGAGCAGCCGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGATCGTGGTGACCGTGAGCGCCGTGCa > 8:162944/1‑127 (MQ=255) ggCGCTGGACCTGGCGGCGGTAGAGCGTGAGCAGCCGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGATCGTGGTGACCGTGAGCGCCGTGCa < 7:162944/127‑1 (MQ=255) ggCGCTGGACCTGGCGGCGGTAGAGCGTGAGCAGCCGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGATCGTGGTGACCGTGAGCGCCGTGCACCGTTGCCGTTGGCCGAAGGcc < 5:324782/149‑1 (MQ=255) cgcTGGACCTGGCGGCGGTAGAGCGTGAGCAGCCGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGATCGTGGTGACCGTGAGCGCCGTGCACCGTTGCCGTTGGCCGAAGGCcgc < 7:227224/149‑1 (MQ=255) cTGGACCTGGCGGCGGTAGAGCGTGAGCAGCCGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGATCGTGGTGACCGTGAGCGCCGTGCACCGTTGCCGTTGGCCGAAGGCCgcgt < 3:191461/149‑1 (MQ=255) gACCTGGCGGCGGTAGAGCGTGAGCAGCCGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGATCGTGGTGa > 5:203230/1‑104 (MQ=255) gACCTGGCGGCGGTAGAGCGTGAGCAGCCGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGATCGTGGTGa < 6:203230/104‑1 (MQ=255) gACCTGGCGGCGGTAGAGCGTGAGCAGCCGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGATCGTGGTGACCGTGAGCGCCGTGCACCGTTGCCGTTGGCCGAAGGCCgcgtgcg < 7:143735/149‑1 (MQ=255) cTGGCGGCGGTAGAGCGTGAGCAGCCGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGATCGTGGTGACCGTGAGCGCCGTGCAccgtt < 3:110111/122‑1 (MQ=255) cTGGCGGCGGTAGAGCGTGAGCAGCCGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGATCGTGGTGACCGTGAGCGCCGTGCAccgtt > 4:110111/1‑122 (MQ=255) gcggcgGTAGAGCGTGAGCAGCCGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGATCGTGGTGACCGTGAGCGCCGTGCACCGTTGCCGTTGGCCGAAGGCCGCGTGCGTTGCCg < 5:46464/149‑1 (MQ=255) ggcggTAGAGCGTGAGCAGCCGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGATCGTGGTGACCGTGAGCGCCGTGCACCGTTGCCGTTGGCCGAAGGCCGCGTGCGTTGCCGTa > 1:188617/1‑149 (MQ=255) cGTGAGCAGCCGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGATCGTGGTGACCGTGAGCGCCGTGCACCGTTGCCGTTGGCCGAAGGCCGCGTGCGTTGCCGTACCGCCTTggg > 4:85577/1‑149 (MQ=255) gTGAGCAGCCGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGATCGTGGTGACCGTGAGCGCCGTGCACCGTTGCCGTTGGCCGAAGGCCGCGTGCGTTGCCGTACCGCCTTGGGt < 5:368874/149‑1 (MQ=255) gAGCAGCCGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGATCGTGGTGACCGTGAGCGCCGTGCACCGTTGCCGTTGGCCGAAGGCCGCGTGCGTTGCCGTACCGCCTTGGGt > 6:360023/1‑147 (MQ=255) gAGCAGCCGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGATCGTGGTGACCGTGAGCGCCGTGCACCGTTGCCGTTGGCCGAAGGCCGCGTGCGTTGCCGTACCGCCTTGGGt < 5:360023/147‑1 (MQ=255) gcagcCGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCTCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGATCGTGGTGACCGTGAGCGCCGTGCACAGTTGCCGTTGGCCGAAGGCCGCGTGCGTTGCCGTACCGCCTTGGGTGccc < 6:231089/149‑1 (MQ=255) ccGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGATCGTGGTGACCGTGAGCGCCGTGCACCGTTGCCGTTGGCCGAAGGCCGCGTGCGTTGCCGTACCGCCTTGGGTGCCCGTGa > 8:104646/1‑149 (MQ=255) gAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGATCGTGGTGACCGTGAGCGCCGTGCACCGTTGCCGTTGGCCGAAGGCCGCGTGCGTTGCCGTACCGCCTTGGGTGCCCGTGATGGCATCGCTg < 1:119630/149‑1 (MQ=255) ttCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTggcgaagctcggcaccagcggctgctcacgctctaccgccgccaggtccagcgcctggccattggtggccttgcgcagcagggccgaagccagggcacgcgcgctgcaac < 6:152128‑M2/149‑111 (MQ=255) cGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTggcgaagctcggcaccagcggctgctcacgctctaccgccgccaggtccagcgcctggccattggtggccttgcgcagcagggccgaagccagggcacgcgcgctgcaacc < 8:162838‑M2/148‑112 (MQ=255) ccccGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTggcgaagctcggcaccagcggctgctcacgctctaccgccgccaggtccagcgcctggccattggtggccttgcgcagcagggccgaagccagggcacgcgcgctgcaacccag > 5:152128‑M2/1‑35 (MQ=255) ccccGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGATCGTGGTGACCGTGAGCGCCGTGCACCGTTGCCGTTGGCCGAAGGCCGCGTGCGTTGCCGTCCCGCCTTGGGTGCCCGTGATGGCATCGCTGCCAAGaa > 2:144688/1‑148 (MQ=255) ccGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGATCGTGGTGACCGTGAGCCCCGTGCACCGTTGCCGTTGGCCGAAGGCCGCGTGCGTTGCCGTACCGCCTTGGGTGCCCGTGATGGCATCGCTGCCAAGAATct > 7:318378/1‑149 (MQ=255) ccGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGATCGTGGTGACCGTGAGCCCCGTGCACCGTTGCCGTTGGCCGAAGGCCGCGTGCGTTGCCGTACCGCCTTGGGTGCCCGTGATGGCATCGCTGCCAAGAATct < 8:318378/149‑1 (MQ=255) cgcgTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGATCGTGGTGACCGTGAGCGCCGTGCACCGTTGCCGTTGGCCGAAGGCCGCGTGCGTTGCCGTACCGCCTTGGGTGCCCGTGATGGCATCGCTGCCAAGAATctg < 5:112887/149‑1 (MQ=255) gtggtgAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGATCGTGGTGACCGTGAGCGCCGTGCACCGTTGCCGTTGGCCGAAGGCCGCGTGCGTTGCCGTACCGCCTTGGGTGCCCGTGATGGCATCGCTGCCAAGAATctgctg < 3:319791/149‑1 (MQ=255) aGCGCTGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGATCGTGGTGACCGTGAGCGCCGTGCACCGTTGCCGTTGGCCGAAGGCCGCGTGCGTTGCCGTACCGCCTTGGGTGCCCGTGATGGCATCGCTGCCAAGAATCTGCTGGGGGCGATCCTCAAc < 1:22063/149‑1 (MQ=255) cgGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGATCGTGGTGACCGTGAGCGCCGTGCACCGTTGCCGTTGGCCGAAGGCCGCGTGCGTTGCCGTACCGCCTTGGGTGCCCGTGATGGCATCGCTGCCAAGAATCTGCTGGGGGCGATCCTCAACGAAg < 6:183434/149‑1 (MQ=255) gAGCGTGGCGAGCGTCCTGATCGTGGTGACCGTGAGCGCCGTGCACCGTTGCCGTTGGCCGAAGGCCGCGTGCGTTGCCGTACCGCCTTGGGTGCCCGTGACGGCATCGCTGCCAAGAATCTGCTGGGGGCGATCCTCAACGAAGGTgg > 5:7776/1‑149 (MQ=255) | GGGTTGCAGCGCGCGTGCCCTGGCTTCGGCCCTGCTGCGCAAGGCCACCAATGGCCAGGCGCTGGACCTGGCGGCGGTAGAGCGTGAGCAGCCGCTGGTGCCGAGCTTCGCCCCGCGTGGTGAGCGTACCGAGCGCGGTGAGCGTGGCGAGCGTCCTGATCGTGGTGACCGTGAGCGCCGTGCACCGTTGCCGTTGGCCGAAGGCCGCGTGCGTTGCCGTACCGCCTTGGGTGCCCGTGATGGCATCGCTGCCAAGAATCTGCTGGGGGCGATCCTCAACGAAGGTGG > NC_002947/2091913‑2092200 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |