| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2295836 = | 42 (0.710) | 5 (0.090) | 5/240 | NT | 8.0% | intergenic (+82/+51) | PP_5496/PP_2023 | hypothetical protein/glutathione S‑transferase family protein |
| ? | NC_002947 | 4282152 = | 75 (1.350) | coding (1078/1089 nt) | PP_3753 | AraC family transcriptional regulator | |||||
CCACCATCAATGCCTGGAACCGGTTCGGCGTCGGCTTTGCCATGGTGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTCCACTTCTTGAACGCCCGGTGGAAGGCACTCGG > NC_002947/4282006‑4282299 | ccaccATCAATGCCTGGAACCGGTTCGGCGTCGGCTTTGCCATGGGGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTCGCCTATTCGCGGGCCAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGGG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAacac < 7:196978‑M2/144‑1 (MQ=255) caccATCAATGCCTGGAACCGGTTCGGCGTCGGCTTTGCCATGGTGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACAcc < 8:21670‑M2/145‑1 (MQ=255) cATCAATGCCTGGAACCGGTTCGGCGTCGGCTTTGCCATGGTGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGc < 8:343864‑M2/148‑1 (MQ=255) aTCAATGCCTGGAACCGGTTCGGCGTCGGCTTTGCCATGGTGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCa < 6:105654/149‑1 (MQ=255) tCAATGCCTGGAACCGGTTCGGCGTCGGCTTTGCCATGGTGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCgg > 6:332578/1‑146 (MQ=255) aaTGCCTGGAACCGGTTCGGCGTCGGCTTTGCCAGGGTGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCaga < 8:54741/148‑1 (MQ=255) gCCTGGAACCGGTTCGGCGTCGGCTTTGCCATGGTGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCaga > 1:120542/1‑145 (MQ=255) gCCTGGAACCGGTTCGGCGTCGGCTTTGCCATGGTGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCaga < 2:120542/145‑1 (MQ=255) cTGGAACCGGTTCGGCGTCGGCTTTGCCATGGTGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGt > 8:79984/1‑149 (MQ=255) tGGAACAGGTTCGGCGTCGGCTTTGCCATGGTGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCACTCCTACAATTCTGGGAGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTg > 5:54180/1‑149 (MQ=255) ggAACCGGTTCGGCGTCGGCTTTGCCATGGTGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGc > 2:294450/1‑149 (MQ=255) aaCCGGTTCGGCGTCGGCTTTGCCATGGTGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCa > 8:146454/1‑149 (MQ=255) gTTCGGCGTCGGCTTTGCCATGGTGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCAc > 5:121352/1‑149 (MQ=255) gggggcGGGTTTGCCATGGTGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAACCCCGCTCCTACAAATCTGGGCGTGCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACcgc < 1:294450/144‑1 (MQ=37) ggCGTCGGCTTAGCCATGGTGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACcgca < 8:75154/149‑2 (MQ=255) ggCTTTGCCATGGTGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCAc < 6:199504/139‑1 (MQ=255) ggCTTTGCCATGGTGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCAc > 5:199504/1‑139 (MQ=255) ggCTTTGCCATGGTGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCggtggt < 4:213291/148‑1 (MQ=255) cTTTGCCATGGTGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTttc < 1:29632/149‑1 (MQ=255) cATGGTGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTcgcg < 7:146454/149‑1 (MQ=255) aTGGTGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCgg < 3:292972/149‑1 (MQ=255) tGGTGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCggg > 6:348403/1‑149 (MQ=255) tGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCAt > 4:319912/1‑149 (MQ=255) ccGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGc < 5:332578/149‑1 (MQ=255) ccGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGc < 3:239375/149‑1 (MQ=255) gaggggtggctggcttcggagctgttcatgtcaatcatggggcgctgattaatcatcgtgctgcagatgggtccgtgtgtgagggggcatgcccgcgaaCACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGc < 6:13381‑M2/50‑1 (MQ=255) ccTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGttt > 8:312411/1‑131 (MQ=255) ccTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGttt < 7:312411/131‑1 (MQ=255) cTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCt > 3:356597/1‑149 (MQ=255) aTCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTc < 3:38910/147‑1 (MQ=255) tggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgtgtgggagcgggcatgcccgcgaaCACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTcc < 5:158996‑M2/57‑1 (MQ=255) tggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgtgtgggagcgggcatgcccgcgaaCACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTcc > 6:158996‑M2/90‑146 (MQ=255) cTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACa < 1:334507/149‑1 (MQ=255) tCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAg < 5:48069/147‑1 (MQ=255) tGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAAc < 4:356597/149‑1 (MQ=255) ccTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACg > 7:332865/1‑147 (MQ=255) cTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAg > 6:3858/1‑149 (MQ=255) tgtgCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAgg > 1:63376/1‑149 (MQ=255) tgtgCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAgg > 1:148786/1‑149 (MQ=255) gCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCg > 8:176312/1‑149 (MQ=255) gCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGAc > 5:142030/1‑147 (MQ=255) gCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGAc > 3:236347/1‑147 (MQ=255) cTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGc > 4:231557/1‑149 (MQ=255) cTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGc > 1:26327/1‑149 (MQ=255) cTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGc > 6:233471/1‑149 (MQ=255) tATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGcc > 3:66270/1‑149 (MQ=255) ttCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGcc < 6:121352/147‑1 (MQ=255) tCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCGTCCCCCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCcgcg > 3:262332/1‑149 (MQ=255) tCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGc > 2:320049/1‑112 (MQ=255) gcgGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGcc > 6:262584/1‑149 (MQ=255) tccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgtgtgggagcgggcatgcccgcgaaCACCGGCaga > 5:208595‑M2/60‑69 (MQ=255) tccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgtgtgggagcgggcatgcccgcgaaCACCGGCaga < 6:208595‑M2/10‑1 (MQ=255) gggCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCg > 6:73000/1‑149 (MQ=255) cAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGGG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTa < 4:66270/149‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTTCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGCTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGAACAGCCTCGCCCCGt > 2:331816/1‑143 (MQ=25) cagCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTTCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCAATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGt < 1:331816/141‑1 (MQ=255) gCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCGCCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCt > 4:273711/1‑149 (MQ=255) gCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCt < 2:63376/149‑1 (MQ=255) tACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAgg < 8:126897/117‑1 (MQ=255) tACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAgg > 7:126897/1‑117 (MQ=255) aCAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGcc < 7:331860/131‑1 (MQ=255) aCAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGcc > 8:331860/1‑131 (MQ=255) ttCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGa > 8:265596/1‑116 (MQ=255) ttCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGa < 7:265596/116‑1 (MQ=255) tGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCgg > 5:352386/1‑149 (MQ=255) ggCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTc < 7:176312/149‑1 (MQ=255) gTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTCCa > 4:39956/1‑148 (MQ=255) gTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTCCAc < 6:54180/149‑1 (MQ=255) gTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTCCAc < 5:73000/149‑1 (MQ=255) ccTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGt > 7:209502/1‑90 (MQ=255) ccTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGt < 8:209502/90‑1 (MQ=255) cTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGGATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGcc > 7:39355/1‑109 (MQ=255) cTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGcc < 8:39355/109‑1 (MQ=255) cTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGcc < 1:371550/136‑1 (MQ=255) cTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTCCActtctt < 3:319912/149‑1 (MQ=255) cTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTCCActtctt > 3:265252/1‑149 (MQ=255) cTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTCCActtctt < 8:332865/149‑1 (MQ=255) ggAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTCCACTTCTTGAAc < 2:26327/148‑1 (MQ=255) ggAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCATCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTCCACTTCTTGAACg > 1:294794/1‑149 (MQ=255) gAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTCCACTTCTTGAACGc > 1:20425/1‑149 (MQ=255) gAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTCCACTTCTTGAACGc > 8:188582/1‑149 (MQ=255) aGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTCCACTTCTTGAACGcc < 5:262584/149‑1 (MQ=255) aGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTCCACTTCTTGAACGcc < 3:224415/149‑1 (MQ=255) tttACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTCCACTTCTTGAACGCCCGGTgg < 5:233471/149‑1 (MQ=255) cccgcgaaCACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTCCACTTCTTGAACGCCCGGTGGAAg < 7:79984‑M2/140‑1 (MQ=255) cccgcgaaCACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTCCACTTCTTGAACGCCCGGTGGAAg < 3:231557‑M2/140‑1 (MQ=255) ccgcgaaCACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTCCACTTCTTGAACGCCCGGTGGAAgg > 5:281934‑M2/8‑148 (MQ=255) gcgaaCACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTc < 2:124584‑M2/116‑1 (MQ=255) gcgaaCACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTc > 1:124584‑M2/6‑121 (MQ=255) gaaCACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCGCCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTCCACTTCTTGAACGCCCGGTGGAAGGCACTc < 3:273711‑M2/146‑1 (MQ=255) aCACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTCCACTTCTTGAACGCCCGGTGGAAGGCACTCgg < 6:352386‑M2/148‑1 (MQ=255) | CCACCATCAATGCCTGGAACCGGTTCGGCGTCGGCTTTGCCATGGTGCCGGCCTGATCCTTTCGGGTGGCCTGTGCTGGCCTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAATTCTGGGCGTG‑CCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGGTTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCTACAGGTAGAACGCAGGCCGACCAGCCGCGCCCGGTAGCTCCCTGGGCTCTGCCCGGTCCACTTCTTGAACGCCCGGTGGAAGGCACTCGG > NC_002947/4282006‑4282299 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |