New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5210219 = | 44 (0.740) | 5 (0.100) | 4/224 | NT | 12.1% | intergenic (‑85/+93) | rnd/PP_4592 | ribonuclease D/metal dependent hydrolase |
? | NC_002947 | 5210310 = | 34 (0.660) | intergenic (‑176/+2) | rnd/PP_4592 | ribonuclease D/metal dependent hydrolase |
TACGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCGGGGCATCGCTGAGCCGTGCCA > NC_002947/5210168‑5210454 | taCGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAg < 4:218271/148‑1 (MQ=255) cGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTTTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATTAAGGGAAAACGGTGTATGTCCCGGGTTTGACCGGGTTAGCGGGCGTGCCCGCTACAACAGGGCTTAAACGCTTTGCCaccagcc > 2:358049/1‑148 (MQ=255) aCTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGcccg > 1:341208/1‑146 (MQ=255) cGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCAGTGGGAGACGGCGCCCCCGCCAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGATTGCCCGGGATCTCCTGGCTTCCCCCACCCACAGGGCTTAACAGCATGGCCGCCAGCCAAGCccggcaaccgg > 8:137711/1‑148 (MQ=255) tttCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGAAGGCAACACGGTGTATGGCGCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCaaa < 8:61773/148‑1 (MQ=255) ttCGGGGGCAGTCCACCCGGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGGGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAAc < 4:141903/148‑1 (MQ=255) gggCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTcc > 7:220818/1‑149 (MQ=255) ggCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTTTGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGGCCGCTACCACAGGGGTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGccggcaacc > 2:4624/1‑135 (MQ=255) gCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAg < 7:89073/149‑1 (MQ=255) aGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGc > 2:104584/1‑148 (MQ=255) tCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGATTGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCaaa > 3:69218/1‑136 (MQ=255) gccACCCTGTGGGCGCGGGCGCGCCCGCGATTGACGGCAACCCGGTGTTTGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGGGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCaaa < 4:69218/135‑1 (MQ=255) ccACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGAct > 8:327999/1‑149 (MQ=255) cACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCGCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGGGa > 7:327235/1‑146 (MQ=255) cgggGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCCACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTgg > 6:265784‑M1/5‑149 (MQ=255) ggtgCGGGCGCCCCGGCTAAGCAAGCCAACACGGTCTTGGGCCGGGGGTGGCCCGGTTGCGCGGGCTGCCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTagag < 1:347267/146‑1 (MQ=255) GAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGc < 1:388‑M1/149‑1 (MQ=255) CGGGCGCGCCCGAGAAGGAAGGCAACACGGTGTATGGCCGGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGATCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCg > 5:292373‑M1/1‑149 (MQ=255) GGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCgg > 2:388‑M1/1‑149 (MQ=255) GGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTAGGGCCCGTGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGTTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGt > 7:295344‑M1/1‑149 (MQ=255) acgcccgcgaacccgggcaaacccgggccatacaccgtgttgccttcattcgcgggcgcgcccgctcccacagggCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGc < 8:61171‑M2/51‑1 (MQ=255) acgcccgcgaacccgggcaaacccgggccatacaccgtgttgccttcattcgcgggcgcgcccgctcccacagggCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGc > 7:61171‑M2/76‑126 (MQ=255) cgcCCGCGAATGAAGGCAACACGGGGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGt < 8:251762/149‑1 (MQ=255) ccGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTAcc > 8:47724/1‑149 (MQ=255) ccGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGACCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGt > 7:93784/1‑146 (MQ=255) ccGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGACCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGt < 8:93784/146‑1 (MQ=255) cgcgaacccgggcaaacccgggccatacaccgtgttgccttcactcgcgggcgcgcccgctcccacagggCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCt > 8:14211‑M2/71‑149 (MQ=255) ggCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGTAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGc > 3:92567/1‑148 (MQ=255) aaCACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACa < 6:84535/142‑1 (MQ=255) aaCACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACa > 5:84535/1‑142 (MQ=255) aaCACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAg > 2:312749/1‑149 (MQ=255) aaCACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAg > 3:364147/1‑149 (MQ=255) ttATGGCCCGGTATTCCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAg < 1:358049/147‑1 (MQ=255) gccatacaccgtgttgccttcactcgcgggcgcgcccgctcccacagggCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGt < 7:14211‑M2/100‑1 (MQ=255) tATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGt < 4:364147/148‑1 (MQ=255) ccGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGt < 7:73515/113‑1 (MQ=255) ccGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGt > 8:73515/1‑113 (MQ=255) ccGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCACGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACTTg < 7:270597/87‑1 (MQ=255) gCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCt > 3:241148/1‑149 (MQ=255) tgtgggagcgggcacgcccgctcccacagggCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTggg > 7:147478‑M2/32‑149 (MQ=255) tCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGc > 1:275138/1‑149 (MQ=255) cgGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGTGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCggg < 7:327999/149‑1 (MQ=255) cgGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCggg < 8:220818/149‑1 (MQ=255) gggCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCgggg < 7:137711/149‑1 (MQ=255) gCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCGGGGCa > 2:111982/1‑149 (MQ=255) cacgcccgctcccacagggCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCGGGGCAt < 8:147478‑M2/130‑1 (MQ=255) gcccgctcccacagggCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCGGGGCATCGc < 7:47724‑M2/133‑1 (MQ=255) cccgctcccacagggCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCGGGGCATCGCt > 8:323375‑M2/16‑149 (MQ=255) acagggCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGTAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCGGGGCATCGCTGAGCCGTGc < 4:92567‑M2/143‑1 (MQ=255) agggCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCGGGGCATCGCTGAGCCGTGc > 8:201289‑M2/5‑147 (MQ=255) agggCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCGGGGCATCGCTGAGCCGTGc > 8:9285‑M2/5‑147 (MQ=255) agggCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCGGGGCATCGCTGAGCCGTGCCa < 7:323375‑M2/145‑1 (MQ=255) | TACGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAGGCCGGCAACCGGCAAACATGTCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCGGGGCATCGCTGAGCCGTGCCA > NC_002947/5210168‑5210454 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |