Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,344,839 | T→C | 8.6% | D97G (GAC→GGC) | PP_2941 ← | hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,344,839 | 0 | T | C | 8.6% | 195.4 / 7.3 | 71 | D97G (GAC→GGC) | PP_2941 | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (33/31); new base C (3/3); total (37/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.27e-01 |
ATACCAGCCGTCGATCGGCGTTATGCCTCGGTGCGGCCAGATCGCCCGGAAGAAGGGGCCGTGTGCCACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGGCGCGACGTTGTACCGGCCAAGTGGCTGGTCGCCGACGTTGTTCTGCCAGGCCTCTGGCAGGCTCAGGGTTTCGACAAAGTCGTGTATGCCTCGG > NC_002947/3344697‑3344985 | aTACCAGCCGTCGATCGGCGTTATGCCTCGGTGCGGCCAGATCGCCCGGAAGAAGGGGCCGTGTGCCACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTccgccc > 4:44162/1‑149 (MQ=255) tACCAGCCGTCGATCGGCGTTATGCCTCGGTGCGGCCAGATCGCCCGGAAGAAGGGGCCGTGTGCCACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTccgcccg > 8:105633/1‑149 (MQ=255) ccAGCCGTCGATCGGCGTTATGCCTCGGTGCGGCCAGATCGCCCGGAAGAAGGGGCCGTGTGCCACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCcgcg > 4:319219/1‑149 (MQ=255) tCGATCGGCGTTATGCCTCGGTGCGGCCAGATCGCCCGGAAGAAGGGGCCGTGTGCCACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGc < 7:105633/149‑1 (MQ=255) cGTTATGCCTCGGTGCGGCCAGATCGCCCGGAAGAAGGGGCCGTGTGCCACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCa > 1:47616/1‑149 (MQ=255) gTTATGCCTCGGTGCGGCCAGATCGCCCGGAAGAAGGGGCCGTGTGCCACCTTTTCGACCGTGGCGTTGTTCGGCGCGGCACGGTCGGTCTCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGGCCTCGGGCCTGCTTCATCCAc < 4:359212/149‑1 (MQ=255) aTGCCTCGGTGCGGCCAGATCGCCCGGAAGAAGGGGCCGTGTGCCACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCGTCCAccc < 5:298323/148‑1 (MQ=255) gCCTCGGTGCGGCCAGATCGCCCGGAAGAAGGGGCCGTGTGCCACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGc < 7:150472/131‑1 (MQ=255) gCCTCGGTGCGGCCAGATCGCCCGGAAGAAGGGGCCGTGTGCCACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGc > 8:150472/1‑131 (MQ=255) gCCTCGGTGCGGCCAGATCGCCCGGAAGAAGGGGCCGTGTGCCACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGCCCGCGGGCGGACCTggt > 8:252358/1‑134 (MQ=255) gCCTCGGTGCGGCCAGATCGCCCGGAAGAAGGGGCCGTGTGCCACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGCCCGCGGGCGGACCTggt < 7:252358/136‑3 (MQ=255) ccTCGGTGCGGCCAGATCGCCCGGAAGAAGGGGCCGTGTGCCACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGc > 5:199132/1‑147 (MQ=255) ccTCGGTGCGGCCAGATCGCCCGGAAGAAGGGGCCGTGTGCCACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCaa < 3:247561/149‑1 (MQ=255) ccTCGGTGCGGCCAGATCGCCCGGAAGAAGGGGCCGTGTGCCACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGCCCGCGGGCGGACCTggtga > 1:278417/1‑133 (MQ=255) ccTCGGTGCGGCCAGATCGCCCGGAAGAAGGGGCCGTGTGCCACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGCCCGCGGGCGGACCTggtga < 2:278417/137‑5 (MQ=255) cTCGGTGCGGCCAGATCGCCCGGAAGAAGGGGCCGTGTGCCACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAag > 5:259444/1‑149 (MQ=255) aGATCGCCCGGAAGAAGGGGCCGTGTGCCACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGc < 3:319219/149‑1 (MQ=255) gATCGCCCGGAAGAAGGGGCCGTGTGCCACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCg < 3:44162/149‑1 (MQ=255) aTCGCCCGGAAGAAGGGGCCGTGTGCCACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGt > 5:382401/1‑149 (MQ=255) gCCCGGAAGAAGGGGCCGTGTGCCACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCGGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTgg < 2:136926/148‑1 (MQ=255) gCCCGGAAGAAGGGGCCGTGTGCCACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGt > 7:11557/1‑149 (MQ=255) gCCCGGAAGAAGGGGCCGTGTGCCACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGt < 2:47616/149‑1 (MQ=255) cccGGAAGAAGGGGCCGTGTGCCACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCAc > 4:153013/1‑124 (MQ=255) cccGGAAGAAGGGGCCGTGTGCCACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCAc < 3:153013/124‑1 (MQ=255) cccGGAAGAAGGGGCCGTGTGCCACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTc < 8:223775/149‑1 (MQ=255) ccGGAAGAAGGGGCCGTGTGCCACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGCCCGCGGGCGGACCTg < 2:150279/113‑1 (MQ=255) ccGGAAGAAGGGGCCGTGTGCCACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGCCCGCGGGCGGACCTg > 1:150279/1‑113 (MQ=39) agaagGGGCCGTGTGCCACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGgcgc > 6:211878/1‑148 (MQ=255) agaagGGGCCGTGTGCCACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGgcg < 5:137166/147‑1 (MQ=255) agaagGGGCCGTGTGCCACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGgcg > 6:137166/1‑147 (MQ=255) ggggCCGTGTGCCAACTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCTCCAAATGCGGTCGCAAGCCCCATCTCACCAGGACCGCCCGCGGGCCTGCTGCATCCACCCGCAAGACTGCCACCCGCGTGGTCGGCGCGACGt > 8:311638/1‑149 (MQ=255) gggCCGTGTGCCACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGGCGCGCCGtt > 8:76427/1‑149 (MQ=255) gggCCGTGTGCCACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGGCGCGACGtt < 5:164137/149‑1 (MQ=255) ggCCGTGTGCCACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGGCGCGACGTTg < 6:259444/149‑1 (MQ=255) ccGTGTGCCACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGGCGCGACGTTGTa > 6:266415/1‑149 (MQ=255) ccGTGTGCCACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGGCGCGACGTTGTa > 6:157300/1‑149 (MQ=255) gCCACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGGCGCGACGTTGTACCGGc > 1:241147/1‑148 (MQ=255) cACCTTTTCGACCCTGGGGTTGATCGGCGCGGAACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGGCGCGACGTTGTACCGGCCaa < 4:326369/149‑1 (MQ=255) cACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGGCGCGACGTTGTACCGGcc > 6:22244/1‑147 (MQ=255) cACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGGCGCGACGTTGTACCGGcc > 2:297986/1‑147 (MQ=255) ccTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGGCGCGACGTTGTACCGGCCAAGt > 6:145800/1‑149 (MQ=255) gACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGt < 5:225558/103‑1 (MQ=255) gACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGt > 6:225558/1‑103 (MQ=255) gACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGGCGCGACGTTGTACCGGCCAAGTGGCTgg < 5:211878/148‑1 (MQ=255) tGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCAGCAAGAGTGCAACCGGCGTGGTCGGCGCGCCGTTGTACCGGCCAAGTGGCTGGTCGCCg > 3:217221/1‑149 (MQ=255) gTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGGCGCGACGTTGTACCGGCCAAGTGGCTGGTCGCCGACgt > 4:239487/1‑149 (MQ=255) aTCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGGCGCGACGTTGTACCGGCCAAGTGGCTGGTCGCCGACgttgtt < 5:266415/149‑1 (MQ=255) tCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGGCGCGACGTTGTACCGGCCAAGTGGCTGGTCGCCGACGTTGTTc > 4:95661/1‑149 (MQ=255) gcgcGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCCCCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGGCGCGACGTTGTACCGGCCAAGTGGCTGGTCGCCGACGTTGTTCTGc > 5:142387/1‑149 (MQ=255) gcgcGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGGCGCGACGTTGTACCGGCCAAGTGGCTGGTCGCCGACGTTGTTCTGc > 5:365350/1‑149 (MQ=255) gcgcGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGGCGCGACGTTGTACCGGCCAAGTGGCTGGTCGCCGACGTTGTTCTGc > 6:26941/1‑149 (MQ=255) aCGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGGCGCGACGTTGTACCGGCCAAGTGGCTGGTCGCCGACGTTGTTCTGCCAGGCct < 6:365350/149‑1 (MQ=255) gtcggtcgCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACGAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCGACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGGCGCGACGTTGTACCGGCCTAGTGGCTGGTCGCCGACGTTGTTCTGCCAGGCCTCTg < 7:311638/149‑1 (MQ=255) gtcggtcgCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTg > 6:11379/1‑77 (MQ=255) gtcggtcgCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTg < 5:11379/77‑1 (MQ=255) ggTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGGCGCGACGTTGTACCGGCCAAGTGGCTGGTCGCCGACGTTGTTCTGCCAGGCCTCTGGCAGGCTCAGGGTTTc < 2:191652/149‑1 (MQ=255) ggTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGGCGCGACGTTGTACCGGCCAAGTGGCTGGTCGCCGACGTTGTTCTGCCAGGCCTCTGGCAGGCTCAGGGTTTc < 5:22244/149‑1 (MQ=255) gTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGGCGCGACGTTGTACCGGCCAAGTGGCTGGTCGCCGACGTTGTTCTGCCAGGCCTCTGGCAGGCTCAGGGTTTCg < 5:157300/149‑1 (MQ=255) tCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGGCGCGa > 6:647/1‑80 (MQ=255) tCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGGCGCGa < 5:647/80‑1 (MQ=255) gCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGGCGCGACGTTGTACCGGCCAAGTgg < 6:19244/97‑1 (MQ=255) gCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGGCGCGACGTTGTACCGGCCAAGTgg > 5:19244/1‑97 (MQ=255) ccATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGGCGCGACGTTGTACCGGCCAAGTGGCTGGTCGCCGACGTTGTTCTGCCAGGCCTCTGGCAGGCTCAGGGTTTCGACAAAGTCgt < 6:369633/149‑1 (MQ=255) ccATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGGCGCGACGTTGTACCGGCCAAGTGGCTGGTCGCCGACGTTGTTCTGCCAGGCCTCTGGCAGGCTCAGGGTTTCGACAAAGTCgt < 8:11557/149‑1 (MQ=255) tcACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTTCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGGCGCGACGTTGTACCGGCCAAGTGGc < 3:166453/86‑1 (MQ=255) tcACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGGCGCGACGTTGTACCGGCCAAGTGGc > 4:166453/1‑86 (MQ=255) tcACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGGCGCGACGTTGTACCGGCCAAGTGGCTGGTCGCCGACGTTGTTCTGCCAGGCCTCTGGCAGGCTCAGGGTTTCGACAAAGTCGTGTATg > 3:112579/1‑149 (MQ=255) aCCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGGCGCGACGTTGTACCGGCCAAGTGGCTGGTCGCCGACGTTGTTCTGCCAGGCCTCTGGCAGGCTCAGGGTTTCGACAAAGTCGTGTATGcc < 2:241147/149‑1 (MQ=255) ccAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGGCGCGACGTTGTACCGGCCAAGTGGCTg < 4:77152/85‑1 (MQ=255) ccAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGGCGCGACGTTGTACCGGCCAAGTGGCTg > 3:77152/1‑85 (MQ=255) gTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGGCGCGACGTTGTACCGGCCAAGTGGCTGGTCGCCGACGTTGTTCTGCCAGGCCTCTGGCAGGCTCAGGGTTTCGACAAAGTCGTGTATGCCTCgg > 5:320010/1‑148 (MQ=255) | ATACCAGCCGTCGATCGGCGTTATGCCTCGGTGCGGCCAGATCGCCCGGAAGAAGGGGCCGTGTGCCACCTTTTCGACCCTGGCGTTGATCGGCGCGGCACGGTCGGTCGCCCAATGCGGTCGCCAGCCCCATCTCACCAGGTCCGCCCGCGGGCCTGCTTCATCCACCCGCAAGAGTGCCACCGGCGTGGTCGGCGCGACGTTGTACCGGCCAAGTGGCTGGTCGCCGACGTTGTTCTGCCAGGCCTCTGGCAGGCTCAGGGTTTCGACAAAGTCGTGTATGCCTCGG > NC_002947/3344697‑3344985 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |