Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,391,522 | G→A | 10.7% | W244* (TGG→TGA) ‡ | PP_2994 → | FMN‑binding oxidoreductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,391,522 | 0 | G | A | 10.7% | 173.2 / 9.5 | 65 | W244* (TGG→TGA) ‡ | PP_2994 | FMN‑binding oxidoreductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (26/32); new base A (5/2); total (31/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.44e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.83e-01 |
GAAAACCGGGCGCGCCTGTTGCTCGAAATCGTCAAGGCGGTCCGGGCCGTGGTTTCTGTGGATTTTGCAGTGGCGGTCAAACTCAACTCCGCCGATTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGCCATGCAGGGTGACGCGCGCGATGGTCGCACCCTGGCTCGCGAAGCTTATTTCGTCGAGTTCGCCCGTGATCTCCAAACCGTCGCCAAAA > NC_002947/3391376‑3391670 | gAAAACCGGGCGCGCCTGTTGCTCGAAATCGTCAAGGCGGTCCGGGCCGTGGTTTCTGTGGATTTTGCAGTGGCGGTCAAACTCAACTCCGCCGATTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGc < 4:369052/148‑1 (MQ=255) cGGGCGCGCCTGTTGCTCGAAATCGTCAAGGCGGTCCGGGCCGTGGTTTCTGTGGATTTTGCAGTGGCGGTCAAACTCAACTCCGCCGATTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGa < 1:69418/149‑1 (MQ=255) cGGGCGCGCCTGTTGCTCGAAATCGTCAAGGCGGTCCGGGCCGTGGTTTCTGTGGATTTTGCAGTGGCGGTCAAACTCAACTCCGCCGATTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGC‑‑CACTCAACGa < 5:274911/149‑1 (MQ=255) gcgcCTGTTGCTCGAAATCGTCAAGGCGGTCCGGGCCGTGGTTTCTGTGGATTTTGCAGTGGCGGTCAAACTCAACTCCGCCGATTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTgg < 5:364634/149‑1 (MQ=255) gTTGCTCGAAATCGTCAAGGCGGTCCGGGCCGTGGTTTCTGTGGATTTTGCAGTGGCGGTCAAACTCAACTCCGCCGATTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCg > 8:240514/1‑146 (MQ=255) gCTCGAAATCGTCAAGGCGGTCCGGGCCGTGGTTTCTGTGGATTTTGCAGTGGCGGTCAAACTCAACTCCGCCGATTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACa > 5:47649/1‑149 (MQ=255) tCGAAATCGTCAAGGCGGTCCGGGCCGTGGTTTCTGTGGATTTTGCAGTGGCGGTCAAACTCAACTCCGCCGATTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACAtg > 1:118447/1‑149 (MQ=255) gAAATCGTCAAGGCGGTCCGGGCCGTGGTTTCTGTGGATTTTGCAGTGGCGGTCAAACTCAACTCCGCCGATTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACAtggt > 2:107155/1‑149 (MQ=255) aaaTCGTCAAGGCGGGCCGGGCCGTGGTTTCTGTGGATTTTGCAGTGGCGGTCAAACTCAACTCCGCCGATTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACAtggtg < 6:267582/149‑1 (MQ=255) aaTCGTCAAGGCGGTCCTGGCCGTGGTTGCTGTGGATTTTGCAGTGGCGGTCAAACTCAACTCCGCCGATTTCCAGCTCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGGCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACAtggtgg < 8:51707/149‑1 (MQ=255) aTCGTCAAGGCGGTCCGGTCCGTGGTTTCTGTGGATTTTGCAGTGGCGCTCAAACTCAACTCCGCCGATTTCCAGCGCGGTGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGGCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGa < 6:293836/149‑1 (MQ=255) aTCGTCAAGGCGGTCCGGGCCGTGGTTTCTGTGGATTTTGCAGTGGCGGTCAAACTCAACTCCGCCGATTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGa < 1:107155/149‑1 (MQ=255) aTCGTCAAGGCGGTCCGGGCCGTGGTTTCTGTGGATTTTGCAGTGGCGGTCAAACTCAACTCCGCCGATTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGa < 3:296578/149‑1 (MQ=255) tCGTCAAGGCGGTCCGGGCCGTGGTTTCTGTGGATTTTGCAGTGGCGGTCAAACTCAACTCCGCCGATTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAg > 6:311998/1‑149 (MQ=255) tCAAGGCGGTCCGGGCCGTGGTTTCTGTGGATTTTGCAGTGGCGGTCAAACTCAACTCCTCCGATTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGC‑‑CACTCAACGAc > 1:317935/1‑125 (MQ=255) tCAAGGCGGTCCGGGCCGTGGTTTCTGTGGATTTTGCAGTGGCGGTCAAACTCAACTCCGCCGATTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGC‑‑CACTCAACGAc < 2:317935/125‑1 (MQ=255) cGGTCCGGGCCGTGGTTTCTGTGGATTTTGCAGTGGCGGTCAAACTCAACTCCGCCGATTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACAtgg > 1:54830/1‑135 (MQ=255) cGGTCCGGGCCGTGGTTTCTGTGGATTTTGCAGTGGCGGTCAAACTCAACTCCGCCGATTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACAtgg < 2:54830/135‑1 (MQ=255) ggTCCGGGCCGTGGTTTCTGTGGATTTTGCAGTGGCGGTCAAACTCAACTCCGCCGATTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAg < 7:33812/149‑1 (MQ=255) tGGTTTCTGTGGATTTTGCAGTGGCGGTCAAACTCAACTCCGCCGATTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACAtg > 1:352957/1‑122 (MQ=255) tGGTTTCTGTGGATTTTGCAGTGGCGGTCAAACTCAACTCCGCCGATTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACAtg < 2:352957/122‑1 (MQ=255) tGGTTTCTGTGGATTTTGCAGTGGCGGTCAAACTCAACTCCGCCGATTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGaa < 1:10225/149‑1 (MQ=255) tgGATTTTGCAGTGGCGGTCAAACTCAACTCCGCCGATTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGaa > 8:105268/1‑140 (MQ=255) tgGATTTTGCAGTGGCGGTCAAACTCAACTCCGCCGATTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGaa < 7:105268/140‑1 (MQ=255) tgGATTTTGCAGTGGCGGTCAAACTCAACTCCGCCGATTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGc > 2:246343/1‑148 (MQ=255) tgGATTTTGCAGTGGCGGTCAAACTCAACTCCGCCGATTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGCAGGCAGCTACGAAGTCCCCGcc < 7:240514/149‑1 (MQ=255) aTTTTGCAGTGGCGGTCAAACTCAACTCCGCCGATTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGCCATg > 5:187018/1‑149 (MQ=255) ttttGCAGTGGCGGTCAAACTCAACTCCGCCGATTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGCCATGc < 5:311998/149‑1 (MQ=255) ttGCAGTGGCGGTCAAACTCAACTCCGCCGATTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGACT‑‑GGCGCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGCCATGCa < 4:2056/148‑1 (MQ=255) tgaaGTGCCGGTAAAACTCAACTCCGCCTATTTCCAGCCCGGTGGGTTAACCACCGATTACCCTAAAAAGGTCGTTTTTTCCTGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGCCATGc < 1:113071/145‑1 (MQ=255) tGCAGTGGCGGTCAAACTCAACTCCGCCGATTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGCCATGCAg < 2:130605/148‑1 (MQ=255) cAGTGGCTGTCAAACTCAACTCCGGCGATTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAATAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGCCATGCAGGGt < 7:342972/149‑1 (MQ=255) cAGTGGCGGTCAAACTCAACTCCGCCGATTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGCCATGCAGGGt < 2:118447/149‑1 (MQ=255) aaaCTCAACTCCGCCGATTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGCCATGCAGGGTGACGCGCGCGa < 1:246343/149‑1 (MQ=255) caactcCGCCGATTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGCCATGCAGGGTGACGCGCGCGATgg > 2:57140/1‑147 (MQ=255) caactcCGCCGATTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGCCATGCAGGGTGACGCGCGCGATgg < 1:57140/147‑1 (MQ=255) ccgccgATTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGCCATGCAGGTTGACGCGCGCGATGGTCGCAcc > 8:58589/1‑149 (MQ=255) ccgATTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGCCATGCAGGGTGACGCGCGCGATGGTCGCACCCTg < 6:47649/149‑1 (MQ=255) aTTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGa > 5:221765/1‑82 (MQ=255) aTTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGa < 6:221765/82‑1 (MQ=255) aTTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGCCATGCAGGGTGACGCGCGCGATGGTCGCACCCTGGCt < 3:213719/149‑1 (MQ=255) ttCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGCCATGCAGGGTGACGCGCGCGATGGTCGCACCCTGGCTcg > 6:297484/1‑149 (MQ=255) ggAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGCCATGCAGGGTGACGCGCGCGATGGTCGCACCCTGGCTCGCGAAGCTTa > 4:92254/1‑149 (MQ=255) ggTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGCCATGCAGGGTGACGCGCGCGATGGTCGCACCCTGGCTCGCGAAGCTTATTtc > 4:214791/1‑149 (MQ=255) ggTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGCCATGCAGGGTGACGCGCGCGATGGTCGCACCCTGGCTCGCGAAGCTTATTtc > 6:214620/1‑149 (MQ=255) ttCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCAACGCCATGCAGTGTGACGCGCGCGATCGAAGCACACTGGCTCGCGAAGCTTATTacgt > 6:248494/1‑149 (MQ=255) caccacCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGCCATGCAGGGTGACGCGCGCGATGGTCGCACCCTGGCTCGCGAAGCTTATTtcgtc < 3:214791/148‑1 (MQ=255) accaccGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGCCATGCAGGGTGACGCGCGCGATGGTCGCACCCTGGCTCGCGaa > 2:307204/1‑135 (MQ=255) accaccGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGCCATGCAGGGTGACGCGCGCGATGGTCGCACCCTGGCTCGCGaa < 1:307204/135‑1 (MQ=255) caccGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGCCATGCAGGGTGACGCGCGCGATGGTCGCACCCTGGCTCGCGAAGCTTATTTCGTCGAGt < 5:214620/149‑1 (MQ=255) ccGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGCCATGCAGGGTGACGCGCGCGATGGTCGCACCCTGGCTCGCGAAGCTTATTTCGTCGAGTTc > 6:35773/1‑149 (MQ=255) cGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGCCATGCAGGGTGACGCGCGCGATGGTCGCACCCTGGCTCGCGAAGCTTATTTCGTCGAGTTCg > 1:178673/1‑149 (MQ=255) cGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGCCATGCAGGGTGACGCGCGCGATGGTCGCACCCTGGCTCGCGAAGCTTATTTCGTCGAGTTCg < 8:173901/149‑1 (MQ=255) gACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGCCATGCAGGGTGACGCGCGCGATGGTCGCACCCTGGCTCGCGAAGCTTATTTCGTCGAGTTCGCCCg > 5:379990/1‑149 (MQ=255) cgAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGCCATGCAGGGTGACGCGCGCGATGGTCGCACCCTGGCTCGCGAAGCTTATTTCGTCGAGTTCGCCCGTGAt > 5:140767/1‑149 (MQ=255) gAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGCCATGCAGGGTGACGCGCGCGATGGTCGCACCCTGGCTCGCGAAGCTTATTTCGTCGAGTTCGCCCGTGAtc < 3:92254/149‑1 (MQ=255) aaaaGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGCCATGCAGGGTGACGCGCGCGATGGTCGCACCCTGGCTCGCGAAGCTTATTTCGTCGAGTTCGCCCGTGAtctc > 5:283680/1‑149 (MQ=255) ccaGGTCGTTGAGC‑‑CACTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGCCATGCAGGGTGACGCGCGCGATGGTCGCACCCTGGCTCGCGAAGCTTATTTCGTCGAGTTCGCCCGTGAtctc > 2:77394/3‑148 (MQ=255) aGGTCGTTGAGC‑‑CACTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTACCAGCCATGCAGGGTGACGCGCGCGATGGTCGCACCCTGGCTCGCGAAGCTTATTTCGTCGAGTTCGCCCGTGATCTCCa > 5:272698/1‑148 (MQ=255) gTCGTTGAGC‑‑CACTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGCCATGCAGGGTGACGCGCGCGATGGTCGCACCCTGGCTCGCGAAGCTTATTTCGTCGAGTTCGCCCGTGATCTCCAAAc > 2:116430/1‑149 (MQ=255) gTCGTTGAGC‑‑CACTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGCCATGCAGGGTGACGCGCGCGATGGTCGCACCCTGGCTCGCGAAGCTTATTTCGTCGAGTTCGCCCGTGATCTCCAAAc > 7:187372/1‑149 (MQ=255) tCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGCCATGCAGGGTGACGCGCGCGATGGTCGCACCCTGGCTCGCGAAGCTTATTTCGTCGAGTTCGCCCGTGATCTCCAAAcc > 8:46931/1‑149 (MQ=255) ttGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGCCATGCAGGGTGACGCGCGCGATGGTCGCACCCTGGCTCGCGAAGCTTATTTCGTCGAGTTCGCCCGTGATCTCCAAACCGTc < 2:178673/149‑1 (MQ=255) ttGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGCCATGCAGGGTGACGCGCGCGATGGTCGCACCCTGGCTCGCGAAGCTTATTTCGTCGAGTTCGCCCGTGATCTCCAAACCGTc > 2:362380/1‑149 (MQ=255) ttGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGCCATGCAGGGTGACGCGCGCGATGGTCGCACCCTGGCTCGCGAAGCTTATTTCGTCGAGTTCGCCCGTGATCTCCAAACCGTc < 1:362380/149‑1 (MQ=255) gCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGCCATGCAGGGTGACGCGCGCGATGGTCGCACCCTGGCTCGCGAAGCTTATTTCGTCGAGTTCGCCCGTGATCTCCAAACCGTCGCCaaaa > 4:87278/1‑149 (MQ=255) | GAAAACCGGGCGCGCCTGTTGCTCGAAATCGTCAAGGCGGTCCGGGCCGTGGTTTCTGTGGATTTTGCAGTGGCGGTCAAACTCAACTCCGCCGATTTCCAGCGCGGAGGGTTCACCACCGAAGACGCGAAAAAGGTCGTTGAGT‑‑GGCTCAACGACCTGGGCGTAGACATGGTGGAGTTATCGGGAGGCAGCTACGAAGTCCCCGCCATGCAGGGTGACGCGCGCGATGGTCGCACCCTGGCTCGCGAAGCTTATTTCGTCGAGTTCGCCCGTGATCTCCAAACCGTCGCCAAAA > NC_002947/3391376‑3391670 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |