| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,478,890 | G→A | 8.1% | R777C (CGC→TGC) | PP_3090 ← | OmpA domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,478,890 | 0 | G | A | 8.1% | 175.0 / 3.9 | 62 | R777C (CGC→TGC) | PP_3090 | OmpA domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (28/28); new base A (3/2); total (31/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 | |||||||||||
CACCCGGCGGTTGGGCTCCAGGCACTTGATCAACTGCGTTCGCGGTTGTTGCATGTCGCAGTTGACCAATGGCTTGCGGCTGCCTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCACCCAGTTGGTCGGC‑GTGCCCCGAGATGATGATCTTGCCGATATTCGGGGTGTTCAGCAGCTTGCTGGCAATTGCGCTCAGCTGATGCTGGCCTTCGTTT > NC_002947/3478750‑3479038 | cACCCGGCGGTTGGGCTCCAGGCACTTGATCAACTGCGTTCGCGGTTGTTGCATGTCGCAGTTGACCAATGGCTTGCGGCTGCCTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGttt < 4:153660/149‑1 (MQ=255)cACCCGGCGGTTGGGCTCCAGGCACTTGATCAACTGCGTTCGCGGTTGTTGCATGTCGCAGTTGACCAATGGCTTGCGGCTGCCTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGttt > 7:36525/1‑149 (MQ=255) ggTTGGGCTCCAGGCACTTGATCAACTGCGTTCGCGGTTGTTGCATGTCGCAGTTGACCAATGGCTTGCGGCTGCCTTCGCCCTGCGCGACCACCTGCTCGGCAGGTAAGCGCTTGCCTAGAAGATAGGTGAGGATGGTTTGCGCCCgt > 5:309381/1‑149 (MQ=255) ggTTGGGCTCCAGGCACTTGATCAACTGCGTTCGCGGTTGTTGCATGTCGCAGTTGACCAATGGCTTGCGGCTGCCTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCgt > 5:309385/1‑149 (MQ=255) gggCTCCAGGCACTTGATCAACTGCGTTCGCGGTTGTTGCATGTCGCAGTTGACCAATGGCTTGCGGCTGCCTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCgttgtt > 2:214705/1‑149 (MQ=255) gCTCCAGGCACTTGATCAACTGCGTTCGCGGTTGTTGCATGTCGCAGTTGACCAATGGCTTGCGGCTGCCTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATg > 4:133057/1‑131 (MQ=255) gCTCCAGGCACTTGATCAACTGCGTTCGCGGTTGTTGCATGTCGCAGTTGACCAATGGCTTGCGGCTGCCTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATg < 3:133057/131‑1 (MQ=255) cAGGCACTTGATCAACTGCGTTCGCGGTTGTTGCATGTCGCAGTTGACCAATGGCTTGCGGCTGCCTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGaaa > 2:294696/1‑149 (MQ=255) cAGGCACTTGATCAACTGCGTTCGCGGTTGTTGCATGTCGCAGTTGACCAATGGCTTGCGGCTGCCTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCACGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATCGTTTGAGCCCGTTGTTTCGaaa > 7:339296/1‑149 (MQ=255) aGGCACTTGATCAACTGCGTTCGCGGTTGTTGCATGTCGCAGTTGACCAATGGCTTGCGGCTGCCTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATTGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAAc < 8:228642/149‑1 (MQ=255) aGGCACTTGATCAACTGCGTTCGCGGTTGTTGCATGTCGCAGTTGACCAATGGCTTGCGGCTGCCTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAAc > 8:230208/1‑149 (MQ=255) cTTGATCAACTGCGTTCGCGGTTGTTGCATGTCGCAGTTGACCAATGGCTTGCGGCTGCCTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTg > 4:247926/1‑147 (MQ=255) cTTGATCAACTGCGTTCGCGGTTGTTGCATGTCGCAGTTGACCAATGGCTTGCGGCTGCCTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTg > 7:328087/1‑147 (MQ=255) gATCAACTGCGTTCGCGGTTGTTGCATGTCGCAGTTGACCAATGGCTTGCGGCTGCCTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGt > 7:123320/1‑149 (MQ=255) aaCTGCGTTCGCGGTTGTTGCATGTCGCAGTTGACCAATGGCTTGCGGCTGCCTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGcc < 8:123320/149‑1 (MQ=255) aaCTGCGTTCGCGGTTGTTGCATGTCGCAGTTGACCAATGGCTTGCGGCTGCCTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGcc > 2:66622/1‑149 (MQ=255) aaCTGCGTTCGCGGTTGTTGCATGTCGCAGTTGACCAATGGCTTGCGGCTGCCTTCGCCCTGCGAGACCACCAGCTCGGCAGGTACTCCCTTGCCAACCAGATAGCTGCAGATGGTTTGCGCCCGTAGATTCGAAACCTGCAGGTTGcc > 2:285177/1‑149 (MQ=255) cTGCGTTCGCGGTTGTTGCATGTCGCAGTTGACCAATGGCTTGCGGCTGCCTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCt > 6:202576/1‑149 (MQ=255) cTGCGTTCGCGGTTGTTGCATGTCGCAGTTGACCAATGGCTTGCGGCTGCCTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCACTTGACAACCAGATAGGTGAGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTAGAAACCTGCAGGTTGCACt > 1:155673/1‑149 (MQ=255) cGTTCGCGGTTGTTGCATGTCGCAGTTGACCAATGGCTTGCGGCTGCCTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTgg < 5:202576/148‑1 (MQ=255) gTTCGCGGTTGTTGCATGTCGCAGTTGACCAATGGCTTGCGGCTGCCTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCt < 2:92879/149‑1 (MQ=255) cgGTTGTTGCATGTCGCAGTTGACCAATGGCTTGCGGCTGCCTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGAGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCAc > 6:70343/1‑149 (MQ=255) ttgCATGTCGCAGTTGACCAATGGCTTGCGGCTGCCTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCACCCAGt < 3:247926/148‑1 (MQ=255) gCATGTCGCAGTTGACCAATGGCTTGCGGCTGCCTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCACCCAGTTgg > 1:325640/1‑149 (MQ=255) gCAGTTGACCAATGGCTTGCGGCTGCCTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCACCCAGTTGGTCGGC‑Gt > 6:175506/1‑149 (MQ=255) gCAGTTGACCAATGGCTTGCGGCTGCCTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTACCCTGGCTGTCACCCAGTTGGTCGGC‑Gt < 1:214705/149‑1 (MQ=255) cAATGGCTTGCGGCTGCCTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCTGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCACCCACTTGGTCGGC‑GTGCCCCgaga < 2:1235/149‑1 (MQ=255) cAATGGCTTGCGGCTGCCTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCACCCAGTTGGTCGGC‑GTGCCCCgaga < 1:314262/149‑1 (MQ=255) cAATGGCTTGCGGCTGCCTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCACCCAGTTGGTCGGC‑GTGCCCCgaga < 8:328087/149‑1 (MQ=255) cAATGGCTTGCGGCTGCCTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCACCCAGTTGGTCGGC‑GTGCCCCgaga < 1:66622/149‑1 (MQ=255) aaTGGCTTGCGGCTGCCTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTgg < 8:81083/117‑1 (MQ=255) aTGGCTTGCGGCTGCCTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCACCCAGTTGGTCGGc > 4:171076/1‑136 (MQ=255) aTGGCTTGCGGCTGCCTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCACCCAGTTGGTCGGc < 3:171076/136‑1 (MQ=255) aTGGCTTGCGGCTGCCTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCACCCAGTTGGTCGGC‑GTGCCCCGAgatg < 8:224943/149‑1 (MQ=255) gCTTGCGGCTGCCTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCACCCAGTTGGTCGGC‑GTGCCCCGAgatgat < 8:36525/148‑1 (MQ=255) cGGCTGCCTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCAc > 4:90823/1‑115 (MQ=255) cGGCTGCCTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCAc < 3:90823/115‑1 (MQ=255) ccatctcccTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATACGTGCGGATGGTTTGCGCCCGATGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCACCCAGTTGGTCGGC‑GTGCCCCGATATGATGATCTTGCCg < 6:309381/141‑1 (MQ=255) ccTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCACCCAGTTGGTCGGC‑GTGCCCCGAGATGATGATCTTGCCg < 6:309385/147‑1 (MQ=255) cTTCGCCCTGCGCGTCCACCAGCTCGGCAGGTACGGCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGGAGGTTGCCCTTGCTGTCACCCAGTTGGTCGGC‑GTGCCCCGAGATGATGATCTTGCCGata < 2:326998/149‑1 (MQ=255) cTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCACCCAGTTGGTCGGC‑GTGCCCCGAGATGATGATCTTGCCGata > 2:232392/1‑149 (MQ=255) ttCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCACCCAGTTGGTCGGC‑GTGCCCCg > 8:355700/1‑128 (MQ=255) ttCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCACCCAGTTGGTCGGC‑GTGCCCCg < 7:355700/128‑1 (MQ=255) ttCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCACCCAGTTGGTCGGC‑GTGCCCCGAGATGATGATCTTGCCGatat > 7:79236/1‑149 (MQ=255) ttCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCAGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCACCCAGTTGGTCGGC‑GTGCCCCGAGATGATGATCTTGCGGatat > 3:324787/1‑149 (MQ=255) ttCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCAGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCACCCAGTTGGTCGGC‑GTGCCCCGAGATGATGATCTTGCCGatat > 3:319326/1‑149 (MQ=255) cccTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTTCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCACCCAGTTGGTCGGC‑GTGCCCCGAGATGATGATCTTGCCGATATTCgg < 7:230208/149‑1 (MQ=255) cccTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGGTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCGGTCACCCAGTTGGTCGGC‑GTGCCCCGAGATGATGATCTTGCCGATATTCgg < 5:118144/149‑1 (MQ=255) gcgACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCAGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCACCCAGTTGGTCGGC‑GTGCCCCGAGATGATGATCTTGCCGATATTCGGGGTGtt < 4:324787/149‑1 (MQ=255) gcgACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCAGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCACCCAGTTGGTCGGC‑GTGCCCCGAGATGATGATCTTGCCGATATTCGGGGTGtt < 4:319326/149‑1 (MQ=255) caccaGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCACCCAGTTGGTCGGC‑GTGCCCCGAGATGATGATCTTGCCGATATTCGGGGTGTTcagca < 2:325640/149‑1 (MQ=255) accaGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCACCCAGTTGGTCGGC‑GTGCCCCGAGATGATGATCTTGCCGATATTCGGGGTGTTcagcag > 3:346840/1‑149 (MQ=255) aGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCACCCAGTTGGTCGGC‑GTGCCCCGAGATGATGATCTTGCCGATATTCGGGGTGTTCAGCAGCtt < 5:175506/149‑1 (MQ=255) cTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCACCCAGTTGGTCGGC‑GTGCCCCGAGATGATGATCTTGCCGATATTCGGGGTGTTCAGCAGCTTGc < 8:79236/149‑1 (MQ=255) tCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCACCCAGTTGGTCGGC‑GTGCCCCGAGATGATGATCTTGCCGATATTCGGGGTGTTCAGCAGCTTGCt > 2:38648/1‑149 (MQ=255) ggCAGGTAAGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCACCCAGTTGGTCGGC‑GTGCCCCGAGATGATGATCTTGCCGATATTCGGGGTGTTCAGCAGCTTGCTgg < 2:155673/149‑1 (MQ=255) gCATGTACGCCCTTGCCTACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGGGGCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCACCCAGTTGGTCGGCGGTGCCCCGAGATGATGATCTTGCCGATATTCGGGGTGTTCAGCAGCTTGCTgg < 1:285177/149‑1 (MQ=255) cAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCACCCAGTTGGTCGGC‑GTGCCCCGAGATGATGATCTTGCCGATATTCGGGGTGTTCAGCAGCTTGCTGGc > 1:229967/1‑148 (MQ=255) cAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCACCCAGTTGGTCGGC‑GTGCCCCGAGATGATGATCTTGCCGATATTCGGGGTGTTCAGCAGCTTGCTGGc > 2:186874/1‑148 (MQ=255) gATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCACCCAGTTGGTCGGC‑GTGCCCCGAGATGATGATCTTGCCGATATTCGGGGTGTTCAGCAGCTTGCTGGCAATTGCGCTCAGCTGATGCTgg > 6:212171/1‑149 (MQ=255) cGGCTGGTTTCCGGCCGTTGGTTCGAAACCTGCAGGCTGCGCTGGCTGTCACACATTTGGTCGGC‑GTGCCCCGAGATGATGATCTTGCCGATTTTCGGGTTGTTCAGGAGCTTGCTGGCAATTGCGCTCAGCTGTTGCTGGCCTTCg < 4:272227/147‑1 (MQ=255) cGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCCAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCACCCAGATGGTCGGC‑GTGCCCCGAGATGATCATCATGCCGATATTCGGGGTGTTAAGCAGCTTGCTGGCAATTGCGCTCAGCTGATGCTGGCCTTCGta > 3:272227/1‑148 (MQ=255) ggATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCACCCAGTTGGTCGGC‑GTGCCCCGAGATGATGATCTTGCCGATATTCGGGGTGTTCAGCAGCTTGCTGGCAATTGCGCTCAGCTGATGCTGGCCTTCGttt > 1:231917/1‑149 (MQ=255) ggATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGATGCCCTGGCTGTCACCCAGTTGGTCGCC‑GTGCCCCGAGATGAAGATCTTGCCGATATTCGGGGTGTTCAGCAGCTTGCTGGCAATTGCGGTCAGCTGATGCTGGACTGCGttt > 6:204141/1‑149 (MQ=255) | CACCCGGCGGTTGGGCTCCAGGCACTTGATCAACTGCGTTCGCGGTTGTTGCATGTCGCAGTTGACCAATGGCTTGCGGCTGCCTTCGCCCTGCGCGACCACCAGCTCGGCAGGTACGCCCTTGCCAACCAGATAGGTGCGGATGGTTTGCGCCCGTTGTTTCGAAACCTGCAGGTTGCCCTGGCTGTCACCCAGTTGGTCGGC‑GTGCCCCGAGATGATGATCTTGCCGATATTCGGGGTGTTCAGCAGCTTGCTGGCAATTGCGCTCAGCTGATGCTGGCCTTCGTTT > NC_002947/3478750‑3479038 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |