| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,532,331 | C→A | 6.9% | L284L (CTG→CTT) | PP_3121 ← | transcriptional regulator, LysR family |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,532,331 | 0 | C | A | 6.9% | 210.9 / 3.6 | 67 | L284L (CTG→CTT) | PP_3121 | transcriptional regulator, LysR family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (29/33); new base A (3/2); total (32/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.64e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
CAGCGCCGCGACTTCGGCAGCCTTGCGACCTGGGTCTTCGCCCATGTACCAGGTGCCTTGGCCGATGGCTGCAACGCTCGTGCCTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCGATGCGCCGCTCGACTGTGGGCTCGACCAAGGTGACGCAGCGGGCACCCAGC‑‑TCCTGCATCTGGTTGATGCACAGGGCCGGCACGGCACTGACCC > NC_002947/3532185‑3532476 | cAGCGCCGCGACTTCGGCAGCCTTGCGACCTGGGTCTTCGCCCATGTACCAGGTGCCTTGGCCGATGGCTGCAACGCTCGTGCCTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAg > 7:358201/1‑149 (MQ=255) gcgACTTCGGCAGCCTTGCGACCTGGGTCTTCGCCCATGTACCAGGTGCCTTGGCCGATGGCTGCAACGCTCGTGCCTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTGCTTGAAGTGCttct < 8:323053/149‑3 (MQ=255) cgACTTCGGCAGCCTTGCGACCTGGGTCTTCGCCCATGTACCAGGTGCCTTGGCCGATGGCTGCAACGCTCGTGCCTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTtgtg > 4:142471/1‑149 (MQ=255) aCTTAGGCAGCCTTGCGTCCTGGGTCTTCGCCCATGTACCAGGTGCCTTGGCCGATGGCTGCAACGCTCGTGCCTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGtgct < 4:253694/149‑1 (MQ=255) ggCAGCCTTGCGACCTGGGTCTTCGCCCATGTACCAGGTGCCTTGGCCGATGGCTGCAACGCTCGTGCCTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCgg < 2:376503/148‑1 (MQ=255) gCAGCCTTGCGACCTGTGTCTTCGCACATGTACCAGGTGCCTTGGCCGATGGCTGCAACCCTCGTGCATGCCAGATTTACGTAAAGCATGTCACCTCCGGGATACGGGTATTGTAAAGAAGCACTTCAAGCAGTCCTTGTGCTGCGGTg > 6:100369/1‑149 (MQ=255) cAGCCTTGCGACCTGGGTCTTCGCCCATGTACCAGGTGCCTTGGCCGATGGCTGCAACGCTCGTGCCTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTgg < 7:112295/149‑1 (MQ=255) ccTTGCGACCTGGGTCTTCGCCCATGTACCAGGTGCCTTGGCCGATGGCTGCAACGCTCGTGCCTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGaaa < 1:198515/149‑1 (MQ=255) gCGACCTGGGTCTTCGCCCATGTACCAGGTGCCTTGGCCGATGGCTGCAACGCTCGTGCCTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCtt > 3:163940/1‑149 (MQ=255) gCGACCTGGGTCTTCGCCCATGTACCAGGTGCCTTGGCCGATGGCTGCAACGCTCGTGCCTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCt < 4:202382/148‑1 (MQ=255) cGACCTGGGTCTTCGCCCATGTACCAGGTGCCTTGGCCGATGGCTGCAACGCTCGTGCCTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCtt < 6:283041/148‑1 (MQ=255) cGACCTGGGTCTTCGCCCATGTACCAGGTGCCTTGGCCGATGGCTGCAACGCTCGTGCCTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCtt < 2:162535/148‑1 (MQ=255) gACCTGGGTCTTCGCCCATGTACCAGGTGCCTTGGCCGATGGCTGCAACGCTCGTGCCTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTtgt < 8:358201/149‑1 (MQ=255) ccTGGGTCTTCGCCCATGTACCAGGTGCCTTGGCCGATGGCTGCAACGCTCGTGCCTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGc < 3:158493/149‑1 (MQ=255) gggTCTTCGCCCATGTACCAGGTGCCTTGGCCGATGGCTGCAACGCTCGTGCCTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCt > 1:193484/1‑147 (MQ=255) gggTCTTCGCCCATGTACCAGGTGCCTTGGCCGATGGCTGCAACGCTCGTGCCTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCt < 2:193484/147‑1 (MQ=255) tCTTCGCCCATGTACCAGGTGCCTTGGCCGATGGCTGCAACGCTCGTGCCTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCt > 5:76973/1‑148 (MQ=255) tCTTCGCCCATGTACCAGGTGCCTTGGCCGATGGCTGCAACGCTCGTGCCTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTg < 3:142471/149‑1 (MQ=255) tCTTCGCCCATGTACCAGGTGCCTTGGCCGATGGCTGCAACGCTCGTGCCTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCGTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTg > 4:71728/1‑149 (MQ=255) gCCCATGTACCAGGTGCCTTGGCCGATGGCTGCAACGCTCGTGCCTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTtg > 7:47787/1‑135 (MQ=255) gCCCATGTACCAGGTGCCTTGGCCGATGGCTGCAACGCTCGTGCCTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTtg < 8:47787/135‑1 (MQ=255) gCCCATGTACCAGGTGCCTTGGCCGATGGCTGCAACGCTCGTGCCTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAggg > 5:322987/1‑148 (MQ=255) gCCCATGTACCAGGTGCCTTGGCCGATGGCTGCAACGCTCGTGACTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAggg > 2:17945/1‑148 (MQ=255) cccATGTACCAGGTGCCTTGGCCGATGGCTGCAACGCTCGTGCCTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGc > 5:7695/1‑148 (MQ=255) aTGTACCAGGTGCCTTGGCCGATGGCTGCAACGCTCGTGCCTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATc < 4:132033/149‑1 (MQ=255) ccAGCTGCCTTGGCCGATGGCTGCAACGCTCCTGCCTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGc < 4:27061/148‑1 (MQ=255) gTGCCTTGGCCGATGGCTGCAACGCTCGTGCCTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGc > 2:131480/1‑144 (MQ=255) gTGCCTTGGCCGATGGCTGCAACGCTCGTGCCTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGc < 1:131480/144‑1 (MQ=255) ccTTGGCCGATGGCTGCAACGCTCGTGCCTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCGATgcgc < 6:7695/149‑1 (MQ=255) aTGGCTGCAACGCTCGTGCCTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCGATGCGCCGCTCGACt < 8:231111/149‑1 (MQ=255) cTGCAACGCTCGTGCCTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCGATGCGCCGCTCGACTGTgg > 2:87050/1‑149 (MQ=255) gCAACGCTCGTGCCTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCGATGCGCCGCTCGACTGTggg < 6:113831/148‑1 (MQ=255) gCAACGCTCGTGCCTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCGATGCGCCGCTCGACTGTggg > 5:113831/1‑148 (MQ=255) aaCGCTCGTGCCTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCGATGCGCCGCTCGACTGTGGGCTc < 6:76973/149‑1 (MQ=255) gCTCGTGCCTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCGATGCGCCGCTc < 6:15808/134‑1 (MQ=255) gCTCGTGCCTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCGATGCGCCGCTc > 5:15808/1‑134 (MQ=255) gCTCGTGCCTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCGATGCGCCGCTCGACtgt < 4:198344/140‑1 (MQ=255) gCTCGTGCCTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCGATGCGCCGCTCGACtgt > 3:198344/1‑140 (MQ=255) tgcctgccAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCGATGCGCCGCTCGACTGTGGGCTCGACCAAgg < 1:87050/149‑1 (MQ=255) cctgccAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGTAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCTATGCGCCGCTCGACTGTGGGCTCGACCAAGGTg < 5:100369/149‑1 (MQ=255) tgccAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCGATGCGCCGCTCGACTGTGGGCTCGACCAAGGTGAc > 7:24773/1‑149 (MQ=255) tttACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCGATGCGCCGCTCGACTGTGGGCTCGACCAAGGTGACGCAGCgg < 4:163940/149‑1 (MQ=255) aCGCATGTCACCTCCCGGATCCGGGTATTGGAAAGAACCACTTCAACCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCGATGCGCCGCTCGACTGTGGGCTCGACCAAGGTGACGCAGCGGGCACCCAg < 6:322987/149‑1 (MQ=255) cTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCGATGCGCCGCTCGACTGTGGGCTCGACCAAGGTGACGCAGCGGGCACCCAGC‑‑TCCTGCagat > 1:100604/1‑146 (MQ=255) cTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCGATGCGCCGCTCGACTGTGGGCTCGACCAAGGTGACGCAGCGGGCACCCAGC‑‑TCCTGCATCt > 3:158442/1‑149 (MQ=255) gATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCGATGCGCCGCTCGACTGTGGGCTCGACCAAGGTGACGCAGCGGGCACCCAGC‑‑TCCTGCATCTGGTTGa < 1:145634/149‑1 (MQ=255) ggAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCGATGCGCCGCTCGACTGTGGGCTCGACCAAGGTGACGCAGCGGGCACCCAGC‑‑TCCTGCATCTGGTTGATGCACAGGGCcg > 1:69853/1‑149 (MQ=255) gAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCGATGCGCCGCTCGACTGTGGGCTCGACCAAGGTGACGCAGCGGGCACCCAGC‑‑TCCTGCATCTGGTTGATGCACAGGGCcgg > 2:36868/1‑149 (MQ=255) gAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCGATGCGCCGCTCGACTGTGGGCTCGACCAAGGTGACGCAGCGGGCACCCAGC‑‑TCCTGCATCTGGTTGATGCACAGGGCcgg > 4:169863/1‑149 (MQ=255) gAAAGAAGCACTTCAAGAAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCGATGCGCCGCTCGACTGTGGGCTCGACCAAGGTGACGCAGCGGGCACCCAGC‑‑TCCTGCAGATGGTTGATGCACAGGGCcgg > 2:160324/1‑149 (MQ=255) aagaagCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCGATGCGCCGCTCGACTGTGGGCTCGACCAAGGTGACGCAGCGGGCACCCAGC‑‑TCCTGCCTCTGGTTGAAGCACAGGGCcggca > 6:264528/1‑149 (MQ=255) agaagCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCGATGCGCCGCTCGACTGTGGGCTCGACCAAGGTGACGCAGCGGGCACCCAGC‑‑TCCTTCATCTGGTTGATGCACAGGGCcggcac < 1:17945/149‑1 (MQ=255) caagCACTGCTTGAAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCGATGCGCCGCTCGACTGTGGGCTCGACCAAGGTGACGCAGCGGGCACCCAGC‑‑TCCTGCATCTGGTTGAt > 8:90775/2‑133 (MQ=255) caagCACTGCTTGAAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCGATGCGCCGCTCGACTGTGGGCTCGACCAAGGTGACGCAGCGGGCACCCAGC‑‑TCCTGCATCTGGTTGAt < 7:90775/132‑1 (MQ=255) aagCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGACGATGCGCCGCTCGACTGTGGGCTCGACCAAGGTGACGCAGCTGGCACCCAGC‑‑TCCTGCATCTGGTTGATGCACAGGGCcggcacgg < 1:160324/149‑1 (MQ=255) aagCACTGCTTGAAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCGATGCGCCGCTCGACTGTGGGCTCGACCAAGGTGACGCAGCGGGCACCCAGC‑‑TCCTGCATCTGGTTGATGCACAGGGCcggcacgg > 1:233043/1‑149 (MQ=255) ttCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGTAAAGCTTGTGCTCTCTGATGGCAATCACGCCGATTCGCCGCTCGACTGTGGGCTCGACCAAGGTGACGCAGCGGGCACCCAGC‑‑TCCTGCATCTGGtt < 5:230934/123‑1 (MQ=255) ttCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCGATGCGCCGCTCGACTGTGGGCTCGACCAAGGTGACGCAGCTGGCCCCCAGC‑‑TCCTGCATCttgat > 6:230934/1‑119 (MQ=255) ttCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCGATGCGCCGCTCGACTGTGGGCTCGACCAAGGTGACGCAGCGGGCACCCAGC‑‑t < 4:87852/110‑1 (MQ=255) ttCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCGATGCGCCGCTCGACTGTGGGCTCGACCAAGGTGACGCAGCGGGCACCCAGC‑‑t > 3:87852/1‑110 (MQ=255) cAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCGATGCGCCGCTCGACTGTGGGCTCGACCAAGGTGACGCAGCGGGCAcc < 4:349308/103‑1 (MQ=255) cAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCGATGCGCCGCTCGACTGTGGGCTCGACCAAGGTGACGCAGCGGGCAcc > 3:349308/1‑103 (MQ=255) cAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCGATGCGCCGCTCGACTGTGGGCTCGACCAAGGTGACGCAGCGGGCACCCAGC‑‑TCCTGCATCTGGTTGATGCACAGGGCCGGCACGGCACTGAc < 4:158442/148‑1 (MQ=255) aGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCGATGCGCCGCTCGACTGTGGGCTCGACCAAGGTGACGCAGCGGGCACCCAGC‑‑TCCTGCATCTGGTTGATGCACAGGGCCGGCACGGCACTg < 4:99357/144‑1 (MQ=255) aGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCGATGCGCCGCTCGACTGTGGGCTCGACCAAGGTGACGCAGCGGGCACCCAGC‑‑TCCTGCATCTGGTTGATGCACAGGGCCGGCACGGCACTg > 3:99357/1‑144 (MQ=255) gCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCGATGCGCCGCTCGACTGTGGGCTCGACCAAGGTGACGCAGCGGGCACCCAGCGGGGCTGCATCTGGTTGATGCACAGGGCCGGCACGGCACTGAccc > 1:126795/1‑149 (MQ=255) gCAGTGCTTGTGCAGCGGAGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCGATGCGCCGCTCGACTGTGGGCTCGACCAAGGTGACGCAGCGGGCACCCAGC‑‑TCCt > 6:209537/1‑108 (MQ=255) | CAGCGCCGCGACTTCGGCAGCCTTGCGACCTGGGTCTTCGCCCATGTACCAGGTGCCTTGGCCGATGGCTGCAACGCTCGTGCCTGCCAGATTTACGTAACGCATGTCACCTCCGGGATCCGGGTATTGGAAAGAAGCACTTCAAGCAGTGCTTGTGCTGCGGTGGAAAGCTTGTGCTCGCTGAGGGCAATCACGCCGATGCGCCGCTCGACTGTGGGCTCGACCAAGGTGACGCAGCGGGCACCCAGC‑‑TCCTGCATCTGGTTGATGCACAGGGCCGGCACGGCACTGACCC > NC_002947/3532185‑3532476 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |