Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 308,213 | G→A | 6.0% | intergenic (+1228/‑641) | hslO → / → PP_0254 | molecular chaperone HslO/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 308,213 | 0 | G | A | 6.0% | 196.6 / 2.1 | 69 | intergenic (+1228/‑641) | hslO/PP_0254 | molecular chaperone HslO/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/28); new base A (2/2); total (37/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.82e-01 |
CAGAACAGCCGTGCGGCCTACCCGCTGGAGCACGTTGCCAAGCGTTCGGAAGCGAACCTGGGCGGCGAGCCTAACGCAGTGATCTTCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGAAATGGGTTCTGGCGGCGGCATCAAGTCGACCTTCTCCACCTGCTTCGGCGCACCGTTCTTCCCGCGTCCGGCTGGCGAGTACGCCGAGCTGCTGATCAAGC > NC_002947/308067‑308361 | cAGAACAGCCGTGCGGCCTACCCGCTGGAGCACGTTGCCAAGCGTTCGGAAGCGAACCTGGGCGGCGAGCCTAACGCAGTGATCTTCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAggcggc > 7:12106/1‑149 (MQ=255) aGAACAGCCGTGCGGCCTACCCGCTGGAGCACGTTGCCAAGCGTTCGGAAGCGAACCTGGGCGGCGAGCCTAACGCAGTGATCTTCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGcc < 2:193865/149‑1 (MQ=255) cAGCCGTGCGGCCTACCCGCTGGAGCACGTTGCCAAGCGTTCGGAAGCGAACCTGGGCGGCGAGCCTAACGCAGTGATCTTCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTAc > 3:351218/1‑148 (MQ=255) aGCCGTGCGGCCTACCCGCTGGAGCACGTTGCCAAGCGTTCGGAAGCGAACCTGGGCGGCGAGCCTAACGCAGTGATCTTCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCa > 7:355191/1‑149 (MQ=255) gTGCGGCCTACCCGCTGGAGCACGTTGCCAAGCGTTCGGAAGCGAACCTGGGCGGCGAGCCTAACGCAGTGATCTTCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTAcc < 3:97396/144‑1 (MQ=255) gTGCGGCCTACCCGCTGGAGCACGTTGCCAAGCGTTCGGAAGCGAACCTGGGCGGCGAGCCTAACGCAGTGATCTTCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTAcc > 4:97396/1‑144 (MQ=255) tACCCGCTGGAGCACGTTGCCAAGCGTTCGGAAGCGAACCTGGGCGGCGAGCCTAACGCAGTGATCTTCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCAGCCt > 6:140055/1‑133 (MQ=255) tACCCGCTGGAGCACGTTGCCAAGCGTTCGGAAGCGAACCTGGGCGGCGAGCCTAACGCAGTGATCTTCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCAGCCt < 5:134212/133‑1 (MQ=255) tACCCGCTGGAGCACGTTGCCAAGCGTTCGGAAGCGAACCTGGGCGGCGAGCCTAACGCAGTGATCTTCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCAGCCt > 6:134212/1‑133 (MQ=255) tACCCGCTGGAGCACGTTGCCAAGCGTTCGGAAGCGAACCTGGGCGGCGAGCCTAACGCAGTGATCTTCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCAGCCt < 5:140055/133‑1 (MQ=255) cctatGGAGCACGTTGCCAAGCGTTCGGAAGAGAACCTGGGAGGCGAGCCTAACGAAGTGATCTTCCTCACCTGCGACATGACAGGTGTTCTGCATCCGGTTTAGATCCTTAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTTTCCGGCt > 2:11497/5‑148 (MQ=255) ccGCTGGAGCACGTTGCCAAGCGTTCGGAAGCGAACCTGGGCGGCGAGCCTAACGCAGTGATCTTCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTa > 1:68368/1‑149 (MQ=255) ccGCTGGACCACGAAGCCAAGCGTTCGGAAGCGAACCTGGGCGGCGACCCTAACCCAGTGATCATCCTCACCAGCGACCTGACAGGACTTCTGCATCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGCCCTACCACTTCCTCTCCGGCTa > 2:5540/1‑149 (MQ=255) cTGGAGCACGTTGCCAAGCGTTCGGAAGCGAACCTGGGCGGCGAGCCTAACGCAGTGATCTTCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTacac < 2:68368/149‑1 (MQ=255) aGCACGTTGCCAAGCGTTCGGAAGCGAACCTGGGCGGCGAGCCTAACGCAGTGATCTTCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACcgcg > 7:301285/1‑149 (MQ=255) cACGTTGCCAAGCGTTCGGAAGCGAACCTGGGCGGCGAGCCTAACGCAGTGATCTTCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTc < 8:64829/129‑1 (MQ=255) cACGTTGCCAAGCGTTCGGAAGCGAACCTGGGCGGCGAGCCTAACGCAGTGATCTTCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTc > 7:64829/1‑129 (MQ=255) gTTGCCAAGCGTTCGGAAGCGAACCTGGGCGGCGAGCCTAACGCAGTGATCTTCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGt > 1:379807/1‑149 (MQ=255) gCCAAGCGTTCGGAAGCGAACCTGGGCGGCGAGCCTAACGCAGTGATCTTCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCg < 2:379807/148‑1 (MQ=255) ccAATCGTTCGGAAGCGAACCTGGGCGGCGAGCCTAACGCAGTGATCTTCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCTGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGt < 1:11497/149‑1 (MQ=255) ccAAGCGTTCGGAAGCGAACCTGGGCGGCGAGCCTAACGCAGTGATCTTCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTTAACAACGAGCAGGCTGCCTACCACTTCCTGTCCGGGTACACCGCGCTGGTCGGt < 1:5540/149‑1 (MQ=255) gCGTTCGGAAGCGAACCTGGGCGGCGAGCCTAACGCAGTGATCTTCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCa > 3:22942/1‑149 (MQ=255) gCGTTCGGAAGCGAACCTGGGCGGCGAGCCTAACGCAGTGATCTTCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCa < 4:8429/149‑1 (MQ=255) ttCGGAAGCGAACCTGGGCGGCGAGCCTAACGCAGTGATCTTCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTg < 4:351218/149‑1 (MQ=255) ggAAGCGAACCTGGGCGGCGAGCCTAACGCAGTGATCTTCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCa > 7:136799/1‑143 (MQ=255) ggAAGCGAACCTGGGCGGCGAGCCTAACGCAGTGATCTTCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCa < 8:136799/143‑1 (MQ=255) ggAAGCGAACCTGGGCGGCGAGCCTAACGCAGTGATCTTCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGaaa > 8:229671/1‑149 (MQ=255) aGCGAACCTGGGCGGCGAGCCTAACGCAGTGATCTTCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGAAATgg < 8:301285/149‑1 (MQ=255) aGCGAACCTGGGCGGCGAGCCTAACGCAGTGATCTTCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGAAATgg > 4:123455/1‑149 (MQ=255) ggcggcGAGCCTAACGCAGTGATCTTCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGAAATGGGTTCTggcgg > 4:343056/1‑149 (MQ=255) cggcgAGCCTAACGCAGTGATCTTCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGAAATGGGTTCTggcggcg < 3:149711/149‑1 (MQ=255) cTAACGCAGTGATCTTCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGAAATGGGTTCTGGCGGCGGCATCAAg < 3:343056/149‑1 (MQ=255) aTCTTCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACt < 6:47383/111‑1 (MQ=255) aTCTTCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACt > 5:47383/1‑111 (MQ=255) cTTCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGAAATGGGTTCTGGCGGCGGCATCCAGTCGCCCTTCGCCa > 8:266221/1‑149 (MQ=255) ttCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTAc > 3:284551/1‑69 (MQ=255) ttCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTAc < 4:284551/69‑1 (MQ=255) ttCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGAAATGGGTTCTGGCGGCGGCATCAAGTCGACCTTCTCCAc > 7:277103/1‑149 (MQ=255) tCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGAAATGGGTTCTGGCGGCGGCATCAAGTCGACCTTCTCCAc < 6:154251/148‑1 (MQ=255) ccTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGAAATGGGTTCTGGCGGCGGCATCAAGTCGACCTTCTCCACCTGCTTc > 4:108099/1‑149 (MQ=255) tGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGt > 2:372405/1‑89 (MQ=255) tGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGt < 1:372405/89‑1 (MQ=255) ccTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGAAATGGGTTCTGGCGGCGGCATCAAGTCGACCTTCTCCACCTGCTTCGGCGCAc < 7:162587/149‑1 (MQ=255) cTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGAAATGGGTTCTGGCGGCGGCATCAAGTCGACCTTCTCCACCTGCTTCGGCGCAcc > 8:150487/1‑149 (MQ=255) tGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGAAATGGGTTCTGGCGGCGGCATCAAGTCGACCTTCTCCACCTGCTTCg > 5:317404/1‑141 (MQ=255) tGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGAAATGGGTTCTGGCGGCGGCATCAAGTCGACCTTCTCCACCTGCTTCg < 6:317404/141‑1 (MQ=255) gtgtTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGAAATGGGTTCTGGCGGCGGCATCAAGTCGACCTTCTCCACCTGCTTCGGCGCACCGttcttc < 7:150487/149‑1 (MQ=255) gtTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGAAATGGGTTCTGGCGGCGGCATCAAGTCGACCTTCTCCACCTGCTTCGGCGCACCGTTCTTccc > 6:132174/1‑149 (MQ=255) ttCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGAAATGGGTTCTGGCGGCGGCATCAAGTCGACCTTCTCCACCTGCTTCGGCGCACCGTTCTTCCcg > 2:51270/1‑149 (MQ=255) cTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGAAATGGGTTCTGGCGGCGGCATCAAGTCGACCTTCTCCACCTGCTTCGGCGCACCGTTCTTCCcgcg > 8:34355/1‑149 (MQ=255) cTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGAAATGGGTTCTGGCGGCGGCATCAAGTCGACCTTCTCCACCTGCTTCGGCGCACCGTTCTTCCcgcg > 2:246043/1‑149 (MQ=255) cTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTAc > 1:316419/1‑38 (MQ=255) cTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTAc < 2:316419/38‑1 (MQ=255) tCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGAAATGGGTTCTGGCGGCGGCATCAAGTCGACCTTCTCCACCTGCTTCGGCGCACCGTTCTTCCCGCGTCCgg > 7:304232/1‑149 (MQ=255) ccGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGAAATGGGTTCTGGCGGCGGCATCAAGTCGACCTTCTCCACCTGCTTCGGCGCACCATTCTTCCCGCGTCCGGc > 8:85407/1‑149 (MQ=255) ggTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGAAATGGGTTCTGGCGGCGGCATCAAGTCGACCTTCTCCACCTGCTTCGGCGCACCGTTCTTCCCGCGTCCGGCTg < 8:12106/149‑1 (MQ=255) gTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGAAATGGGTTCTGGCGGCGGCATCAAGTCGACCTTCTCCACCTGCTTCGGCGCACCGTTCTTCCCGCGTCCGGCTgg < 7:266221/149‑1 (MQ=255) tttCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGAAATGGGTTCTGGCGGCGGCATCAAGTCGACCTTCTCCACCTGCTTCGGCGCACCGTTCTTCCCGCGTCCGGCTGGc < 4:22942/149‑1 (MQ=255) tttCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGAAATGGGTTCTGGCGGCGGCATCAAGTCGACCTTCTCCACCTGCTTCGGCGCACCGTTCTTCCCGCGTCCGGCTGGc > 1:223635/1‑149 (MQ=255) ttCGATCCTGAACAACGAGCAGGCCGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGAAATGGGTTCTGGCGGCGGCATCAAGTCGACCTTCTCCACCTGCTTCGGCGCACCGTTCTTCCCGCGTCCGGCTGGc > 8:99348/1‑148 (MQ=255) aTCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGAAATGGGTTCTGGCGGCGGCATCAAGTCGACCTTCTCCACCTGCTTCGGCGCACCGTTCTTCCCGCGTCCGGCTGGCGAGTa > 8:217653/1‑149 (MQ=255) tCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGAAATGGGTTCTGGCGGCGGCATCAAGTCGACCTTCTCCACCTGCTTCGGCGCACCGTTCTTCCCGCGTCCGGCt > 4:31082/1‑140 (MQ=255) tCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGAAATGGGTTCTGGCGGCGGCATCAAGTCGACCTTCTCCACCTGCTTCGGCGCACCGTTCTTCCCGCGTCCGGCt < 3:31082/140‑1 (MQ=255) cTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGAAATGGGTTCTGGCGGCGGCATCAAGTCGACCTTCTCCACCTGCTTCGGCGCACCGTTCTTCCCGCGTCCGGCTGGCGAGTACg < 1:51270/148‑1 (MQ=255) cTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGAAATGGGTTCTGGCGGCGGCATCAAGTCGACCTTCTCCACCTGCTTCGGCGCACCGTTCTTCCCGCGTCCGGCTGGCGAGTACGc > 1:158767/1‑149 (MQ=255) aacaacGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGAAATGGGTTCTGGCGGCGGCATCAAGTCGACCTTCTCCACCTGCTTCGGCGCACCGTTCTTCCCGCGTCCGGCTGGCGAGTACGCCGa < 1:246043/149‑1 (MQ=255) acaacGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGAAATGGGTTCTGGCGGCGGCATCAAGTCGACCTTCTCCACCTGCTTCGGCGCACCGTTCTTCCCGCGTCCGGCTGGCGAGTACGCCGAg < 7:99348/149‑1 (MQ=255) cGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGAAATGGGTTCTGGCGGCGGCATCAAGTCGACCTTCTCCACCTGCTTCGGCGCACCGTTCTTCCCGCGTCCGGCTGGCGAGTACGCCGAgctgc < 2:158767/149‑1 (MQ=255) cAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCa > 6:341390/1‑49 (MQ=255) cAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCa < 5:341390/49‑1 (MQ=255) gcggcCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGAAATGGGTTCTGGCGGCGGCATCAAGTCGACCTTCTCCACCTGCTTCGGCGCACCGTTCTTccc > 4:28431/1‑113 (MQ=255) gcggcCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGAAATGGGTTCTGGCGGCGGCATCAAGTCGACCTTCTCCACCTGCTTCGGCGCACCGTTCTTccc < 3:28431/113‑1 (MQ=255) ggcCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGAAATGGGTTCTGGCGGCGGCATCAAGTCGACCTTCTCCACCTGCTTCGGCGCACCGTTCTTCCCGCGTCCGGCTGGCGAGTACGCCGAGCTGCTGATCAAGc < 3:123455/149‑1 (MQ=255) | CAGAACAGCCGTGCGGCCTACCCGCTGGAGCACGTTGCCAAGCGTTCGGAAGCGAACCTGGGCGGCGAGCCTAACGCAGTGATCTTCCTCACCTGCGACCTGACAGGTGTTCTGCCTCCGGTTTCGATCCTGAACAACGAGCAGGCGGCCTACCACTTCCTGTCCGGCTACACCGCGCTGGTCGGTTCCACTGAAATGGGTTCTGGCGGCGGCATCAAGTCGACCTTCTCCACCTGCTTCGGCGCACCGTTCTTCCCGCGTCCGGCTGGCGAGTACGCCGAGCTGCTGATCAAGC > NC_002947/308067‑308361 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |