| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,706,254 | T→C | 5.9% | T347A (ACC→GCC) | phaK ← | phenylacetic acid‑specific porin |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,706,254 | 0 | T | C | 5.9% | 199.2 / 2.5 | 69 | T347A (ACC→GCC) | phaK | phenylacetic acid‑specific porin |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (31/32); new base C (2/2); total (34/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.27e-01 | |||||||||||
GGAGCGGAAGGTGACATTGCGCCAGCGCAGGCTGACGTCCTTGAACGGGCCACTCTGGATGACATACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAGTCGTAGTCGTAGCGCACTTGCCAAGAGTCCAGCCCGGCGCGGGTGAAGGTGTTGTAGGTGACCAGGTTGACGGTGAACGGGTCGCCGCCGTTGACGAACGGGAAGGCGCTG > NC_002947/3706108‑3706402 | ggAGCGGAAGGTGACATTGCGCCAGCGCAGGCTGACGTCCTTGAACGGGCCACTCTGGATGACATACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCa > 6:328520/1‑149 (MQ=255) gCGGAAGGTGACATTGCGCCAGCGCAGGCTGACGTCCTTGAACGGGCCACTCTGGATGACATACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGa < 2:92439/149‑1 (MQ=255) gAAGGTGACATTGCGCCAGCGCAGGCTGACGTCCTTGAACGGGCCACTCTGGATGACATACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAAc > 8:298612/1‑149 (MQ=255) gAAGGTGACATTGCGCCAGCGCAGGCTGACGTCCTTGAACGGGCCACTCTGGATGACATACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAAc > 8:142766/1‑149 (MQ=255) ggTGACATTGCGCCAGCGCAGGCTGACGTCCTTGAACGGGCCACTCTGGATGACATACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCa < 2:110173/149‑1 (MQ=255) aCATTGCGCCAGCGCAGGCTGACGTCCTTGAACGGGCCACTCTGGATGACATACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGcc > 2:328917/1‑149 (MQ=255) cATTGCGCCAGCGCAGGCTGACGTCCTTGAACGGGCCACTCTGGATGACATACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCg < 7:142766/149‑1 (MQ=255) aTTGCGCCAGCGCAGGCTGACGTCCTTGAACGGGCCACTCTGGATGACATACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCgg > 2:46908/1‑149 (MQ=255) ttGCGCCAGCGCAGGCTGACGTCCTTGAACGGGCCACTCTGGATGACATACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTTTAGCGGGGCATGAAACTCAGGCCggg > 7:255578/1‑149 (MQ=255) gcCAGCGCAGGCTGACGTCCTTGAACGGGCCACTCTGGATGACATACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATg > 1:144767/1‑149 (MQ=255) gcCAGCGCAGGCTGACGTCCTTGAACGGGCCACTCTGGATGACAAACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATAGGTCACGCTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCCTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATg > 3:315424/1‑149 (MQ=255) cAGCGCAGGCTGACGTCCTTGAACGGGCCACTCTGGATGACATACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGcc > 3:96889/1‑149 (MQ=255) cAGCGCAGGCTGACGTCCTTGAACGGGCCACTCTGGATGACATACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGcc > 3:371823/1‑149 (MQ=255) cgcAGGCTGACGTCCTTGAACGGGCCACTCTGGATGACATACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCAt < 7:78869/149‑1 (MQ=255) cAGGCTGACGTCCTTGAACGGGCCACTCTGGATGACATACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATgg < 4:305678/149‑1 (MQ=255) aGGCTGACGTCCTTGAACGGGCCACTCTGGATGACATACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATgg > 1:35226/1‑148 (MQ=255) gCTGACGTCCTTGAACGTGCCACTCTGGATGACATACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCaa < 5:218981/149‑1 (MQ=255) gACGTCCTTGAACGGGCCACTCTGGATGACATACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCTCGGTGGCAGTTTCCGTGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACg > 1:240879/1‑148 (MQ=255) gTCCTTGAACGGGCCACTCTGGATGACATACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAagt < 2:144767/149‑1 (MQ=255) tCCTTGATCGGGCCACTCTGGATGACATACGTGTTGTGGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGAGCGTCGGTATAGCGGGTCATGAATCTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAagtc < 4:315424/149‑1 (MQ=255) gAACGGGCCACTCTGGATGACATACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAagtcgta < 7:298612/147‑1 (MQ=255) gAACGGGCCACTCTGGATGACATACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAagtc < 1:151410/144‑1 (MQ=255) aaCGGGCCACTCTGGATGACATACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAagtcgtagtc > 4:93719/1‑149 (MQ=255) aCGGGCCACTCTGGATGACATACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAagtcgtagtcg > 6:128288/1‑149 (MQ=255) ggCCACTCTGGATGACATACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACg < 8:211627/134‑1 (MQ=255) ggCCACTCTGGATGACATACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACg > 7:211627/1‑134 (MQ=255) ggCCACTCTGGATGACATACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAGtcgtagtcgtag > 6:30047/1‑149 (MQ=255) ggCCACTCTGGATGACATACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAGtcgtagtcgtag > 7:297419/1‑149 (MQ=255) gCCACTCTGGATGACATACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAGTCGTAGTCGTAgc < 4:96889/149‑1 (MQ=255) tGGATGACATACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAGTCGTAGTCGTAGCGCACTTg > 3:316433/1‑149 (MQ=255) gATGACATACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAACCTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAGTCGTAGTCGTAGCGCACTTg < 7:122222/147‑1 (MQ=255) gATGACATACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAGTCGTAGTCGTAGCGCACTTGcc < 1:46908/149‑1 (MQ=255) aTGACATACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAGTCGTAGTCGTAGCGCACTTGcc > 5:385533/1‑148 (MQ=255) tGACATACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAagtc > 2:209319/1‑127 (MQ=255) tGACATACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAagtc < 1:209319/127‑1 (MQ=255) aCATACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAGTCGTAGTCGTAGCGCACTTGCCAaga < 2:314290/149‑1 (MQ=255) cATACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCTCGGTGGCAGTTTCCGTGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAGTCGTAGTCGTAGCGCACTTGCCAaga < 2:240879/148‑1 (MQ=255) aTACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAagtcgtagt > 2:301795/1‑128 (MQ=255) aTACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAagtcgtagt < 1:301795/128‑1 (MQ=255) gTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAGTCGTAGTCGTAGCGCACTTGCCAAGAGTCCAg > 3:138300/1‑149 (MQ=255) cGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCgg < 2:35722/90‑1 (MQ=255) gtgtCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCTCGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAGTCGTAGTCGTAGCGCACTTGCCAAGAGTCCAGCCCGGcgcg > 1:35368/1‑149 (MQ=255) gtgtCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAGTCGTAGTCGTAGCGCACTTGCCAAGAGTCCAGCCCGGcgcg > 1:66394/1‑149 (MQ=255) tgtCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAGTCGTAGTCGTAGCGCACTTGCCAAGAGTCCAGCCCGGCGCgg < 5:128288/149‑1 (MQ=255) tgtCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAGTCGTAGTCGTAGCGCACTTGCCAAGAGTCCAGCCCGGCGCgg < 5:30047/149‑1 (MQ=255) tgtCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAGTCGTAGTCGTAGCGCACTTGCCAAGAGTCCAGCCCGGCGCgg < 8:297419/149‑1 (MQ=255) tcgcgctcgcgcTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAagtc > 4:123755/1‑107 (MQ=255) tcgcgctcgcgcTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAagtc < 3:123755/107‑1 (MQ=255) gctcgcgctcACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAGTCGTAGTCGTAGCGCACTTGCCAAGAGTCCAGCCCGGCGCGGGTGAAg < 4:138300/149‑1 (MQ=255) tcACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAGTCGTAGTCGTAGCGCACTTGCCAAGAGTCCAGCCCGGCGCGGGTGAAGGtgttg > 8:350833/1‑147 (MQ=255) tcACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAGTCGTAGTCGTAGCGCACTTGCCAAGAGTCCAGCCCGCCGAGGGTCAAGGtgttg > 7:225920/1‑147 (MQ=255) tCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAGTCGTAGTCGTAGCGCACTTGCCAAGAGTCCAGCCCGGCGCGGGTGAAGGTGTTGTAGGTGACCAGGtt > 3:69862/1‑148 (MQ=255) tCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGCCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAgtcgtagtcgta > 5:319445/1‑91 (MQ=255) tCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGCCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAgtcgtagtcgta < 6:314177/91‑1 (MQ=255) tCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGCCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAgtcgtagtcgta < 6:319445/91‑1 (MQ=255) tCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGCCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAgtcgtagtcgta > 5:314177/1‑91 (MQ=255) aCGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAGGCGTAGTCGTAGCGCACTTGCCAAGAGTCCAGCCCGGCGCGGGTGAAGGTGTTGTAGGTGACCAGGTTGAc < 2:35368/149‑1 (MQ=255) cGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAGTCGTAGTCGTAGCGCACTTGCCAAGAGTCCAGCCCGGCGCGGGTGAAGGTGTTGTAGGTGACCAGGTTGACg < 4:69862/149‑1 (MQ=255) gTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAGTCGTAGTCGTAGCGCACTTGCCAAGAGTCCAGCCCGGCGCGGGTGAAGGtgttg > 6:24603/1‑129 (MQ=255) gTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAGTCGTAGTCGTAGCGCACTTGCCAAGAGTCCAGCCCGGCGCGGGTGAAGGtgttg < 5:24603/129‑1 (MQ=255) gTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAGTCGTAGTCGTAGCGCACTTGCCAAGAGTCCAGCCCGGCGCGGGTGAAGGTGTTGTAGGTGACCAGGTTGACTGt < 4:316433/149‑1 (MQ=255) gCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAGTCGTAGTCGTAGCGCACTTGCCAAGAGTCCAGCCCGGCGCGGGTGAAGGTGTTGTAGGTGACCAGGTTGACGGTGaa < 5:328520/149‑1 (MQ=255) ggttCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGGCATGCACCTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAGTCGTAGTCGTAGCGCACTTGCCAAGAGTCCAGCCCGGCGCGGGTGAAGGTGTTGTAGGTGACCAGGTTGACGGTGAACgg < 8:255578/147‑1 (MQ=255) ggCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAGTCGTAGTCGTAGCGCACTTGCCAAGAGTCCAGCCCGGCGCGGGTGAAGGTGTTGTAGGTGa < 2:81051/120‑1 (MQ=255) ggCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAGTCGTAGTCGTAGCGCACTTGCCAAGAGTCCAGCCCGGCGCGGGTGAAGGTGTTGTAGGTGa > 1:81051/1‑120 (MQ=255) gACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAGTCGTAGTCGTAGCGCACTTGCCAAGAGTCCAGCCCGGCGCGGGTGAAGGTGTTGTAGGTGACCAGGTTGACGGTGAACGGGTCGCCGCCGtt > 1:155655/1‑148 (MQ=255) aCCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAGTCGTAGTCGTAGCGCACTTGCCAAGAGTCCAGCCCGGCGCGGGTGAAGGTGTTGTAGGTGACCAGGTTGACGGTGAACGGGTCGCCGCCGTTGa < 2:66394/149‑1 (MQ=255) aGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAGTCGTAGTCGTAGCGCACTTGCCAAGAGTCCAGCCCGGCGCGGGTGAAGGTGTTGTAGGTGACCAGGTTGACGGTGAACGGGTCGCCGCCGTTGACGAACGGGAAg > 7:278123/1‑149 (MQ=255) gTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAGTCGTAGTCGTAGCGCACTTGCCAAGAGTCCAGCCCGGCGCGGGTGAAGGTGTTGTAGGTGACCAGGTTGACGGTGAACGGGTCGCCGCCGTTGACGAACGGGAAGGCGCt < 4:371823/149‑1 (MQ=255) tCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAGTCGTAGTCGTAGCGCACTTGCCAAGAGTCCAGCCCGGCGCGGGTGAAGGTGTTGTAGGTGACCAGGTTGACGGTGAACGGGTCGCCGCCGTTGACGAACGGGAAGGCGCTg < 1:328917/149‑1 (MQ=255) | GGAGCGGAAGGTGACATTGCGCCAGCGCAGGCTGACGTCCTTGAACGGGCCACTCTGGATGACATACGTGATGTCGGTGTCGCGCTCGCGCTCACGGCCATTGGTCACGGTGGCAGTTTCCGCGTGGCGACCGTCGGTATAGCGGGTCATGAAACTCAGGCCGGGGATGCCCATGGCAACGAAGTCGTAGTCGTAGCGCACTTGCCAAGAGTCCAGCCCGGCGCGGGTGAAGGTGTTGTAGGTGACCAGGTTGACGGTGAACGGGTCGCCGCCGTTGACGAACGGGAAGGCGCTG > NC_002947/3706108‑3706402 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |