| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,006,596 | G→C | 7.6% | A427G (GCC→GGC) | PP_3535 ← | gamma‑glutamyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,006,596 | 0 | G | C | 7.6% | 204.3 / 6.2 | 66 | A427G (GCC→GGC) | PP_3535 | gamma‑glutamyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (37/24); new base C (3/2); total (40/26) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.87e-01 | |||||||||||
GTTTGCCCGGCTGCACCCGATTGGCCACAGGCTTGCCGTGCTCGTGGGGGATGAACGAGAAGTCGGTCAGCTGATTGTTGAGCAGGAAGCCCTTGACCATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCG‑CCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGG > NC_002947/4006450‑4006743 | gTTTGACCGGCTGCACCCGATTGGCCACAGGCTTGCCGTGCTCGTGGGGGATGAACGAGAAGTCGGTCAGCTGATTGTTGAGCAGGAAGCCCTTGACAATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGcc > 8:208840/1‑149 (MQ=255) ccGGCTGCACCCGATTGGCCACAGGCTTGCCGTGCTCGTGGGGGATGAACGAGAAGTCGGTCAGCTGATTGTTGAGCAGGAAGCCCTTGACCATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCg > 1:327437/1‑149 (MQ=255) ccGGCTGCACCCGATTGGCCACAGGCTTGCCGTGCTCGTGGGGGATGAACGAGAAGTCGGTCAGCTGATTGTTGAGCAGGAAGCCCTTGACCATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGCCCTGGcca > 2:373451/1‑148 (MQ=255) ggCTGCACCCGATTGGCCACAGGCTTGCCGTGCTCGTGGGGGATGAACGAGAAGTCGGTCAGCTGATTGTTGAGCAGGAAGCCCTTGACCATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGCCCTGGccatg < 1:373451/149‑4 (MQ=255) aCCCGATTGGCCACAGGCTTGCCGTGCTCGTGGGGGATGAACGAGAAGTCGGTCAGCTGATTGTTGAGCAGGAAGCCCTTGACCATCAGGTACGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATc > 6:217556/1‑149 (MQ=255) cGATTGGCCACAGGCTTGCCGTGCTCGTGGGGGATGAACGAGAAGTCGGTCAGCTGATTGTTGAGCAGGAAGCCCTTGACCATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCAc > 2:55459/1‑149 (MQ=255) aTTGGCCACAGGCTTGCCGTGCTCGTGGGGGATGAACGAGAAGTCGGTCAGCTGATTGTTGAGCAGGAAGCCCTTGACCATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGt > 5:7104/1‑140 (MQ=255) aTTGGCCACAGGCTTGCCGTGCTCGTGGGGGATGAACGAGAAGTCGGTCAGCTGATTGTTGAGCAGGAAGCCCTTGACCATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGt < 6:7104/140‑1 (MQ=255) tGGCCACAGGCTTGCCGTGCTCGTGGGGGATGAACGAGAAGTCGGTCAGCTGATTGTTGAGCAGGAAGCCCTTGACCATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCa > 5:256150/1‑149 (MQ=255) cacaGGCTTGCCGTGCTCGTGGGGGATGAACGAGAAGTCGGTCAGCTGATTGTTGAGCAGGAAGCCCTTGACCATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGa < 6:175670/149‑1 (MQ=255) acaGGCTTGCCGTGCTCGTGGGGGATGAACGAGAAGTCGGTCAGCTGATTGTTGAGCAGGAAGCCCTTGACCATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAg < 6:220345/149‑1 (MQ=255) caGGCTTGCCGTGCTCGTGGGGGATGAACGAGAAGTCGGTCAGCTGATTGTTGAGCAGGAAGCCCTTGACCATCAGGTACGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAgg < 5:217556/149‑1 (MQ=255) gCCGTGCTCGTGGGGGATGAACGAGAAGTCGGTCAGCTGATTGTTGAGCAGGAAGCCCTTGACCATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTgaga < 5:384913/147‑1 (MQ=255) gCCGTGCTCGTGGGGGATGAACGAGAAGTCGGTCAGCTGATTGTTGAGCAGGAAGCCCTTGACCATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAgg > 8:25300/1‑149 (MQ=255) gCCGTGCTCGTGGGGGATGAACGAGAAGTCGGTCAGCTGATTGTTGAGCAGGAAGCCCTTGACCATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAgg > 4:87393/1‑149 (MQ=255) ccGTGCTCGTGGGGGATGAACGAGAAGTCGGTCAGCTGATTGTTGAGCAGGAAGCCCTTGACCATCAGGTGCGAGCCAAATGCTTGGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGagag < 1:112584/149‑1 (MQ=255) cGTGCTCGTGGGGGATGAACGAGAAGTCGGTCAGCTGATTGTTGAGCAGGAAGCCCTTGACCATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTg < 3:87393/149‑1 (MQ=255) cGTGCTCGTGGGGGATGAACGAGAAGTCGGTCAGCTGATTGTTGAGCAGGAAGCCCTTGACCATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGCCCTGGccat < 5:1538/120‑3 (MQ=255) cGTGCTCGTGGGGGATGAACGAGAAGTCGGTCAGCTGATTGTTGAGCAGGAAGCCCTTGACCATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGCCCTGGccat > 6:1538/1‑118 (MQ=255) cGTGGGGGATGAACGAGAAGTCGGTCAGCTGATTGTTGAGCAGGAAGCCCTTGACCATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATg > 4:53948/1‑149 (MQ=255) gggggATGAACGAGAAGTCGGTCAGCTGATTGTTGAGCAGGAAGCCCTTGACCATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATgcg > 7:24525/1‑148 (MQ=255) ggggATGAACGAGAAGTCGGTCAGCTGATTGTTGAGCAGGAAGCCCTTGACCATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCa < 1:55459/149‑1 (MQ=255) aaCGAGAAGTCGGTCAGCTGATTGTTGAGCAGGAAGCCCTTGACCATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGc > 1:171463/1‑147 (MQ=255) gagaAGTCGGTCAGCTGATTGTTGAGCAGGAAGCCCTTGACCATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCg > 7:89389/1‑149 (MQ=255) gagaAGTCGGTCAGCTGATTGTTGAGCAGGAAGCCCTTGACCATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCg < 2:15939/149‑1 (MQ=255) ggTCAGCTGATTGTTGAGCAGGAAGCCCTTGACCATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGgcg < 7:25300/149‑1 (MQ=255) tCAGCTGATTGTTGAGCAGGAAGCCCTTGACCATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGgcgc > 2:230226/1‑148 (MQ=255) aGCTGATTGTTGAGCAGGAAGCCCTTGACCATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCaa < 3:53948/148‑1 (MQ=255) tGATTGTTGAGCAGGAAGCCCTTGACCATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAgcg‑c > 3:39531/1‑149 (MQ=255) tGATTGTTGAGCAGGAAGCCCTTGACCATCAGGAGCCAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAgcg‑c > 3:44453/1‑149 (MQ=255) gATTGTTGAGCAGGAAGCCCTTGACCATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAgcg‑c > 6:232513/1‑148 (MQ=255) aTTGTTGAGCAGGAAGCCCTTGACCATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAgcg‑c < 1:230226/147‑1 (MQ=255) ttgAGCAGGAAGCCCTTGACCATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTCGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCG‑CCAGGTc > 5:285406/1‑149 (MQ=255) aGCAGGAAGCCCTTGACCATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCG‑CCAGGTCCGc < 2:327437/149‑1 (MQ=255) cAGGAAGCCCTTGACCATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCG‑CCAGGTCCGCTc > 7:178083/1‑149 (MQ=255) aGGAAGCCCTTGACCATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCG‑CCAGGTCCGCTcc > 2:254051/1‑149 (MQ=255) gAAGCCCTTGACCATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCG‑CCAGGTCCGCTCCtt > 4:125296/1‑149 (MQ=255) aGCCCTTGACCATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCG‑CCAGGTCCGCTCCTTGc < 5:109339/149‑1 (MQ=255) gCCCTTGACCATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCG‑CCAGGTCCGCTCCTTGCg > 2:228930/1‑149 (MQ=255) cTTGACCATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCG‑CCAGGTCCGCTCCTTGCGGCt > 6:78624/1‑149 (MQ=255) acgaTCAGGTGCGAGCCATATGC‑‑GGCCTCCACCGTGGTGGTCATGGGGATGGCCTGTCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCG‑CCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGc < 6:285406/145‑1 (MQ=255) cATCAGGTGCTAGGAAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTAATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGTTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCG‑CCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCg < 4:44453/149‑1 (MQ=255) cATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCG‑CCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCg < 4:39531/149‑1 (MQ=255) aGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCG‑CCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGAc < 8:24525/148‑1 (MQ=255) aGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCG‑CCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACg > 8:348880/1‑149 (MQ=255) gCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCGCCCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGgcgcgc < 1:254051/149‑1 (MQ=255) gCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGACATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCG‑CCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCt > 8:62355/1‑149 (MQ=255) aaTGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCG‑CCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCAt > 6:383484/1‑149 (MQ=255) ggCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCG‑CCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCtgt < 7:329059/149‑1 (MQ=255) ccACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCG‑CCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCg > 2:97663/1‑149 (MQ=255) cACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCG‑CCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCtt < 8:161581/135‑1 (MQ=255) cACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCG‑CCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCtt > 7:161581/1‑135 (MQ=255) cACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCG‑CCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGc > 3:250131/1‑149 (MQ=255) cACCGAGCTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCAGTGAGGTGAGAGGTGGAGGTGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCG‑CCAGGTCCGCTGCTGGCGGCTGGCCCGGACGGGCGGGCGTCATGCTGTGCTCGc > 4:101036/1‑149 (MQ=255) ccGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCG‑CTAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCg < 1:97663/149‑1 (MQ=255) aGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCG‑CCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGAt > 4:89755/1‑148 (MQ=255) aTGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCG‑CCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGcgccgc > 5:352175/1‑149 (MQ=255) cggCCAGGCCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCG‑CCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCcgcg > 4:303561/2‑149 (MQ=255) ccAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGTTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCG‑CCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCgg > 1:50453/1‑149 (MQ=255) ccAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCG‑CCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGcgcc > 2:170471/1‑143 (MQ=255) ccAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCG‑CCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGcgcc < 1:170471/143‑1 (MQ=255) ccAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCG‑CCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCgg > 5:307906/1‑149 (MQ=255) cAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCG‑CCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGc > 3:352269/1‑149 (MQ=255) aGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCG‑CCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCa < 3:208084/118‑1 (MQ=255) aGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCG‑CCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCa > 4:208084/1‑118 (MQ=255) aGGGCCTCCCAGTTGTCATCCACCGCACAGAGCTCAGAGGAGCAGATGCGAAGAGGCGAGCGGTCGGCCGCAAGCG‑CCAGGTCCGCTCCTTGCGCCTGGCCCGGACTGCCGCGCATCATACTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCt > 6:134546/1‑149 (MQ=255) ggCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCG‑CCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTgg < 3:125296/149‑1 (MQ=255) | GTTTGCCCGGCTGCACCCGATTGGCCACAGGCTTGCCGTGCTCGTGGGGGATGAACGAGAAGTCGGTCAGCTGATTGTTGAGCAGGAAGCCCTTGACCATCAGGTGCGAGCCAAATGC‑‑GGCCTCCACCGAGGTGGTCATGGCCAGGGCCTGGCCGTTGTCATCCACCGCACTGAGGTGAGAGGTGGAGATGCGCAGTGGCGAGCGGTCGGGCGCAAGCG‑CCAGGTCCGCTCCTTGCGGCTGGCCCGGACGGGCGCGCTTCATGCTGTGCTCGCCGATCAGCGCCGCGCGGCTGG > NC_002947/4006450‑4006743 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |