Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 48,872 | T→G | 8.4% | D168A (GAC→GCC) ‡ | czcA‑I ← | cation efflux system protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 48,872 | 0 | T | G | 8.4% | 214.7 / 10.3 | 71 | D168A (GAC→GCC) ‡ | czcA‑I | cation efflux system protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (35/30); new base G (3/3); total (38/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.01e-01 |
ACGCTGCGACCAGGTCATTGAGTGTCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTCAACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTAGATACCGGACCCATGACGGCCTCTACACCTTCTGGCAGCT > NC_002947/48726‑49016 | aCGCTGCGACCAGGTCATTGAGTGTCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTcc < 6:379461/149‑1 (MQ=255) gACCAGGTCATTGAGTGTCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCa > 8:346192/1‑149 (MQ=255) ccAGGTCATTGAGTGTCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCAcg > 1:214581/1‑149 (MQ=255) ccAGGTCATTGAGTGTCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGGACTGGATCatc < 6:341277/149‑3 (MQ=255) ccAGGTCATTGAGTGTCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGGACTGGATCatc < 2:366790/149‑3 (MQ=255) aGGTCATTGAGTGTCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGGACTGGATCatcaa < 7:286469/149‑5 (MQ=255) ttGAGTGTCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAggtc > 6:58193/1‑149 (MQ=255) tCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCggg < 5:162624/149‑1 (MQ=255) tCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCggg < 5:332003/149‑1 (MQ=255) tCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCggg > 8:146189/1‑149 (MQ=255) tCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCggg < 7:295915/149‑1 (MQ=255) aGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCgggg < 5:208275/148‑1 (MQ=255) ttGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTa > 3:370970/1‑149 (MQ=255) gtagCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTg < 1:254731/116‑1 (MQ=255) gtagCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTg > 2:254731/1‑116 (MQ=255) ccAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGAGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCg > 7:89781/1‑149 (MQ=255) tttGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCTTAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCct < 6:206201/145‑1 (MQ=255) tttGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCct > 5:206201/1‑145 (MQ=255) ttgATCCGGCGCAACCAGGACCTGCTTGGCATCACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCttt < 8:312129/145‑1 (MQ=255) tGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCttt < 5:58193/147‑1 (MQ=255) tCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACcgc > 2:347328/1‑149 (MQ=255) cAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGGCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCt < 7:123518/149‑1 (MQ=255) aaCCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCgcgc > 7:281800/1‑143 (MQ=255) aaCCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCgcgc < 8:281800/143‑1 (MQ=255) aCCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTc < 4:370970/149‑1 (MQ=255) cAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCggg > 7:101927/1‑109 (MQ=255) cAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCggg < 8:101927/109‑1 (MQ=255) gAACTGCTTAGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCtt > 7:340599/1‑149 (MQ=255) aaCTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCtt > 5:340924/1‑148 (MQ=255) aCTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTCa > 3:244286/1‑149 (MQ=255) cTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGc < 5:9277/109‑1 (MQ=255) cTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGc > 6:9277/1‑109 (MQ=255) cTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTCAACAg > 2:271541/1‑149 (MQ=255) cTTGGCATAACCGACTATTGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCGGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTCAACa < 7:332776/148‑1 (MQ=255) ggCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTCAACAGTc < 7:346192/148‑1 (MQ=255) aaCCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTCAACAGTCCACAg > 8:135028/1‑148 (MQ=255) ccgccgATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTCAACAGTCCACAgg > 3:358123/1‑147 (MQ=255) cgccgATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTCAACAGTCCACAgg > 4:282137/1‑146 (MQ=255) aTGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTCAACAGTCCACAGGAAGAtctc < 1:271541/149‑1 (MQ=255) tGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTCAACAGTCCACAGGAAGATCTCg > 1:309320/1‑149 (MQ=255) ggTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTc > 1:36840/1‑126 (MQ=255) ggTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTc < 2:36840/126‑1 (MQ=255) aaTTGATCTCGGCCACACCCGGGACGATACGAAGCAGACCCTAGATGAACCAGTCCAGGATCACGCCCAGGTCGGTCGGCGTCTACCGCGTACCATCCTCTTTGACCTCCCCATGGTCCGCTTCACCAGTCCACCGGAAGATCTCGCCg > 8:250558/2‑149 (MQ=255) ttGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTCAACAGTCCACAGGAAGATCTCg > 1:371160/1‑144 (MQ=255) ttGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTCAACAGTCCACAGGAAGATCTCg < 2:371160/144‑1 (MQ=255) gATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTCAACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAgg < 8:340599/148‑1 (MQ=255) tctcGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTCAACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCg > 7:71520/1‑149 (MQ=255) ggCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTCAACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTa < 1:347328/148‑1 (MQ=255) ggCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTCAACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTAg > 4:110543/1‑149 (MQ=255) ggCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTCAACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCAAGGCCGGTa < 2:214581/148‑1 (MQ=255) acacCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTCAACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTa > 3:262128/1‑144 (MQ=255) acacCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTCAACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTa > 3:267159/1‑144 (MQ=255) acacCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTCAACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTa < 4:262128/144‑1 (MQ=255) acacCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTCAACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTa < 4:267159/144‑1 (MQ=255) ccGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTCAACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTAGATACCGGa > 8:153417/1‑149 (MQ=255) gggACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTCAACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTAGATACCGGAcc > 4:336611/1‑149 (MQ=255) aCGTTACGCAGCTGAGGCTTTATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTCAACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTAGATACCGGACCCAt < 7:146189/149‑1 (MQ=255) ttACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTCAACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTAGATACCGGACCCATGAc > 2:297451/1‑149 (MQ=255) aCGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTCAACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTAGATACCGGACCCATGACg < 6:340924/148‑1 (MQ=255) gCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTCAACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTAGATACCGGACCCATGACGGcc > 1:380942/1‑149 (MQ=255) gCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTCAACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTAGATACCGGACCCATGACGGCctct < 7:153417/149‑1 (MQ=255) tgcgcgtgagCCAGGACTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTCAACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTAGATACCGGACCCATGACGGCCTCTACAcc > 5:148172/7‑148 (MQ=255) ttGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTCAACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTAGATACCGGACCCATGACGGCCTCTACACCTTc > 6:168966/1‑149 (MQ=255) gatgatCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTCAACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTAGATACCGGACCCATGACGGCCTCTACACCTTCt < 2:380942/148‑1 (MQ=255) gatgatCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTCAACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTAGATACCGGACCCATGACGGCCTCTACACCTTCTg > 3:83489/1‑149 (MQ=255) cgtgatCCAGGACTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTCAACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTAGATACCGGACCCATGACGGCCTCTACACCTTCTg > 7:120605/3‑149 (MQ=255) cgtgatCCAGGACTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACAGCGCCATCTTCGGCTTCAACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTAGATACCGGACCCATGACGGCCTCTACACCTTCTg > 6:304528/3‑149 (MQ=255) atgatCCAGTCCTGTATCACGCGCAGGTAGGTCGGGGTGTACGGCGGACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTCAACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTAGATACCGGACCCATGACGGCCTCTACACCTTCTgg < 8:89781/149‑1 (MQ=255) gatCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTCAACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTAGATACCGGACCCATGACGGCCTCTACCCCTTCTGGct > 1:356731/1‑148 (MQ=255) ccAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTCAACAGTCCACAGGAAGATCACGCCGAGGCCGGTAGATACCGGACCCATGACCGCCTATACACCTACTGGCAGCt > 6:308385/1‑149 (MQ=255) cAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTCAACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTAGATACCGGACCCATGACGGCCTCTACACCTTCTGGCAGCt < 5:61982/148‑1 (MQ=255) | ACGCTGCGACCAGGTCATTGAGTGTCAGCTTGTAGGTAGCCAGGCGCTTTGGATCCGGCGCAACCAGGAACTGCTTGGCATAACCGCCGATGGTATTGATCTCGGCCACACCCGGGACGTTACGCAGCTGAGGCTTGATGATCCAGTCCTGGATCACGCGCAGGTCGGTCGGGGTGTACGGCGTACCGTCCTCTTTGACCGCGCCATCTTCGGCTTCAACAGTCCACAGGAAGATCTCGCCGAGGCCGGTAGATACCGGACCCATGACGGCCTCTACACCTTCTGGCAGCT > NC_002947/48726‑49016 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |